MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 346

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	CCCG	2	8	298	305	0 %	0 %	25 %	75 %	221634493
2	NC_011960	CGGG	2	8	340	347	0 %	0 %	75 %	25 %	221634493
3	NC_011960	TCGG	2	8	421	428	0 %	25 %	50 %	25 %	221634493
4	NC_011960	CGGG	2	8	949	956	0 %	0 %	75 %	25 %	221634494
5	NC_011960	GCCC	2	8	1102	1109	0 %	0 %	25 %	75 %	221634494
6	NC_011960	GCCT	2	8	1435	1442	0 %	25 %	25 %	50 %	221634495
7	NC_011960	GCTC	2	8	1714	1721	0 %	25 %	25 %	50 %	221634495
8	NC_011960	AAGA	2	8	1986	1993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011960	GCCG	2	8	2027	2034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011960	TTCA	2	8	2736	2743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011960	CGGA	2	8	3043	3050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011960	CCCG	2	8	3074	3081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_011960	CGGG	2	8	3128	3135	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011960	CGGG	2	8	3744	3751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011960	GCGG	2	8	4470	4477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011960	GCCG	2	8	4553	4560	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
17	NC_011960	AGCG	2	8	4582	4589	25 %	0 %	50 %	25 %	221634499
18	NC_011960	CGCC	2	8	5821	5828	0 %	0 %	25 %	75 %	221634500
19	NC_011960	CCGG	2	8	6422	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
20	NC_011960	GACG	2	8	6550	6557	25 %	0 %	50 %	25 %	221634501
21	NC_011960	CGAG	2	8	6588	6595	25 %	0 %	50 %	25 %	221634501
22	NC_011960	TCCA	2	8	6794	6801	25 %	25 %	0 %	50 %	221634501
23	NC_011960	CGGC	2	8	6828	6835	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
24	NC_011960	CCGG	2	8	7182	7189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011960	CGGG	2	8	7583	7590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011960	CGGG	2	8	7874	7881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011960	GGAT	2	8	8229	8236	25 %	25 %	50 %	0 %	221634504
28	NC_011960	CGGG	2	8	8302	8309	0 %	0 %	75 %	25 %	221634504
29	NC_011960	GCGA	2	8	8364	8371	25 %	0 %	50 %	25 %	221634504
30	NC_011960	CGCC	2	8	8440	8447	0 %	0 %	25 %	75 %	221634504
31	NC_011960	CGCC	2	8	8812	8819	0 %	0 %	25 %	75 %	221634504
32	NC_011960	CGTC	2	8	9564	9571	0 %	25 %	25 %	50 %	221634505
33	NC_011960	GGGC	2	8	9595	9602	0 %	0 %	75 %	25 %	221634505
34	NC_011960	CGGC	2	8	9976	9983	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
35	NC_011960	GCAG	2	8	10199	10206	25 %	0 %	50 %	25 %	221634506
36	NC_011960	GCCC	2	8	10221	10228	0 %	0 %	25 %	75 %	221634506
37	NC_011960	CATC	2	8	10321	10328	25 %	25 %	0 %	50 %	221634506
38	NC_011960	CCGG	2	8	10372	10379	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
39	NC_011960	CGGC	2	8	10531	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
40	NC_011960	TCCG	2	8	10606	10613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011960	CGTT	2	8	10652	10659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011960	GGCG	2	8	10837	10844	0 %	0 %	75 %	25 %	221634507
43	NC_011960	GGGC	2	8	11023	11030	0 %	0 %	75 %	25 %	221634507
44	NC_011960	GGGT	2	8	11169	11176	0 %	25 %	75 %	0 %	221634507
45	NC_011960	CCGC	2	8	11601	11608	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
46	NC_011960	GCCC	2	8	11627	11634	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
47	NC_011960	CGCC	2	8	11791	11798	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
48	NC_011960	CCGC	2	8	11838	11845	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
49	NC_011960	TCTT	2	8	11886	11893	0 %	75 %	0 %	25 %	221634508
50	NC_011960	GGGC	2	8	12001	12008	0 %	0 %	75 %	25 %	221634508
51	NC_011960	ATGG	2	8	12444	12451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011960	GCCC	2	8	12605	12612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
53	NC_011960	CTCG	2	8	13285	13292	0 %	25 %	25 %	50 %	221634509
54	NC_011960	GGCC	2	8	13339	13346	0 %	0 %	50 %	50 %	221634509
55	NC_011960	CGGC	2	8	13371	13378	0 %	0 %	50 %	50 %	221634509
56	NC_011960	GACC	2	8	13492	13499	25 %	0 %	25 %	50 %	221634509
57	NC_011960	GACC	2	8	13872	13879	25 %	0 %	25 %	50 %	221634510
58	NC_011960	GGCG	2	8	14525	14532	0 %	0 %	75 %	25 %	221634511
59	NC_011960	GCTG	2	8	14844	14851	0 %	25 %	50 %	25 %	221634512
60	NC_011960	CGCA	2	8	14939	14946	25 %	0 %	25 %	50 %	221634512
61	NC_011960	CCGG	2	8	15291	15298	0 %	0 %	50 %	50 %	221634512
62	NC_011960	GCAG	2	8	15443	15450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011960	GAAC	2	8	16029	16036	50 %	0 %	25 %	25 %	221634514
64	NC_011960	GTTC	2	8	16148	16155	0 %	50 %	25 %	25 %	221634514
65	NC_011960	TCGG	2	8	16271	16278	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
66	NC_011960	GGCC	2	8	16454	16461	0 %	0 %	50 %	50 %	221634514
67	NC_011960	GACG	2	8	16962	16969	25 %	0 %	50 %	25 %	221634514
68	NC_011960	CTGG	2	8	17097	17104	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
69	NC_011960	GTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	25 %	25 %	221634514
70	NC_011960	CGGT	2	8	18024	18031	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
71	NC_011960	TCGG	2	8	18283	18290	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
72	NC_011960	AGGA	2	8	18755	18762	50 %	0 %	50 %	0 %	221634514
73	NC_011960	CGGA	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	221634514
74	NC_011960	CGAT	2	8	19028	19035	25 %	25 %	25 %	25 %	221634514
75	NC_011960	GCAT	2	8	19259	19266	25 %	25 %	25 %	25 %	221634515
76	NC_011960	ATCT	2	8	19537	19544	25 %	50 %	0 %	25 %	221634515
77	NC_011960	ACGC	2	8	20210	20217	25 %	0 %	25 %	50 %	221634515
78	NC_011960	CGCA	2	8	20320	20327	25 %	0 %	25 %	50 %	221634515
79	NC_011960	GGGC	2	8	21205	21212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011960	GCGA	2	8	21459	21466	25 %	0 %	50 %	25 %	221634516
81	NC_011960	CCGA	2	8	21617	21624	25 %	0 %	25 %	50 %	221634516
82	NC_011960	TCGG	2	8	22405	22412	0 %	25 %	50 %	25 %	221634517
83	NC_011960	CCCG	2	8	22587	22594	0 %	0 %	25 %	75 %	221634517
84	NC_011960	GCCC	2	8	22793	22800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_011960	AAAT	2	8	23375	23382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011960	CCAC	3	12	23659	23670	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_011960	GGGC	2	8	23956	23963	0 %	0 %	75 %	25 %	221634519
88	NC_011960	GCCA	2	8	24100	24107	25 %	0 %	25 %	50 %	221634519
89	NC_011960	GGGC	2	8	24866	24873	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
90	NC_011960	GCGG	2	8	24950	24957	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
91	NC_011960	GCGG	2	8	25043	25050	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
92	NC_011960	GGCC	2	8	25317	25324	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
93	NC_011960	GCCT	2	8	25587	25594	0 %	25 %	25 %	50 %	221634520
94	NC_011960	CCGC	2	8	25669	25676	0 %	0 %	25 %	75 %	221634520
95	NC_011960	CGGC	2	8	25709	25716	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
96	NC_011960	CGGG	2	8	26155	26162	0 %	0 %	75 %	25 %	221634521
97	NC_011960	GGCC	2	8	26492	26499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_011960	CGGG	2	8	26569	26576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011960	CCGC	2	8	26808	26815	0 %	0 %	25 %	75 %	221634522
100	NC_011960	CGCC	2	8	26827	26834	0 %	0 %	25 %	75 %	221634522
101	NC_011960	CCGG	2	8	27461	27468	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
102	NC_011960	CTGG	2	8	28098	28105	0 %	25 %	50 %	25 %	221634523
103	NC_011960	GCCG	2	8	28251	28258	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
104	NC_011960	TCCC	2	8	28458	28465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_011960	CGGG	2	8	29460	29467	0 %	0 %	75 %	25 %	221634524
106	NC_011960	GGCG	2	8	29491	29498	0 %	0 %	75 %	25 %	221634524
107	NC_011960	GAGG	2	8	30083	30090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011960	GGCG	2	8	30337	30344	0 %	0 %	75 %	25 %	221634525
109	NC_011960	GCCG	2	8	30574	30581	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
110	NC_011960	GCGG	2	8	30690	30697	0 %	0 %	75 %	25 %	221634525
111	NC_011960	AGGC	2	8	31043	31050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011960	CGAT	2	8	31630	31637	25 %	25 %	25 %	25 %	221634527
113	NC_011960	AGCC	2	8	31713	31720	25 %	0 %	25 %	50 %	221634527
114	NC_011960	GACC	2	8	32111	32118	25 %	0 %	25 %	50 %	221634527
115	NC_011960	GGCC	2	8	32608	32615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_011960	GTGC	2	8	33245	33252	0 %	25 %	50 %	25 %	221634528
117	NC_011960	CGGC	2	8	33723	33730	0 %	0 %	50 %	50 %	221634529
118	NC_011960	CGGC	2	8	33792	33799	0 %	0 %	50 %	50 %	221634529
119	NC_011960	GCTG	2	8	33975	33982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011960	GCCC	2	8	34019	34026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_011960	CAAG	2	8	34281	34288	50 %	0 %	25 %	25 %	221634531
122	NC_011960	CCGC	2	8	34415	34422	0 %	0 %	25 %	75 %	221634531
123	NC_011960	GCGG	2	8	35715	35722	0 %	0 %	75 %	25 %	221634533
124	NC_011960	CCCG	2	8	35770	35777	0 %	0 %	25 %	75 %	221634533
125	NC_011960	GTCG	2	8	37828	37835	0 %	25 %	50 %	25 %	221634533
126	NC_011960	TCGC	2	8	38420	38427	0 %	25 %	25 %	50 %	221634533
127	NC_011960	CAGG	2	8	38725	38732	25 %	0 %	50 %	25 %	221634533
128	NC_011960	CCGA	2	8	38846	38853	25 %	0 %	25 %	50 %	221634533
129	NC_011960	CGAC	2	8	38856	38863	25 %	0 %	25 %	50 %	221634533
130	NC_011960	CTGC	2	8	39213	39220	0 %	25 %	25 %	50 %	221634533
131	NC_011960	CGGG	2	8	39649	39656	0 %	0 %	75 %	25 %	221634533
132	NC_011960	TGGT	2	8	39797	39804	0 %	50 %	50 %	0 %	221634533
133	NC_011960	GATC	2	8	40039	40046	25 %	25 %	25 %	25 %	221634533
134	NC_011960	GCCT	2	8	40875	40882	0 %	25 %	25 %	50 %	221634534
135	NC_011960	GCGG	2	8	40972	40979	0 %	0 %	75 %	25 %	221634534
136	NC_011960	CGGA	2	8	41236	41243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011960	TCAT	2	8	41844	41851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011960	GGTT	2	8	41976	41983	0 %	50 %	50 %	0 %	221634536
139	NC_011960	CGTT	2	8	42229	42236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011960	GCCA	2	8	42366	42373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011960	CAGC	2	8	42427	42434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011960	CCAG	2	8	43064	43071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011960	GTGC	2	8	43167	43174	0 %	25 %	50 %	25 %	221634538
144	NC_011960	GAAG	2	8	43200	43207	50 %	0 %	50 %	0 %	221634538
145	NC_011960	CGGC	2	8	43388	43395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.