MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011900	TAAGGA	2	12	18307	18318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011900	GAAGTG	2	12	21395	21406	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011900	ACTAAT	2	12	21425	21436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011900	GATAGA	2	12	22014	22025	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011900	TCTTGT	2	12	22660	22671	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011900	CATCTC	2	12	23205	23216	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011900	AGTTGA	2	12	23324	23335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011900	AAGAAA	2	12	30499	30510	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011900	CAGGCT	2	12	31680	31691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011900	TTGTTT	2	12	35948	35959	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011900	AAAATT	2	12	35979	35990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011900	TAAAAA	2	12	47386	47397	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011900	AAAAAT	2	12	63390	63401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011900	TTCTAT	2	12	73234	73245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011900	TCCCAT	2	12	79042	79053	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011900	TAAAAT	2	12	81420	81431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011900	GCTTGC	2	12	90182	90193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011900	TAAAAA	2	12	96427	96438	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011900	GCTTAT	2	12	113056	113067	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011900	GCTTAT	2	12	118631	118642	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011900	ATAAAA	2	12	123257	123268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011900	TTGAAA	2	12	124294	124305	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011900	CCAGCT	2	12	125055	125066	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011900	CCAGCT	2	12	125208	125219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011900	TTTGCT	2	12	132484	132495	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011900	ATAAAA	2	12	132875	132886	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011900	ATAAAT	2	12	137787	137798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011900	TTTTAC	2	12	183030	183041	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011900	CATAAT	2	12	211469	211480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011900	TCTTAA	2	12	227134	227145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011900	TCTTTT	2	12	264774	264785	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011900	TAGATA	2	12	271028	271039	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011900	GAAAAA	2	12	295587	295598	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011900	ACAAGA	2	12	302824	302835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011900	AAATTA	2	12	318696	318707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011900	GCAGTT	2	12	340546	340557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011900	ATGAAG	2	12	405305	405316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011900	GCTTGC	2	12	428019	428030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011900	TGCTTT	2	12	478011	478022	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011900	CATCTC	2	12	495766	495777	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011900	AGTTGA	2	12	495885	495896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011900	GAAAAG	2	12	509960	509971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011900	TCTTTT	2	12	510510	510521	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011900	AAAGTT	2	12	561941	561952	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011900	ACTTCT	2	12	578639	578650	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011900	GAGATG	2	12	581088	581099	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011900	TGAGTT	2	12	614662	614673	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011900	TTTTCA	2	12	712260	712271	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011900	GATAGA	2	12	724625	724636	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011900	TCTTGT	2	12	725272	725283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011900	GAAGTT	2	12	737784	737795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011900	AAAAAC	2	12	738515	738526	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011900	TTCGGG	2	12	761782	761793	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011900	CATCTC	2	12	764130	764141	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011900	AGTTGA	2	12	764249	764260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011900	TTAAAA	2	12	797257	797268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011900	TATAAA	2	12	800701	800712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011900	TCAAGT	2	12	820698	820709	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011900	CTTTTC	2	12	821226	821237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011900	AAAAAG	2	12	851583	851594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011900	ACCAAG	2	12	852446	852457	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011900	TTTTTA	2	12	871595	871606	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011900	CTATTT	2	12	883073	883084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011900	AAAAAG	2	12	883122	883133	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011900	GATAGA	2	12	890489	890500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011900	TTTTCT	2	12	893412	893423	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011900	TAAAAA	2	12	923496	923507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011900	TGTCAA	2	12	929113	929124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011900	AAGAAA	2	12	930419	930430	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011900	AAAGTA	2	12	931199	931210	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011900	AATGGA	2	12	941052	941063	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011900	CAAAAG	2	12	943086	943097	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011900	TTTTGG	2	12	945118	945129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011900	TAACAG	2	12	945192	945203	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011900	CATCTC	2	12	985552	985563	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011900	AGTTGA	2	12	985671	985682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011900	ACAAGA	2	12	1013884	1013895	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011900	TCTATC	2	12	1014517	1014528	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011900	AATTTT	2	12	1052653	1052664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011900	TTTTTG	2	12	1062597	1062608	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011900	GTTTGT	2	12	1071562	1071573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011900	TGAAAA	2	12	1087135	1087146	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011900	AGAAAA	2	12	1124947	1124958	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011900	TAAAAA	2	12	1165550	1165561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011900	TAATTT	2	12	1194698	1194709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011900	AATCTA	2	12	1206181	1206192	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011900	TTTAAA	2	12	1223900	1223911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011900	TAGAAT	2	12	1227460	1227471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011900	ATTCTG	2	12	1229187	1229198	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011900	TAATGT	2	12	1248097	1248108	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011900	TCTTTT	2	12	1250386	1250397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011900	AATTCA	2	12	1250604	1250615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011900	TTTTCT	2	12	1252836	1252847	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011900	TCAATC	2	12	1252896	1252907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011900	CCATCA	2	12	1254287	1254298	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011900	AAAATA	2	12	1266479	1266490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011900	AGATTT	2	12	1283824	1283835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011900	TAGGTA	2	12	1305173	1305184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011900	TTGAAA	2	12	1316149	1316160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011900	GATGGT	2	12	1344905	1344916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011900	TTTTAT	2	12	1356413	1356424	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011900	TTTCCT	2	12	1359657	1359668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011900	ATGAAA	2	12	1392478	1392489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011900	CTTCTC	2	12	1401045	1401056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011900	TCAACT	2	12	1407352	1407363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011900	GAGATG	2	12	1407471	1407482	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011900	TGTATT	2	12	1414382	1414393	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011900	TGCTTC	2	12	1414825	1414836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011900	ACTAAA	2	12	1416148	1416159	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011900	AAATTT	2	12	1430908	1430919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011900	AGCCTG	2	12	1487817	1487828	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011900	TTAAAA	2	12	1625335	1625346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011900	AACTTG	2	12	1662371	1662382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011900	ATTTGA	2	12	1687566	1687577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011900	TAATCA	2	12	1695733	1695744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_011900	CACTTC	2	12	1751420	1751431	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011900	AAAAAT	2	12	1762687	1762698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011900	TCTATT	2	12	1768213	1768224	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011900	GAACAT	2	12	1784884	1784895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011900	CTTTCT	2	12	1807195	1807206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011900	TAGGCT	2	12	1808122	1808133	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011900	TCATTA	2	12	1820096	1820107	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011900	TAATCA	2	12	1838854	1838865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011900	TCAACT	2	12	1865280	1865291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011900	TATTAG	2	12	1868018	1868029	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011900	CACTTC	2	12	1868049	1868060	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011900	TCCTTA	2	12	1871137	1871148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011900	TCAACT	2	12	1876982	1876993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011900	GAGATG	2	12	1877101	1877112	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011900	CCAGAA	2	12	1899036	1899047	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011900	AGGTAG	2	12	1918055	1918066	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011900	AGGACA	2	12	1950887	1950898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_011900	AAAAAT	2	12	1954651	1954662	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011900	TATTAG	2	12	1966646	1966657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011900	CACTTC	2	12	1966677	1966688	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011900	TCCTTA	2	12	1969765	1969776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011900	TCTATC	2	12	1979424	1979435	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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140	NC_011900	TATTAG	2	12	2028555	2028566	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011900	CACTTC	2	12	2028586	2028597	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011900	TCCTTA	2	12	2031674	2031685	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.