MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	TCGTG	2	10	20917	20926	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011899	GGGAG	2	10	22114	22123	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011899	ATCTC	2	10	24515	24524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011899	GTAGC	2	10	25531	25540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011899	AAGTC	2	10	31855	31864	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_011899	GAATT	2	10	34166	34175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011899	AATTA	2	10	34294	34303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011899	TTATA	2	10	36889	36898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011899	AAAGA	2	10	37588	37597	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011899	GTGCT	2	10	41506	41515	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011899	ATAAA	2	10	50099	50108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011899	TTAAA	2	10	53175	53184	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011899	TATGG	2	10	53860	53869	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011899	TATAA	2	10	59154	59163	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011899	TTTTA	2	10	68041	68050	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011899	ATTTT	2	10	68072	68081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011899	TAATA	2	10	68138	68147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011899	TACAT	2	10	77369	77378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011899	AAAAG	2	10	77791	77800	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011899	ATATA	2	10	79954	79963	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011899	TTTTA	2	10	94946	94955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011899	TCGTG	2	10	96343	96352	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_011899	GGGAG	2	10	97641	97650	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011899	ATCTC	2	10	100042	100051	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011899	TTTAA	2	10	100093	100102	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011899	ATATA	2	10	113148	113157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011899	TATAT	2	10	114945	114954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011899	AAATA	2	10	123037	123046	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011899	TAAAT	2	10	124259	124268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011899	TATAA	2	10	124404	124413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011899	GTTTA	2	10	124527	124536	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011899	ATTAT	2	10	154948	154957	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011899	ATAGA	2	10	156090	156099	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011899	TATAA	2	10	168547	168556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011899	GTAGA	2	10	170535	170544	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011899	GTTAA	2	10	171385	171394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011899	TATAT	2	10	178358	178367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011899	ACTCC	2	10	190789	190798	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_011899	TGGAG	2	10	190926	190935	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011899	AAAAG	2	10	194814	194823	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011899	AAGTT	2	10	211473	211482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011899	CCGGG	2	10	224061	224070	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011899	AATAT	2	10	224930	224939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011899	ATTAA	2	10	225433	225442	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011899	GACAT	2	10	225568	225577	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011899	TAAAA	2	10	242165	242174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011899	ATTAT	2	10	253132	253141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011899	ATAGA	2	10	254274	254283	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011899	GTTGA	2	10	266147	266156	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011899	GTGGG	2	10	267901	267910	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011899	AAATA	2	10	268402	268411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011899	TTTTA	2	10	271535	271544	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011899	TATTT	2	10	271652	271661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011899	AATTA	2	10	276744	276753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011899	ATTTA	2	10	278148	278157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011899	TCAGG	2	10	278172	278181	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011899	TTTTA	2	10	280878	280887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011899	TTTAG	2	10	285922	285931	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011899	GGAGA	2	10	285979	285988	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011899	TTTAT	2	10	293179	293188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011899	TAAAT	2	10	311724	311733	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011899	AATAA	2	10	311851	311860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011899	TATAA	2	10	314265	314274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011899	ATTTC	2	10	320164	320173	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011899	TAAAT	2	10	332292	332301	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011899	ATTAA	2	10	333793	333802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011899	AAAGT	2	10	333878	333887	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011899	TTCCC	2	10	337264	337273	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_011899	ATTAT	2	10	340019	340028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011899	TTTTA	2	10	350494	350503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011899	AATAT	2	10	350546	350555	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011899	GGAGG	2	10	356501	356510	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011899	ATTAT	2	10	357119	357128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011899	TAATT	2	10	360511	360520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011899	AAAAT	2	10	364783	364792	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011899	AGGTA	2	10	369025	369034	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011899	TATTT	2	10	370456	370465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011899	ATTTT	2	10	375651	375660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011899	ATTTT	2	10	377353	377362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011899	CCTGG	2	10	380903	380912	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011899	TCAGT	2	10	382100	382109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011899	TAGGA	2	10	382415	382424	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011899	AATTA	2	10	383424	383433	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011899	AATTA	2	10	387080	387089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011899	ATATA	2	10	388121	388130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011899	AATTA	2	10	394894	394903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011899	AATAA	2	10	410223	410232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011899	ATAAA	2	10	417077	417086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011899	TATAT	2	10	432900	432909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011899	ATAGT	2	10	437130	437139	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011899	AATTT	2	10	445125	445134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011899	GATTA	2	10	450227	450236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011899	AATTA	2	10	455579	455588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011899	AGAGG	2	10	455612	455621	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011899	GGGGT	2	10	460251	460260	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011899	TTCTG	2	10	464382	464391	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011899	AGCTA	2	10	464428	464437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011899	ATTTT	2	10	464832	464841	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011899	TAAAT	2	10	465220	465229	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011899	CTAAT	2	10	469992	470001	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011899	AATAT	2	10	470040	470049	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011899	AATAT	2	10	476597	476606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011899	TTTTA	2	10	485757	485766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011899	AGAAA	2	10	504940	504949	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011899	ATTAA	2	10	513790	513799	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011899	ATTTT	2	10	516556	516565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011899	CAATA	2	10	521235	521244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011899	TAAAA	2	10	525532	525541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011899	TAAAT	2	10	525550	525559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011899	ATATT	2	10	530950	530959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011899	TCAGT	2	10	531217	531226	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011899	ATATA	2	10	531375	531384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011899	TTGTA	2	10	545936	545945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011899	TATAA	2	10	559824	559833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011899	AAATA	2	10	563549	563558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011899	AGGAG	2	10	563646	563655	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011899	AATTT	2	10	566518	566527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011899	TAATA	2	10	569075	569084	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011899	TTAAT	2	10	580279	580288	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011899	GGAGG	2	10	580538	580547	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011899	ATTTT	2	10	589608	589617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011899	AATTA	2	10	589970	589979	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011899	TATTG	2	10	590160	590169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011899	TATAA	2	10	591289	591298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011899	CATTT	2	10	595407	595416	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011899	GTTCA	2	10	602858	602867	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_011899	CAATA	2	10	603402	603411	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011899	GTAGC	2	10	604526	604535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011899	TAATA	2	10	606945	606954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011899	GTAGG	2	10	606993	607002	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011899	ATGGA	2	10	609343	609352	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011899	AGAAA	2	10	609365	609374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011899	TGTTT	2	10	609574	609583	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011899	TGGTA	2	10	611736	611745	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011899	AGTGA	2	10	611754	611763	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011899	TAAAA	2	10	623803	623812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011899	ATAGT	2	10	626066	626075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011899	GTTTT	2	10	637211	637220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011899	AAATA	2	10	648841	648850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011899	TAACT	2	10	653110	653119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011899	AAAAG	2	10	684200	684209	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011899	AAAAT	2	10	685571	685580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011899	TAAAT	2	10	685977	685986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011899	TTTAA	2	10	696190	696199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011899	AATAA	2	10	699971	699980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011899	TTAAT	2	10	700408	700417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_011899	GCCAG	2	10	744499	744508	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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494	NC_011899	TCTCC	2	10	2435125	2435134	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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