MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halothermothrix orenii H 168 chromosome

Total Repeats: 7495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011899	TTTA	2	8	87	94	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011899	ACAT	2	8	202	209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011899	ATTT	2	8	226	233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011899	TATT	2	8	279	286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011899	CTGG	2	8	760	767	0 %	25 %	50 %	25 %	220930851
6	NC_011899	AAAT	2	8	1231	1238	75 %	25 %	0 %	0 %	220930851
7	NC_011899	AAAG	2	8	1289	1296	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
8	NC_011899	GAAA	2	8	1378	1385	75 %	0 %	25 %	0 %	220930851
9	NC_011899	ATTA	2	8	1579	1586	50 %	50 %	0 %	0 %	220930851
10	NC_011899	GATA	2	8	1942	1949	50 %	25 %	25 %	0 %	220930851
11	NC_011899	TAAA	3	12	2262	2273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011899	CCAG	2	8	2542	2549	25 %	0 %	25 %	50 %	220930852
13	NC_011899	ATAC	2	8	2852	2859	50 %	25 %	0 %	25 %	220930852
14	NC_011899	GAAA	2	8	2903	2910	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
15	NC_011899	AGAA	2	8	3383	3390	75 %	0 %	25 %	0 %	220930852
16	NC_011899	TTTA	2	8	3403	3410	25 %	75 %	0 %	0 %	220930852
17	NC_011899	CAGG	2	8	3550	3557	25 %	0 %	50 %	25 %	220930853
18	NC_011899	TATT	2	8	3684	3691	25 %	75 %	0 %	0 %	220930854
19	NC_011899	ATGG	2	8	5200	5207	25 %	25 %	50 %	0 %	220930856
20	NC_011899	GGAA	2	8	6057	6064	50 %	0 %	50 %	0 %	220930856
21	NC_011899	CCTT	2	8	6185	6192	0 %	50 %	0 %	50 %	220930856
22	NC_011899	ATAA	2	8	6559	6566	75 %	25 %	0 %	0 %	220930856
23	NC_011899	ATTA	2	8	7016	7023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011899	ATTT	2	8	7068	7075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011899	GGAT	2	8	7253	7260	25 %	25 %	50 %	0 %	220930857
26	NC_011899	CGGG	2	8	7844	7851	0 %	0 %	75 %	25 %	220930857
27	NC_011899	ATCT	2	8	9745	9752	25 %	50 %	0 %	25 %	220930858
28	NC_011899	ATAG	2	8	10282	10289	50 %	25 %	25 %	0 %	220930859
29	NC_011899	GCCT	2	8	10487	10494	0 %	25 %	25 %	50 %	220930859
30	NC_011899	TAAA	2	8	10573	10580	75 %	25 %	0 %	0 %	220930859
31	NC_011899	AATA	2	8	10774	10781	75 %	25 %	0 %	0 %	220930859
32	NC_011899	GACT	2	8	10813	10820	25 %	25 %	25 %	25 %	220930859
33	NC_011899	TAAA	2	8	10938	10945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011899	ATAA	2	8	11816	11823	75 %	25 %	0 %	0 %	220930860
35	NC_011899	GTTT	2	8	11983	11990	0 %	75 %	25 %	0 %	220930860
36	NC_011899	TACT	2	8	12971	12978	25 %	50 %	0 %	25 %	220930861
37	NC_011899	TTAA	2	8	13248	13255	50 %	50 %	0 %	0 %	220930861
38	NC_011899	ATTT	2	8	13555	13562	25 %	75 %	0 %	0 %	220930861
39	NC_011899	TAGT	2	8	14232	14239	25 %	50 %	25 %	0 %	220930862
40	NC_011899	AGGG	2	8	14575	14582	25 %	0 %	75 %	0 %	220930862
41	NC_011899	GACT	2	8	14701	14708	25 %	25 %	25 %	25 %	220930862
42	NC_011899	ATAA	2	8	14870	14877	75 %	25 %	0 %	0 %	220930862
43	NC_011899	GTAT	2	8	15072	15079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011899	AATA	2	8	15307	15314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011899	AGAC	2	8	15577	15584	50 %	0 %	25 %	25 %	220930863
46	NC_011899	TTCA	2	8	15767	15774	25 %	50 %	0 %	25 %	220930864
47	NC_011899	ACCA	2	8	16331	16338	50 %	0 %	0 %	50 %	220930864
48	NC_011899	ACCT	2	8	16724	16731	25 %	25 %	0 %	50 %	220930864
49	NC_011899	CACC	2	8	16844	16851	25 %	0 %	0 %	75 %	220930864
50	NC_011899	CTTT	2	8	17002	17009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011899	ATAG	2	8	17212	17219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011899	CAGA	2	8	17341	17348	50 %	0 %	25 %	25 %	220930865
53	NC_011899	ACCA	2	8	17475	17482	50 %	0 %	0 %	50 %	220930865
54	NC_011899	AAAG	2	8	17633	17640	75 %	0 %	25 %	0 %	220930865
55	NC_011899	TGAT	2	8	17678	17685	25 %	50 %	25 %	0 %	220930865
56	NC_011899	GACA	2	8	17907	17914	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011899	GGTT	2	8	18279	18286	0 %	50 %	50 %	0 %	220930866
58	NC_011899	AATT	2	8	18395	18402	50 %	50 %	0 %	0 %	220930866
59	NC_011899	AAAG	2	8	18462	18469	75 %	0 %	25 %	0 %	220930866
60	NC_011899	TTTA	2	8	18660	18667	25 %	75 %	0 %	0 %	220930867
61	NC_011899	TTTA	2	8	18724	18731	25 %	75 %	0 %	0 %	220930867
62	NC_011899	GGTT	2	8	19036	19043	0 %	50 %	50 %	0 %	220930867
63	NC_011899	AGAT	2	8	19571	19578	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011899	GCCC	2	8	19891	19898	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_011899	GGTA	2	8	21538	21545	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011899	CATT	2	8	22709	22716	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011899	GTGA	2	8	23643	23650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011899	CCAG	2	8	24860	24867	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011899	TCCC	2	8	25329	25336	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_011899	AAGG	2	8	25646	25653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011899	TTTA	2	8	26063	26070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011899	TTTA	2	8	26115	26122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011899	ACTA	2	8	26184	26191	50 %	25 %	0 %	25 %	220930868
74	NC_011899	TGGT	2	8	26396	26403	0 %	50 %	50 %	0 %	220930868
75	NC_011899	CTGG	2	8	26653	26660	0 %	25 %	50 %	25 %	220930868
76	NC_011899	ATTA	2	8	27102	27109	50 %	50 %	0 %	0 %	220930868
77	NC_011899	CGGT	2	8	27125	27132	0 %	25 %	50 %	25 %	220930868
78	NC_011899	AACC	2	8	28007	28014	50 %	0 %	0 %	50 %	220930869
79	NC_011899	TAAA	2	8	28454	28461	75 %	25 %	0 %	0 %	220930869
80	NC_011899	CAAC	2	8	29066	29073	50 %	0 %	0 %	50 %	220930870
81	NC_011899	GAAA	2	8	29333	29340	75 %	0 %	25 %	0 %	220930870
82	NC_011899	ATTC	2	8	29517	29524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011899	GAAT	2	8	30018	30025	50 %	25 %	25 %	0 %	220930871
84	NC_011899	ATTT	2	8	30710	30717	25 %	75 %	0 %	0 %	220930873
85	NC_011899	ATGT	2	8	31395	31402	25 %	50 %	25 %	0 %	220930874
86	NC_011899	AGAA	2	8	31463	31470	75 %	0 %	25 %	0 %	220930874
87	NC_011899	AAAT	2	8	31758	31765	75 %	25 %	0 %	0 %	220930874
88	NC_011899	AACA	2	8	31984	31991	75 %	0 %	0 %	25 %	220930875
89	NC_011899	TTAA	2	8	32111	32118	50 %	50 %	0 %	0 %	220930875
90	NC_011899	TAAA	2	8	32166	32173	75 %	25 %	0 %	0 %	220930875
91	NC_011899	TTTA	2	8	33482	33489	25 %	75 %	0 %	0 %	220930876
92	NC_011899	AAGA	2	8	33825	33832	75 %	0 %	25 %	0 %	220930876
93	NC_011899	AATC	2	8	34075	34082	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011899	GGTT	2	8	34090	34097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011899	TTGA	2	8	34923	34930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011899	ACTT	2	8	35194	35201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011899	TAAA	2	8	35479	35486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011899	TGAT	2	8	36378	36385	25 %	50 %	25 %	0 %	220930878
99	NC_011899	GCCA	2	8	36461	36468	25 %	0 %	25 %	50 %	220930878
100	NC_011899	GAAA	3	12	36709	36720	75 %	0 %	25 %	0 %	220930878
101	NC_011899	AATG	2	8	36945	36952	50 %	25 %	25 %	0 %	220930879
102	NC_011899	AAAG	2	8	37047	37054	75 %	0 %	25 %	0 %	220930879
103	NC_011899	GAAA	2	8	37453	37460	75 %	0 %	25 %	0 %	220930879
104	NC_011899	GGAT	2	8	37483	37490	25 %	25 %	50 %	0 %	220930879
105	NC_011899	GATG	2	8	37598	37605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011899	TTGC	2	8	37779	37786	0 %	50 %	25 %	25 %	220930880
107	NC_011899	TAAT	2	8	37792	37799	50 %	50 %	0 %	0 %	220930880
108	NC_011899	TGCA	2	8	38441	38448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011899	GAAA	2	8	38853	38860	75 %	0 %	25 %	0 %	220930882
110	NC_011899	TTGT	2	8	39095	39102	0 %	75 %	25 %	0 %	220930882
111	NC_011899	AATT	2	8	39339	39346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011899	GTGG	2	8	40197	40204	0 %	25 %	75 %	0 %	220930883
113	NC_011899	ATTA	2	8	40330	40337	50 %	50 %	0 %	0 %	220930883
114	NC_011899	TATT	2	8	40639	40646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011899	AATT	2	8	40867	40874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011899	TAAA	2	8	41171	41178	75 %	25 %	0 %	0 %	220930884
117	NC_011899	TTTA	2	8	41342	41349	25 %	75 %	0 %	0 %	220930884
118	NC_011899	TGTT	2	8	41355	41362	0 %	75 %	25 %	0 %	220930884
119	NC_011899	AAAT	2	8	42413	42420	75 %	25 %	0 %	0 %	220930886
120	NC_011899	ATGG	2	8	43562	43569	25 %	25 %	50 %	0 %	220930886
121	NC_011899	CAAT	2	8	43573	43580	50 %	25 %	0 %	25 %	220930886
122	NC_011899	AATA	2	8	43668	43675	75 %	25 %	0 %	0 %	220930886
123	NC_011899	TATT	2	8	43938	43945	25 %	75 %	0 %	0 %	220930887
124	NC_011899	TTAA	2	8	44145	44152	50 %	50 %	0 %	0 %	220930887
125	NC_011899	GAAA	2	8	44881	44888	75 %	0 %	25 %	0 %	220930887
126	NC_011899	AATC	2	8	44899	44906	50 %	25 %	0 %	25 %	220930888
127	NC_011899	CTAC	2	8	45165	45172	25 %	25 %	0 %	50 %	220930888
128	NC_011899	CAGT	2	8	45370	45377	25 %	25 %	25 %	25 %	220930888
129	NC_011899	ATTT	2	8	46375	46382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011899	TTTA	2	8	46507	46514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011899	AAAG	2	8	46958	46965	75 %	0 %	25 %	0 %	220930889
132	NC_011899	GAAA	2	8	48391	48398	75 %	0 %	25 %	0 %	220930890
133	NC_011899	CGGG	2	8	48439	48446	0 %	0 %	75 %	25 %	220930890
134	NC_011899	GATA	2	8	48586	48593	50 %	25 %	25 %	0 %	220930890
135	NC_011899	TCCT	2	8	48756	48763	0 %	50 %	0 %	50 %	220930890
136	NC_011899	TGGA	2	8	48825	48832	25 %	25 %	50 %	0 %	220930890
137	NC_011899	AAAG	2	8	49333	49340	75 %	0 %	25 %	0 %	220930890
138	NC_011899	GGCA	2	8	49761	49768	25 %	0 %	50 %	25 %	220930890
139	NC_011899	TGGA	2	8	50166	50173	25 %	25 %	50 %	0 %	220930891
140	NC_011899	CTTG	2	8	50794	50801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011899	AAAT	2	8	50816	50823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011899	AGAA	2	8	51095	51102	75 %	0 %	25 %	0 %	220930892
143	NC_011899	TGGT	2	8	51360	51367	0 %	50 %	50 %	0 %	220930892
144	NC_011899	TACC	2	8	51459	51466	25 %	25 %	0 %	50 %	220930892
145	NC_011899	AATT	2	8	51636	51643	50 %	50 %	0 %	0 %	220930892
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