MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 plasmid pRSKD131B

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011960	CCCG	2	8	298	305	0 %	0 %	25 %	75 %	221634493
2	NC_011960	CGGG	2	8	340	347	0 %	0 %	75 %	25 %	221634493
3	NC_011960	TCGG	2	8	421	428	0 %	25 %	50 %	25 %	221634493
4	NC_011960	CGGG	2	8	949	956	0 %	0 %	75 %	25 %	221634494
5	NC_011960	GCCC	2	8	1102	1109	0 %	0 %	25 %	75 %	221634494
6	NC_011960	GCCT	2	8	1435	1442	0 %	25 %	25 %	50 %	221634495
7	NC_011960	GCTC	2	8	1714	1721	0 %	25 %	25 %	50 %	221634495
8	NC_011960	GCCG	2	8	4553	4560	0 %	0 %	50 %	50 %	221634499
9	NC_011960	AGCG	2	8	4582	4589	25 %	0 %	50 %	25 %	221634499
10	NC_011960	CGCC	2	8	5821	5828	0 %	0 %	25 %	75 %	221634500
11	NC_011960	CCGG	2	8	6422	6429	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
12	NC_011960	GACG	2	8	6550	6557	25 %	0 %	50 %	25 %	221634501
13	NC_011960	CGAG	2	8	6588	6595	25 %	0 %	50 %	25 %	221634501
14	NC_011960	TCCA	2	8	6794	6801	25 %	25 %	0 %	50 %	221634501
15	NC_011960	CGGC	2	8	6828	6835	0 %	0 %	50 %	50 %	221634501
16	NC_011960	GGAT	2	8	8229	8236	25 %	25 %	50 %	0 %	221634504
17	NC_011960	CGGG	2	8	8302	8309	0 %	0 %	75 %	25 %	221634504
18	NC_011960	GCGA	2	8	8364	8371	25 %	0 %	50 %	25 %	221634504
19	NC_011960	CGCC	2	8	8440	8447	0 %	0 %	25 %	75 %	221634504
20	NC_011960	CGCC	2	8	8812	8819	0 %	0 %	25 %	75 %	221634504
21	NC_011960	CGTC	2	8	9564	9571	0 %	25 %	25 %	50 %	221634505
22	NC_011960	GGGC	2	8	9595	9602	0 %	0 %	75 %	25 %	221634505
23	NC_011960	CGGC	2	8	9976	9983	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
24	NC_011960	GCAG	2	8	10199	10206	25 %	0 %	50 %	25 %	221634506
25	NC_011960	GCCC	2	8	10221	10228	0 %	0 %	25 %	75 %	221634506
26	NC_011960	CATC	2	8	10321	10328	25 %	25 %	0 %	50 %	221634506
27	NC_011960	CCGG	2	8	10372	10379	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
28	NC_011960	CGGC	2	8	10531	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	221634506
29	NC_011960	GGCG	2	8	10837	10844	0 %	0 %	75 %	25 %	221634507
30	NC_011960	GGGC	2	8	11023	11030	0 %	0 %	75 %	25 %	221634507
31	NC_011960	GGGT	2	8	11169	11176	0 %	25 %	75 %	0 %	221634507
32	NC_011960	CCGC	2	8	11601	11608	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
33	NC_011960	GCCC	2	8	11627	11634	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
34	NC_011960	CGCC	2	8	11791	11798	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
35	NC_011960	CCGC	2	8	11838	11845	0 %	0 %	25 %	75 %	221634508
36	NC_011960	TCTT	2	8	11886	11893	0 %	75 %	0 %	25 %	221634508
37	NC_011960	GGGC	2	8	12001	12008	0 %	0 %	75 %	25 %	221634508
38	NC_011960	CTCG	2	8	13285	13292	0 %	25 %	25 %	50 %	221634509
39	NC_011960	GGCC	2	8	13339	13346	0 %	0 %	50 %	50 %	221634509
40	NC_011960	CGGC	2	8	13371	13378	0 %	0 %	50 %	50 %	221634509
41	NC_011960	GACC	2	8	13492	13499	25 %	0 %	25 %	50 %	221634509
42	NC_011960	GACC	2	8	13872	13879	25 %	0 %	25 %	50 %	221634510
43	NC_011960	GGCG	2	8	14525	14532	0 %	0 %	75 %	25 %	221634511
44	NC_011960	GCTG	2	8	14844	14851	0 %	25 %	50 %	25 %	221634512
45	NC_011960	CGCA	2	8	14939	14946	25 %	0 %	25 %	50 %	221634512
46	NC_011960	CCGG	2	8	15291	15298	0 %	0 %	50 %	50 %	221634512
47	NC_011960	GAAC	2	8	16029	16036	50 %	0 %	25 %	25 %	221634514
48	NC_011960	GTTC	2	8	16148	16155	0 %	50 %	25 %	25 %	221634514
49	NC_011960	TCGG	2	8	16271	16278	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
50	NC_011960	GGCC	2	8	16454	16461	0 %	0 %	50 %	50 %	221634514
51	NC_011960	GACG	2	8	16962	16969	25 %	0 %	50 %	25 %	221634514
52	NC_011960	CTGG	2	8	17097	17104	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
53	NC_011960	GTTC	2	8	17174	17181	0 %	50 %	25 %	25 %	221634514
54	NC_011960	CGGT	2	8	18024	18031	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
55	NC_011960	TCGG	2	8	18283	18290	0 %	25 %	50 %	25 %	221634514
56	NC_011960	AGGA	2	8	18755	18762	50 %	0 %	50 %	0 %	221634514
57	NC_011960	CGGA	2	8	18844	18851	25 %	0 %	50 %	25 %	221634514
58	NC_011960	CGAT	2	8	19028	19035	25 %	25 %	25 %	25 %	221634514
59	NC_011960	GCAT	2	8	19259	19266	25 %	25 %	25 %	25 %	221634515
60	NC_011960	ATCT	2	8	19537	19544	25 %	50 %	0 %	25 %	221634515
61	NC_011960	ACGC	2	8	20210	20217	25 %	0 %	25 %	50 %	221634515
62	NC_011960	CGCA	2	8	20320	20327	25 %	0 %	25 %	50 %	221634515
63	NC_011960	GCGA	2	8	21459	21466	25 %	0 %	50 %	25 %	221634516
64	NC_011960	CCGA	2	8	21617	21624	25 %	0 %	25 %	50 %	221634516
65	NC_011960	TCGG	2	8	22405	22412	0 %	25 %	50 %	25 %	221634517
66	NC_011960	CCCG	2	8	22587	22594	0 %	0 %	25 %	75 %	221634517
67	NC_011960	GGGC	2	8	23956	23963	0 %	0 %	75 %	25 %	221634519
68	NC_011960	GCCA	2	8	24100	24107	25 %	0 %	25 %	50 %	221634519
69	NC_011960	GGGC	2	8	24866	24873	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
70	NC_011960	GCGG	2	8	24950	24957	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
71	NC_011960	GCGG	2	8	25043	25050	0 %	0 %	75 %	25 %	221634520
72	NC_011960	GGCC	2	8	25317	25324	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
73	NC_011960	GCCT	2	8	25587	25594	0 %	25 %	25 %	50 %	221634520
74	NC_011960	CCGC	2	8	25669	25676	0 %	0 %	25 %	75 %	221634520
75	NC_011960	CGGC	2	8	25709	25716	0 %	0 %	50 %	50 %	221634520
76	NC_011960	CGGG	2	8	26155	26162	0 %	0 %	75 %	25 %	221634521
77	NC_011960	CCGC	2	8	26808	26815	0 %	0 %	25 %	75 %	221634522
78	NC_011960	CGCC	2	8	26827	26834	0 %	0 %	25 %	75 %	221634522
79	NC_011960	CCGG	2	8	27461	27468	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
80	NC_011960	CTGG	2	8	28098	28105	0 %	25 %	50 %	25 %	221634523
81	NC_011960	GCCG	2	8	28251	28258	0 %	0 %	50 %	50 %	221634523
82	NC_011960	CGGG	2	8	29460	29467	0 %	0 %	75 %	25 %	221634524
83	NC_011960	GGCG	2	8	29491	29498	0 %	0 %	75 %	25 %	221634524
84	NC_011960	GGCG	2	8	30337	30344	0 %	0 %	75 %	25 %	221634525
85	NC_011960	GCCG	2	8	30574	30581	0 %	0 %	50 %	50 %	221634525
86	NC_011960	GCGG	2	8	30690	30697	0 %	0 %	75 %	25 %	221634525
87	NC_011960	CGAT	2	8	31630	31637	25 %	25 %	25 %	25 %	221634527
88	NC_011960	AGCC	2	8	31713	31720	25 %	0 %	25 %	50 %	221634527
89	NC_011960	GACC	2	8	32111	32118	25 %	0 %	25 %	50 %	221634527
90	NC_011960	GTGC	2	8	33245	33252	0 %	25 %	50 %	25 %	221634528
91	NC_011960	CGGC	2	8	33723	33730	0 %	0 %	50 %	50 %	221634529
92	NC_011960	CGGC	2	8	33792	33799	0 %	0 %	50 %	50 %	221634529
93	NC_011960	CAAG	2	8	34281	34288	50 %	0 %	25 %	25 %	221634531
94	NC_011960	CCGC	2	8	34415	34422	0 %	0 %	25 %	75 %	221634531
95	NC_011960	GCGG	2	8	35715	35722	0 %	0 %	75 %	25 %	221634533
96	NC_011960	CCCG	2	8	35770	35777	0 %	0 %	25 %	75 %	221634533
97	NC_011960	GTCG	2	8	37828	37835	0 %	25 %	50 %	25 %	221634533
98	NC_011960	TCGC	2	8	38420	38427	0 %	25 %	25 %	50 %	221634533
99	NC_011960	CAGG	2	8	38725	38732	25 %	0 %	50 %	25 %	221634533
100	NC_011960	CCGA	2	8	38846	38853	25 %	0 %	25 %	50 %	221634533
101	NC_011960	CGAC	2	8	38856	38863	25 %	0 %	25 %	50 %	221634533
102	NC_011960	CTGC	2	8	39213	39220	0 %	25 %	25 %	50 %	221634533
103	NC_011960	CGGG	2	8	39649	39656	0 %	0 %	75 %	25 %	221634533
104	NC_011960	TGGT	2	8	39797	39804	0 %	50 %	50 %	0 %	221634533
105	NC_011960	GATC	2	8	40039	40046	25 %	25 %	25 %	25 %	221634533
106	NC_011960	GCCT	2	8	40875	40882	0 %	25 %	25 %	50 %	221634534
107	NC_011960	GCGG	2	8	40972	40979	0 %	0 %	75 %	25 %	221634534
108	NC_011960	GGTT	2	8	41976	41983	0 %	50 %	50 %	0 %	221634536
109	NC_011960	GTGC	2	8	43167	43174	0 %	25 %	50 %	25 %	221634538
110	NC_011960	GAAG	2	8	43200	43207	50 %	0 %	50 %	0 %	221634538
111	NC_011960	CTTT	2	8	45355	45362	0 %	75 %	0 %	25 %	221634541
112	NC_011960	AGGT	2	8	45391	45398	25 %	25 %	50 %	0 %	221634541
113	NC_011960	GTCG	2	8	45692	45699	0 %	25 %	50 %	25 %	221634542
114	NC_011960	CCCG	2	8	45984	45991	0 %	0 %	25 %	75 %	221634543
115	NC_011960	GCGG	2	8	46143	46150	0 %	0 %	75 %	25 %	221634544
116	NC_011960	CGAG	2	8	46918	46925	25 %	0 %	50 %	25 %	221634545
117	NC_011960	GAGC	2	8	47389	47396	25 %	0 %	50 %	25 %	221634546
118	NC_011960	GCCC	2	8	47565	47572	0 %	0 %	25 %	75 %	221634546
119	NC_011960	TCGC	2	8	47759	47766	0 %	25 %	25 %	50 %	221634546
120	NC_011960	GCGG	2	8	47985	47992	0 %	0 %	75 %	25 %	221634546
121	NC_011960	GCCC	2	8	48609	48616	0 %	0 %	25 %	75 %	221634547
122	NC_011960	GCGG	2	8	48680	48687	0 %	0 %	75 %	25 %	221634547
123	NC_011960	GGCG	2	8	49146	49153	0 %	0 %	75 %	25 %	221634548
124	NC_011960	TCCC	2	8	49183	49190	0 %	25 %	0 %	75 %	221634548
125	NC_011960	CGAG	2	8	49409	49416	25 %	0 %	50 %	25 %	221634549
126	NC_011960	CCCG	2	8	49802	49809	0 %	0 %	25 %	75 %	221634549
127	NC_011960	AAGG	2	8	50048	50055	50 %	0 %	50 %	0 %	221634550
128	NC_011960	CATC	2	8	50218	50225	25 %	25 %	0 %	50 %	221634551
129	NC_011960	CGCC	2	8	50253	50260	0 %	0 %	25 %	75 %	221634551
130	NC_011960	AGCC	2	8	50309	50316	25 %	0 %	25 %	50 %	221634551
131	NC_011960	GGCG	2	8	50500	50507	0 %	0 %	75 %	25 %	221634551
132	NC_011960	CGGG	2	8	50538	50545	0 %	0 %	75 %	25 %	221634551
133	NC_011960	GATC	2	8	51397	51404	25 %	25 %	25 %	25 %	221634553
134	NC_011960	CCGA	2	8	51546	51553	25 %	0 %	25 %	50 %	221634553
135	NC_011960	CGGC	2	8	52162	52169	0 %	0 %	50 %	50 %	221634553
136	NC_011960	GCCC	2	8	52189	52196	0 %	0 %	25 %	75 %	221634553
137	NC_011960	GGGA	2	8	52299	52306	25 %	0 %	75 %	0 %	221634553
138	NC_011960	CGGG	2	8	53470	53477	0 %	0 %	75 %	25 %	221634555
139	NC_011960	GCCG	2	8	53560	53567	0 %	0 %	50 %	50 %	221634555
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141	NC_011960	TGCG	2	8	53916	53923	0 %	25 %	50 %	25 %	221634555
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280	NC_011960	GGTG	2	8	99259	99266	0 %	25 %	75 %	0 %	221634591
281	NC_011960	CCGC	2	8	101738	101745	0 %	0 %	25 %	75 %	221634593
282	NC_011960	GGCG	2	8	101892	101899	0 %	0 %	75 %	25 %	221634593
283	NC_011960	TCGG	2	8	103121	103128	0 %	25 %	50 %	25 %	221634594

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.