MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 60390

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	ATG	3	9	29	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011901	TCC	2	6	117	122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011901	CAG	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
4	NC_011901	GGA	2	6	237	242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
5	NC_011901	CTG	2	6	259	264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
6	NC_011901	TTC	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
7	NC_011901	GCG	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
8	NC_011901	GCC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
9	NC_011901	CCG	2	6	428	433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
10	NC_011901	GCC	2	6	466	471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
11	NC_011901	CAA	2	6	489	494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
12	NC_011901	TCG	2	6	524	529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
13	NC_011901	GCC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
14	NC_011901	CGG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933194
15	NC_011901	GGT	2	6	693	698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
16	NC_011901	GCA	2	6	744	749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
17	NC_011901	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
18	NC_011901	CTA	2	6	774	779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
19	NC_011901	GCT	2	6	795	800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
20	NC_011901	CGA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
21	NC_011901	TTC	2	6	817	822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
22	NC_011901	TTC	2	6	850	855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
23	NC_011901	CAG	3	9	883	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
24	NC_011901	AGG	2	6	920	925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
25	NC_011901	GGA	2	6	936	941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
26	NC_011901	GCC	2	6	987	992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933194
27	NC_011901	CTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933194
28	NC_011901	GTG	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
29	NC_011901	AGG	2	6	1181	1186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933194
30	NC_011901	CTG	2	6	1198	1203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
31	NC_011901	ACA	2	6	1232	1237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933194
32	NC_011901	AGA	2	6	1241	1246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933194
33	NC_011901	TAC	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933194
34	NC_011901	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
35	NC_011901	GGT	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933194
36	NC_011901	CTG	2	6	1483	1488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933194
37	NC_011901	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933194
38	NC_011901	TTA	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011901	ATC	3	9	1715	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011901	TAA	2	6	1735	1740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011901	GCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
42	NC_011901	TGG	2	6	1915	1920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933195
43	NC_011901	CGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
44	NC_011901	CAG	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933195
45	NC_011901	TAC	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
46	NC_011901	CCT	2	6	2320	2325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933195
47	NC_011901	TCA	2	6	2335	2340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933195
48	NC_011901	CTG	2	6	2364	2369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
49	NC_011901	CTG	2	6	2373	2378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
50	NC_011901	TGA	2	6	2387	2392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933195
51	NC_011901	CTG	2	6	2622	2627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933195
52	NC_011901	GCC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011901	CTG	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
54	NC_011901	CTC	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933196
55	NC_011901	GGC	3	9	3121	3129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
56	NC_011901	CTG	2	6	3259	3264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
57	NC_011901	GCG	2	6	3269	3274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
58	NC_011901	CCG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
59	NC_011901	GCT	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
60	NC_011901	CTG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
61	NC_011901	GCT	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
62	NC_011901	AGA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933196
63	NC_011901	CTG	2	6	3658	3663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933196
64	NC_011901	GCC	2	6	3665	3670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933196
65	NC_011901	CAG	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933196
66	NC_011901	GTG	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
67	NC_011901	TGG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933196
68	NC_011901	CGG	2	6	3806	3811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933196
69	NC_011901	TGA	2	6	3839	3844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933196
70	NC_011901	GCA	2	6	4032	4037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
71	NC_011901	CAC	2	6	4144	4149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
72	NC_011901	GGT	2	6	4161	4166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
73	NC_011901	CGA	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
74	NC_011901	CAA	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
75	NC_011901	ATC	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
76	NC_011901	GAT	2	6	4252	4257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
77	NC_011901	GAA	2	6	4288	4293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
78	NC_011901	CGC	2	6	4302	4307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
79	NC_011901	TCA	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
80	NC_011901	TGC	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
81	NC_011901	CGA	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
82	NC_011901	CGG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
83	NC_011901	GGT	2	6	4398	4403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
84	NC_011901	TCT	2	6	4559	4564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
85	NC_011901	CGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
86	NC_011901	AGG	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
87	NC_011901	CAA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
88	NC_011901	GAC	2	6	4774	4779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933197
89	NC_011901	TCT	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
90	NC_011901	CAA	2	6	4842	4847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
91	NC_011901	CGC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
92	NC_011901	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
93	NC_011901	CCA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
94	NC_011901	TGA	2	6	4968	4973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
95	NC_011901	TCC	2	6	5056	5061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220933197
96	NC_011901	GTG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
97	NC_011901	ACC	2	6	5096	5101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
98	NC_011901	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
99	NC_011901	TCA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
100	NC_011901	ATC	2	6	5155	5160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
101	NC_011901	CCG	2	6	5187	5192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
102	NC_011901	TGG	2	6	5297	5302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
103	NC_011901	CCG	2	6	5312	5317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
104	NC_011901	CGG	2	6	5423	5428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
105	NC_011901	ACC	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
106	NC_011901	CAT	4	12	5508	5519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933197
107	NC_011901	CTG	3	9	5557	5565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
108	NC_011901	CTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
109	NC_011901	GCC	2	6	5625	5630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
110	NC_011901	GAA	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933197
111	NC_011901	CAA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933197
112	NC_011901	TGC	2	6	5699	5704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
113	NC_011901	GGA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
114	NC_011901	TGA	2	6	5729	5734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933197
115	NC_011901	CCG	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
116	NC_011901	GCG	2	6	5759	5764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
117	NC_011901	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933197
118	NC_011901	CGC	2	6	5827	5832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
119	NC_011901	CTG	2	6	5845	5850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
120	NC_011901	TCT	2	6	5861	5866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
121	NC_011901	TGG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933197
122	NC_011901	GCC	2	6	5953	5958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
123	NC_011901	GCC	2	6	5962	5967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
124	NC_011901	GGC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933197
125	NC_011901	TTC	2	6	6070	6075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933197
126	NC_011901	GCC	2	6	6142	6147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
127	NC_011901	GCT	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
128	NC_011901	CCG	2	6	6219	6224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933197
129	NC_011901	ACC	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
130	NC_011901	CTG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933197
131	NC_011901	CAC	2	6	6360	6365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933197
132	NC_011901	GCG	2	6	6567	6572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
133	NC_011901	GCT	2	6	6584	6589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
134	NC_011901	CTG	2	6	6681	6686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
135	NC_011901	TGT	2	6	6764	6769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220933198
136	NC_011901	GAA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933198
137	NC_011901	GGC	2	6	6944	6949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
138	NC_011901	GCT	2	6	7064	7069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933198
139	NC_011901	CAC	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933198
140	NC_011901	GGC	2	6	7181	7186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933198
141	NC_011901	CCG	2	6	7246	7251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933198
142	NC_011901	TTC	2	6	7299	7304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933198
143	NC_011901	GGT	2	6	7347	7352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933198
144	NC_011901	CAG	2	6	7383	7388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933198
145	NC_011901	CAT	2	6	7410	7415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933198
146	NC_011901	TCA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011901	TTG	3	9	7580	7588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011901	CTG	2	6	7823	7828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933199
149	NC_011901	CGC	2	6	7840	7845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933199
150	NC_011901	CTG	2	6	7856	7861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933199
151	NC_011901	CTG	2	6	7910	7915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933199
152	NC_011901	GGT	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933199
153	NC_011901	GAG	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933199
154	NC_011901	GGT	2	6	8122	8127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933199
155	NC_011901	GCG	2	6	8157	8162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
156	NC_011901	AAG	2	6	8180	8185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933199
157	NC_011901	GAG	2	6	8237	8242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933199
158	NC_011901	GAA	2	6	8269	8274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933199
159	NC_011901	CTA	2	6	8392	8397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933199
160	NC_011901	TGA	2	6	8403	8408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933199
161	NC_011901	ACA	2	6	8499	8504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933199
162	NC_011901	CCA	2	6	8589	8594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933199
163	NC_011901	GTG	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933199
164	NC_011901	GGC	2	6	8641	8646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
165	NC_011901	CGA	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933199
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167	NC_011901	AGC	2	6	8754	8759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933199
168	NC_011901	AGG	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933199
169	NC_011901	GTG	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933199
170	NC_011901	TGG	2	6	8844	8849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933199
171	NC_011901	AAG	2	6	8984	8989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220933199
172	NC_011901	CGG	2	6	8992	8997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
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174	NC_011901	CAC	2	6	9161	9166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933199
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178	NC_011901	CGG	2	6	9547	9552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
179	NC_011901	CGG	2	6	9558	9563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
180	NC_011901	GAG	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933199
181	NC_011901	GGC	2	6	9683	9688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933199
182	NC_011901	CTG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933199
183	NC_011901	GAG	2	6	9773	9778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220933199
184	NC_011901	GGC	2	6	9801	9806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_011901	GCA	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220933200
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189	NC_011901	GCG	2	6	10097	10102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933200
190	NC_011901	CGC	2	6	10109	10114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933200
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192	NC_011901	GTG	2	6	10257	10262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933200
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197	NC_011901	CAT	2	6	10529	10534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933200
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199	NC_011901	GCC	2	6	10721	10726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
200	NC_011901	CGC	2	6	10743	10748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
201	NC_011901	CGG	2	6	10877	10882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933201
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220	NC_011901	TGA	2	6	12025	12030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220933201
221	NC_011901	CCA	2	6	12106	12111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220933201
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225	NC_011901	ACC	2	6	12250	12255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
226	NC_011901	CAC	2	6	12272	12277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
227	NC_011901	CAT	2	6	12367	12372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220933202
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232	NC_011901	CGG	3	9	12603	12611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933202
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247	NC_011901	GCG	2	6	13515	13520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933204
248	NC_011901	GCG	2	6	13534	13539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933204
249	NC_011901	GGC	2	6	13616	13621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_011901	CGG	2	6	13625	13630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_011901	GGC	2	6	13707	13712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933205
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253	NC_011901	CTT	3	9	13924	13932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933206
254	NC_011901	GCG	2	6	13958	13963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933206
255	NC_011901	CTT	2	6	13969	13974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933206
256	NC_011901	CGG	2	6	14010	14015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933206
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258	NC_011901	TGG	2	6	14172	14177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220933206
259	NC_011901	CTT	2	6	14332	14337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220933206
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263	NC_011901	GTT	2	6	14774	14779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_011901	GTG	2	6	14857	14862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_011901	CAA	2	6	21727	21732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220933214
381	NC_011901	GGC	2	6	21739	21744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220933214
382	NC_011901	GCT	2	6	21748	21753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220933214
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384	NC_011901	CGC	3	9	22024	22032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220933215
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