MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 1838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	CCCGG	2	10	1042	1051	0 %	0 %	40 %	60 %	220930851
2	NC_011899	AAAGA	2	10	1759	1768	80 %	0 %	20 %	0 %	220930851
3	NC_011899	TTTTG	2	10	4982	4991	0 %	80 %	20 %	0 %	220930855
4	NC_011899	AATGA	2	10	7182	7191	60 %	20 %	20 %	0 %	220930857
5	NC_011899	AAAGA	2	10	8478	8487	80 %	0 %	20 %	0 %	220930857
6	NC_011899	CCGAC	2	10	12158	12167	20 %	0 %	20 %	60 %	220930860
7	NC_011899	TCTTA	2	10	12866	12875	20 %	60 %	0 %	20 %	220930861
8	NC_011899	GGGCA	2	10	15536	15545	20 %	0 %	60 %	20 %	220930863
9	NC_011899	GTCGG	2	10	26272	26281	0 %	20 %	60 %	20 %	220930868
10	NC_011899	TATTT	2	10	26514	26523	20 %	80 %	0 %	0 %	220930868
11	NC_011899	ATTTG	2	10	28031	28040	20 %	60 %	20 %	0 %	220930869
12	NC_011899	CATAA	2	10	28339	28348	60 %	20 %	0 %	20 %	220930869
13	NC_011899	AAAAG	2	10	29344	29353	80 %	0 %	20 %	0 %	220930870
14	NC_011899	AATTC	2	10	33352	33361	40 %	40 %	0 %	20 %	220930876
15	NC_011899	TAATC	2	10	35684	35693	40 %	40 %	0 %	20 %	220930877
16	NC_011899	AGAAA	2	10	36153	36162	80 %	0 %	20 %	0 %	220930878
17	NC_011899	ACATA	2	10	36264	36273	60 %	20 %	0 %	20 %	220930878
18	NC_011899	TAATT	2	10	37113	37122	40 %	60 %	0 %	0 %	220930879
19	NC_011899	ATTTT	2	10	39865	39874	20 %	80 %	0 %	0 %	220930883
20	NC_011899	ATATT	2	10	39961	39970	40 %	60 %	0 %	0 %	220930883
21	NC_011899	TCAGG	2	10	41987	41996	20 %	20 %	40 %	20 %	220930885
22	NC_011899	ACCCC	2	10	45197	45206	20 %	0 %	0 %	80 %	220930888
23	NC_011899	CAGAG	2	10	46756	46765	40 %	0 %	40 %	20 %	220930889
24	NC_011899	GATAT	2	10	46822	46831	40 %	40 %	20 %	0 %	220930889
25	NC_011899	CCTTC	2	10	49351	49360	0 %	40 %	0 %	60 %	220930890
26	NC_011899	GGAAG	2	10	50312	50321	40 %	0 %	60 %	0 %	220930891
27	NC_011899	AGAAA	2	10	57496	57505	80 %	0 %	20 %	0 %	220930899
28	NC_011899	TAAAG	2	10	59373	59382	60 %	20 %	20 %	0 %	220930900
29	NC_011899	ACCCT	2	10	59802	59811	20 %	20 %	0 %	60 %	220930901
30	NC_011899	GGCAG	2	10	61653	61662	20 %	0 %	60 %	20 %	220930903
31	NC_011899	GATGG	2	10	63345	63354	20 %	20 %	60 %	0 %	220930903
32	NC_011899	TTTAA	2	10	64301	64310	40 %	60 %	0 %	0 %	220930904
33	NC_011899	AATAA	2	10	64577	64586	80 %	20 %	0 %	0 %	220930904
34	NC_011899	ATTAT	2	10	66413	66422	40 %	60 %	0 %	0 %	220930906
35	NC_011899	GCCGG	2	10	67401	67410	0 %	0 %	60 %	40 %	220930906
36	NC_011899	CAAAG	2	10	69815	69824	60 %	0 %	20 %	20 %	220930908
37	NC_011899	ATAAG	2	10	70351	70360	60 %	20 %	20 %	0 %	220930908
38	NC_011899	GGTGG	2	10	70713	70722	0 %	20 %	80 %	0 %	220930908
39	NC_011899	CAGTT	2	10	70998	71007	20 %	40 %	20 %	20 %	220930908
40	NC_011899	TTAAA	2	10	73952	73961	60 %	40 %	0 %	0 %	220930911
41	NC_011899	CAGGG	2	10	74127	74136	20 %	0 %	60 %	20 %	220930911
42	NC_011899	AAGAA	2	10	74943	74952	80 %	0 %	20 %	0 %	220930911
43	NC_011899	GGAGG	2	10	75039	75048	20 %	0 %	80 %	0 %	220930911
44	NC_011899	TCAGG	2	10	75280	75289	20 %	20 %	40 %	20 %	220930912
45	NC_011899	GAAGG	2	10	75746	75755	40 %	0 %	60 %	0 %	220930912
46	NC_011899	TTATT	2	10	76370	76379	20 %	80 %	0 %	0 %	220930913
47	NC_011899	CTTAT	2	10	76720	76729	20 %	60 %	0 %	20 %	220930913
48	NC_011899	TTATA	2	10	77954	77963	40 %	60 %	0 %	0 %	220930914
49	NC_011899	AGGAG	2	10	78702	78711	40 %	0 %	60 %	0 %	220930914
50	NC_011899	AAAGA	2	10	79878	79887	80 %	0 %	20 %	0 %	220930915
51	NC_011899	GGCCA	2	10	80555	80564	20 %	0 %	40 %	40 %	220930916
52	NC_011899	AGAAC	2	10	81762	81771	60 %	0 %	20 %	20 %	220930917
53	NC_011899	ATGTT	2	10	82349	82358	20 %	60 %	20 %	0 %	220930918
54	NC_011899	TTGGA	2	10	83504	83513	20 %	40 %	40 %	0 %	220930919
55	NC_011899	CCGGA	2	10	83992	84001	20 %	0 %	40 %	40 %	220930919
56	NC_011899	AAAAG	2	10	84841	84850	80 %	0 %	20 %	0 %	220930920
57	NC_011899	TTAAA	2	10	86570	86579	60 %	40 %	0 %	0 %	220930922
58	NC_011899	ATGAT	2	10	87623	87632	40 %	40 %	20 %	0 %	220930923
59	NC_011899	GTATG	2	10	88155	88164	20 %	40 %	40 %	0 %	220930923
60	NC_011899	TAAAG	2	10	89501	89510	60 %	20 %	20 %	0 %	220930925
61	NC_011899	GAAGA	2	10	90631	90640	60 %	0 %	40 %	0 %	220930926
62	NC_011899	TTACC	2	10	92301	92310	20 %	40 %	0 %	40 %	220930927
63	NC_011899	GTCTG	2	10	92803	92812	0 %	40 %	40 %	20 %	220930928
64	NC_011899	CCTGG	2	10	93173	93182	0 %	20 %	40 %	40 %	220930928
65	NC_011899	ATGAT	2	10	93283	93292	40 %	40 %	20 %	0 %	220930928
66	NC_011899	GATAT	2	10	93791	93800	40 %	40 %	20 %	0 %	220930929
67	NC_011899	AATTT	2	10	100954	100963	40 %	60 %	0 %	0 %	220930931
68	NC_011899	TTAAA	2	10	101170	101179	60 %	40 %	0 %	0 %	220930931
69	NC_011899	CCTCC	2	10	101937	101946	0 %	20 %	0 %	80 %	220930931
70	NC_011899	CAGAT	2	10	102195	102204	40 %	20 %	20 %	20 %	220930932
71	NC_011899	AAAAT	2	10	103368	103377	80 %	20 %	0 %	0 %	220930934
72	NC_011899	GAGAA	2	10	109410	109419	60 %	0 %	40 %	0 %	220930938
73	NC_011899	TTCTG	2	10	110944	110953	0 %	60 %	20 %	20 %	220930939
74	NC_011899	GATCA	2	10	113818	113827	40 %	20 %	20 %	20 %	220930943
75	NC_011899	CTGGG	2	10	114163	114172	0 %	20 %	60 %	20 %	220930943
76	NC_011899	ATTAT	2	10	117225	117234	40 %	60 %	0 %	0 %	220930946
77	NC_011899	CGGAC	2	10	118797	118806	20 %	0 %	40 %	40 %	220930948
78	NC_011899	TAATT	2	10	118876	118885	40 %	60 %	0 %	0 %	220930948
79	NC_011899	AAAAT	2	10	118887	118896	80 %	20 %	0 %	0 %	220930948
80	NC_011899	CCAGA	2	10	119521	119530	40 %	0 %	20 %	40 %	220930949
81	NC_011899	GGTAG	2	10	119876	119885	20 %	20 %	60 %	0 %	220930949
82	NC_011899	AGCCA	2	10	120067	120076	40 %	0 %	20 %	40 %	220930949
83	NC_011899	CTGAA	2	10	120881	120890	40 %	20 %	20 %	20 %	220930951
84	NC_011899	AAGAT	2	10	121167	121176	60 %	20 %	20 %	0 %	220930952
85	NC_011899	AATTG	2	10	121420	121429	40 %	40 %	20 %	0 %	220930952
86	NC_011899	AGGTA	2	10	122647	122656	40 %	20 %	40 %	0 %	220930954
87	NC_011899	ACCAG	2	10	125736	125745	40 %	0 %	20 %	40 %	220930957
88	NC_011899	GACCA	2	10	125799	125808	40 %	0 %	20 %	40 %	220930957
89	NC_011899	TGGAA	2	10	126359	126368	40 %	20 %	40 %	0 %	220930957
90	NC_011899	CCGGT	2	10	129806	129815	0 %	20 %	40 %	40 %	220930958
91	NC_011899	GTACT	2	10	130945	130954	20 %	40 %	20 %	20 %	220930958
92	NC_011899	CCAGA	2	10	135328	135337	40 %	0 %	20 %	40 %	220930963
93	NC_011899	GGTAG	2	10	135683	135692	20 %	20 %	60 %	0 %	220930963
94	NC_011899	AGCCA	2	10	135874	135883	40 %	0 %	20 %	40 %	220930963
95	NC_011899	CAGCT	2	10	137440	137449	20 %	20 %	20 %	40 %	220930966
96	NC_011899	ATTGT	2	10	137899	137908	20 %	60 %	20 %	0 %	220930966
97	NC_011899	GCAAG	2	10	139505	139514	40 %	0 %	40 %	20 %	220930970
98	NC_011899	ATGAT	2	10	139646	139655	40 %	40 %	20 %	0 %	220930970
99	NC_011899	CAGGC	2	10	143255	143264	20 %	0 %	40 %	40 %	220930979
100	NC_011899	CAGGT	2	10	145113	145122	20 %	20 %	40 %	20 %	220930983
101	NC_011899	TAAAG	2	10	146863	146872	60 %	20 %	20 %	0 %	220930985
102	NC_011899	ATATT	2	10	148072	148081	40 %	60 %	0 %	0 %	220930987
103	NC_011899	GGAAA	2	10	148605	148614	60 %	0 %	40 %	0 %	220930989
104	NC_011899	TTCTA	2	10	150131	150140	20 %	60 %	0 %	20 %	220930992
105	NC_011899	AAACA	2	10	159471	159480	80 %	0 %	0 %	20 %	220931004
106	NC_011899	TACCC	2	10	160556	160565	20 %	20 %	0 %	60 %	220931005
107	NC_011899	TAAGT	2	10	161214	161223	40 %	40 %	20 %	0 %	220931005
108	NC_011899	AATAA	2	10	162329	162338	80 %	20 %	0 %	0 %	220931006
109	NC_011899	ATAAG	2	10	166326	166335	60 %	20 %	20 %	0 %	220931008
110	NC_011899	TGAAA	2	10	167042	167051	60 %	20 %	20 %	0 %	220931009
111	NC_011899	GAAAA	2	10	169607	169616	80 %	0 %	20 %	0 %	220931012
112	NC_011899	ATGCT	2	10	172526	172535	20 %	40 %	20 %	20 %	220931016
113	NC_011899	CTGGT	2	10	172970	172979	0 %	40 %	40 %	20 %	220931016
114	NC_011899	GCCAG	2	10	174905	174914	20 %	0 %	40 %	40 %	220931018
115	NC_011899	AAAGA	2	10	178167	178176	80 %	0 %	20 %	0 %	220931021
116	NC_011899	AAGGT	2	10	180637	180646	40 %	20 %	40 %	0 %	220931025
117	NC_011899	AATGA	2	10	180852	180861	60 %	20 %	20 %	0 %	220931025
118	NC_011899	GTCCG	2	10	181395	181404	0 %	20 %	40 %	40 %	220931025
119	NC_011899	TAAAA	2	10	181771	181780	80 %	20 %	0 %	0 %	220931025
120	NC_011899	GAAAG	2	10	182767	182776	60 %	0 %	40 %	0 %	220931026
121	NC_011899	GGAGT	2	10	184065	184074	20 %	20 %	60 %	0 %	220931027
122	NC_011899	ATAAA	2	10	184233	184242	80 %	20 %	0 %	0 %	220931027
123	NC_011899	TATTT	2	10	185899	185908	20 %	80 %	0 %	0 %	220931029
124	NC_011899	CTGAC	2	10	188310	188319	20 %	20 %	20 %	40 %	220931030
125	NC_011899	GAATT	2	10	189225	189234	40 %	40 %	20 %	0 %	220931030
126	NC_011899	CATAG	2	10	190277	190286	40 %	20 %	20 %	20 %	220931032
127	NC_011899	CCAGG	2	10	190364	190373	20 %	0 %	40 %	40 %	220931032
128	NC_011899	ATATA	2	10	192096	192105	60 %	40 %	0 %	0 %	220931034
129	NC_011899	ATTTT	2	10	192461	192470	20 %	80 %	0 %	0 %	220931034
130	NC_011899	CACCC	2	10	193836	193845	20 %	0 %	0 %	80 %	220931036
131	NC_011899	AAAAC	2	10	197541	197550	80 %	0 %	0 %	20 %	220931040
132	NC_011899	ATCCT	2	10	197687	197696	20 %	40 %	0 %	40 %	220931040
133	NC_011899	GCTAT	2	10	197785	197794	20 %	40 %	20 %	20 %	220931040
134	NC_011899	GCAGG	2	10	197868	197877	20 %	0 %	60 %	20 %	220931040
135	NC_011899	AAATT	2	10	198681	198690	60 %	40 %	0 %	0 %	220931041
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