MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	GGGCAT	2	12	14961	14972	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011901	CTGGTG	2	12	107945	107956	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011901	CTGGAC	2	12	108830	108841	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011901	TGGCCC	2	12	109645	109656	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011901	ACCTAG	2	12	135886	135897	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011901	CCAGGC	2	12	150560	150571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011901	GAAGTT	2	12	204798	204809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011901	TAGGCC	2	12	228476	228487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011901	AACGGG	2	12	265339	265350	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011901	GCGCAC	2	12	276395	276406	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011901	TGCGCC	2	12	338191	338202	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011901	GCCTGC	2	12	345898	345909	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011901	GCGCGA	2	12	350716	350727	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011901	GACATT	2	12	355033	355044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011901	CAGGGC	2	12	357265	357276	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011901	GACTTC	2	12	380653	380664	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011901	GGGAGA	2	12	421263	421274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011901	CTTTGA	4	24	421973	421996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011901	TCCCTG	2	12	441595	441606	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011901	GCTCAG	2	12	538015	538026	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011901	AACCAT	2	12	593757	593768	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011901	TCCTTG	2	12	646572	646583	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011901	GCTTTG	2	12	661508	661519	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011901	TTGAGC	2	12	673216	673227	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011901	GAGGGA	2	12	720371	720382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011901	CCGGGG	2	12	720986	720997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011901	GAGGGG	2	12	744823	744834	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011901	AGTTGG	2	12	808251	808262	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011901	CCGGCG	2	12	908773	908784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011901	CGGGCT	2	12	911151	911162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011901	GACGGT	2	12	922394	922405	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011901	GACTCA	2	12	935712	935723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011901	CCAGGG	2	12	936893	936904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011901	CGAGGA	2	12	978632	978643	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011901	CGCAAG	2	12	978753	978764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011901	AGCCCG	2	12	978865	978876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011901	CGCCGA	2	12	986882	986893	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011901	GCAAGC	2	12	986902	986913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011901	CCTGTC	2	12	1017190	1017201	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011901	CCTGTC	2	12	1018593	1018604	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011901	GAGGGA	2	12	1045979	1045990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011901	ATTCAA	2	12	1052366	1052377	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011901	TTTGAT	2	12	1059823	1059834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011901	CGGATT	2	12	1081772	1081783	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011901	AAGAAA	2	12	1120687	1120698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011901	CCCCGG	2	12	1194281	1194292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011901	GCAGGC	2	12	1241414	1241425	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011901	GGTGCT	2	12	1351075	1351086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011901	TCAGCA	2	12	1412484	1412495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011901	AACCTG	2	12	1412872	1412883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011901	GGGTCG	2	12	1452999	1453010	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011901	CCTGAG	2	12	1464503	1464514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011901	CAAGTT	2	12	1555921	1555932	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011901	GATGGT	2	12	1556212	1556223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011901	GCGGGC	2	12	1596251	1596262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011901	CTCGGG	2	12	1598878	1598889	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011901	ACGGGA	2	12	1636072	1636083	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011901	TGGATT	2	12	1664834	1664845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011901	ACCGCC	2	12	1740939	1740950	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_011901	CTGCGC	2	12	1780724	1780735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011901	CATCCG	2	12	1906380	1906391	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011901	CCCCAT	2	12	1927453	1927464	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011901	CTGACC	2	12	1929209	1929220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011901	GATTCA	2	12	1984642	1984653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_011901	GGCAGG	2	12	1995536	1995547	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_011901	GCCCCG	2	12	1997679	1997690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011901	GGCTTG	2	12	2031319	2031330	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011901	GCCTCG	2	12	2067897	2067908	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011901	TCGCCT	2	12	2106447	2106458	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011901	GAGGGA	2	12	2123758	2123769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011901	CCCCAG	2	12	2140142	2140153	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011901	TCAAAG	2	12	2140926	2140937	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011901	CCAAAC	2	12	2141636	2141647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011901	CAGGGA	2	12	2171107	2171118	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011901	TCCAGA	2	12	2220538	2220549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011901	CCCTTG	2	12	2301764	2301775	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011901	TTGAAT	2	12	2371318	2371329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011901	GAGGGA	2	12	2412261	2412272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011901	CTTTGA	2	12	2425557	2425568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011901	CCGGCA	2	12	2458263	2458274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011901	GCGGCC	2	12	2468720	2468731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011901	TCTCCC	2	12	2471255	2471266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011901	AAAATC	2	12	2516158	2516169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011901	AGGCAC	2	12	2533471	2533482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011901	TGTCCC	2	12	2545487	2545498	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011901	ATTTCA	2	12	2545692	2545703	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011901	CCATCA	2	12	2545991	2546002	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011901	CGCCGG	2	12	2560455	2560466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011901	TCAGCA	2	12	2568204	2568215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011901	GCCTGT	2	12	2589838	2589849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011901	CGCAGG	2	12	2620184	2620195	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011901	CGCTTT	2	12	2636061	2636072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011901	GCCCAC	2	12	2657633	2657644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011901	GCCCTG	2	12	2675652	2675663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011901	ATCCTC	2	12	2695192	2695203	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011901	CACGCG	2	12	2734971	2734982	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011901	CAGGGT	2	12	2749194	2749205	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011901	ACATCG	2	12	2749253	2749264	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011901	GCGCCC	2	12	2800232	2800243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011901	AAATCA	2	12	2860299	2860310	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011901	ATCATT	2	12	2867870	2867881	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_011901	CCCAGG	2	12	2878271	2878282	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_011901	CCGGCT	2	12	2921523	2921534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011901	TCCCTG	2	12	2922675	2922686	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011901	ACCAAC	2	12	2951751	2951762	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011901	TGCAGT	2	12	2956636	2956647	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011901	CGGTGC	2	12	2967953	2967964	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011901	GGACGG	2	12	3021664	3021675	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011901	TATTCT	2	12	3049079	3049090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011901	ACGGCC	2	12	3076379	3076390	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011901	CAAGGT	2	12	3076558	3076569	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011901	AAAGGC	2	12	3100279	3100290	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_011901	TGGCCC	2	12	3181534	3181545	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011901	GCACCC	2	12	3195044	3195055	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011901	GCGGGT	2	12	3208805	3208816	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011901	TGTCAT	2	12	3217039	3217050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011901	TAGACA	2	12	3227144	3227155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011901	CATCCA	2	12	3256463	3256474	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011901	AGAAAA	2	12	3271705	3271716	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011901	CATGTC	2	12	3274282	3274293	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011901	GAGATC	2	12	3354406	3354417	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011901	CGGCCC	2	12	3356845	3356856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011901	ATTCCG	2	12	3367551	3367562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011901	TCCCTC	2	12	3368571	3368582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011901	AGGGTG	2	12	3368595	3368606	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011901	CCCTTG	2	12	3371262	3371273	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011901	TTCCAA	2	12	3371411	3371422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011901	CCTGTC	2	12	3389905	3389916	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011901	GCACCT	2	12	3427017	3427028	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.