MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	TAAAAG	2	12	45610	45621	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011898	ATATTA	2	12	82580	82591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011898	TGATAA	2	12	88730	88741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011898	ATATTA	2	12	162283	162294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011898	AGCATA	2	12	174261	174272	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011898	AGCTTT	2	12	204405	204416	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011898	AAAGAC	2	12	205912	205923	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011898	ATTCCT	2	12	207838	207849	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011898	AATAAC	2	12	298944	298955	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011898	ACATTA	2	12	301872	301883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011898	TCATAT	2	12	327749	327760	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011898	CTAGTT	2	12	348116	348127	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011898	ATTCCT	2	12	385383	385394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011898	ATTTTT	2	12	400473	400484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011898	ATGGTT	2	12	418505	418516	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011898	CATCCA	2	12	461628	461639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011898	CATTTT	2	12	475462	475473	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011898	ATACAT	2	12	475515	475526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011898	TAAAAA	2	12	496629	496640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011898	CCATAT	2	12	497047	497058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011898	CCATAT	2	12	497062	497073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011898	AATTGA	2	12	657071	657082	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011898	AAATTA	2	12	661492	661503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011898	GCGTTT	2	12	661550	661561	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011898	TGTTAT	2	12	706103	706114	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011898	TTGTAT	2	12	706220	706231	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011898	TACATA	2	12	729219	729230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011898	ACTTTT	2	12	738388	738399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011898	TGGATA	2	12	744561	744572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011898	ATTCCT	2	12	796217	796228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011898	ATTAAA	2	12	809702	809713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011898	TAATTT	2	12	821962	821973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011898	ATTGAT	2	12	831121	831132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011898	ATATCA	2	12	854838	854849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011898	AATTGA	2	12	890111	890122	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011898	AGTTTA	2	12	897401	897412	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011898	TAAGTA	2	12	935134	935145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011898	AAAAAT	2	12	1090310	1090321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011898	TTAAAA	2	12	1106619	1106630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011898	AACAAA	2	12	1106699	1106710	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011898	TACTTT	2	12	1115954	1115965	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011898	GATAGT	2	12	1122087	1122098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011898	ATAAAA	2	12	1128205	1128216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011898	ATTTAA	2	12	1140326	1140337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011898	AATATT	2	12	1142195	1142206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011898	AAATAA	2	12	1143701	1143712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011898	CAAAAA	2	12	1225180	1225191	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011898	TTTTTG	2	12	1239754	1239765	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011898	AAATGC	2	12	1262053	1262064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011898	TTTCAG	2	12	1266109	1266120	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011898	AGGGAA	2	12	1273309	1273320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011898	TTATAG	2	12	1321063	1321074	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011898	AAATGT	2	12	1340214	1340225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011898	AATTAT	2	12	1343573	1343584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011898	AATAAA	2	12	1355326	1355337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011898	TACCAA	2	12	1505194	1505205	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011898	CCTACA	2	12	1531583	1531594	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011898	TTCTTT	2	12	1548815	1548826	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011898	AAATAT	2	12	1604740	1604751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011898	ATTGTA	2	12	1635344	1635355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011898	ATGTAT	2	12	1639450	1639461	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011898	AATATA	2	12	1644749	1644760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011898	ATTATG	2	12	1849276	1849287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011898	ATAGAA	2	12	1856798	1856809	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011898	AATTTT	2	12	1902629	1902640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011898	TAGCGT	2	12	1920415	1920426	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011898	TAGCGT	2	12	1927728	1927739	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011898	TAGCGT	2	12	1935041	1935052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011898	TATAAT	2	12	1935669	1935680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011898	AATGTT	2	12	1950200	1950211	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011898	TATTTT	2	12	2037824	2037835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011898	TTTTCA	2	12	2148487	2148498	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011898	ATATTA	2	12	2163613	2163624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011898	TAATTC	2	12	2176603	2176614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_011898	TGAATT	2	12	2179621	2179632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011898	GTATAT	2	12	2185132	2185143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011898	TACATA	2	12	2191044	2191055	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011898	AAAACC	2	12	2201268	2201279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011898	ATTTTA	2	12	2208783	2208794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011898	TTCATG	2	12	2217597	2217608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_011898	TATTTT	2	12	2246714	2246725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011898	ATCATA	2	12	2252222	2252233	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_011898	ATTGAT	2	12	2263428	2263439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011898	ATAAAT	2	12	2275119	2275130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011898	TAAACA	2	12	2294251	2294262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011898	AGTTAC	2	12	2336739	2336750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_011898	AAATAT	2	12	2438221	2438232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011898	TTTAAA	2	12	2442800	2442811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011898	ATTGGG	2	12	2459924	2459935	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011898	ACCCGA	2	12	2494793	2494804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011898	TAAATG	2	12	2507689	2507700	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011898	CTTCCT	2	12	2509491	2509502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011898	TTGCTT	2	12	2509621	2509632	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011898	ATAGGT	2	12	2520858	2520869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011898	GTTTCC	2	12	2521224	2521235	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011898	ATATTT	2	12	2521719	2521730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011898	TCATAT	2	12	2522206	2522217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011898	TGTTTT	2	12	2524643	2524654	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011898	TATATT	2	12	2534809	2534820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011898	GTTAAT	2	12	2534823	2534834	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011898	AAAATT	2	12	2543179	2543190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011898	TTGTAA	2	12	2560762	2560773	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011898	GAGCAA	2	12	2573586	2573597	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011898	TAAAAA	2	12	2582758	2582769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011898	TTTAAC	2	12	2597150	2597161	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011898	TTTATA	2	12	2598133	2598144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011898	TAAACA	2	12	2617940	2617951	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011898	TAAAAA	2	12	2617952	2617963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011898	TATATT	2	12	2634782	2634793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011898	TAAGTA	2	12	2657178	2657189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011898	CATTTT	2	12	2663961	2663972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011898	CCAATA	2	12	2700050	2700061	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011898	TATTGT	2	12	2702038	2702049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011898	TTTATA	2	12	2702071	2702082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011898	TTTTAT	2	12	2743577	2743588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011898	CTAATA	2	12	2763644	2763655	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_011898	TATTTA	2	12	2867549	2867560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011898	ATTTCC	2	12	2881841	2881852	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011898	ATTTGC	2	12	2916386	2916397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_011898	CAAAAC	2	12	2940917	2940928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011898	TTTACA	2	12	2950078	2950089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_011898	ATTAAA	2	12	2974848	2974859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011898	TAATTA	2	12	2980371	2980382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011898	GATATA	2	12	2985953	2985964	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011898	TATAAA	2	12	3017694	3017705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011898	TCTAAA	2	12	3083650	3083661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011898	TAATAT	2	12	3123630	3123641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011898	TACAAA	2	12	3124687	3124698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011898	AATGTT	2	12	3125990	3126001	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011898	TAATAT	2	12	3136517	3136528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011898	TTTACA	2	12	3152505	3152516	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_011898	ATTATA	2	12	3510169	3510180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.