MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011900	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011900	TCGTG	2	10	17834	17843	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011900	GTTAA	2	10	18555	18564	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011900	GGGAG	2	10	19073	19082	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011900	AGGGA	2	10	21284	21293	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011900	CTTTT	2	10	25621	25630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011900	CATTT	2	10	27080	27089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011900	TTATA	2	10	30475	30484	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011900	TTTTG	2	10	32220	32229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011900	ATTAT	2	10	32361	32370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011900	TATCG	2	10	32537	32546	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011900	TATTT	2	10	35583	35592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011900	TTTTA	2	10	35595	35604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011900	GATGG	2	10	38537	38546	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011900	AGAGG	2	10	50512	50521	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011900	ATTTT	2	10	67660	67669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011900	TTTAT	2	10	73096	73105	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011900	ATTCA	2	10	78971	78980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011900	TATCA	2	10	84726	84735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011900	GAAAG	2	10	86582	86591	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011900	GCGGT	2	10	87823	87832	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011900	ATAAA	2	10	94179	94188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011900	TAACC	2	10	94277	94286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011900	AGATA	2	10	103896	103905	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011900	GTTTG	2	10	104063	104072	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011900	GGCTT	2	10	111766	111775	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011900	TAAAA	2	10	122196	122205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011900	ATTAA	2	10	125863	125872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011900	GTTTG	2	10	132652	132661	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011900	ATGAC	2	10	132799	132808	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011900	GAAAA	2	10	133389	133398	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011900	TATAA	2	10	159442	159451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011900	TGAAA	2	10	160814	160823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011900	ATTTC	2	10	162340	162349	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011900	CCCTG	2	10	169590	169599	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_011900	ATGAT	2	10	184771	184780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011900	AAGGA	2	10	197013	197022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011900	GTTCA	2	10	198647	198656	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011900	AAAAT	2	10	202454	202463	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011900	ATCGA	2	10	203202	203211	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011900	TTTTA	2	10	207826	207835	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011900	ATTCT	2	10	212586	212595	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011900	CTATC	2	10	213808	213817	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011900	CTTTT	2	10	226769	226778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011900	CTTAA	2	10	229126	229135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011900	AAGCC	2	10	242726	242735	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_011900	AATAG	2	10	244242	244251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011900	CTTTT	2	10	274518	274527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011900	AGAAC	2	10	278785	278794	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011900	AAATA	2	10	289545	289554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011900	TGCTT	2	10	302696	302705	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011900	AATCA	2	10	309983	309992	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011900	TTTCC	2	10	323409	323418	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011900	CTATC	2	10	323471	323480	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011900	ATAAA	2	10	338381	338390	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011900	TTTTC	2	10	351291	351300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011900	TTTTA	2	10	365910	365919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011900	TAAAA	2	10	378018	378027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011900	GACTG	2	10	403522	403531	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011900	TGATT	2	10	405579	405588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011900	CTGAC	2	10	411208	411217	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_011900	TCCAG	2	10	411233	411242	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_011900	AAATA	2	10	414469	414478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011900	AGAAA	2	10	414490	414499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011900	TTTGC	2	10	417614	417623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011900	GGAAT	2	10	419846	419855	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011900	AAGAG	2	10	424733	424742	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011900	CAGGG	2	10	428061	428070	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011900	TGAAA	2	10	433394	433403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011900	CTATT	2	10	435464	435473	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011900	AATAA	2	10	440691	440700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011900	CTTTT	2	10	441959	441968	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011900	TAAAA	2	10	441972	441981	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011900	TGTTT	2	10	444844	444853	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011900	CTTTC	2	10	450907	450916	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_011900	ATAAA	2	10	453287	453296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011900	AGCGA	2	10	456423	456432	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011900	ATTCA	2	10	461021	461030	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_011900	TACTG	2	10	461794	461803	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011900	ATATA	2	10	461811	461820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011900	TTCTT	2	10	464375	464384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011900	GATAA	2	10	467051	467060	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011900	ATTCT	2	10	471856	471865	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011900	ATTGG	2	10	485147	485156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011900	TATAA	2	10	485243	485252	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011900	CTTTT	2	10	488149	488158	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011900	TTTTA	2	10	488230	488239	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011900	ATTTT	2	10	496408	496417	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011900	ATAAA	2	10	499388	499397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011900	TTTTA	2	10	499539	499548	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011900	TTTAT	2	10	503780	503789	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011900	AGGAA	2	10	505859	505868	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011900	ATAAA	2	10	513894	513903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011900	TGTCT	2	10	514381	514390	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011900	TTAGT	2	10	518272	518281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011900	ATATA	2	10	527394	527403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011900	TAGTA	2	10	530624	530633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011900	ATAAC	2	10	530690	530699	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011900	CATTT	2	10	532077	532086	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011900	TAAAA	2	10	540496	540505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011900	ACTTC	2	10	568531	568540	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011900	AAACA	2	10	568947	568956	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011900	ATATA	2	10	571731	571740	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011900	AAAAG	2	10	609864	609873	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011900	GAAAA	2	10	610903	610912	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011900	GTTAT	2	10	610942	610951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011900	TCCTT	2	10	614518	614527	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_011900	CTTTT	2	10	635682	635691	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011900	ATTTT	2	10	648491	648500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011900	TAGTA	2	10	649205	649214	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011900	ACGAA	2	10	650684	650693	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011900	AGGGG	2	10	652150	652159	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011900	CCCTG	2	10	652236	652245	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_011900	ATGGA	2	10	673668	673677	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011900	ATAAA	2	10	684776	684785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011900	TAAAA	2	10	692635	692644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011900	GGAAA	2	10	697596	697605	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011900	TAAAA	2	10	708330	708339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011900	TAAAA	2	10	722641	722650	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011900	ATTTT	2	10	723893	723902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011900	CAAGA	2	10	729839	729848	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011900	CTGAT	2	10	736355	736364	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011900	CTGAA	2	10	738551	738560	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_011900	ATAAA	2	10	738721	738730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011900	TTTGA	2	10	738749	738758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011900	TTTTA	2	10	741625	741634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011900	AAATA	2	10	746376	746385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011900	TATTT	2	10	761939	761948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011900	TTTTG	2	10	787875	787884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011900	TATAT	2	10	800665	800674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011900	ATCTA	2	10	807221	807230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011900	TATGA	2	10	809286	809295	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011900	TGTTT	2	10	809785	809794	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011900	AAATC	2	10	816933	816942	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011900	AGGTT	2	10	817012	817021	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011900	CATTT	2	10	817169	817178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011900	AGAAC	2	10	821828	821837	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011900	ATATA	2	10	824759	824768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011900	CTTTT	2	10	830161	830170	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_011900	TAATA	2	10	831173	831182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011900	ATAGA	2	10	840036	840045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011900	TAAAA	2	10	845231	845240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011900	CTTTT	2	10	851888	851897	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011900	CATCT	2	10	852257	852266	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
145	NC_011900	CTTTT	2	10	852508	852517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011900	GAAGA	2	10	852742	852751	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011900	ACCAA	2	10	858948	858957	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_011900	TCTTT	2	10	860998	861007	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_011900	AATAA	2	10	862857	862866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011900	AGGCT	2	10	881101	881110	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_011900	AGAGT	2	10	940674	940683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_011900	TATAA	2	10	1063718	1063727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_011900	ATTAA	2	10	1751499	1751508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_011900	TAAAA	2	10	1761595	1761604	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_011900	TAATT	2	10	1762702	1762711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011900	ATAAA	2	10	1763335	1763344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_011900	ATTCA	2	10	1777474	1777483	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
295	NC_011900	AATTG	2	10	1798316	1798325	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_011900	ATGAA	2	10	1805852	1805861	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_011900	TAAAA	2	10	1807817	1807826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_011900	TCGCT	2	10	1808235	1808244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
299	NC_011900	TATAT	2	10	1811748	1811757	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_011900	CTTAT	2	10	1818970	1818979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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321	NC_011900	ATATC	2	10	1896828	1896837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
322	NC_011900	ACTGA	2	10	1897364	1897373	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_011900	ATACT	2	10	1899238	1899247	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
324	NC_011900	CTTTT	2	10	1905604	1905613	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_011900	AGAAT	2	10	1953509	1953518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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362	NC_011900	CTTAG	2	10	2092676	2092685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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365	NC_011900	ACTTT	2	10	2106112	2106121	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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370	NC_011900	AATGG	2	10	2175563	2175572	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
371	NC_011900	CTTTT	2	10	2180556	2180565	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
372	NC_011900	CTTCC	2	10	2184910	2184919	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
373	NC_011900	TCTCA	2	10	2213881	2213890	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.