MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhodobacter sphaeroides KD131 chromosome 2

Total Repeats: 1240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011958	CCGGA	2	10	2242	2251	20 %	0 %	40 %	40 %	221368941
2	NC_011958	ACGGC	2	10	2561	2570	20 %	0 %	40 %	40 %	221368941
3	NC_011958	GCGCC	2	10	3360	3369	0 %	0 %	40 %	60 %	221368942
4	NC_011958	GCCGC	2	10	3943	3952	0 %	0 %	40 %	60 %	221368942
5	NC_011958	CGGGG	2	10	4263	4272	0 %	0 %	80 %	20 %	221368942
6	NC_011958	TTCGA	2	10	5863	5872	20 %	40 %	20 %	20 %	221368943
7	NC_011958	TCTGG	2	10	10801	10810	0 %	40 %	40 %	20 %	221368948
8	NC_011958	CGCGG	2	10	13476	13485	0 %	0 %	60 %	40 %	221368952
9	NC_011958	GGGCG	2	10	16950	16959	0 %	0 %	80 %	20 %	221368955
10	NC_011958	GGCTC	2	10	18068	18077	0 %	20 %	40 %	40 %	221368957
11	NC_011958	GGCCG	2	10	18117	18126	0 %	0 %	60 %	40 %	221368957
12	NC_011958	GCGCC	2	10	18428	18437	0 %	0 %	40 %	60 %	221368957
13	NC_011958	CGAAG	2	10	21554	21563	40 %	0 %	40 %	20 %	221368961
14	NC_011958	CCGGC	2	10	22097	22106	0 %	0 %	40 %	60 %	221368961
15	NC_011958	CGCGG	2	10	22436	22445	0 %	0 %	60 %	40 %	221368961
16	NC_011958	GGCCC	2	10	22516	22525	0 %	0 %	40 %	60 %	221368961
17	NC_011958	CGGCG	2	10	22611	22620	0 %	0 %	60 %	40 %	221368961
18	NC_011958	CCCGC	2	10	24916	24925	0 %	0 %	20 %	80 %	221368964
19	NC_011958	AGCCC	2	10	25294	25303	20 %	0 %	20 %	60 %	221368964
20	NC_011958	CCCGC	2	10	25387	25396	0 %	0 %	20 %	80 %	221368964
21	NC_011958	CGAGC	2	10	25526	25535	20 %	0 %	40 %	40 %	221368964
22	NC_011958	GCCGG	2	10	27048	27057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011958	TCCTC	2	10	27075	27084	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_011958	CGCCT	2	10	27667	27676	0 %	20 %	20 %	60 %	221368967
25	NC_011958	CTGCC	2	10	29531	29540	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_011958	CGGGC	2	10	30166	30175	0 %	0 %	60 %	40 %	221368970
27	NC_011958	TGTGG	2	10	30416	30425	0 %	40 %	60 %	0 %	221368970
28	NC_011958	CTCGC	2	10	34289	34298	0 %	20 %	20 %	60 %	221368976
29	NC_011958	CGCAG	2	10	40018	40027	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_011958	GGCGC	2	10	40528	40537	0 %	0 %	60 %	40 %	221368981
31	NC_011958	TCGGC	2	10	43838	43847	0 %	20 %	40 %	40 %	221368986
32	NC_011958	ACGGA	2	10	44953	44962	40 %	0 %	40 %	20 %	221368987
33	NC_011958	GGTCG	2	10	46983	46992	0 %	20 %	60 %	20 %	221368988
34	NC_011958	GGGGC	2	10	47452	47461	0 %	0 %	80 %	20 %	221368989
35	NC_011958	TCGGC	2	10	47926	47935	0 %	20 %	40 %	40 %	221368989
36	NC_011958	GGGGC	2	10	49708	49717	0 %	0 %	80 %	20 %	221368992
37	NC_011958	GGACG	2	10	50400	50409	20 %	0 %	60 %	20 %	221368993
38	NC_011958	GCCGC	2	10	53457	53466	0 %	0 %	40 %	60 %	221368996
39	NC_011958	CGGGC	2	10	53975	53984	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_011958	CCCTG	2	10	54166	54175	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_011958	GCATC	2	10	54988	54997	20 %	20 %	20 %	40 %	221368998
42	NC_011958	CCGCG	2	10	55045	55054	0 %	0 %	40 %	60 %	221368998
43	NC_011958	CCGAG	2	10	55857	55866	20 %	0 %	40 %	40 %	221369000
44	NC_011958	CCCGA	2	10	56426	56435	20 %	0 %	20 %	60 %	221369002
45	NC_011958	GGCCG	2	10	56505	56514	0 %	0 %	60 %	40 %	221369002
46	NC_011958	GGGCG	2	10	56589	56598	0 %	0 %	80 %	20 %	221369002
47	NC_011958	CCGGG	2	10	57900	57909	0 %	0 %	60 %	40 %	221369002
48	NC_011958	TCGTG	2	10	59547	59556	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011958	GATCA	2	10	60804	60813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011958	CTCAT	2	10	63351	63360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011958	ATCCC	2	10	63859	63868	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_011958	ACCGC	2	10	66280	66289	20 %	0 %	20 %	60 %	221369005
53	NC_011958	CAGCG	2	10	66915	66924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011958	TGGCG	2	10	67547	67556	0 %	20 %	60 %	20 %	221369006
55	NC_011958	CCGCC	2	10	70054	70063	0 %	0 %	20 %	80 %	221369007
56	NC_011958	CACCG	2	10	70288	70297	20 %	0 %	20 %	60 %	221369007
57	NC_011958	CGGTC	2	10	70372	70381	0 %	20 %	40 %	40 %	221369007
58	NC_011958	GCATC	2	10	70882	70891	20 %	20 %	20 %	40 %	221369008
59	NC_011958	GGGCG	2	10	72360	72369	0 %	0 %	80 %	20 %	221369009
60	NC_011958	AACCG	2	10	74827	74836	40 %	0 %	20 %	40 %	221369013
61	NC_011958	CGAGG	2	10	76441	76450	20 %	0 %	60 %	20 %	221369017
62	NC_011958	GCGCG	2	10	76527	76536	0 %	0 %	60 %	40 %	221369017
63	NC_011958	CGTCC	2	10	80928	80937	0 %	20 %	20 %	60 %	221369021
64	NC_011958	GTCAT	2	10	81223	81232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011958	TCCGA	2	10	82304	82313	20 %	20 %	20 %	40 %	221369023
66	NC_011958	GTGAT	2	10	83585	83594	20 %	40 %	40 %	0 %	221369023
67	NC_011958	AGCCC	2	10	84642	84651	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_011958	CAATA	2	10	85470	85479	60 %	20 %	0 %	20 %	221369024
69	NC_011958	CCGTC	2	10	86310	86319	0 %	20 %	20 %	60 %	221369025
70	NC_011958	CGCTG	2	10	86699	86708	0 %	20 %	40 %	40 %	221369025
71	NC_011958	GAGGC	2	10	87936	87945	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011958	CAGCG	2	10	90076	90085	20 %	0 %	40 %	40 %	221369027
73	NC_011958	TCAGG	2	10	91256	91265	20 %	20 %	40 %	20 %	221369028
74	NC_011958	GCGCG	2	10	92778	92787	0 %	0 %	60 %	40 %	221369030
75	NC_011958	CGCGG	2	10	92969	92978	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011958	GATCG	2	10	94271	94280	20 %	20 %	40 %	20 %	221369032
77	NC_011958	CAGCT	2	10	94554	94563	20 %	20 %	20 %	40 %	221369032
78	NC_011958	GCGCC	2	10	95245	95254	0 %	0 %	40 %	60 %	221369032
79	NC_011958	TAGCG	2	10	97530	97539	20 %	20 %	40 %	20 %	221369035
80	NC_011958	GCCGC	2	10	98656	98665	0 %	0 %	40 %	60 %	221369037
81	NC_011958	CGGCG	2	10	99117	99126	0 %	0 %	60 %	40 %	221369037
82	NC_011958	GCCGT	2	10	100402	100411	0 %	20 %	40 %	40 %	221369038
83	NC_011958	GCGCC	2	10	100418	100427	0 %	0 %	40 %	60 %	221369038
84	NC_011958	CTGGC	2	10	100991	101000	0 %	20 %	40 %	40 %	221369039
85	NC_011958	GGGAG	2	10	103326	103335	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011958	GGTCA	2	10	104356	104365	20 %	20 %	40 %	20 %	221369043
87	NC_011958	CGCGG	2	10	105411	105420	0 %	0 %	60 %	40 %	221369044
88	NC_011958	CTGGG	2	10	106125	106134	0 %	20 %	60 %	20 %	221369045
89	NC_011958	GCTGG	2	10	106283	106292	0 %	20 %	60 %	20 %	221369045
90	NC_011958	GCCCG	2	10	106590	106599	0 %	0 %	40 %	60 %	221369045
91	NC_011958	GATCA	2	10	108213	108222	40 %	20 %	20 %	20 %	221369047
92	NC_011958	CGCGC	2	10	108506	108515	0 %	0 %	40 %	60 %	221369047
93	NC_011958	GCCGC	2	10	108577	108586	0 %	0 %	40 %	60 %	221369047
94	NC_011958	GGCGC	2	10	109117	109126	0 %	0 %	60 %	40 %	221369048
95	NC_011958	GCCCG	2	10	109551	109560	0 %	0 %	40 %	60 %	221369048
96	NC_011958	CTTCG	2	10	111197	111206	0 %	40 %	20 %	40 %	221369049
97	NC_011958	CCGGC	2	10	111214	111223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_011958	TCCAT	2	10	111450	111459	20 %	40 %	0 %	40 %	221369050
99	NC_011958	CCTCG	2	10	112339	112348	0 %	20 %	20 %	60 %	221369050
100	NC_011958	GCCCG	2	10	113496	113505	0 %	0 %	40 %	60 %	221369051
101	NC_011958	TGGTC	2	10	114405	114414	0 %	40 %	40 %	20 %	221369051
102	NC_011958	GGCGA	2	10	115290	115299	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011958	CCCGG	2	10	115360	115369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
104	NC_011958	GCCGC	2	10	118160	118169	0 %	0 %	40 %	60 %	221369052
105	NC_011958	GTCAG	2	10	121076	121085	20 %	20 %	40 %	20 %	221369056
106	NC_011958	TCGAT	2	10	121327	121336	20 %	40 %	20 %	20 %	221369056
107	NC_011958	GCCGC	2	10	123924	123933	0 %	0 %	40 %	60 %	221369057
108	NC_011958	CGGGC	2	10	126193	126202	0 %	0 %	60 %	40 %	221369059
109	NC_011958	TCCGG	2	10	128170	128179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_011958	CGCGC	2	10	128382	128391	0 %	0 %	40 %	60 %	221369060
111	NC_011958	GCAGG	2	10	128603	128612	20 %	0 %	60 %	20 %	221369061
112	NC_011958	CGGTG	2	10	129121	129130	0 %	20 %	60 %	20 %	221369061
113	NC_011958	CCGGC	2	10	129496	129505	0 %	0 %	40 %	60 %	221369062
114	NC_011958	GGCCG	2	10	129666	129675	0 %	0 %	60 %	40 %	221369062
115	NC_011958	GCGCC	2	10	130966	130975	0 %	0 %	40 %	60 %	221369063
116	NC_011958	CCGAT	2	10	131196	131205	20 %	20 %	20 %	40 %	221369063
117	NC_011958	GCCGT	2	10	131577	131586	0 %	20 %	40 %	40 %	221369064
118	NC_011958	CCCGG	2	10	131619	131628	0 %	0 %	40 %	60 %	221369064
119	NC_011958	CCGGC	2	10	132493	132502	0 %	0 %	40 %	60 %	221369066
120	NC_011958	AGCCG	2	10	133488	133497	20 %	0 %	40 %	40 %	221369066
121	NC_011958	AGCGG	2	10	134635	134644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011958	TGTCC	2	10	135187	135196	0 %	40 %	20 %	40 %	221369068
123	NC_011958	TCGGG	2	10	136947	136956	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011958	GGCAA	2	10	137929	137938	40 %	0 %	40 %	20 %	221369070
125	NC_011958	TCCCG	2	10	138760	138769	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_011958	CGCCA	2	10	139232	139241	20 %	0 %	20 %	60 %	221369072
127	NC_011958	GCGAC	2	10	139703	139712	20 %	0 %	40 %	40 %	221369073
128	NC_011958	ACGGC	2	10	140600	140609	20 %	0 %	40 %	40 %	221369075
129	NC_011958	CCGCA	2	10	141450	141459	20 %	0 %	20 %	60 %	221369075
130	NC_011958	GTCCC	2	10	142976	142985	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_011958	CCGGC	2	10	144037	144046	0 %	0 %	40 %	60 %	221369077
132	NC_011958	GCCAG	2	10	145219	145228	20 %	0 %	40 %	40 %	221369078
133	NC_011958	GCGCC	2	10	147846	147855	0 %	0 %	40 %	60 %	221369082
134	NC_011958	GGCGG	2	10	148526	148535	0 %	0 %	80 %	20 %	221369082
135	NC_011958	GGGCG	2	10	148769	148778	0 %	0 %	80 %	20 %	221369082
136	NC_011958	GCGAG	2	10	149664	149673	20 %	0 %	60 %	20 %	221369083
137	NC_011958	CGCGG	2	10	150757	150766	0 %	0 %	60 %	40 %	221369084
138	NC_011958	GGAGC	2	10	155141	155150	20 %	0 %	60 %	20 %	221369088
139	NC_011958	CCGCT	2	10	155307	155316	0 %	20 %	20 %	60 %	221369088
140	NC_011958	TGCGC	2	10	156055	156064	0 %	20 %	40 %	40 %	221369089
141	NC_011958	ACCCG	2	10	156162	156171	20 %	0 %	20 %	60 %	221369089
142	NC_011958	GGCGT	2	10	156920	156929	0 %	20 %	60 %	20 %	221369089
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145	NC_011958	TGCGG	2	10	159054	159063	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011958	CGCGG	2	10	159821	159830	0 %	0 %	60 %	40 %	221369092
147	NC_011958	GGCGT	2	10	161353	161362	0 %	20 %	60 %	20 %	221369093
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150	NC_011958	CGCGG	2	10	165516	165525	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_011958	GCCCG	2	10	166302	166311	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_011958	CCCGC	2	10	166609	166618	0 %	0 %	20 %	80 %	221369099
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154	NC_011958	GCTCG	2	10	169667	169676	0 %	20 %	40 %	40 %	221369100
155	NC_011958	CCTCG	2	10	170775	170784	0 %	20 %	20 %	60 %	221369101
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159	NC_011958	GCCGT	2	10	175324	175333	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
160	NC_011958	AAAGG	2	10	175404	175413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_011958	GCGCA	2	10	177892	177901	20 %	0 %	40 %	40 %	221369110
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171	NC_011958	GCACC	2	10	186302	186311	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
172	NC_011958	TGCGC	2	10	187805	187814	0 %	20 %	40 %	40 %	221369120
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180	NC_011958	CGATG	2	10	196445	196454	20 %	20 %	40 %	20 %	221369126
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191	NC_011958	GTGCG	2	10	203027	203036	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
192	NC_011958	CATAT	2	10	203320	203329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_011958	CGAGC	2	10	207954	207963	20 %	0 %	40 %	40 %	221369138
197	NC_011958	GCCGC	2	10	209923	209932	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
198	NC_011958	ACCGA	2	10	209970	209979	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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203	NC_011958	CAGCG	2	10	214445	214454	20 %	0 %	40 %	40 %	221369145
204	NC_011958	GCGGG	2	10	214871	214880	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
205	NC_011958	CGCCC	2	10	214895	214904	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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220	NC_011958	CCGCG	2	10	236526	236535	0 %	0 %	40 %	60 %	221369168
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224	NC_011958	GCGTC	2	10	242210	242219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
225	NC_011958	GCCCG	2	10	242303	242312	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
226	NC_011958	GGCGC	2	10	242327	242336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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242	NC_011958	CGGGC	2	10	257054	257063	0 %	0 %	60 %	40 %	221369187
243	NC_011958	ACCGC	2	10	257113	257122	20 %	0 %	20 %	60 %	221369187
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249	NC_011958	GAAGG	2	10	263354	263363	40 %	0 %	60 %	0 %	221369194
250	NC_011958	TCGCC	2	10	264026	264035	0 %	20 %	20 %	60 %	221369195
251	NC_011958	GATGG	2	10	264129	264138	20 %	20 %	60 %	0 %	221369195
252	NC_011958	CTGAG	2	10	264484	264493	20 %	20 %	40 %	20 %	221369195
253	NC_011958	TCATG	2	10	264851	264860	20 %	40 %	20 %	20 %	221369195
254	NC_011958	GTGCC	2	10	265275	265284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
255	NC_011958	GTCGC	2	10	265671	265680	0 %	20 %	40 %	40 %	221369196
256	NC_011958	GCGCC	2	10	267295	267304	0 %	0 %	40 %	60 %	221369197
257	NC_011958	CCCAG	2	10	267457	267466	20 %	0 %	20 %	60 %	221369197
258	NC_011958	GCCTC	2	10	268500	268509	0 %	20 %	20 %	60 %	221369198
259	NC_011958	GCGAT	2	10	270225	270234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_011958	CGGGG	2	10	270510	270519	0 %	0 %	80 %	20 %	221369200
261	NC_011958	GCGCC	2	10	270989	270998	0 %	0 %	40 %	60 %	221369200
262	NC_011958	AGGCG	2	10	272338	272347	20 %	0 %	60 %	20 %	221369203
263	NC_011958	CCGGC	2	10	273965	273974	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
264	NC_011958	GGGAC	2	10	274209	274218	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
265	NC_011958	CTCCC	2	10	274333	274342	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
266	NC_011958	TCGGC	2	10	274793	274802	0 %	20 %	40 %	40 %	221369205
267	NC_011958	CGGGC	2	10	276458	276467	0 %	0 %	60 %	40 %	221369207
268	NC_011958	GGGGC	2	10	276775	276784	0 %	0 %	80 %	20 %	221369207
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393	NC_011958	CCCCT	2	10	412466	412475	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
394	NC_011958	GGCTC	2	10	413112	413121	0 %	20 %	40 %	40 %	221369331
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398	NC_011958	CGGCG	2	10	416620	416629	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
399	NC_011958	CTCCA	2	10	417732	417741	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
400	NC_011958	GCCCG	2	10	418297	418306	0 %	0 %	40 %	60 %	221369337
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