MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 3134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	ATGTT	2	10	1756	1765	20 %	60 %	20 %	0 %	220927461
2	NC_011898	TGTTT	2	10	3299	3308	0 %	80 %	20 %	0 %	220927463
3	NC_011898	AGGGA	2	10	5757	5766	40 %	0 %	60 %	0 %	220927465
4	NC_011898	TCCAA	2	10	7076	7085	40 %	20 %	0 %	40 %	220927466
5	NC_011898	TAAAA	2	10	9842	9851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011898	TCAAA	2	10	10666	10675	60 %	20 %	0 %	20 %	220927470
7	NC_011898	AACAA	2	10	13238	13247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011898	ATACT	2	10	15015	15024	40 %	40 %	0 %	20 %	220927475
9	NC_011898	ATGAA	2	10	16623	16632	60 %	20 %	20 %	0 %	220927475
10	NC_011898	AACAA	2	10	20920	20929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011898	CATAA	2	10	21022	21031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011898	TTTGA	2	10	21897	21906	20 %	60 %	20 %	0 %	220927480
13	NC_011898	TAATT	2	10	22776	22785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011898	AAGAC	2	10	22940	22949	60 %	0 %	20 %	20 %	220927481
15	NC_011898	CGGAG	2	10	25898	25907	20 %	0 %	60 %	20 %	220927483
16	NC_011898	ATTTT	2	10	26205	26214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011898	AGAAA	2	10	27795	27804	80 %	0 %	20 %	0 %	220927486
18	NC_011898	TATAT	2	10	30523	30532	40 %	60 %	0 %	0 %	220927488
19	NC_011898	TTTAT	2	10	30748	30757	20 %	80 %	0 %	0 %	220927488
20	NC_011898	TATAA	2	10	31732	31741	60 %	40 %	0 %	0 %	220927488
21	NC_011898	ATTTT	2	10	31775	31784	20 %	80 %	0 %	0 %	220927488
22	NC_011898	AAAAT	2	10	32413	32422	80 %	20 %	0 %	0 %	220927489
23	NC_011898	TATTT	2	10	36742	36751	20 %	80 %	0 %	0 %	220927493
24	NC_011898	TAAAG	2	10	40943	40952	60 %	20 %	20 %	0 %	220927497
25	NC_011898	AGAGG	2	10	41784	41793	40 %	0 %	60 %	0 %	220927498
26	NC_011898	ATATT	2	10	42319	42328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011898	TGCAA	2	10	43801	43810	40 %	20 %	20 %	20 %	220927500
28	NC_011898	CTGAC	2	10	44571	44580	20 %	20 %	20 %	40 %	220927501
29	NC_011898	TGCTT	2	10	46108	46117	0 %	60 %	20 %	20 %	220927502
30	NC_011898	TTTCT	2	10	46425	46434	0 %	80 %	0 %	20 %	220927503
31	NC_011898	TCCAA	2	10	46540	46549	40 %	20 %	0 %	40 %	220927503
32	NC_011898	CATTC	2	10	46599	46608	20 %	40 %	0 %	40 %	220927503
33	NC_011898	GAATA	2	10	50716	50725	60 %	20 %	20 %	0 %	220927506
34	NC_011898	CAACC	2	10	50758	50767	40 %	0 %	0 %	60 %	220927506
35	NC_011898	TAAAG	2	10	52533	52542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011898	TTTTA	2	10	52928	52937	20 %	80 %	0 %	0 %	220927508
37	NC_011898	AAATA	2	10	55730	55739	80 %	20 %	0 %	0 %	220927509
38	NC_011898	ACATA	2	10	56461	56470	60 %	20 %	0 %	20 %	220927510
39	NC_011898	TAATG	2	10	56894	56903	40 %	40 %	20 %	0 %	220927510
40	NC_011898	AAATA	2	10	58345	58354	80 %	20 %	0 %	0 %	220927511
41	NC_011898	CCTGT	2	10	58647	58656	0 %	40 %	20 %	40 %	220927511
42	NC_011898	TTGAA	2	10	58959	58968	40 %	40 %	20 %	0 %	220927511
43	NC_011898	CAAGA	2	10	59346	59355	60 %	0 %	20 %	20 %	220927511
44	NC_011898	TCAGC	2	10	64096	64105	20 %	20 %	20 %	40 %	220927514
45	NC_011898	ATTTT	2	10	67841	67850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011898	ACGAT	2	10	69125	69134	40 %	20 %	20 %	20 %	220927521
47	NC_011898	CAGCT	2	10	73620	73629	20 %	20 %	20 %	40 %	220927524
48	NC_011898	AAAGA	2	10	78125	78134	80 %	0 %	20 %	0 %	220927526
49	NC_011898	TGATA	2	10	79738	79747	40 %	40 %	20 %	0 %	220927527
50	NC_011898	AATAC	2	10	80101	80110	60 %	20 %	0 %	20 %	220927527
51	NC_011898	GATAC	2	10	81086	81095	40 %	20 %	20 %	20 %	220927528
52	NC_011898	AAGAA	2	10	84939	84948	80 %	0 %	20 %	0 %	220927531
53	NC_011898	ATATT	2	10	85787	85796	40 %	60 %	0 %	0 %	220927531
54	NC_011898	AAAAT	2	10	85817	85826	80 %	20 %	0 %	0 %	220927531
55	NC_011898	GTTTT	2	10	87490	87499	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011898	AACTA	2	10	90033	90042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011898	GAAAG	2	10	91717	91726	60 %	0 %	40 %	0 %	220927536
58	NC_011898	AATAA	2	10	92156	92165	80 %	20 %	0 %	0 %	220927537
59	NC_011898	TATTT	2	10	93435	93444	20 %	80 %	0 %	0 %	220927539
60	NC_011898	AGCCC	2	10	96020	96029	20 %	0 %	20 %	60 %	220927541
61	NC_011898	GGAAT	2	10	97653	97662	40 %	20 %	40 %	0 %	220927542
62	NC_011898	AAATA	2	10	98540	98549	80 %	20 %	0 %	0 %	220927542
63	NC_011898	GGACT	2	10	99122	99131	20 %	20 %	40 %	20 %	220927543
64	NC_011898	TAATA	2	10	99249	99258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011898	TGTAT	2	10	100218	100227	20 %	60 %	20 %	0 %	220927544
66	NC_011898	AAAAG	2	10	101216	101225	80 %	0 %	20 %	0 %	220927544
67	NC_011898	AAGAA	2	10	103230	103239	80 %	0 %	20 %	0 %	220927546
68	NC_011898	TCAGG	2	10	103890	103899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011898	GATTT	2	10	104064	104073	20 %	60 %	20 %	0 %	220927548
70	NC_011898	GGTTT	2	10	104670	104679	0 %	60 %	40 %	0 %	220927548
71	NC_011898	ATGAA	2	10	105810	105819	60 %	20 %	20 %	0 %	220927548
72	NC_011898	AAAGA	2	10	106923	106932	80 %	0 %	20 %	0 %	220927549
73	NC_011898	GGCAG	2	10	106961	106970	20 %	0 %	60 %	20 %	220927549
74	NC_011898	TATAA	2	10	109785	109794	60 %	40 %	0 %	0 %	220927553
75	NC_011898	GCAAT	2	10	110743	110752	40 %	20 %	20 %	20 %	220927553
76	NC_011898	AGGTA	2	10	110873	110882	40 %	20 %	40 %	0 %	220927553
77	NC_011898	TGAAA	2	10	110914	110923	60 %	20 %	20 %	0 %	220927554
78	NC_011898	ACAGA	2	10	113273	113282	60 %	0 %	20 %	20 %	220927555
79	NC_011898	TCAGA	2	10	115181	115190	40 %	20 %	20 %	20 %	220927559
80	NC_011898	AATAT	2	10	115654	115663	60 %	40 %	0 %	0 %	220927559
81	NC_011898	AAATG	2	10	115733	115742	60 %	20 %	20 %	0 %	220927559
82	NC_011898	TCAGA	2	10	116229	116238	40 %	20 %	20 %	20 %	220927560
83	NC_011898	AAATG	2	10	116781	116790	60 %	20 %	20 %	0 %	220927560
84	NC_011898	TCAGA	2	10	117335	117344	40 %	20 %	20 %	20 %	220927561
85	NC_011898	AAATG	2	10	117896	117905	60 %	20 %	20 %	0 %	220927561
86	NC_011898	TGTCC	2	10	118486	118495	0 %	40 %	20 %	40 %	220927562
87	NC_011898	GATAA	2	10	119965	119974	60 %	20 %	20 %	0 %	220927564
88	NC_011898	ATATT	2	10	122383	122392	40 %	60 %	0 %	0 %	220927565
89	NC_011898	GTTAA	2	10	122989	122998	40 %	40 %	20 %	0 %	220927566
90	NC_011898	ACTTC	2	10	123277	123286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011898	TGAAG	2	10	124662	124671	40 %	20 %	40 %	0 %	220927567
92	NC_011898	TGGAT	2	10	126596	126605	20 %	40 %	40 %	0 %	220927569
93	NC_011898	GAAAA	2	10	128482	128491	80 %	0 %	20 %	0 %	220927570
94	NC_011898	AGGAG	2	10	129155	129164	40 %	0 %	60 %	0 %	220927571
95	NC_011898	GAAAA	2	10	132991	133000	80 %	0 %	20 %	0 %	220927575
96	NC_011898	TTAAA	2	10	133835	133844	60 %	40 %	0 %	0 %	220927576
97	NC_011898	AATGA	2	10	135934	135943	60 %	20 %	20 %	0 %	220927581
98	NC_011898	GGACG	2	10	136149	136158	20 %	0 %	60 %	20 %	220927581
99	NC_011898	CAAAA	2	10	137271	137280	80 %	0 %	0 %	20 %	220927582
100	NC_011898	TAAAA	2	10	139472	139481	80 %	20 %	0 %	0 %	220927583
101	NC_011898	TTTTA	2	10	140739	140748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011898	GCCGG	2	10	142041	142050	0 %	0 %	60 %	40 %	220927585
103	NC_011898	GCAGA	2	10	144403	144412	40 %	0 %	40 %	20 %	220927588
104	NC_011898	TTTTA	2	10	145337	145346	20 %	80 %	0 %	0 %	220927589
105	NC_011898	GTTAT	2	10	150050	150059	20 %	60 %	20 %	0 %	220927593
106	NC_011898	AGTCT	2	10	151395	151404	20 %	40 %	20 %	20 %	220927594
107	NC_011898	ATGAA	2	10	154555	154564	60 %	20 %	20 %	0 %	220927597
108	NC_011898	ATGAA	2	10	156107	156116	60 %	20 %	20 %	0 %	220927598
109	NC_011898	AAGGC	2	10	157673	157682	40 %	0 %	40 %	20 %	220927599
110	NC_011898	AATTT	2	10	159945	159954	40 %	60 %	0 %	0 %	220927601
111	NC_011898	ACACA	2	10	161008	161017	60 %	0 %	0 %	40 %	220927601
112	NC_011898	TTCAT	2	10	161041	161050	20 %	60 %	0 %	20 %	220927601
113	NC_011898	ATCAA	2	10	162541	162550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011898	GGATG	2	10	162823	162832	20 %	20 %	60 %	0 %	220927602
115	NC_011898	TGATA	2	10	162903	162912	40 %	40 %	20 %	0 %	220927602
116	NC_011898	GCAGA	2	10	167739	167748	40 %	0 %	40 %	20 %	220927606
117	NC_011898	GGAAA	2	10	169746	169755	60 %	0 %	40 %	0 %	220927607
118	NC_011898	ATATT	2	10	171059	171068	40 %	60 %	0 %	0 %	220927608
119	NC_011898	CTTTA	2	10	172595	172604	20 %	60 %	0 %	20 %	220927609
120	NC_011898	TTTCA	2	10	175484	175493	20 %	60 %	0 %	20 %	220927611
121	NC_011898	CCATG	2	10	179212	179221	20 %	20 %	20 %	40 %	220927613
122	NC_011898	GTACT	2	10	180579	180588	20 %	40 %	20 %	20 %	220927613
123	NC_011898	ATTTA	2	10	181608	181617	40 %	60 %	0 %	0 %	220927614
124	NC_011898	AATAC	2	10	181801	181810	60 %	20 %	0 %	20 %	220927614
125	NC_011898	CAGAG	2	10	181881	181890	40 %	0 %	40 %	20 %	220927614
126	NC_011898	ACATT	2	10	182763	182772	40 %	40 %	0 %	20 %	220927615
127	NC_011898	ACTTG	2	10	183822	183831	20 %	40 %	20 %	20 %	220927617
128	NC_011898	AGAAA	2	10	185094	185103	80 %	0 %	20 %	0 %	220927619
129	NC_011898	TTTTA	2	10	185202	185211	20 %	80 %	0 %	0 %	220927619
130	NC_011898	TTAAT	2	10	188204	188213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011898	CAATG	2	10	188754	188763	40 %	20 %	20 %	20 %	220927624
132	NC_011898	ATCGC	2	10	189463	189472	20 %	20 %	20 %	40 %	220927625
133	NC_011898	GGCGG	2	10	191330	191339	0 %	0 %	80 %	20 %	220927627
134	NC_011898	AAAAT	2	10	191577	191586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011898	ATATT	2	10	194199	194208	40 %	60 %	0 %	0 %	220927630
136	NC_011898	CAGGA	2	10	195444	195453	40 %	0 %	40 %	20 %	220927631
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