MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium leprae Br4923 chromosome

Total Repeats: 4249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011896	CGTT	2	8	2002	2009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011896	TAAA	2	8	7267	7274	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011896	TCCG	2	8	12610	12617	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011896	TAGA	2	8	13739	13746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011896	ACAT	3	12	14217	14228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011896	TTGA	2	8	14317	14324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011896	TTGG	2	8	14472	14479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011896	GCAT	2	8	14708	14715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011896	GTTG	2	8	14849	14856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011896	GAAA	2	8	14910	14917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011896	ATTT	2	8	15003	15010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011896	GCTG	2	8	15431	15438	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011896	GACT	2	8	15506	15513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011896	CGGT	2	8	15554	15561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011896	TGGA	2	8	15636	15643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011896	CCTT	2	8	15680	15687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011896	GCCC	2	8	18074	18081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_011896	CGAT	2	8	18095	18102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011896	CCGG	2	8	18235	18242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011896	GTTC	2	8	29556	29563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011896	TCCG	2	8	29580	29587	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011896	CGAA	2	8	30673	30680	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011896	CATT	2	8	30940	30947	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011896	CGCC	2	8	31143	31150	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011896	CTGT	2	8	31387	31394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011896	CCAG	2	8	31472	31479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011896	ATTC	2	8	32031	32038	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011896	CCGG	2	8	32714	32721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011896	CGCT	2	8	32799	32806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011896	GGCA	2	8	33827	33834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011896	GCAA	2	8	33995	34002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011896	GGTT	2	8	39309	39316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011896	CTGC	2	8	39450	39457	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011896	CAGC	2	8	39808	39815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011896	CTTT	2	8	40861	40868	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011896	GATA	2	8	41061	41068	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011896	ACGT	2	8	41249	41256	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011896	GAAA	2	8	41478	41485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011896	CCGG	2	8	41807	41814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011896	AGAT	2	8	41938	41945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011896	AGCT	2	8	42352	42359	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011896	AGAA	2	8	42556	42563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011896	GCCG	2	8	43040	43047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011896	AGTT	2	8	43077	43084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011896	GTTG	2	8	43716	43723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011896	CGTA	2	8	44284	44291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011896	CCGA	2	8	44488	44495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011896	TTCG	2	8	44711	44718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011896	CCTA	2	8	44936	44943	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011896	GCTT	2	8	45875	45882	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011896	GATC	2	8	46987	46994	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011896	ATTG	2	8	48330	48337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011896	CACC	2	8	48818	48825	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_011896	CATC	2	8	48944	48951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011896	GTTG	2	8	48955	48962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011896	CGAA	2	8	49415	49422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011896	GTGG	2	8	49464	49471	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011896	TCAG	2	8	49498	49505	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011896	CCAC	2	8	49819	49826	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_011896	AAGG	2	8	53964	53971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011896	GCCG	2	8	54245	54252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_011896	CTTT	2	8	54617	54624	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011896	TAGT	2	8	55122	55129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011896	AGCT	2	8	55319	55326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011896	GGTG	2	8	55622	55629	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011896	AATG	2	8	55982	55989	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011896	GAAA	2	8	56722	56729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011896	ACCG	2	8	57212	57219	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011896	GACT	2	8	57564	57571	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011896	GCCC	2	8	61374	61381	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_011896	CGTG	2	8	61388	61395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_011896	TAGC	2	8	65169	65176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011896	CCGG	2	8	71818	71825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011896	TTTA	2	8	72135	72142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011896	TGCT	2	8	72242	72249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011896	CTAC	2	8	72494	72501	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011896	GCCT	2	8	72718	72725	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_011896	CCAG	2	8	73358	73365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011896	CTCA	2	8	73382	73389	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011896	GTCT	2	8	73849	73856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011896	TTTG	2	8	74223	74230	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011896	GTGG	2	8	74547	74554	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011896	TGCT	2	8	74651	74658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011896	GCAG	2	8	75014	75021	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011896	CCAC	2	8	75026	75033	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_011896	GGCC	2	8	75561	75568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011896	CGGT	2	8	75808	75815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011896	CTTA	2	8	75903	75910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011896	ATTA	2	8	76407	76414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011896	GGCG	2	8	76785	76792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011896	CGCC	2	8	76915	76922	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_011896	ACCG	2	8	77004	77011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011896	TTTA	2	8	77156	77163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011896	ACGG	2	8	77585	77592	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011896	CAGG	2	8	77620	77627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011896	GGCC	2	8	84296	84303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011896	ATGC	2	8	85942	85949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011896	GGTG	2	8	89363	89370	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011896	AGCA	2	8	91059	91066	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011896	CACC	2	8	91587	91594	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011896	TTCC	2	8	93302	93309	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011896	TGAT	2	8	93312	93319	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011896	AACT	2	8	93657	93664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_011896	TGCT	2	8	96161	96168	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011896	ACTT	2	8	96577	96584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011896	GGGT	2	8	96715	96722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011896	CAGC	2	8	97131	97138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011896	TGAG	2	8	97173	97180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011896	CGGC	2	8	97431	97438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011896	GCTG	2	8	98034	98041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011896	GCAG	2	8	98159	98166	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011896	CATC	2	8	102030	102037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011896	CCTG	2	8	103760	103767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011896	CTTG	2	8	103952	103959	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011896	GAGC	2	8	104380	104387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011896	GGCC	2	8	105014	105021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011896	TGCT	2	8	105321	105328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011896	TGCT	2	8	105432	105439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011896	GAAA	2	8	105837	105844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011896	TAGC	2	8	106451	106458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011896	GTAA	2	8	107016	107023	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011896	TCGG	2	8	108414	108421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011896	TGCA	2	8	108944	108951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011896	CTGT	2	8	111252	111259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011896	TCGG	2	8	111649	111656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011896	GATC	2	8	112123	112130	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011896	GCTT	2	8	113927	113934	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011896	CTCG	2	8	121033	121040	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011896	CCGA	2	8	124608	124615	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011896	TTTA	2	8	133859	133866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011896	GTTT	2	8	134461	134468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011896	GTTC	2	8	134941	134948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011896	GCAT	2	8	135559	135566	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011896	CCGG	2	8	136081	136088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_011896	GCCG	2	8	143314	143321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_011896	TCGT	2	8	152283	152290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011896	GCTT	2	8	152451	152458	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011896	TGGC	2	8	158075	158082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011896	TTGT	2	8	160461	160468	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011896	TCCT	2	8	162932	162939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011896	CGAT	2	8	162950	162957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011896	ACGG	2	8	163267	163274	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011896	GCAA	2	8	164114	164121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011896	CTGA	2	8	164878	164885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_011896	CATG	2	8	164892	164899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011896	ACCG	2	8	165668	165675	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011896	GTCA	2	8	166299	166306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011896	GTTG	2	8	166553	166560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011896	GCTG	2	8	166570	166577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011896	GCTA	2	8	166786	166793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_011896	GTTC	2	8	179994	180001	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011896	GATG	2	8	192003	192010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011896	CAAA	2	8	193903	193910	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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466	NC_011896	GATC	2	8	430595	430602	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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495	NC_011896	CGGT	2	8	437928	437935	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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499	NC_011896	CGGT	2	8	440730	440737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_011896	TCCA	2	8	440820	440827	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

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