MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 1226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011900	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011900	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011900	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011900	GCTT	2	8	16839	16846	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011900	CCTG	2	8	16887	16894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011900	GTGA	2	8	17167	17174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011900	AGCG	2	8	17338	17345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_011900	AGCC	2	8	18219	18226	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011900	GTAA	2	8	18641	18648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011900	GCGA	2	8	18797	18804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011900	ATTC	2	8	19663	19670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011900	CTAA	2	8	20017	20024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011900	GTCT	2	8	20042	20049	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011900	TAGG	2	8	20673	20680	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011900	CTTT	2	8	22767	22774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011900	ATGT	2	8	24203	24210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011900	TTTG	2	8	26363	26370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011900	ATGT	2	8	26575	26582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011900	GTAT	2	8	26819	26826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011900	TTTC	2	8	27026	27033	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011900	ATTC	2	8	27101	27108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011900	CTTG	2	8	27431	27438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011900	AAAT	2	8	30077	30084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011900	TGCT	2	8	30422	30429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011900	CGGA	2	8	31547	31554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011900	TAAA	2	8	31638	31645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011900	TATC	2	8	32289	32296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011900	AATA	2	8	32587	32594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011900	AGAA	2	8	35556	35563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011900	ACGG	2	8	35644	35651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011900	GGGA	2	8	35793	35800	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011900	TTGA	2	8	36408	36415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011900	AATA	2	8	37511	37518	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011900	CCAA	2	8	37610	37617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011900	ATCA	2	8	37853	37860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011900	AAGT	2	8	38721	38728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011900	AATT	2	8	38927	38934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011900	CTAT	2	8	39031	39038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011900	TAGA	2	8	42379	42386	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011900	GAAT	2	8	47163	47170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011900	ATTT	2	8	47987	47994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011900	GGGA	2	8	48104	48111	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011900	GAAG	2	8	48127	48134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011900	TGAC	2	8	48241	48248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011900	ATAG	2	8	56548	56555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011900	TTTC	2	8	61855	61862	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011900	TAAT	2	8	74364	74371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011900	GTTT	2	8	80322	80329	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011900	TGCT	2	8	83678	83685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011900	GAAG	2	8	87365	87372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011900	TAGC	2	8	87766	87773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011900	AAGG	2	8	87993	88000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011900	TAAT	2	8	88625	88632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011900	CCTA	2	8	89077	89084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011900	CCTA	2	8	89533	89540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011900	AAAT	2	8	90253	90260	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011900	CTTT	2	8	90314	90321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011900	AATT	2	8	93354	93361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011900	TGAT	2	8	94009	94016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011900	TTTG	2	8	94205	94212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011900	ATTC	2	8	97950	97957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011900	AAAT	2	8	98108	98115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011900	ATAA	2	8	98151	98158	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011900	AGCT	2	8	99271	99278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011900	GTTT	2	8	99394	99401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011900	ACAT	2	8	103379	103386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011900	AAAG	2	8	103397	103404	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011900	ATGG	2	8	103734	103741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011900	GGTA	2	8	103956	103963	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011900	TAGA	2	8	104339	104346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011900	GATT	2	8	104356	104363	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011900	AGGC	2	8	104480	104487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011900	AACT	2	8	104506	104513	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011900	TTCT	2	8	109040	109047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011900	AGAA	2	8	111935	111942	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011900	AGCC	2	8	112745	112752	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011900	TAGA	2	8	112832	112839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011900	GAAG	2	8	113256	113263	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011900	AAAT	2	8	113340	113347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011900	TTCA	2	8	116436	116443	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011900	AAAG	2	8	117532	117539	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011900	AGCC	2	8	118320	118327	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011900	TAGA	2	8	118407	118414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011900	GTAG	2	8	118773	118780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011900	GTAT	2	8	118831	118838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011900	TGCT	2	8	118968	118975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011900	TTCT	2	8	120371	120378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011900	AAAG	2	8	120585	120592	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011900	AAAT	2	8	120674	120681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011900	AAGC	2	8	120757	120764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011900	GGCT	2	8	120885	120892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011900	GGAT	2	8	121004	121011	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011900	ATTT	2	8	122034	122041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011900	AATT	2	8	122628	122635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011900	TAGC	2	8	123203	123210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011900	GAAA	2	8	123375	123382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011900	GAAG	2	8	123485	123492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011900	AAGA	2	8	123853	123860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011900	AAGC	2	8	125497	125504	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011900	AAGC	2	8	125740	125747	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011900	TTAT	2	8	126042	126049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011900	TGAA	2	8	126060	126067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011900	AAAG	2	8	130044	130051	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011900	TAGA	2	8	130167	130174	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011900	TTGC	2	8	132530	132537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011900	TCAA	2	8	135934	135941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_011900	TAGG	2	8	137443	137450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011900	GTAG	2	8	137541	137548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011900	AAGC	2	8	137562	137569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011900	CTGC	2	8	137730	137737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011900	AAAT	2	8	138279	138286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011900	ATGG	2	8	138681	138688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011900	AATA	2	8	138827	138834	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011900	GAAA	2	8	139055	139062	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011900	GAAG	2	8	139286	139293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011900	GGGA	2	8	142047	142054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011900	ATTT	2	8	142520	142527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011900	TTTA	2	8	142719	142726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011900	GGCT	2	8	145066	145073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011900	AATT	2	8	148682	148689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011900	GAAA	2	8	148952	148959	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011900	GCAG	2	8	148979	148986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011900	AGAT	2	8	149986	149993	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011900	CAAA	2	8	150995	151002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011900	TGAT	2	8	162319	162326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011900	TTTC	2	8	162390	162397	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011900	TTCT	2	8	163603	163610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011900	TAAT	2	8	163631	163638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011900	AGCT	2	8	172932	172939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011900	AGAA	2	8	174786	174793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011900	GGTA	2	8	178807	178814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011900	AGAA	2	8	179265	179272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011900	AAAT	2	8	179857	179864	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011900	ATTG	2	8	181174	181181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011900	AGAA	2	8	184726	184733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011900	CTAA	2	8	184752	184759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011900	AGAA	2	8	186557	186564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011900	AGAA	2	8	190734	190741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011900	GTTT	2	8	198596	198603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011900	ACAA	2	8	198604	198611	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011900	ACAA	2	8	203573	203580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011900	TAAA	2	8	207687	207694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011900	TTTA	2	8	207761	207768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011900	TCAT	2	8	207836	207843	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011900	CTTG	2	8	208577	208584	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011900	AGTG	2	8	211485	211492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011900	AATT	2	8	212648	212655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011900	GAAA	2	8	213826	213833	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011900	ACGA	2	8	213841	213848	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011900	GAAA	2	8	217941	217948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_011900	AATT	2	8	222316	222323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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