MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 1762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011898	TAAT	2	8	8958	8965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011898	TATT	2	8	9774	9781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011898	AAAT	2	8	9966	9973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011898	TAAT	2	8	11051	11058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011898	GGAT	2	8	11158	11165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011898	TAAT	2	8	12827	12834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011898	TAAA	2	8	13083	13090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011898	AAAT	2	8	17055	17062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011898	GGCC	2	8	18257	18264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011898	ATCT	2	8	20011	20018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011898	TTAT	2	8	20182	20189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011898	TATT	2	8	22763	22770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011898	TAAA	2	8	22858	22865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011898	TAAA	2	8	26140	26147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011898	TTAA	2	8	31999	32006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011898	ATTA	2	8	35642	35649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011898	TTAT	2	8	45470	45477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011898	ATTT	2	8	45534	45541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011898	AAAT	2	8	47892	47899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011898	TTTA	2	8	47965	47972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011898	TAAA	2	8	52482	52489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011898	AATA	3	12	52512	52523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011898	TTAC	2	8	54559	54566	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011898	ATTT	2	8	63807	63814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011898	AAAT	2	8	63921	63928	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011898	AAAT	2	8	66329	66336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011898	AATT	2	8	66381	66388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011898	TAAA	2	8	66452	66459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011898	AACA	2	8	67024	67031	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011898	AAAT	2	8	67851	67858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011898	TAAT	2	8	67922	67929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011898	CAAA	2	8	82421	82428	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011898	ATGT	2	8	82534	82541	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011898	TCAT	2	8	84479	84486	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011898	ATCA	2	8	84700	84707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011898	ATTT	2	8	87329	87336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011898	GTTT	2	8	87348	87355	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011898	TAAT	2	8	87437	87444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011898	CTAT	2	8	87478	87485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_011898	ACCA	2	8	88514	88521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011898	CATT	2	8	88546	88553	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011898	TGTA	2	8	88584	88591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011898	TTCA	2	8	90130	90137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011898	TATG	2	8	91995	92002	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011898	AATA	2	8	99292	99299	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011898	TTAT	2	8	101358	101365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011898	TAAA	2	8	101837	101844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011898	GGGA	2	8	107283	107290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011898	AAAT	2	8	107820	107827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011898	TTAC	2	8	114099	114106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011898	ATTT	2	8	114857	114864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011898	AAAG	2	8	117041	117048	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011898	ACTC	2	8	119366	119373	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011898	ATTA	2	8	122670	122677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011898	TTTA	2	8	125867	125874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011898	AAAT	2	8	136350	136357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011898	ATCC	2	8	142121	142128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_011898	AATT	2	8	145557	145564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011898	GGAG	2	8	151413	151420	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011898	TACT	2	8	153511	153518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_011898	TATT	2	8	154797	154804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011898	TTAA	2	8	154813	154820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011898	TTTA	2	8	154973	154980	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011898	ATTA	2	8	162382	162389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011898	TATT	2	8	162558	162565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011898	GAAT	2	8	166332	166339	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011898	TACA	2	8	166417	166424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011898	GAAA	2	8	166508	166515	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011898	ATAA	2	8	167347	167354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011898	TCAA	2	8	185755	185762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011898	TGTT	2	8	185805	185812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011898	GTTG	2	8	187752	187759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011898	ATAA	2	8	188159	188166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011898	TAAA	2	8	190568	190575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011898	TAAA	2	8	190779	190786	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011898	ATTT	2	8	196656	196663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011898	TAAA	2	8	203131	203138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011898	AAAT	2	8	205932	205939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011898	GTCA	2	8	207258	207265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011898	TGCT	2	8	208372	208379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011898	CTTA	2	8	208831	208838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011898	TGCC	2	8	208937	208944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011898	TATC	2	8	209078	209085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011898	AATT	2	8	209144	209151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011898	TATT	2	8	210096	210103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011898	AGGA	2	8	212825	212832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011898	AATA	2	8	214722	214729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011898	AATA	2	8	216246	216253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011898	GTAT	2	8	216611	216618	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011898	TTTG	2	8	226290	226297	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011898	GAAG	2	8	226357	226364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011898	ATTT	2	8	230445	230452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011898	ATAA	2	8	231184	231191	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011898	TGTA	2	8	239237	239244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011898	TTTA	2	8	247144	247151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011898	AATA	2	8	248034	248041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011898	CGGG	2	8	249869	249876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011898	TGCT	2	8	252880	252887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011898	TAAA	2	8	253075	253082	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011898	CCTT	2	8	256828	256835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011898	TTAT	2	8	257562	257569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011898	GTTT	2	8	259725	259732	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011898	AATT	2	8	263003	263010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011898	GGAA	2	8	270989	270996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011898	TGTA	2	8	278166	278173	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011898	GGGA	2	8	283777	283784	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011898	TTTA	2	8	285089	285096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011898	CCTC	2	8	290507	290514	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_011898	AAGA	2	8	296189	296196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011898	TTTA	2	8	296315	296322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011898	CAAA	2	8	301822	301829	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011898	TTCA	2	8	317763	317770	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011898	GTGG	2	8	319252	319259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011898	TAAA	2	8	321325	321332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011898	AAAT	2	8	333778	333785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011898	TAAT	2	8	335629	335636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011898	AATT	2	8	336521	336528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011898	TAAA	2	8	337309	337316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011898	TATT	2	8	346143	346150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011898	AAGG	2	8	347384	347391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011898	ATTA	2	8	356181	356188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011898	CAAA	2	8	356208	356215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011898	AATT	2	8	357317	357324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011898	AGTT	2	8	357647	357654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011898	TTTA	2	8	365464	365471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011898	GTTA	2	8	368812	368819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011898	TGTT	2	8	368847	368854	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011898	GTGA	2	8	371898	371905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011898	TGTA	2	8	373384	373391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011898	TTTA	2	8	375264	375271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011898	AAAG	2	8	375494	375501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011898	GTCA	2	8	384803	384810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011898	TGCT	2	8	385917	385924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011898	CTTA	2	8	386376	386383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011898	ATAA	2	8	386426	386433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011898	TTAT	2	8	389888	389895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011898	GCCC	2	8	392240	392247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
138	NC_011898	GAAT	2	8	393644	393651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011898	AATT	2	8	397341	397348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011898	AATA	2	8	399504	399511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011898	TAAT	2	8	399557	399564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011898	TAAA	2	8	399579	399586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011898	TTAT	3	12	404357	404368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011898	ATTT	2	8	406650	406657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011898	TGTA	2	8	406879	406886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011898	TAAC	2	8	406981	406988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011898	AAAT	2	8	411757	411764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011898	GAAA	2	8	415287	415294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011898	TTGT	2	8	415606	415613	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011898	AATA	2	8	415614	415621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011898	TAAA	2	8	418557	418564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011898	TATG	2	8	420612	420619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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