MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	GGC	2	6	47	52	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011893	GCC	2	6	59	64	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011893	GCA	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011893	CGC	3	9	928	936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011893	GCA	2	6	966	971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011893	GAT	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011893	CGG	2	6	1658	1663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011893	TGA	2	6	1688	1693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011893	GTT	2	6	1710	1715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011893	CCA	2	6	1815	1820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011893	CCG	2	6	1828	1833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011893	AGT	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011893	AAC	2	6	1983	1988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011893	GAG	2	6	2110	2115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011893	CAG	2	6	3039	3044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011893	GCC	2	6	3051	3056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011893	GAT	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011893	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_011893	CGA	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011893	GTT	2	6	3244	3249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011893	GCG	2	6	3394	3399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011893	TCT	2	6	4671	4676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011893	TGC	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011893	AAC	2	6	4747	4752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011893	GGC	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011893	GCC	2	6	5014	5019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_011893	TCG	3	9	5064	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011893	GTT	2	6	5152	5157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011893	ATG	2	6	5169	5174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011893	CGC	2	6	5260	5265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011893	ATA	2	6	5331	5336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011893	CCT	2	6	5343	5348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011893	CTG	2	6	5538	5543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011893	GGC	2	6	5765	5770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011893	ATC	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011893	TGT	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011893	AGC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011893	GCT	2	6	7255	7260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011893	CAG	2	6	7261	7266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011893	GCC	2	6	7273	7278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011893	ACG	2	6	7431	7436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011893	TCC	2	6	7723	7728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011893	ATC	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011893	GCA	2	6	7802	7807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011893	CTC	2	6	7876	7881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011893	GTT	2	6	7921	7926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011893	CCG	2	6	7942	7947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_011893	CGA	2	6	8000	8005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011893	CGT	2	6	8033	8038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011893	CGA	2	6	8045	8050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011893	GGC	2	6	8276	8281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011893	GCC	2	6	8472	8477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011893	CTG	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011893	GCA	2	6	9362	9367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011893	CGC	3	9	9375	9383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_011893	GCG	3	9	9560	9568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011893	CCG	2	6	9794	9799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_011893	GAG	2	6	9828	9833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011893	TGT	3	9	10400	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011893	CTG	2	6	10422	10427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011893	CGC	2	6	10974	10979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_011893	AGT	2	6	10991	10996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011893	TCA	2	6	11011	11016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011893	GAT	2	6	11034	11039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011893	GCT	2	6	11047	11052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011893	CTG	2	6	11142	11147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011893	AGC	2	6	11167	11172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011893	GGC	2	6	11265	11270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011893	TGC	2	6	11488	11493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011893	TTC	2	6	11562	11567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011893	GAT	2	6	11575	11580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011893	CCG	3	9	12635	12643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_011893	CGG	2	6	12660	12665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011893	CCG	2	6	12666	12671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011893	CCG	2	6	12674	12679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_011893	CCT	2	6	12909	12914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011893	ACC	2	6	12978	12983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011893	GCG	2	6	13033	13038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011893	GCC	2	6	13059	13064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_011893	CTC	2	6	13066	13071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_011893	GTG	2	6	13298	13303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011893	CGC	2	6	13495	13500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_011893	CGT	2	6	13749	13754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011893	TCC	2	6	13758	13763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_011893	CCG	2	6	13794	13799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_011893	GCA	2	6	14084	14089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011893	TTG	2	6	14138	14143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011893	GCC	2	6	14463	14468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011893	CAC	2	6	14551	14556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_011893	CAG	3	9	14560	14568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011893	GGC	2	6	14628	14633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011893	GCC	2	6	14660	14665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011893	CGC	2	6	14958	14963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011893	TGC	2	6	15043	15048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011893	GGC	2	6	15050	15055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011893	TCC	2	6	15139	15144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011893	GCT	2	6	15238	15243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011893	CCG	2	6	19978	19983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_011893	CTG	2	6	19984	19989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011893	CTG	2	6	20034	20039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011893	GCC	2	6	20306	20311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011893	GCG	2	6	20777	20782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011893	TCC	2	6	20957	20962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_011893	AGC	2	6	21061	21066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011893	GCT	2	6	21081	21086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011893	TCG	2	6	21272	21277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011893	CTC	2	6	21328	21333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_011893	GCG	2	6	21391	21396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011893	AGT	2	6	21398	21403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011893	TCG	2	6	21460	21465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011893	GAT	2	6	21482	21487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011893	CTG	2	6	21500	21505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_011893	CGG	3	9	21572	21580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011893	CGC	2	6	21604	21609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011893	GCC	2	6	22234	22239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011893	GAA	2	6	23071	23076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011893	GCG	2	6	23192	23197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011893	GGT	2	6	23262	23267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011893	CTG	2	6	23338	23343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011893	TCA	2	6	23360	23365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011893	ATG	3	9	23418	23426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011893	CTG	2	6	23454	23459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011893	GAC	2	6	23485	23490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011893	CCG	2	6	23741	23746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_011893	AAC	2	6	23837	23842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011893	ATA	2	6	23919	23924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011893	GCA	2	6	24271	24276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011893	CAG	2	6	24381	24386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011893	CCG	2	6	24393	24398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011893	GCG	2	6	24493	24498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011893	GGC	2	6	24525	24530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011893	GCG	2	6	24617	24622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011893	AAG	2	6	25041	25046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011893	TGC	2	6	25080	25085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011893	CCT	2	6	25244	25249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011893	CCG	2	6	25272	25277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011893	GGT	2	6	26323	26328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011893	ACC	3	9	26336	26344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_011893	TCA	2	6	26527	26532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011893	GAT	2	6	26573	26578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011893	AGC	2	6	26582	26587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011893	AGC	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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195	NC_011893	CCT	2	6	40004	40009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.