MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thioalkalivibrio sulfidophilus HL-EbGr7 chromosome

Total Repeats: 4649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011901	ATG	3	9	29	37	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011901	TCC	2	6	117	122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011901	TTA	2	6	1707	1712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011901	ATC	3	9	1715	1723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011901	TAA	2	6	1735	1740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011901	GCC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011901	TCA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011901	TTG	3	9	7580	7588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011901	GGC	2	6	9801	9806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011901	GCC	2	6	10721	10726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011901	CGC	2	6	10743	10748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011901	ACC	2	6	12250	12255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_011901	CAC	2	6	12272	12277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_011901	GGC	2	6	13616	13621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011901	CGG	2	6	13625	13630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011901	CAA	2	6	14609	14614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011901	GGT	2	6	14747	14752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011901	GCG	2	6	14766	14771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011901	GTT	2	6	14774	14779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011901	GTG	2	6	14857	14862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011901	TTC	2	6	14983	14988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011901	CAT	2	6	15003	15008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011901	CCG	2	6	15022	15027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_011901	CAA	2	6	15074	15079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011901	CGG	2	6	15115	15120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011901	GGT	3	9	15134	15142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011901	TGG	2	6	15152	15157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011901	GCA	2	6	15241	15246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011901	CGG	2	6	15271	15276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011901	TGC	2	6	15277	15282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011901	TGG	2	6	15283	15288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011901	GGC	2	6	15291	15296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011901	CTG	2	6	15333	15338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011901	AAC	2	6	15856	15861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011901	GCT	2	6	18914	18919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011901	ACC	2	6	18922	18927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011901	GGA	2	6	21974	21979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011901	CAG	2	6	22483	22488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011901	CGA	2	6	22512	22517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011901	GCT	2	6	22536	22541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011901	GCC	2	6	23499	23504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011901	TTC	2	6	29460	29465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011901	CGC	2	6	29576	29581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011901	TCC	2	6	31399	31404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011901	CCG	2	6	31405	31410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011901	GTT	2	6	31492	31497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011901	ATC	2	6	31578	31583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011901	CGG	2	6	33014	33019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011901	TCG	2	6	33059	33064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011901	CCG	2	6	33090	33095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011901	GCG	2	6	33184	33189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011901	TCC	2	6	35706	35711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011901	TGA	2	6	35792	35797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011901	GAT	2	6	36605	36610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011901	CAG	2	6	36731	36736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011901	GTG	2	6	37635	37640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011901	ATT	2	6	37694	37699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011901	ACC	2	6	37738	37743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011901	CAT	2	6	37746	37751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011901	ACG	2	6	41475	41480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011901	TTA	2	6	44218	44223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011901	GAT	2	6	44268	44273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011901	TTC	2	6	46016	46021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011901	GCC	2	6	50377	50382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011901	CTG	2	6	50391	50396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011901	GCG	2	6	50428	50433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011901	CGC	2	6	50438	50443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_011901	CCT	2	6	50470	50475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_011901	GCG	2	6	50549	50554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011901	CGC	2	6	50559	50564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_011901	AGC	2	6	54393	54398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011901	TAA	2	6	55319	55324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011901	CGG	2	6	55366	55371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011901	ACA	3	9	57495	57503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011901	CGC	2	6	57908	57913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011901	TCT	2	6	57985	57990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011901	CAG	2	6	61194	61199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011901	CTG	2	6	61209	61214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011901	GTC	2	6	61225	61230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011901	GGA	2	6	61368	61373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011901	GGA	2	6	63454	63459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011901	GCG	2	6	64598	64603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011901	GCA	2	6	64717	64722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011901	CGT	2	6	64736	64741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011901	ATT	2	6	64840	64845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011901	AGC	2	6	64893	64898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011901	AAC	2	6	65006	65011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011901	CCT	2	6	66531	66536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011901	CGT	2	6	66617	66622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011901	TGC	3	9	68114	68122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011901	ACA	2	6	69098	69103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011901	CCG	2	6	74212	74217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011901	AGC	2	6	74348	74353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011901	GGA	2	6	74389	74394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011901	CTT	2	6	76673	76678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011901	TTG	2	6	78013	78018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011901	TGG	2	6	80973	80978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011901	CAA	2	6	83251	83256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011901	CGC	2	6	83260	83265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011901	GCC	2	6	84558	84563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011901	CGG	2	6	87241	87246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011901	TGG	2	6	87286	87291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011901	CCG	2	6	87317	87322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011901	GCG	2	6	87412	87417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011901	GCG	2	6	87524	87529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011901	GCC	2	6	88636	88641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_011901	GTG	2	6	88762	88767	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011901	TCA	2	6	90897	90902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011901	TGC	2	6	90995	91000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011901	CCA	2	6	93829	93834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_011901	TTC	2	6	93857	93862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011901	CCG	2	6	93979	93984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011901	TCC	2	6	94141	94146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_011901	CAT	2	6	95983	95988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_011901	CGC	2	6	96052	96057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011901	CGG	2	6	96111	96116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011901	TGA	2	6	98202	98207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011901	TGC	2	6	100299	100304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011901	CAC	2	6	100305	100310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_011901	ACC	2	6	102714	102719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_011901	CCG	2	6	102744	102749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011901	ATT	2	6	104143	104148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011901	CAT	2	6	104256	104261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011901	TTG	2	6	106170	106175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011901	TCA	2	6	106220	106225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011901	CCG	3	9	107260	107268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011901	GTC	2	6	107280	107285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011901	GGC	2	6	107329	107334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011901	ACA	2	6	107469	107474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011901	CCA	2	6	107477	107482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_011901	TGG	2	6	107616	107621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011901	CGG	2	6	107631	107636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011901	CGA	2	6	107695	107700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011901	CCT	2	6	107715	107720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011901	GCT	2	6	107752	107757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011901	TGA	2	6	107772	107777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011901	TCT	2	6	107832	107837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011901	GGC	2	6	107842	107847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011901	TGG	2	6	107853	107858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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