MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 1271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	GGAAAC	2	12	369	380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220927460
2	NC_011898	GGAAAA	2	12	1957	1968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927461
3	NC_011898	ATACAA	2	12	2995	3006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	220927463
4	NC_011898	GCTGAT	2	12	5942	5953	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220927465
5	NC_011898	TATTGA	2	12	6746	6757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220927466
6	NC_011898	TTTTAT	2	12	8491	8502	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	220927468
7	NC_011898	CTAAAA	2	12	8552	8563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	220927468
8	NC_011898	TAAAAA	2	12	9536	9547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	220927469
9	NC_011898	TGCAGC	2	12	12191	12202	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220927472
10	NC_011898	TAAAAA	2	12	17279	17290	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	220927476
11	NC_011898	TCGGTA	2	12	18803	18814	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220927477
12	NC_011898	GTGGTT	2	12	19736	19747	0 %	50 %	50 %	0 %	220927477
13	NC_011898	AGGCAG	2	12	25183	25194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220927483
14	NC_011898	GTGAAA	2	12	25513	25524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927483
15	NC_011898	ACCTTA	2	12	28958	28969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927487
16	NC_011898	GGTAAA	2	12	29401	29412	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927487
17	NC_011898	GGAGAA	2	12	29887	29898	50 %	0 %	50 %	0 %	220927487
18	NC_011898	TGAAAT	2	12	32246	32257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927489
19	NC_011898	AAAACA	2	12	36110	36121	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	220927492
20	NC_011898	TTTATT	2	12	37927	37938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	220927494
21	NC_011898	GCTTTA	2	12	41226	41237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220927498
22	NC_011898	TGAAAT	2	12	43366	43377	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927499
23	NC_011898	ACCTGA	2	12	48873	48884	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220927504
24	NC_011898	TGGCAA	2	12	55361	55372	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220927509
25	NC_011898	TGAAAA	2	12	56033	56044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220927510
26	NC_011898	AAATCC	2	12	56967	56978	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	220927510
27	NC_011898	GGATGA	2	12	64694	64705	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	220927515
28	NC_011898	ATGAGA	2	12	65082	65093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927516
29	NC_011898	AAAATT	2	12	66243	66254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927518
30	NC_011898	GAATCA	2	12	72341	72352	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927524
31	NC_011898	GAAACA	2	12	75620	75631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220927525
32	NC_011898	TTGATT	2	12	87086	87097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220927531
33	NC_011898	ATGAGA	2	12	90319	90330	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927534
34	NC_011898	GAGTTT	2	12	91658	91669	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220927536
35	NC_011898	ATTGAT	2	12	92738	92749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220927537
36	NC_011898	TTATTG	2	12	93893	93904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220927539
37	NC_011898	GGAAGC	2	12	95501	95512	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220927540
38	NC_011898	AAAAGA	2	12	98608	98619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	220927542
39	NC_011898	CATCTG	2	12	99688	99699	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220927544
40	NC_011898	GGAGGC	2	12	99855	99866	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220927544
41	NC_011898	ATGGTA	2	12	102208	102219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927546
42	NC_011898	ATGCCT	2	12	102496	102507	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220927546
43	NC_011898	TTATTG	2	12	103620	103631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220927547
44	NC_011898	GGTATG	2	12	110094	110105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220927553
45	NC_011898	GAGTAT	2	12	126582	126593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927569
46	NC_011898	ATGTTT	2	12	126626	126637	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220927569
47	NC_011898	TTTTTG	2	12	131389	131400	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	220927573
48	NC_011898	TCAAAT	2	12	132116	132127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	220927574
49	NC_011898	GAAAAA	2	12	132328	132339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	220927574
50	NC_011898	TACAGG	2	12	138530	138541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220927583
51	NC_011898	AATGAC	2	12	140807	140818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927585
52	NC_011898	GGAAAT	2	12	146032	146043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927590
53	NC_011898	GGTGCT	2	12	154116	154127	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220927597
54	NC_011898	TTACAG	2	12	155474	155485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220927598
55	NC_011898	AATGTT	2	12	158427	158438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220927600
56	NC_011898	TAGGGC	2	12	158834	158845	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220927600
57	NC_011898	ATATGA	2	12	159434	159445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927600
58	NC_011898	TAAATG	2	12	170392	170403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927607
59	NC_011898	AATATC	2	12	170505	170516	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	220927607
60	NC_011898	AAGTAA	2	12	171330	171341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220927608
61	NC_011898	AACAGC	2	12	172652	172663	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220927609
62	NC_011898	AAAGCA	2	12	174411	174422	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220927610
63	NC_011898	AAGTAT	2	12	178462	178473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927613
64	NC_011898	CTTGGT	2	12	188668	188679	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220927624
65	NC_011898	TATTTC	2	12	191652	191663	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220927628
66	NC_011898	GAAAAG	2	12	196316	196327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927632
67	NC_011898	CATACA	2	12	198057	198068	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	220927634
68	NC_011898	TTCAAA	2	12	204584	204595	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	220927640
69	NC_011898	ATTTTC	2	12	209277	209288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220927643
70	NC_011898	TAAAAT	2	12	213108	213119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927647
71	NC_011898	GCACTT	2	12	217191	217202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220927652
72	NC_011898	GGAAAC	2	12	222126	222137	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220927656
73	NC_011898	AAAGGC	2	12	236684	236695	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220927667
74	NC_011898	ACGAAG	2	12	242406	242417	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220927672
75	NC_011898	TTACTG	2	12	248467	248478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220927677
76	NC_011898	AGTTAT	2	12	267724	267735	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220927696
77	NC_011898	TCAAAA	2	12	268101	268112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	220927697
78	NC_011898	CAAAGC	2	12	268840	268851	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220927697
79	NC_011898	AAAATA	2	12	274018	274029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	220927703
80	NC_011898	ATAAGA	2	12	279756	279767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220927709
81	NC_011898	GGAGGC	2	12	281198	281209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220927709
82	NC_011898	GATATG	2	12	284732	284743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927712
83	NC_011898	ATAAGG	2	12	286048	286059	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927713
84	NC_011898	TGACAA	2	12	288570	288581	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927716
85	NC_011898	TGTTGA	2	12	289690	289701	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220927718
86	NC_011898	AATAGC	2	12	295963	295974	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927725
87	NC_011898	TTGTTT	2	12	296422	296433	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	220927726
88	NC_011898	GCAGTA	2	12	297246	297257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220927727
89	NC_011898	TAATGA	2	12	303129	303140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927732
90	NC_011898	TGGCTT	2	12	304052	304063	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220927732
91	NC_011898	ATTGGT	2	12	305849	305860	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220927733
92	NC_011898	TATACT	2	12	308001	308012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	220927734
93	NC_011898	TTGCAC	2	12	315120	315131	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220927735
94	NC_011898	GCTTCT	2	12	316255	316266	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220927736
95	NC_011898	TTATGG	2	12	320150	320161	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220927739
96	NC_011898	ACACCA	2	12	320659	320670	50 %	0 %	0 %	50 %	220927740
97	NC_011898	ATATAA	2	12	322875	322886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927742
98	NC_011898	TGATCT	2	12	324272	324283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220927743
99	NC_011898	ACTTGT	2	12	324605	324616	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220927743
100	NC_011898	GTAACA	2	12	330826	330837	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927747
101	NC_011898	TATCAG	2	12	330859	330870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220927747
102	NC_011898	AGACAC	2	12	335300	335311	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220927749
103	NC_011898	TTATAA	2	12	341565	341576	50 %	50 %	0 %	0 %	220927754
104	NC_011898	AAATTT	2	12	342118	342129	50 %	50 %	0 %	0 %	220927755
105	NC_011898	TAGCAA	2	12	342188	342199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220927755
106	NC_011898	TTCAAT	2	12	352800	352811	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	220927762
107	NC_011898	GAATTG	2	12	354675	354686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927765
108	NC_011898	GATATA	2	12	359115	359126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927770
109	NC_011898	TTGACG	2	12	365424	365435	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220927772
110	NC_011898	GCAGGA	2	12	366880	366891	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220927775
111	NC_011898	GTTGAA	2	12	366986	366997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927775
112	NC_011898	GGCTAA	2	12	368926	368937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220927776
113	NC_011898	AAATAG	2	12	371397	371408	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	220927778
114	NC_011898	GGACTT	2	12	374441	374452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220927781
115	NC_011898	CTGTTG	2	12	375156	375167	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220927781
116	NC_011898	GATATA	2	12	377400	377411	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	220927784
117	NC_011898	ATTTAT	2	12	379187	379198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927785
118	NC_011898	TATTGA	2	12	381176	381187	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	220927786
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346	NC_011898	GTAAAG	2	12	1099986	1099997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220928360
347	NC_011898	GCACTG	2	12	1104404	1104415	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220928366
348	NC_011898	CAATGG	2	12	1104780	1104791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220928367
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452	NC_011898	ATATTT	2	12	1457113	1457124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220928619
453	NC_011898	TATTAA	2	12	1458701	1458712	50 %	50 %	0 %	0 %	220928620
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