MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	GGAGG	2	10	322	331	20 %	0 %	80 %	0 %	221634493
2	NC_011960	GTCTG	2	10	485	494	0 %	40 %	40 %	20 %	221634493
3	NC_011960	CCGCA	2	10	1340	1349	20 %	0 %	20 %	60 %	221634494
4	NC_011960	GGCAG	2	10	1672	1681	20 %	0 %	60 %	20 %	221634495
5	NC_011960	TCCGG	2	10	2325	2334	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011960	AGGCG	2	10	2429	2438	20 %	0 %	60 %	20 %	221634496
7	NC_011960	GGCCC	2	10	2933	2942	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8	NC_011960	CCCCT	2	10	3245	3254	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_011960	GCCCG	2	10	6679	6688	0 %	0 %	40 %	60 %	221634501
10	NC_011960	GGGCC	2	10	7283	7292	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011960	CGGGG	2	10	8154	8163	0 %	0 %	80 %	20 %	221634504
12	NC_011960	CCGCC	2	10	8332	8341	0 %	0 %	20 %	80 %	221634504
13	NC_011960	CGGTG	2	10	8494	8503	0 %	20 %	60 %	20 %	221634504
14	NC_011960	AAGGG	2	10	8979	8988	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011960	GGTCC	2	10	10070	10079	0 %	20 %	40 %	40 %	221634506
16	NC_011960	CCCGC	2	10	10699	10708	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
17	NC_011960	GGCAG	2	10	12538	12547	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011960	GCCGG	2	10	13686	13695	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011960	GCGCG	2	10	13790	13799	0 %	0 %	60 %	40 %	221634510
20	NC_011960	CGGGC	2	10	14156	14165	0 %	0 %	60 %	40 %	221634511
21	NC_011960	CGGGA	2	10	14893	14902	20 %	0 %	60 %	20 %	221634512
22	NC_011960	GGCCC	2	10	15278	15287	0 %	0 %	40 %	60 %	221634512
23	NC_011960	CGCGC	2	10	16866	16875	0 %	0 %	40 %	60 %	221634514
24	NC_011960	ACGGC	2	10	18470	18479	20 %	0 %	40 %	40 %	221634514
25	NC_011960	ACCGC	2	10	22053	22062	20 %	0 %	20 %	60 %	221634517
26	NC_011960	CCGGC	2	10	24959	24968	0 %	0 %	40 %	60 %	221634520
27	NC_011960	CCGCT	2	10	26085	26094	0 %	20 %	20 %	60 %	221634521
28	NC_011960	GCCGG	2	10	26504	26513	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011960	GGTCG	2	10	27058	27067	0 %	20 %	60 %	20 %	221634522
30	NC_011960	GCCGC	2	10	27092	27101	0 %	0 %	40 %	60 %	221634522
31	NC_011960	GCCGC	2	10	27317	27326	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_011960	TGCGC	2	10	28086	28095	0 %	20 %	40 %	40 %	221634523
33	NC_011960	CGCGA	2	10	28132	28141	20 %	0 %	40 %	40 %	221634523
34	NC_011960	CGGGG	2	10	28239	28248	0 %	0 %	80 %	20 %	221634523
35	NC_011960	CAGGA	2	10	31507	31516	40 %	0 %	40 %	20 %	221634526
36	NC_011960	GCCGC	2	10	31890	31899	0 %	0 %	40 %	60 %	221634527
37	NC_011960	GTCCG	2	10	32154	32163	0 %	20 %	40 %	40 %	221634527
38	NC_011960	GCCGT	2	10	32353	32362	0 %	20 %	40 %	40 %	221634527
39	NC_011960	CCGTT	2	10	32401	32410	0 %	40 %	20 %	40 %	221634527
40	NC_011960	ACTGG	2	10	34040	34049	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011960	GTGGC	2	10	35182	35191	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011960	CCGCG	2	10	35856	35865	0 %	0 %	40 %	60 %	221634533
43	NC_011960	GGTGC	2	10	36712	36721	0 %	20 %	60 %	20 %	221634533
44	NC_011960	GCCGT	2	10	37637	37646	0 %	20 %	40 %	40 %	221634533
45	NC_011960	GCGCC	2	10	37932	37941	0 %	0 %	40 %	60 %	221634533
46	NC_011960	GTCCG	2	10	39621	39630	0 %	20 %	40 %	40 %	221634533
47	NC_011960	CATCA	2	10	42512	42521	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_011960	TTTGT	2	10	44002	44011	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011960	GGGCG	2	10	44196	44205	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011960	CAGGG	2	10	44690	44699	20 %	0 %	60 %	20 %	221634539
51	NC_011960	GAAGC	2	10	44765	44774	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011960	AATGC	2	10	45212	45221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011960	AGCCA	2	10	45238	45247	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011960	CCGGC	2	10	46371	46380	0 %	0 %	40 %	60 %	221634544
55	NC_011960	AGCGC	2	10	46615	46624	20 %	0 %	40 %	40 %	221634544
56	NC_011960	CGGCG	2	10	46641	46650	0 %	0 %	60 %	40 %	221634544
57	NC_011960	CCCGG	2	10	49724	49733	0 %	0 %	40 %	60 %	221634549
58	NC_011960	TCCGG	2	10	50519	50528	0 %	20 %	40 %	40 %	221634551
59	NC_011960	CCCTG	2	10	52541	52550	0 %	20 %	20 %	60 %	221634554
60	NC_011960	GCCCC	2	10	52593	52602	0 %	0 %	20 %	80 %	221634554
61	NC_011960	TCGCC	2	10	52873	52882	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011960	CGATC	2	10	58292	58301	20 %	20 %	20 %	40 %	221634559
63	NC_011960	CCGCC	2	10	59259	59268	0 %	0 %	20 %	80 %	221634560
64	NC_011960	CCGCC	3	15	59421	59435	0 %	0 %	20 %	80 %	221634560
65	NC_011960	AGCCG	2	10	59604	59613	20 %	0 %	40 %	40 %	221634560
66	NC_011960	CCCCG	2	10	59650	59659	0 %	0 %	20 %	80 %	221634560
67	NC_011960	GTCTG	2	10	60012	60021	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011960	CGTCC	2	10	60389	60398	0 %	20 %	20 %	60 %	221634561
69	NC_011960	CGGCC	2	10	60916	60925	0 %	0 %	40 %	60 %	221634561
70	NC_011960	GCCCC	2	10	61138	61147	0 %	0 %	20 %	80 %	221634561
71	NC_011960	CTGCC	2	10	61736	61745	0 %	20 %	20 %	60 %	221634562
72	NC_011960	GCGGA	2	10	63316	63325	20 %	0 %	60 %	20 %	221634563
73	NC_011960	GCAGC	2	10	64293	64302	20 %	0 %	40 %	40 %	221634565
74	NC_011960	GGGCA	2	10	65067	65076	20 %	0 %	60 %	20 %	221634565
75	NC_011960	GGCTC	2	10	65360	65369	0 %	20 %	40 %	40 %	221634566
76	NC_011960	ACCGC	2	10	65786	65795	20 %	0 %	20 %	60 %	221634566
77	NC_011960	CTGCC	2	10	68709	68718	0 %	20 %	20 %	60 %	221634568
78	NC_011960	CCCGG	2	10	68756	68765	0 %	0 %	40 %	60 %	221634568
79	NC_011960	CGCGG	2	10	69139	69148	0 %	0 %	60 %	40 %	221634568
80	NC_011960	GGCCC	2	10	71053	71062	0 %	0 %	40 %	60 %	221634569
81	NC_011960	AGCGC	2	10	71838	71847	20 %	0 %	40 %	40 %	221634570
82	NC_011960	TCGAA	2	10	73069	73078	40 %	20 %	20 %	20 %	221634571
83	NC_011960	GGACC	2	10	74660	74669	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_011960	TGCCC	2	10	74851	74860	0 %	20 %	20 %	60 %	221634573
85	NC_011960	GCCGC	2	10	75806	75815	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
86	NC_011960	CGCGG	2	10	76160	76169	0 %	0 %	60 %	40 %	221634574
87	NC_011960	GCGCC	2	10	76657	76666	0 %	0 %	40 %	60 %	221634574
88	NC_011960	TCGGC	2	10	77436	77445	0 %	20 %	40 %	40 %	221634576
89	NC_011960	CGGGC	2	10	77671	77680	0 %	0 %	60 %	40 %	221634576
90	NC_011960	CGAAG	2	10	78567	78576	40 %	0 %	40 %	20 %	221634577
91	NC_011960	GGCGG	2	10	83319	83328	0 %	0 %	80 %	20 %	221634581
92	NC_011960	GCCGC	2	10	83686	83695	0 %	0 %	40 %	60 %	221634581
93	NC_011960	GCCGC	2	10	84355	84364	0 %	0 %	40 %	60 %	221634582
94	NC_011960	CGCGG	2	10	84632	84641	0 %	0 %	60 %	40 %	221634582
95	NC_011960	CCCCG	2	10	84980	84989	0 %	0 %	20 %	80 %	221634582
96	NC_011960	GGGCG	2	10	85821	85830	0 %	0 %	80 %	20 %	221634583
97	NC_011960	CAGGG	2	10	86882	86891	20 %	0 %	60 %	20 %	221634583
98	NC_011960	CCGCC	2	10	86949	86958	0 %	0 %	20 %	80 %	221634583
99	NC_011960	GCAGC	2	10	87064	87073	20 %	0 %	40 %	40 %	221634583
100	NC_011960	TGGCG	2	10	88401	88410	0 %	20 %	60 %	20 %	221634584
101	NC_011960	AGCCG	2	10	88431	88440	20 %	0 %	40 %	40 %	221634584
102	NC_011960	GCCGG	2	10	88620	88629	0 %	0 %	60 %	40 %	221634584
103	NC_011960	GCTCG	2	10	89604	89613	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
104	NC_011960	CGGCA	2	10	89895	89904	20 %	0 %	40 %	40 %	221634586
105	NC_011960	GCTCG	2	10	89940	89949	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
106	NC_011960	GCTCG	2	10	90180	90189	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
107	NC_011960	GCTCG	2	10	90756	90765	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
108	NC_011960	GCTCG	2	10	91332	91341	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
109	NC_011960	GCTCG	2	10	91692	91701	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
110	NC_011960	GCTCG	2	10	91908	91917	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
111	NC_011960	CTCGG	2	10	92053	92062	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
112	NC_011960	TCGGC	2	10	92486	92495	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
113	NC_011960	GCTCG	2	10	92508	92517	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
114	NC_011960	GCTCG	2	10	92724	92733	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
115	NC_011960	GCTCG	2	10	92868	92877	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
116	NC_011960	CTCGG	2	10	93205	93214	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
117	NC_011960	CTCGG	2	10	93301	93310	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
118	NC_011960	GCTCG	2	10	93540	93549	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
119	NC_011960	CTCGG	2	10	93685	93694	0 %	20 %	40 %	40 %	221634586
120	NC_011960	CCGCC	2	10	94497	94506	0 %	0 %	20 %	80 %	221634587
121	NC_011960	CGGGG	2	10	97634	97643	0 %	0 %	80 %	20 %	221634588
122	NC_011960	GGCCG	2	10	97903	97912	0 %	0 %	60 %	40 %	221634588
123	NC_011960	GGGGC	2	10	97919	97928	0 %	0 %	80 %	20 %	221634588
124	NC_011960	CCGGG	2	10	98498	98507	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011960	AGCGC	2	10	102801	102810	20 %	0 %	40 %	40 %	221634594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.