MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	TAAAA	2	10	9842	9851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011898	AACAA	2	10	13238	13247	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011898	AACAA	2	10	20920	20929	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011898	CATAA	2	10	21022	21031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011898	TAATT	2	10	22776	22785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011898	ATTTT	2	10	26205	26214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011898	ATATT	2	10	42319	42328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011898	TAAAG	2	10	52533	52542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011898	ATTTT	2	10	67841	67850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011898	GTTTT	2	10	87490	87499	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011898	AACTA	2	10	90033	90042	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011898	TAATA	2	10	99249	99258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011898	TCAGG	2	10	103890	103899	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_011898	ACTTC	2	10	123277	123286	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011898	TTTTA	2	10	140739	140748	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011898	ATCAA	2	10	162541	162550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011898	TTAAT	2	10	188204	188213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011898	AAAAT	2	10	191577	191586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011898	ATTTG	2	10	208749	208758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011898	ATATT	2	10	216503	216512	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011898	ATGGA	2	10	220476	220485	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011898	AAAGT	2	10	236907	236916	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011898	GGAAA	2	10	236931	236940	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011898	CCCTT	2	10	241466	241475	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_011898	TTATT	2	10	245792	245801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011898	AAGAA	2	10	247201	247210	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011898	CCTAT	2	10	256987	256996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011898	TAAAA	2	10	258870	258879	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011898	TATAA	2	10	259658	259667	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011898	AAATT	2	10	260526	260535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011898	ATTTT	2	10	270597	270606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011898	GTTCA	2	10	270803	270812	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011898	ATATA	2	10	272896	272905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011898	ATTAA	2	10	285103	285112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011898	CTATG	2	10	294684	294693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011898	CTTAT	2	10	298934	298943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_011898	GTAGG	2	10	301841	301850	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011898	TATAT	2	10	322519	322528	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011898	TTTTC	2	10	335614	335623	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011898	TAATT	2	10	336554	336563	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011898	TTAAT	2	10	357375	357384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011898	ATGTT	2	10	357411	357420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011898	GATTG	2	10	366671	366680	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011898	TATTT	2	10	371231	371240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011898	TTATA	2	10	371927	371936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011898	TTTTG	2	10	373368	373377	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011898	ATTTG	2	10	386294	386303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011898	TTTTC	2	10	406931	406940	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011898	TAATA	2	10	422005	422014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011898	TGAAA	2	10	424462	424471	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011898	TCGTG	2	10	454966	454975	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011898	AAGCT	2	10	455151	455160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011898	CCAAA	2	10	456473	456482	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_011898	GGGAG	2	10	456735	456744	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011898	AAAGT	2	10	457514	457523	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011898	AAAGT	2	10	470482	470491	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011898	TAAAA	2	10	478182	478191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011898	ATATG	2	10	491562	491571	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011898	AACTG	2	10	520848	520857	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_011898	ATTAA	2	10	522561	522570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011898	ATTTG	2	10	572799	572808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011898	CAAAA	2	10	581186	581195	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011898	AATAA	3	15	600276	600290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011898	GAGTA	2	10	604562	604571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011898	TTAAA	2	10	604633	604642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011898	TCGTG	2	10	606294	606303	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_011898	AAGCT	2	10	606479	606488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011898	CCAAA	2	10	607801	607810	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_011898	GGGAG	2	10	608063	608072	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011898	AAAGT	2	10	608842	608851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011898	TATAA	2	10	613121	613130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011898	TTATA	2	10	613434	613443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011898	TATAA	2	10	615230	615239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011898	GTGAT	2	10	624785	624794	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011898	AAATA	2	10	625167	625176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011898	ATTAA	2	10	625853	625862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011898	TCATT	2	10	629490	629499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_011898	TAATA	2	10	633861	633870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011898	TTGTT	2	10	634814	634823	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011898	TTTTA	2	10	635555	635564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011898	ATAAA	2	10	644857	644866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011898	TCGTG	2	10	655975	655984	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_011898	AAGCT	2	10	656160	656169	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011898	CCAAA	2	10	657507	657516	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011898	GGGAG	2	10	657769	657778	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011898	AAAGT	2	10	658679	658688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011898	TAATA	2	10	660838	660847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011898	AAAAT	2	10	660857	660866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011898	TTCTT	2	10	674286	674295	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011898	CAATA	2	10	674400	674409	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011898	ATAAA	2	10	680146	680155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011898	TAACA	2	10	683535	683544	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011898	ATTTT	2	10	683616	683625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011898	TTAAT	2	10	683630	683639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011898	GGAAA	2	10	698238	698247	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011898	AATAA	2	10	719169	719178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011898	TAGTA	2	10	723619	723628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011898	ACAGA	2	10	741645	741654	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011898	CAAAT	2	10	752375	752384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011898	ACACA	2	10	762043	762052	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011898	TTTAC	2	10	771106	771115	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011898	TATTT	2	10	793657	793666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011898	TGAAA	2	10	793979	793988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011898	ATTTG	2	10	797128	797137	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011898	AAAAT	2	10	803727	803736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011898	TTATT	2	10	811046	811055	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011898	TTAAA	2	10	811152	811161	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011898	ATATC	2	10	819160	819169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_011898	TTAAG	2	10	819281	819290	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011898	GAGTA	2	10	819309	819318	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011898	GTAAA	2	10	820152	820161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011898	ATTAC	2	10	834984	834993	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011898	ATTTA	2	10	837488	837497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011898	AATTA	2	10	837701	837710	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011898	TAAAA	2	10	838250	838259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011898	AATTT	2	10	846769	846778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011898	TCCTA	2	10	851776	851785	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_011898	ATATT	2	10	877244	877253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011898	AAATT	2	10	878536	878545	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011898	CAAAT	2	10	882815	882824	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011898	TCGTG	2	10	889015	889024	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011898	AAGCT	2	10	889200	889209	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_011898	CCAAA	2	10	890547	890556	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011898	GGGAG	2	10	890809	890818	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011898	AAAGT	2	10	891719	891728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011898	ATTAG	2	10	905118	905127	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011898	ATTGT	2	10	906645	906654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011898	TAAAT	2	10	915112	915121	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011898	ATTTG	2	10	926034	926043	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011898	ATAAA	2	10	932698	932707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011898	AAATA	2	10	936594	936603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011898	TTCAT	2	10	937335	937344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011898	TGATT	2	10	940115	940124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011898	ACGAT	2	10	942364	942373	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011898	ACTGC	2	10	954961	954970	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011898	TAATT	2	10	958256	958265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011898	AAATG	2	10	959435	959444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011898	GTTAA	2	10	959550	959559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011898	AAATA	2	10	966533	966542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011898	GGATT	2	10	968708	968717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011898	TATTT	2	10	968811	968820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011898	GATTG	2	10	1041193	1041202	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011898	AAATC	2	10	1053948	1053957	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011898	CATTT	2	10	1054029	1054038	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011898	CTTTA	2	10	1062539	1062548	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011898	ATTAT	2	10	1063601	1063610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011898	GTATA	2	10	1071872	1071881	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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