MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	GAAAA	2	10	36	45	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011893	TGCCG	2	10	520	529	0 %	20 %	40 %	40 %	220920001
3	NC_011893	CAGAG	2	10	817	826	40 %	0 %	40 %	20 %	220920001
4	NC_011893	CTGAT	2	10	2389	2398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011893	GCCGC	2	10	4155	4164	0 %	0 %	40 %	60 %	220920005
6	NC_011893	TGAGT	2	10	5211	5220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011893	ATAAG	2	10	5266	5275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011893	GCGCG	2	10	7762	7771	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011893	CGGAG	2	10	9626	9635	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011893	GCACC	2	10	10117	10126	20 %	0 %	20 %	60 %	220920011
11	NC_011893	ACCCA	2	10	11377	11386	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_011893	CGAGC	2	10	13000	13009	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011893	CGGTG	2	10	13611	13620	0 %	20 %	60 %	20 %	220920016
14	NC_011893	TGCCG	2	10	14345	14354	0 %	20 %	40 %	40 %	220920018
15	NC_011893	CCGGC	2	10	15248	15257	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_011893	TCCCT	2	10	15703	15712	0 %	40 %	0 %	60 %	220920020
17	NC_011893	GCACG	2	10	16448	16457	20 %	0 %	40 %	40 %	220920023
18	NC_011893	TCGCC	2	10	19215	19224	0 %	20 %	20 %	60 %	220920027
19	NC_011893	CGGGC	2	10	19882	19891	0 %	0 %	60 %	40 %	220920029
20	NC_011893	GCCCT	2	10	20839	20848	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_011893	TGCCC	2	10	20919	20928	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_011893	GCCTT	2	10	22620	22629	0 %	40 %	20 %	40 %	220920034
23	NC_011893	CTTTT	2	10	22739	22748	0 %	80 %	0 %	20 %	220920034
24	NC_011893	TTTGA	2	10	22872	22881	20 %	60 %	20 %	0 %	220920034
25	NC_011893	CGGCC	2	10	24233	24242	0 %	0 %	40 %	60 %	220920036
26	NC_011893	GCCGC	2	10	24969	24978	0 %	0 %	40 %	60 %	220920037
27	NC_011893	GCGGG	2	10	26819	26828	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011893	TGGCC	2	10	28296	28305	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011893	GCCGA	2	10	28711	28720	20 %	0 %	40 %	40 %	220920040
30	NC_011893	AAGCA	2	10	30788	30797	60 %	0 %	20 %	20 %	220920041
31	NC_011893	CCGGC	2	10	32034	32043	0 %	0 %	40 %	60 %	220920043
32	NC_011893	CCGAA	2	10	33049	33058	40 %	0 %	20 %	40 %	220920044
33	NC_011893	GCGTC	2	10	33236	33245	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011893	GCCGT	2	10	34448	34457	0 %	20 %	40 %	40 %	220920046
35	NC_011893	GCCGT	2	10	35153	35162	0 %	20 %	40 %	40 %	220920046
36	NC_011893	AGCGC	2	10	36700	36709	20 %	0 %	40 %	40 %	220920047
37	NC_011893	TCCGA	2	10	37579	37588	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_011893	CGGGC	2	10	38619	38628	0 %	0 %	60 %	40 %	220920051
39	NC_011893	AGGCG	2	10	39591	39600	20 %	0 %	60 %	20 %	220920052
40	NC_011893	CCGGC	2	10	40322	40331	0 %	0 %	40 %	60 %	220920053

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.