MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	CTGA	2	8	1735	1742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011893	CACC	2	8	1858	1865	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_011893	CGCC	2	8	1916	1923	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_011893	TTGT	2	8	1997	2004	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011893	GCCG	2	8	2434	2441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011893	CCGC	2	8	2517	2524	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_011893	GCCG	2	8	3304	3311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011893	GGAA	2	8	3363	3370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011893	GCCC	2	8	3498	3505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_011893	GTTG	2	8	3584	3591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011893	TGAG	2	8	3596	3603	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011893	GCCC	2	8	4954	4961	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_011893	CACG	2	8	5020	5027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011893	GCCG	2	8	7383	7390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011893	CTCA	2	8	8297	8304	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011893	GGCG	2	8	8388	8395	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011893	GCGG	2	8	8403	8410	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011893	CCAT	2	8	9612	9619	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011893	CATG	2	8	11002	11009	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011893	CAAG	2	8	11056	11063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011893	CTGC	2	8	11550	11557	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011893	TCGC	2	8	13215	13222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_011893	ATGG	2	8	13456	13463	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011893	ACGG	2	8	14487	14494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011893	GGAG	2	8	14508	14515	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011893	CGGG	2	8	14605	14612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011893	CGTG	2	8	18482	18489	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011893	CCCG	2	8	18498	18505	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_011893	CAGT	2	8	20052	20059	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011893	CCCT	2	8	20767	20774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_011893	GCCG	2	8	21207	21214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011893	ATCC	2	8	21549	21556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011893	GCTG	2	8	23146	23153	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011893	CGGC	2	8	23274	23281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011893	GACT	2	8	23372	23379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011893	TATT	2	8	23857	23864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011893	GGCG	2	8	24569	24576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011893	CGAC	2	8	24768	24775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011893	CCTC	2	8	26314	26321	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_011893	CCCA	2	8	26871	26878	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_011893	GGGA	2	8	26946	26953	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011893	CGAC	2	8	26963	26970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011893	ATCG	2	8	27097	27104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011893	AACC	2	8	27255	27262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011893	TCCA	2	8	27465	27472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011893	GCCC	2	8	28130	28137	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_011893	ACCC	2	8	31134	31141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
48	NC_011893	GGGC	2	8	33301	33308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_011893	CTAA	2	8	34123	34130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011893	CCGC	2	8	36412	36419	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011893	ATCG	2	8	38883	38890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.