MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD03

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011893	CG	3	6	280	285	0 %	0 %	50 %	50 %	220920001
2	NC_011893	CT	3	6	1728	1733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011893	CA	3	6	2012	2017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011893	GC	4	8	2036	2043	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011893	GA	3	6	2320	2325	50 %	0 %	50 %	0 %	220920003
6	NC_011893	CG	3	6	2584	2589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011893	CG	3	6	2664	2669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011893	GA	3	6	2938	2943	50 %	0 %	50 %	0 %	220920004
9	NC_011893	CA	3	6	3202	3207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011893	GT	3	6	3453	3458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011893	CG	3	6	3566	3571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_011893	GC	3	6	3763	3768	0 %	0 %	50 %	50 %	220920005
13	NC_011893	CG	4	8	4120	4127	0 %	0 %	50 %	50 %	220920005
14	NC_011893	GC	3	6	4429	4434	0 %	0 %	50 %	50 %	220920005
15	NC_011893	CG	3	6	5913	5918	0 %	0 %	50 %	50 %	220920006
16	NC_011893	CT	3	6	6622	6627	0 %	50 %	0 %	50 %	220920007
17	NC_011893	CT	3	6	7064	7069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011893	CG	4	8	7393	7400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011893	CG	4	8	7447	7454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011893	GC	3	6	7841	7846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011893	CG	3	6	7985	7990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011893	AC	3	6	8081	8086	50 %	0 %	0 %	50 %	220920009
23	NC_011893	CG	3	6	8104	8109	0 %	0 %	50 %	50 %	220920009
24	NC_011893	GC	3	6	8889	8894	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
25	NC_011893	CG	3	6	9295	9300	0 %	0 %	50 %	50 %	220920010
26	NC_011893	CG	3	6	10087	10092	0 %	0 %	50 %	50 %	220920011
27	NC_011893	CG	3	6	10252	10257	0 %	0 %	50 %	50 %	220920011
28	NC_011893	GC	3	6	10742	10747	0 %	0 %	50 %	50 %	220920012
29	NC_011893	AG	3	6	11198	11203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011893	TG	3	6	11207	11212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011893	GA	3	6	11343	11348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011893	GC	4	8	11936	11943	0 %	0 %	50 %	50 %	220920013
33	NC_011893	GC	3	6	12595	12600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011893	GC	3	6	13149	13154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011893	GC	3	6	13187	13192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011893	AG	3	6	13502	13507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011893	GT	3	6	13666	13671	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011893	CG	3	6	13722	13727	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011893	CT	3	6	14250	14255	0 %	50 %	0 %	50 %	220920018
40	NC_011893	CA	3	6	15266	15271	50 %	0 %	0 %	50 %	220920020
41	NC_011893	GT	3	6	15574	15579	0 %	50 %	50 %	0 %	220920020
42	NC_011893	TC	3	6	16251	16256	0 %	50 %	0 %	50 %	220920022
43	NC_011893	GC	3	6	16690	16695	0 %	0 %	50 %	50 %	220920024
44	NC_011893	GC	3	6	16937	16942	0 %	0 %	50 %	50 %	220920024
45	NC_011893	CG	3	6	17959	17964	0 %	0 %	50 %	50 %	220920024
46	NC_011893	CG	3	6	18317	18322	0 %	0 %	50 %	50 %	220920025
47	NC_011893	CG	3	6	18873	18878	0 %	0 %	50 %	50 %	220920026
48	NC_011893	CG	3	6	19153	19158	0 %	0 %	50 %	50 %	220920027
49	NC_011893	GC	3	6	19206	19211	0 %	0 %	50 %	50 %	220920027
50	NC_011893	GC	4	8	19532	19539	0 %	0 %	50 %	50 %	220920028
51	NC_011893	CG	3	6	19787	19792	0 %	0 %	50 %	50 %	220920029
52	NC_011893	CG	3	6	20482	20487	0 %	0 %	50 %	50 %	220920031
53	NC_011893	GC	3	6	21021	21026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011893	CG	3	6	21174	21179	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011893	TC	3	6	21249	21254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011893	GC	3	6	21836	21841	0 %	0 %	50 %	50 %	220920032
57	NC_011893	GC	3	6	21914	21919	0 %	0 %	50 %	50 %	220920032
58	NC_011893	TG	3	6	21989	21994	0 %	50 %	50 %	0 %	220920032
59	NC_011893	CG	3	6	22149	22154	0 %	0 %	50 %	50 %	220920032
60	NC_011893	CG	3	6	22327	22332	0 %	0 %	50 %	50 %	220920033
61	NC_011893	AG	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011893	CG	3	6	23581	23586	0 %	0 %	50 %	50 %	220920035
63	NC_011893	GC	3	6	24599	24604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011893	TG	3	6	25018	25023	0 %	50 %	50 %	0 %	220920037
65	NC_011893	GC	3	6	25391	25396	0 %	0 %	50 %	50 %	220920038
66	NC_011893	GC	3	6	25673	25678	0 %	0 %	50 %	50 %	220920038
67	NC_011893	CG	3	6	25930	25935	0 %	0 %	50 %	50 %	220920038
68	NC_011893	GC	3	6	27385	27390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_011893	CG	3	6	27538	27543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011893	AG	3	6	27597	27602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011893	TC	3	6	28384	28389	0 %	50 %	0 %	50 %	220920039
72	NC_011893	AG	3	6	28777	28782	50 %	0 %	50 %	0 %	220920040
73	NC_011893	CG	3	6	30674	30679	0 %	0 %	50 %	50 %	220920041
74	NC_011893	CG	3	6	30734	30739	0 %	0 %	50 %	50 %	220920041
75	NC_011893	TC	3	6	30835	30840	0 %	50 %	0 %	50 %	220920041
76	NC_011893	GC	3	6	30956	30961	0 %	0 %	50 %	50 %	220920041
77	NC_011893	CT	3	6	31564	31569	0 %	50 %	0 %	50 %	220920042
78	NC_011893	CG	3	6	31872	31877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011893	CT	4	8	32006	32013	0 %	50 %	0 %	50 %	220920043
80	NC_011893	GC	3	6	32198	32203	0 %	0 %	50 %	50 %	220920043
81	NC_011893	CG	3	6	32346	32351	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011893	TG	3	6	33228	33233	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011893	GC	3	6	33865	33870	0 %	0 %	50 %	50 %	220920045
84	NC_011893	GT	3	6	33944	33949	0 %	50 %	50 %	0 %	220920045
85	NC_011893	CT	3	6	34155	34160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011893	CG	3	6	34212	34217	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
87	NC_011893	CG	3	6	34538	34543	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
88	NC_011893	CG	5	10	34675	34684	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
89	NC_011893	CG	3	6	34820	34825	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
90	NC_011893	CG	3	6	35384	35389	0 %	0 %	50 %	50 %	220920046
91	NC_011893	GT	3	6	36394	36399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011893	CG	3	6	36526	36531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_011893	TG	3	6	36611	36616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011893	CG	3	6	36652	36657	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
95	NC_011893	GC	3	6	37171	37176	0 %	0 %	50 %	50 %	220920047
96	NC_011893	CG	4	8	37404	37411	0 %	0 %	50 %	50 %	220920048
97	NC_011893	CG	3	6	37755	37760	0 %	0 %	50 %	50 %	220920049
98	NC_011893	GC	3	6	38282	38287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_011893	GC	3	6	38599	38604	0 %	0 %	50 %	50 %	220920051
100	NC_011893	GT	3	6	38829	38834	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011893	GC	3	6	39235	39240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011893	GC	3	6	39428	39433	0 %	0 %	50 %	50 %	220920052

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.