MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 725

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011959	CGCT	2	8	4198	4205	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011959	TGCC	2	8	4224	4231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011959	GTAC	2	8	4260	4267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011959	CGAC	2	8	7937	7944	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011959	GCTC	2	8	8048	8055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011959	GCTC	2	8	8113	8120	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011959	CGAG	2	8	12079	12086	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011959	CGCC	2	8	15853	15860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_011959	GGGC	2	8	15953	15960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011959	GACC	2	8	16173	16180	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011959	CTGC	2	8	16520	16527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011959	AGGA	2	8	19346	19353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011959	GCGA	2	8	20439	20446	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011959	GCTC	2	8	26585	26592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011959	GGCT	2	8	31192	31199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011959	GCCA	2	8	31979	31986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011959	TCGG	2	8	32593	32600	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011959	ACTG	2	8	32628	32635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011959	CGAG	2	8	32782	32789	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011959	GTTT	2	8	33591	33598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011959	TGGC	2	8	35502	35509	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011959	CGAC	2	8	35890	35897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011959	CGGT	2	8	36454	36461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011959	AGCG	2	8	36810	36817	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011959	CGGG	2	8	39340	39347	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011959	GACC	2	8	42350	42357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011959	AGTG	2	8	43691	43698	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011959	AGCG	2	8	50335	50342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_011959	TCCC	2	8	50365	50372	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_011959	ACCG	2	8	57188	57195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011959	CGCT	2	8	60671	60678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011959	TCCT	2	8	60940	60947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011959	CGAG	2	8	62570	62577	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011959	CTCG	2	8	79750	79757	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011959	TTCC	2	8	84164	84171	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011959	CGGC	2	8	84306	84313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011959	CTCG	2	8	84925	84932	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011959	TCAG	2	8	87677	87684	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011959	TCCC	2	8	90697	90704	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_011959	CGAC	2	8	91774	91781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011959	TGCG	2	8	92008	92015	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011959	CGAG	2	8	104523	104530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_011959	CGAT	2	8	107025	107032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011959	ATGC	2	8	109612	109619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011959	CTGA	2	8	109830	109837	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011959	GGTG	2	8	109961	109968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011959	ATCC	2	8	110201	110208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011959	GCTC	2	8	120346	120353	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011959	GCGA	2	8	121498	121505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011959	CCAG	2	8	125737	125744	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011959	CTCG	2	8	128224	128231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011959	CTGC	2	8	128233	128240	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011959	GATC	2	8	129399	129406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011959	ATCC	2	8	129426	129433	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011959	CGGT	2	8	129777	129784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011959	GCTC	2	8	130973	130980	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011959	CTCG	2	8	131520	131527	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011959	CTCC	2	8	136797	136804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_011959	GCAG	2	8	145935	145942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011959	GCTC	2	8	146085	146092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011959	TCGA	2	8	146638	146645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011959	GCCA	2	8	152927	152934	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011959	TGGT	2	8	153028	153035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011959	CCTG	2	8	167164	167171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011959	GAGC	2	8	191579	191586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011959	GGGC	2	8	200176	200183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011959	GAAC	2	8	200360	200367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011959	CGAT	2	8	200425	200432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011959	CCGC	2	8	200754	200761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011959	CGTT	2	8	212747	212754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011959	CGCT	3	12	225259	225270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011959	CAGT	2	8	225313	225320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011959	TCGG	2	8	227709	227716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011959	TCGC	2	8	229294	229301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011959	CGCT	2	8	234094	234101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011959	GTGA	2	8	239465	239472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011959	GATC	2	8	248567	248574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011959	TGGC	2	8	248630	248637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011959	CGTC	2	8	249835	249842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011959	GGAG	2	8	251580	251587	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011959	GCCT	2	8	255164	255171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011959	TTCG	2	8	259782	259789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011959	CTGA	2	8	260233	260240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011959	TGCT	2	8	261168	261175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011959	GGCA	2	8	261494	261501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011959	CCTC	2	8	262229	262236	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_011959	CCGA	2	8	262436	262443	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011959	GAAG	2	8	262802	262809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011959	GTTG	2	8	262880	262887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011959	TCGA	2	8	278287	278294	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011959	CGGT	2	8	279012	279019	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011959	CGCT	2	8	284528	284535	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011959	CTCC	3	12	285825	285836	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
94	NC_011959	GAGG	2	8	289250	289257	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011959	GCAG	2	8	295353	295360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011959	TTCG	2	8	295619	295626	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011959	CGGT	2	8	295784	295791	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011959	CGAT	2	8	295807	295814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011959	CTTG	2	8	295942	295949	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011959	CGCT	2	8	298480	298487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011959	TCGC	2	8	302982	302989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011959	AGCG	2	8	304765	304772	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011959	GCGG	2	8	306662	306669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011959	AGGG	2	8	309207	309214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011959	GGAG	2	8	312092	312099	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011959	AGCG	2	8	313090	313097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011959	GCTC	2	8	313115	313122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011959	CCCT	2	8	313770	313777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_011959	CGAC	2	8	313787	313794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011959	GCGT	2	8	315677	315684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011959	AGCG	2	8	325234	325241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011959	CGGA	2	8	325435	325442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011959	GCAG	2	8	325447	325454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011959	GGTT	2	8	325668	325675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011959	GCTG	2	8	325909	325916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011959	GCGG	2	8	326065	326072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011959	CTCC	2	8	327592	327599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_011959	ACCT	2	8	327622	327629	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011959	AGTC	2	8	329544	329551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011959	ACAG	2	8	330173	330180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011959	AGGG	3	12	331984	331995	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011959	GTAC	2	8	332053	332060	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011959	GCGA	2	8	332258	332265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011959	GGGC	2	8	332274	332281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011959	TCCC	2	8	332410	332417	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_011959	CGAG	2	8	332675	332682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011959	TCGA	2	8	337769	337776	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011959	AGCC	2	8	341892	341899	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011959	GAAC	2	8	342004	342011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011959	GGGA	2	8	344655	344662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011959	CCTC	2	8	349058	349065	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_011959	CGTG	2	8	351623	351630	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011959	GATC	2	8	351780	351787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011959	TCGA	2	8	355679	355686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011959	GGAG	2	8	355746	355753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011959	ACGG	2	8	357136	357143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011959	GTGG	2	8	361670	361677	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011959	TGCC	2	8	377015	377022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_011959	TGGC	2	8	378578	378585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011959	CCAG	2	8	378608	378615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011959	ACTC	2	8	384906	384913	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011959	TCCC	2	8	387197	387204	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_011959	CGAA	2	8	392809	392816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011959	CTGT	2	8	392867	392874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011959	TCGC	2	8	406157	406164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_011959	CGTT	2	8	410823	410830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011959	GAGC	2	8	410834	410841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011959	CTCC	2	8	431855	431862	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_011959	GGAA	2	8	435368	435375	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011959	CGCT	2	8	435661	435668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_011959	GTGG	2	8	437155	437162	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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