MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Thermomicrobium roseum DSM 5159 chromosome

Total Repeats: 387

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011959	C	6	6	3131	3136	0 %	0 %	0 %	100 %	221632040
2	NC_011959	C	6	6	7437	7442	0 %	0 %	0 %	100 %	221632042
3	NC_011959	G	6	6	11221	11226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011959	G	6	6	22797	22802	0 %	0 %	100 %	0 %	221632056
5	NC_011959	T	6	6	24091	24096	0 %	100 %	0 %	0 %	221632058
6	NC_011959	G	6	6	28600	28605	0 %	0 %	100 %	0 %	221632063
7	NC_011959	A	6	6	31119	31124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011959	G	6	6	31128	31133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011959	T	6	6	35283	35288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011959	G	6	6	37329	37334	0 %	0 %	100 %	0 %	221632066
11	NC_011959	C	6	6	51195	51200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_011959	G	6	6	57339	57344	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011959	G	6	6	57993	57998	0 %	0 %	100 %	0 %	221632084
14	NC_011959	G	6	6	64764	64769	0 %	0 %	100 %	0 %	221632091
15	NC_011959	C	6	6	67133	67138	0 %	0 %	0 %	100 %	221632093
16	NC_011959	G	6	6	69162	69167	0 %	0 %	100 %	0 %	221632095
17	NC_011959	G	6	6	69603	69608	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011959	G	6	6	73869	73874	0 %	0 %	100 %	0 %	221632099
19	NC_011959	C	7	7	74396	74402	0 %	0 %	0 %	100 %	221632099
20	NC_011959	G	6	6	75848	75853	0 %	0 %	100 %	0 %	221632101
21	NC_011959	T	6	6	80666	80671	0 %	100 %	0 %	0 %	221632107
22	NC_011959	C	6	6	93213	93218	0 %	0 %	0 %	100 %	221632117
23	NC_011959	G	6	6	99018	99023	0 %	0 %	100 %	0 %	221632122
24	NC_011959	T	7	7	105260	105266	0 %	100 %	0 %	0 %	221632130
25	NC_011959	T	6	6	106169	106174	0 %	100 %	0 %	0 %	221632132
26	NC_011959	G	6	6	115718	115723	0 %	0 %	100 %	0 %	221632142
27	NC_011959	G	6	6	117065	117070	0 %	0 %	100 %	0 %	221632144
28	NC_011959	C	6	6	129766	129771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_011959	C	6	6	134051	134056	0 %	0 %	0 %	100 %	221632161
30	NC_011959	T	6	6	137219	137224	0 %	100 %	0 %	0 %	221632165
31	NC_011959	C	6	6	144062	144067	0 %	0 %	0 %	100 %	221632170
32	NC_011959	A	6	6	144136	144141	100 %	0 %	0 %	0 %	221632170
33	NC_011959	G	6	6	146097	146102	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011959	G	6	6	146504	146509	0 %	0 %	100 %	0 %	221632172
35	NC_011959	G	6	6	149392	149397	0 %	0 %	100 %	0 %	221632175
36	NC_011959	C	7	7	154005	154011	0 %	0 %	0 %	100 %	221632176
37	NC_011959	G	6	6	159175	159180	0 %	0 %	100 %	0 %	221632183
38	NC_011959	T	6	6	170749	170754	0 %	100 %	0 %	0 %	221632199
39	NC_011959	G	6	6	180730	180735	0 %	0 %	100 %	0 %	221632207
40	NC_011959	C	6	6	200230	200235	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_011959	C	6	6	216060	216065	0 %	0 %	0 %	100 %	221632243
42	NC_011959	C	6	6	219509	219514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_011959	C	6	6	224631	224636	0 %	0 %	0 %	100 %	221632248
44	NC_011959	A	6	6	225222	225227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011959	G	6	6	227867	227872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011959	G	6	6	228811	228816	0 %	0 %	100 %	0 %	221632252
47	NC_011959	G	7	7	232434	232440	0 %	0 %	100 %	0 %	221632255
48	NC_011959	C	6	6	242333	242338	0 %	0 %	0 %	100 %	221632266
49	NC_011959	C	6	6	249687	249692	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
50	NC_011959	T	6	6	250924	250929	0 %	100 %	0 %	0 %	221632275
51	NC_011959	T	6	6	264709	264714	0 %	100 %	0 %	0 %	221632293
52	NC_011959	C	6	6	283514	283519	0 %	0 %	0 %	100 %	221632307
53	NC_011959	A	6	6	284170	284175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011959	G	6	6	285508	285513	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011959	G	6	6	318244	318249	0 %	0 %	100 %	0 %	221632342
56	NC_011959	C	6	6	320422	320427	0 %	0 %	0 %	100 %	221632344
57	NC_011959	G	7	7	325122	325128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011959	G	6	6	327341	327346	0 %	0 %	100 %	0 %	221632351
59	NC_011959	G	8	8	329054	329061	0 %	0 %	100 %	0 %	221632353
60	NC_011959	G	6	6	330815	330820	0 %	0 %	100 %	0 %	221632357
61	NC_011959	G	6	6	331820	331825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011959	C	7	7	334535	334541	0 %	0 %	0 %	100 %	221632360
63	NC_011959	G	7	7	342244	342250	0 %	0 %	100 %	0 %	221632366
64	NC_011959	C	6	6	344857	344862	0 %	0 %	0 %	100 %	221632369
65	NC_011959	G	6	6	346901	346906	0 %	0 %	100 %	0 %	221632371
66	NC_011959	T	6	6	349626	349631	0 %	100 %	0 %	0 %	221632374
67	NC_011959	G	6	6	351328	351333	0 %	0 %	100 %	0 %	221632376
68	NC_011959	G	6	6	355282	355287	0 %	0 %	100 %	0 %	221632381
69	NC_011959	C	6	6	362726	362731	0 %	0 %	0 %	100 %	221632389
70	NC_011959	G	6	6	365394	365399	0 %	0 %	100 %	0 %	221632391
71	NC_011959	C	6	6	371581	371586	0 %	0 %	0 %	100 %	221632396
72	NC_011959	G	6	6	400604	400609	0 %	0 %	100 %	0 %	221632428
73	NC_011959	G	6	6	407616	407621	0 %	0 %	100 %	0 %	221632435
74	NC_011959	T	6	6	416492	416497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011959	G	6	6	421862	421867	0 %	0 %	100 %	0 %	221632450
76	NC_011959	G	6	6	422294	422299	0 %	0 %	100 %	0 %	221632450
77	NC_011959	G	6	6	438036	438041	0 %	0 %	100 %	0 %	221632467
78	NC_011959	G	6	6	438403	438408	0 %	0 %	100 %	0 %	221632467
79	NC_011959	A	8	8	439140	439147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011959	G	6	6	458501	458506	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011959	C	6	6	458512	458517	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_011959	A	6	6	459581	459586	100 %	0 %	0 %	0 %	221632489
83	NC_011959	C	6	6	467321	467326	0 %	0 %	0 %	100 %	221632495
84	NC_011959	G	7	7	470092	470098	0 %	0 %	100 %	0 %	221632499
85	NC_011959	G	6	6	471790	471795	0 %	0 %	100 %	0 %	221632500
86	NC_011959	A	6	6	473386	473391	100 %	0 %	0 %	0 %	221632501
87	NC_011959	G	6	6	487968	487973	0 %	0 %	100 %	0 %	221632518
88	NC_011959	C	6	6	494745	494750	0 %	0 %	0 %	100 %	221632523
89	NC_011959	G	6	6	495284	495289	0 %	0 %	100 %	0 %	221632524
90	NC_011959	C	6	6	495594	495599	0 %	0 %	0 %	100 %	221632524
91	NC_011959	C	6	6	497492	497497	0 %	0 %	0 %	100 %	221632526
92	NC_011959	G	6	6	499519	499524	0 %	0 %	100 %	0 %	221632527
93	NC_011959	G	6	6	512985	512990	0 %	0 %	100 %	0 %	221632538
94	NC_011959	G	6	6	514335	514340	0 %	0 %	100 %	0 %	221632541
95	NC_011959	T	6	6	521455	521460	0 %	100 %	0 %	0 %	221632549
96	NC_011959	G	6	6	525658	525663	0 %	0 %	100 %	0 %	221632552
97	NC_011959	G	6	6	527162	527167	0 %	0 %	100 %	0 %	221632553
98	NC_011959	G	6	6	535351	535356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011959	G	6	6	544154	544159	0 %	0 %	100 %	0 %	221632575
100	NC_011959	G	6	6	546428	546433	0 %	0 %	100 %	0 %	221632578
101	NC_011959	C	6	6	546747	546752	0 %	0 %	0 %	100 %	221632578
102	NC_011959	C	6	6	547330	547335	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_011959	G	6	6	560562	560567	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011959	T	6	6	562026	562031	0 %	100 %	0 %	0 %	221632589
105	NC_011959	G	6	6	574857	574862	0 %	0 %	100 %	0 %	221632601
106	NC_011959	G	6	6	585076	585081	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011959	T	7	7	585521	585527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011959	A	9	9	586787	586795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011959	G	6	6	596752	596757	0 %	0 %	100 %	0 %	221632625
110	NC_011959	G	6	6	598299	598304	0 %	0 %	100 %	0 %	221632626
111	NC_011959	G	6	6	613652	613657	0 %	0 %	100 %	0 %	221632640
112	NC_011959	C	6	6	617548	617553	0 %	0 %	0 %	100 %	221632644
113	NC_011959	G	6	6	620851	620856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011959	G	6	6	623966	623971	0 %	0 %	100 %	0 %	221632652
115	NC_011959	G	7	7	628893	628899	0 %	0 %	100 %	0 %	221632656
116	NC_011959	A	6	6	631732	631737	100 %	0 %	0 %	0 %	221632658
117	NC_011959	T	6	6	640663	640668	0 %	100 %	0 %	0 %	221632664
118	NC_011959	A	6	6	652743	652748	100 %	0 %	0 %	0 %	221632674
119	NC_011959	G	6	6	670321	670326	0 %	0 %	100 %	0 %	221632689
120	NC_011959	G	6	6	670809	670814	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011959	C	6	6	670883	670888	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
122	NC_011959	G	7	7	671943	671949	0 %	0 %	100 %	0 %	221632690
123	NC_011959	G	6	6	676816	676821	0 %	0 %	100 %	0 %	221632699
124	NC_011959	G	6	6	681595	681600	0 %	0 %	100 %	0 %	221632703
125	NC_011959	T	6	6	684931	684936	0 %	100 %	0 %	0 %	221632708
126	NC_011959	G	6	6	699528	699533	0 %	0 %	100 %	0 %	221632719
127	NC_011959	A	6	6	702290	702295	100 %	0 %	0 %	0 %	221632721
128	NC_011959	C	6	6	703700	703705	0 %	0 %	0 %	100 %	221632723
129	NC_011959	T	6	6	705606	705611	0 %	100 %	0 %	0 %	221632724
130	NC_011959	T	6	6	717717	717722	0 %	100 %	0 %	0 %	221632736
131	NC_011959	G	6	6	720145	720150	0 %	0 %	100 %	0 %	221632736
132	NC_011959	A	7	7	720903	720909	100 %	0 %	0 %	0 %	221632738
133	NC_011959	G	6	6	721827	721832	0 %	0 %	100 %	0 %	221632739
134	NC_011959	C	6	6	731007	731012	0 %	0 %	0 %	100 %	221632750
135	NC_011959	G	6	6	740546	740551	0 %	0 %	100 %	0 %	221632759
136	NC_011959	G	6	6	747706	747711	0 %	0 %	100 %	0 %	221632765
137	NC_011959	G	6	6	749420	749425	0 %	0 %	100 %	0 %	221632767
138	NC_011959	C	6	6	764188	764193	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_011959	G	6	6	764873	764878	0 %	0 %	100 %	0 %	221632784
140	NC_011959	T	6	6	769608	769613	0 %	100 %	0 %	0 %	221632789
141	NC_011959	T	6	6	774872	774877	0 %	100 %	0 %	0 %	221632798
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.