MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium leprae Br4923 chromosome

Total Repeats: 1240

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011896	ACCAC	2	10	1448	1457	40 %	0 %	0 %	60 %	221229344
2	NC_011896	GCCGA	2	10	3027	3036	20 %	0 %	40 %	40 %	221229345
3	NC_011896	AGGGT	2	10	4724	4733	20 %	20 %	60 %	0 %	221229347
4	NC_011896	TGGTG	2	10	4902	4911	0 %	40 %	60 %	0 %	221229347
5	NC_011896	GCAGC	2	10	7392	7401	20 %	0 %	40 %	40 %	221229349
6	NC_011896	GGCAA	2	10	7655	7664	40 %	0 %	40 %	20 %	221229349
7	NC_011896	AAGCT	2	10	8612	8621	40 %	20 %	20 %	20 %	221229349
8	NC_011896	GGGGT	2	10	10919	10928	0 %	20 %	80 %	0 %	221229349
9	NC_011896	ACCGT	2	10	11624	11633	20 %	20 %	20 %	40 %	221229350
10	NC_011896	ACTGG	2	10	13039	13048	20 %	20 %	40 %	20 %	221229351
11	NC_011896	TCACC	2	10	19275	19284	20 %	20 %	0 %	60 %	221229357
12	NC_011896	TAGCG	2	10	22464	22473	20 %	20 %	40 %	20 %	221229359
13	NC_011896	TGGGG	2	10	25085	25094	0 %	20 %	80 %	0 %	221229361
14	NC_011896	CGGAT	2	10	26005	26014	20 %	20 %	40 %	20 %	221229361
15	NC_011896	CCGCG	2	10	28077	28086	0 %	0 %	40 %	60 %	221229363
16	NC_011896	GCCCT	2	10	28129	28138	0 %	20 %	20 %	60 %	221229363
17	NC_011896	CTCGA	2	10	28583	28592	20 %	20 %	20 %	40 %	221229363
18	NC_011896	ACCGT	2	10	34379	34388	20 %	20 %	20 %	40 %	221229368
19	NC_011896	CGATG	2	10	36376	36385	20 %	20 %	40 %	20 %	221229371
20	NC_011896	CGTAC	2	10	37990	37999	20 %	20 %	20 %	40 %	221229371
21	NC_011896	GCACC	2	10	38788	38797	20 %	0 %	20 %	60 %	221229371
22	NC_011896	GTGGC	2	10	53216	53225	0 %	20 %	60 %	20 %	221229373
23	NC_011896	CCGGG	2	10	59304	59313	0 %	0 %	60 %	40 %	221229375
24	NC_011896	GTCGA	2	10	59635	59644	20 %	20 %	40 %	20 %	221229376
25	NC_011896	ACATT	2	10	59952	59961	40 %	40 %	0 %	20 %	221229376
26	NC_011896	GCTGT	2	10	60023	60032	0 %	40 %	40 %	20 %	221229376
27	NC_011896	GGCAG	2	10	62594	62603	20 %	0 %	60 %	20 %	221229379
28	NC_011896	TCTGC	2	10	62940	62949	0 %	40 %	20 %	40 %	221229379
29	NC_011896	GTCAG	2	10	63739	63748	20 %	20 %	40 %	20 %	221229380
30	NC_011896	TCCGG	2	10	64084	64093	0 %	20 %	40 %	40 %	221229380
31	NC_011896	GAACT	2	10	65330	65339	40 %	20 %	20 %	20 %	221229381
32	NC_011896	GGCGT	2	10	68446	68455	0 %	20 %	60 %	20 %	221229382
33	NC_011896	ATTCG	2	10	69197	69206	20 %	40 %	20 %	20 %	221229383
34	NC_011896	CCCGT	2	10	69360	69369	0 %	20 %	20 %	60 %	221229383
35	NC_011896	ACTTT	2	10	69862	69871	20 %	60 %	0 %	20 %	221229383
36	NC_011896	GCTAC	2	10	77989	77998	20 %	20 %	20 %	40 %	221229385
37	NC_011896	GATGC	2	10	78144	78153	20 %	20 %	40 %	20 %	221229385
38	NC_011896	GTGCT	2	10	78820	78829	0 %	40 %	40 %	20 %	221229385
39	NC_011896	GCATG	2	10	79496	79505	20 %	20 %	40 %	20 %	221229385
40	NC_011896	GTGAT	2	10	81067	81076	20 %	40 %	40 %	0 %	221229385
41	NC_011896	GGAAT	2	10	82509	82518	40 %	20 %	40 %	0 %	221229386
42	NC_011896	GGTCA	2	10	89704	89713	20 %	20 %	40 %	20 %	221229391
43	NC_011896	CGGAG	2	10	90796	90805	20 %	0 %	60 %	20 %	221229392
44	NC_011896	TGGTG	2	10	93207	93216	0 %	40 %	60 %	0 %	221229395
45	NC_011896	AGTTG	2	10	95120	95129	20 %	40 %	40 %	0 %	221229396
46	NC_011896	TCGTT	2	10	99003	99012	0 %	60 %	20 %	20 %	221229398
47	NC_011896	TTGCG	2	10	102675	102684	0 %	40 %	40 %	20 %	221229401
48	NC_011896	TGGTG	2	10	113450	113459	0 %	40 %	60 %	0 %	221229404
49	NC_011896	AGCCG	2	10	114297	114306	20 %	0 %	40 %	40 %	221229405
50	NC_011896	GCACC	2	10	115300	115309	20 %	0 %	20 %	60 %	221229405
51	NC_011896	GCCGC	2	10	116331	116340	0 %	0 %	40 %	60 %	221229406
52	NC_011896	CGGCG	2	10	116570	116579	0 %	0 %	60 %	40 %	221229406
53	NC_011896	GTGCC	2	10	117484	117493	0 %	20 %	40 %	40 %	221229407
54	NC_011896	GCCGC	2	10	126460	126469	0 %	0 %	40 %	60 %	221229413
55	NC_011896	AGCGA	2	10	126657	126666	40 %	0 %	40 %	20 %	221229414
56	NC_011896	CGATG	2	10	128143	128152	20 %	20 %	40 %	20 %	221229414
57	NC_011896	GCGAC	2	10	129090	129099	20 %	0 %	40 %	40 %	221229414
58	NC_011896	GGCGA	2	10	129137	129146	20 %	0 %	60 %	20 %	221229414
59	NC_011896	CCTGG	2	10	132664	132673	0 %	20 %	40 %	40 %	221229415
60	NC_011896	TGGCA	2	10	137917	137926	20 %	20 %	40 %	20 %	221229416
61	NC_011896	GAACG	2	10	137932	137941	40 %	0 %	40 %	20 %	221229416
62	NC_011896	ACGCC	2	10	138181	138190	20 %	0 %	20 %	60 %	221229416
63	NC_011896	ACGGT	2	10	139605	139614	20 %	20 %	40 %	20 %	221229416
64	NC_011896	CGGAT	2	10	140790	140799	20 %	20 %	40 %	20 %	221229417
65	NC_011896	CCGGA	2	10	140965	140974	20 %	0 %	40 %	40 %	221229417
66	NC_011896	ACGGT	2	10	145547	145556	20 %	20 %	40 %	20 %	221229418
67	NC_011896	CTGGC	2	10	145910	145919	0 %	20 %	40 %	40 %	221229418
68	NC_011896	GGCTG	2	10	146956	146965	0 %	20 %	60 %	20 %	221229418
69	NC_011896	CACGG	2	10	147146	147155	20 %	0 %	40 %	40 %	221229418
70	NC_011896	ATGTC	2	10	149001	149010	20 %	40 %	20 %	20 %	221229419
71	NC_011896	CCTGG	2	10	149576	149585	0 %	20 %	40 %	40 %	221229420
72	NC_011896	GATCA	2	10	153578	153587	40 %	20 %	20 %	20 %	221229423
73	NC_011896	GCGAT	2	10	154121	154130	20 %	20 %	40 %	20 %	221229424
74	NC_011896	GCCGC	2	10	154194	154203	0 %	0 %	40 %	60 %	221229424
75	NC_011896	TGCCA	2	10	156775	156784	20 %	20 %	20 %	40 %	221229427
76	NC_011896	CGCAG	2	10	158249	158258	20 %	0 %	40 %	40 %	221229428
77	NC_011896	CGGGC	2	10	159497	159506	0 %	0 %	60 %	40 %	221229429
78	NC_011896	CGTAG	2	10	161866	161875	20 %	20 %	40 %	20 %	221229431
79	NC_011896	TCAGC	2	10	173197	173206	20 %	20 %	20 %	40 %	221229438
80	NC_011896	CAGGT	2	10	173788	173797	20 %	20 %	40 %	20 %	221229438
81	NC_011896	CGAAT	2	10	174022	174031	40 %	20 %	20 %	20 %	221229438
82	NC_011896	TTTCG	2	10	175477	175486	0 %	60 %	20 %	20 %	221229440
83	NC_011896	TCGCG	2	10	177278	177287	0 %	20 %	40 %	40 %	221229441
84	NC_011896	GCAAC	2	10	177419	177428	40 %	0 %	20 %	40 %	221229441
85	NC_011896	CGGTG	2	10	180167	180176	0 %	20 %	60 %	20 %	221229443
86	NC_011896	TCAGT	2	10	180706	180715	20 %	40 %	20 %	20 %	221229443
87	NC_011896	TGTCG	2	10	182415	182424	0 %	40 %	40 %	20 %	221229444
88	NC_011896	TGGCG	2	10	183867	183876	0 %	20 %	60 %	20 %	221229444
89	NC_011896	AGTGG	2	10	184845	184854	20 %	20 %	60 %	0 %	221229444
90	NC_011896	TTTGG	2	10	186071	186080	0 %	60 %	40 %	0 %	221229444
91	NC_011896	CCGGG	2	10	186762	186771	0 %	0 %	60 %	40 %	221229444
92	NC_011896	TCGGC	2	10	189301	189310	0 %	20 %	40 %	40 %	221229446
93	NC_011896	ACAGC	2	10	189777	189786	40 %	0 %	20 %	40 %	221229446
94	NC_011896	TGGCC	2	10	192693	192702	0 %	20 %	40 %	40 %	221229447
95	NC_011896	ACTGG	2	10	193046	193055	20 %	20 %	40 %	20 %	221229447
96	NC_011896	GGGAT	2	10	194281	194290	20 %	20 %	60 %	0 %	221229448
97	NC_011896	GGTGG	2	10	194441	194450	0 %	20 %	80 %	0 %	221229448
98	NC_011896	GCACA	2	10	195288	195297	40 %	0 %	20 %	40 %	221229448
99	NC_011896	CTATC	2	10	195329	195338	20 %	40 %	0 %	40 %	221229448
100	NC_011896	TGGTG	2	10	198069	198078	0 %	40 %	60 %	0 %	221229448
101	NC_011896	GCGCC	2	10	200016	200025	0 %	0 %	40 %	60 %	221229448
102	NC_011896	GTGTC	2	10	215795	215804	0 %	40 %	40 %	20 %	221229454
103	NC_011896	TCCGG	2	10	216445	216454	0 %	20 %	40 %	40 %	221229454
104	NC_011896	CACGG	2	10	217230	217239	20 %	0 %	40 %	40 %	221229455
105	NC_011896	CGGCG	2	10	217896	217905	0 %	0 %	60 %	40 %	221229455
106	NC_011896	TTGGT	2	10	220161	220170	0 %	60 %	40 %	0 %	221229457
107	NC_011896	CCACC	2	10	222456	222465	20 %	0 %	0 %	80 %	221229458
108	NC_011896	CCCGG	2	10	224109	224118	0 %	0 %	40 %	60 %	221229460
109	NC_011896	GCGTG	2	10	225903	225912	0 %	20 %	60 %	20 %	221229461
110	NC_011896	GATTT	2	10	241093	241102	20 %	60 %	20 %	0 %	221229465
111	NC_011896	GGCTT	2	10	243874	243883	0 %	40 %	40 %	20 %	221229467
112	NC_011896	CCAAG	2	10	243899	243908	40 %	0 %	20 %	40 %	221229467
113	NC_011896	TGGTG	2	10	244422	244431	0 %	40 %	60 %	0 %	221229468
114	NC_011896	GGTGG	2	10	244486	244495	0 %	20 %	80 %	0 %	221229468
115	NC_011896	TGCGT	2	10	247792	247801	0 %	40 %	40 %	20 %	221229472
116	NC_011896	CGGTG	2	10	248487	248496	0 %	20 %	60 %	20 %	221229473
117	NC_011896	AGCCG	2	10	248873	248882	20 %	0 %	40 %	40 %	221229473
118	NC_011896	GTGCT	2	10	249629	249638	0 %	40 %	40 %	20 %	221229474
119	NC_011896	GCGTG	2	10	249968	249977	0 %	20 %	60 %	20 %	221229474
120	NC_011896	GTCCT	2	10	253208	253217	0 %	40 %	20 %	40 %	221229476
121	NC_011896	GACAA	2	10	254305	254314	60 %	0 %	20 %	20 %	221229477
122	NC_011896	ACGTC	2	10	257816	257825	20 %	20 %	20 %	40 %	221229479
123	NC_011896	CTGTG	2	10	258739	258748	0 %	40 %	40 %	20 %	221229480
124	NC_011896	CGGTG	2	10	258986	258995	0 %	20 %	60 %	20 %	221229480
125	NC_011896	CGCGG	2	10	265519	265528	0 %	0 %	60 %	40 %	221229482
126	NC_011896	AGTCG	2	10	266107	266116	20 %	20 %	40 %	20 %	221229483
127	NC_011896	TCCGA	2	10	266729	266738	20 %	20 %	20 %	40 %	221229483
128	NC_011896	GTGCG	2	10	268940	268949	0 %	20 %	60 %	20 %	221229484
129	NC_011896	CGGCA	2	10	269769	269778	20 %	0 %	40 %	40 %	221229484
130	NC_011896	AGCTG	2	10	270664	270673	20 %	20 %	40 %	20 %	221229485
131	NC_011896	CTGCA	2	10	270804	270813	20 %	20 %	20 %	40 %	221229485
132	NC_011896	GATGC	2	10	273336	273345	20 %	20 %	40 %	20 %	221229486
133	NC_011896	CCCAG	2	10	274642	274651	20 %	0 %	20 %	60 %	221229486
134	NC_011896	GGTCC	2	10	274836	274845	0 %	20 %	40 %	40 %	221229486
135	NC_011896	CCGAC	2	10	275497	275506	20 %	0 %	20 %	60 %	221229487
136	NC_011896	GATCG	2	10	279822	279831	20 %	20 %	40 %	20 %	221229490
137	NC_011896	CTGAT	2	10	279995	280004	20 %	40 %	20 %	20 %	221229490
138	NC_011896	CGATG	2	10	282450	282459	20 %	20 %	40 %	20 %	221229492
139	NC_011896	ACTGA	2	10	285270	285279	40 %	20 %	20 %	20 %	221229493
140	NC_011896	GTGGA	2	10	285436	285445	20 %	20 %	60 %	0 %	221229493
141	NC_011896	GAAAA	2	10	294968	294977	80 %	0 %	20 %	0 %	221229497
142	NC_011896	CCCGG	2	10	296868	296877	0 %	0 %	40 %	60 %	221229499
143	NC_011896	CGGGT	2	10	298188	298197	0 %	20 %	60 %	20 %	221229501
144	NC_011896	GATCT	2	10	298235	298244	20 %	40 %	20 %	20 %	221229501
145	NC_011896	GCTGA	2	10	298379	298388	20 %	20 %	40 %	20 %	221229501
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147	NC_011896	GGGTC	2	10	300128	300137	0 %	20 %	60 %	20 %	221229503
148	NC_011896	TCGGT	2	10	302486	302495	0 %	40 %	40 %	20 %	221229506
149	NC_011896	CCGTC	2	10	303046	303055	0 %	20 %	20 %	60 %	221229507
150	NC_011896	GGTGT	2	10	303426	303435	0 %	40 %	60 %	0 %	221229507
151	NC_011896	GCTGG	2	10	303444	303453	0 %	20 %	60 %	20 %	221229507
152	NC_011896	GGGTA	2	10	303955	303964	20 %	20 %	60 %	0 %	221229508
153	NC_011896	CGGCC	2	10	304398	304407	0 %	0 %	40 %	60 %	221229508
154	NC_011896	GACTG	2	10	305218	305227	20 %	20 %	40 %	20 %	221229508
155	NC_011896	AACTG	2	10	305273	305282	40 %	20 %	20 %	20 %	221229508
156	NC_011896	TAAAA	2	10	305719	305728	80 %	20 %	0 %	0 %	221229509
157	NC_011896	TGAGC	2	10	306281	306290	20 %	20 %	40 %	20 %	221229510
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162	NC_011896	GGATG	2	10	316044	316053	20 %	20 %	60 %	0 %	221229514
163	NC_011896	CGGAT	2	10	320981	320990	20 %	20 %	40 %	20 %	221229519
164	NC_011896	TTGGG	2	10	322703	322712	0 %	40 %	60 %	0 %	221229520
165	NC_011896	GTGTT	2	10	323190	323199	0 %	60 %	40 %	0 %	221229521
166	NC_011896	GTGAT	2	10	323361	323370	20 %	40 %	40 %	0 %	221229521
167	NC_011896	TCCGG	2	10	329218	329227	0 %	20 %	40 %	40 %	221229524
168	NC_011896	GCCAG	2	10	329962	329971	20 %	0 %	40 %	40 %	221229524
169	NC_011896	GCTGC	2	10	330636	330645	0 %	20 %	40 %	40 %	221229524
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172	NC_011896	CAGCC	2	10	353024	353033	20 %	0 %	20 %	60 %	221229530
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175	NC_011896	CATCG	2	10	361986	361995	20 %	20 %	20 %	40 %	221229536
176	NC_011896	TCCCG	2	10	362009	362018	0 %	20 %	20 %	60 %	221229536
177	NC_011896	TCGGC	2	10	362157	362166	0 %	20 %	40 %	40 %	221229536
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180	NC_011896	CGCAG	2	10	365989	365998	20 %	0 %	40 %	40 %	221229539
181	NC_011896	GCAGC	2	10	366056	366065	20 %	0 %	40 %	40 %	221229539
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183	NC_011896	GGGAT	2	10	373646	373655	20 %	20 %	60 %	0 %	221229544
184	NC_011896	ATCAC	2	10	378656	378665	40 %	20 %	0 %	40 %	221229546
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187	NC_011896	CGACC	2	10	385857	385866	20 %	0 %	20 %	60 %	221229552
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202	NC_011896	AGGTA	2	10	426634	426643	40 %	20 %	40 %	0 %	221229571
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246	NC_011896	TCTCC	2	10	547449	547458	0 %	40 %	0 %	60 %	221229617
247	NC_011896	CGTAT	2	10	547530	547539	20 %	40 %	20 %	20 %	221229617
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252	NC_011896	CCACC	2	10	555197	555206	20 %	0 %	0 %	80 %	221229624
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258	NC_011896	CCTTC	2	10	585499	585508	0 %	40 %	0 %	60 %	221229639
259	NC_011896	CGGCT	2	10	585931	585940	0 %	20 %	40 %	40 %	221229639
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