MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	AAGA	2	8	1986	1993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011960	GCCG	2	8	2027	2034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011960	TTCA	2	8	2736	2743	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011960	CGGA	2	8	3043	3050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011960	CCCG	2	8	3074	3081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_011960	CGGG	2	8	3128	3135	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011960	CGGG	2	8	3744	3751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011960	GCGG	2	8	4470	4477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011960	CCGG	2	8	7182	7189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011960	CGGG	2	8	7583	7590	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011960	CGGG	2	8	7874	7881	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011960	TCCG	2	8	10606	10613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011960	CGTT	2	8	10652	10659	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011960	ATGG	2	8	12444	12451	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011960	GCCC	2	8	12605	12612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_011960	GCAG	2	8	15443	15450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011960	GGGC	2	8	21205	21212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011960	GCCC	2	8	22793	22800	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_011960	AAAT	2	8	23375	23382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011960	CCAC	3	12	23659	23670	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_011960	GGCC	2	8	26492	26499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011960	CGGG	2	8	26569	26576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011960	TCCC	2	8	28458	28465	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_011960	GAGG	2	8	30083	30090	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011960	AGGC	2	8	31043	31050	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011960	GGCC	2	8	32608	32615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011960	GCTG	2	8	33975	33982	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011960	GCCC	2	8	34019	34026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011960	CGGA	2	8	41236	41243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011960	TCAT	2	8	41844	41851	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011960	CGTT	2	8	42229	42236	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011960	GCCA	2	8	42366	42373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011960	CAGC	2	8	42427	42434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011960	CCAG	2	8	43064	43071	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011960	CGGC	2	8	43388	43395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011960	CCAA	2	8	43593	43600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011960	AATT	2	8	43602	43609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011960	TCAT	2	8	44032	44039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011960	GGCG	2	8	44432	44439	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011960	CTCG	2	8	44888	44895	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011960	TTTC	2	8	45405	45412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011960	CCCG	2	8	52778	52785	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_011960	CCGA	2	8	52931	52938	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011960	GGGC	2	8	53082	53089	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011960	TTCA	2	8	53413	53420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011960	AAGG	2	8	54648	54655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011960	CGGG	2	8	54752	54759	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011960	CGCC	2	8	54821	54828	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011960	TCCA	2	8	56040	56047	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011960	CGGC	2	8	56829	56836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011960	GCCG	2	8	59008	59015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011960	GGGC	2	8	60130	60137	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011960	CGTC	2	8	68398	68405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011960	GCCC	2	8	71406	71413	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_011960	GTTT	2	8	72576	72583	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011960	AAAC	2	8	72648	72655	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011960	CGGG	2	8	87304	87311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011960	TCCC	2	8	87319	87326	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_011960	CGGG	2	8	97198	97205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011960	CCCT	2	8	97225	97232	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_011960	CCGC	2	8	98473	98480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_011960	GCGG	2	8	102110	102117	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011960	GCCG	2	8	102252	102259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.