MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae ATCC 700669

Total Repeats: 24125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011900	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230949
2	NC_011900	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230949
3	NC_011900	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230949
4	NC_011900	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230949
5	NC_011900	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230949
6	NC_011900	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221230949
7	NC_011900	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230949
8	NC_011900	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230949
9	NC_011900	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230949
10	NC_011900	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230949
11	NC_011900	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221230949
12	NC_011900	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230949
13	NC_011900	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230949
14	NC_011900	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230949
15	NC_011900	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230950
16	NC_011900	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230950
17	NC_011900	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230950
18	NC_011900	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230950
19	NC_011900	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230950
20	NC_011900	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230950
21	NC_011900	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230950
22	NC_011900	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230950
23	NC_011900	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230950
24	NC_011900	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230950
25	NC_011900	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230950
26	NC_011900	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230950
27	NC_011900	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230950
28	NC_011900	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230950
29	NC_011900	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230951
30	NC_011900	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230951
31	NC_011900	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230951
32	NC_011900	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230951
33	NC_011900	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230952
34	NC_011900	ATT	2	6	3235	3240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230952
35	NC_011900	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230952
36	NC_011900	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221230952
37	NC_011900	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230952
38	NC_011900	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230952
39	NC_011900	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230952
40	NC_011900	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230952
41	NC_011900	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230952
42	NC_011900	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230952
43	NC_011900	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230952
44	NC_011900	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230952
45	NC_011900	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	221230952
46	NC_011900	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230952
47	NC_011900	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230952
48	NC_011900	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230952
49	NC_011900	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230952
50	NC_011900	GAA	2	6	4464	4469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230953
51	NC_011900	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230953
52	NC_011900	GAT	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230953
53	NC_011900	CAG	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230953
54	NC_011900	TAT	2	6	4725	4730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230953
55	NC_011900	GTT	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230953
56	NC_011900	CAT	2	6	4807	4812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230953
57	NC_011900	GAT	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230953
58	NC_011900	ACT	2	6	4886	4891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230953
59	NC_011900	TTA	2	6	4951	4956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
60	NC_011900	CTA	2	6	5045	5050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230954
61	NC_011900	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
62	NC_011900	GAT	2	6	5188	5193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
63	NC_011900	TGG	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221230954
64	NC_011900	GAA	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
65	NC_011900	GAG	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221230954
66	NC_011900	TGA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
67	NC_011900	AGA	2	6	5715	5720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
68	NC_011900	TGA	2	6	5841	5846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
69	NC_011900	TGA	2	6	5858	5863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
70	NC_011900	AGA	2	6	5907	5912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
71	NC_011900	AGA	2	6	6102	6107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
72	NC_011900	ATT	2	6	6139	6144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
73	NC_011900	GGA	2	6	6180	6185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221230954
74	NC_011900	CGT	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230954
75	NC_011900	ACA	2	6	6363	6368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230954
76	NC_011900	TGT	2	6	6423	6428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230954
77	NC_011900	CAT	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230954
78	NC_011900	TGA	2	6	6672	6677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
79	NC_011900	TGA	4	12	6732	6743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
80	NC_011900	TGA	2	6	6756	6761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
81	NC_011900	GAT	2	6	6784	6789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
82	NC_011900	GTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
83	NC_011900	CGA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230954
84	NC_011900	TGT	2	6	7128	7133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230954
85	NC_011900	TGA	2	6	7151	7156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
86	NC_011900	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
87	NC_011900	GAA	2	6	7212	7217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
88	NC_011900	CCG	2	6	7312	7317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221230954
89	NC_011900	TAT	2	6	7414	7419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
90	NC_011900	ACA	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230954
91	NC_011900	GAC	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230954
92	NC_011900	TAT	2	6	7584	7589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
93	NC_011900	TTA	2	6	7909	7914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
94	NC_011900	GTA	2	6	8137	8142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230954
95	NC_011900	ATA	2	6	8216	8221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230954
96	NC_011900	ATT	2	6	8273	8278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
97	NC_011900	CTG	2	6	8389	8394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230954
98	NC_011900	TTA	2	6	8410	8415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230954
99	NC_011900	GAA	2	6	8434	8439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230954
100	NC_011900	CGT	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230955
101	NC_011900	TGC	2	6	8672	8677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230955
102	NC_011900	GCA	2	6	8722	8727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221230955
103	NC_011900	AGA	2	6	8760	8765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230955
104	NC_011900	AAT	2	6	8792	8797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230956
105	NC_011900	CGT	2	6	8822	8827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230956
106	NC_011900	TGA	2	6	8835	8840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230956
107	NC_011900	TAT	2	6	8895	8900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230956
108	NC_011900	TGA	2	6	8998	9003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230956
109	NC_011900	TGC	2	6	9052	9057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230956
110	NC_011900	TAT	2	6	9080	9085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230956
111	NC_011900	TTA	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230957
112	NC_011900	GAA	2	6	9198	9203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230957
113	NC_011900	ATT	2	6	9221	9226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230957
114	NC_011900	AAG	2	6	9235	9240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230957
115	NC_011900	ATT	2	6	9271	9276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230958
116	NC_011900	TTG	2	6	9277	9282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221230958
117	NC_011900	GTC	2	6	9331	9336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230958
118	NC_011900	TTA	2	6	9354	9359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230958
119	NC_011900	TAG	2	6	9452	9457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230958
120	NC_011900	ATC	2	6	9548	9553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230958
121	NC_011900	CAA	2	6	9605	9610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221230958
122	NC_011900	AAG	2	6	9668	9673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230958
123	NC_011900	ATC	2	6	9678	9683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230958
124	NC_011900	GAA	2	6	9790	9795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230958
125	NC_011900	ACT	2	6	9877	9882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221230958
126	NC_011900	AAG	2	6	9887	9892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	221230958
127	NC_011900	TAT	2	6	9952	9957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	221230958
128	NC_011900	ATA	2	6	10082	10087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	221230958
129	NC_011900	GAT	2	6	10222	10227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221230958
130	NC_011900	TCT	2	6	10252	10257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	221230958
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134	NC_011900	GCT	2	6	10740	10745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221230959
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