MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD01

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011892	CGCGGA	2	12	5630	5641	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011892	GAGGGC	2	12	15142	15153	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011892	GTCCCG	2	12	35474	35485	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011892	CGGGAC	2	12	43641	43652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011892	ATCCAG	2	12	57090	57101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011892	GGGTTC	2	12	68790	68801	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011892	CCGGGT	2	12	81683	81694	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011892	GCGACC	2	12	87332	87343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011892	TCCGCT	2	12	102887	102898	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011892	AAGCGG	2	12	105941	105952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011892	AACTCG	2	12	121633	121644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011892	GCCTAC	2	12	122551	122562	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011892	GGCGCG	2	12	122607	122618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011892	CATGCG	2	12	143265	143276	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011892	GCCGTC	2	12	143402	143413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011892	GTCCCG	2	12	149302	149313	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011892	CATCCG	2	12	160497	160508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011892	ACCGCG	2	12	160580	160591	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_011892	GCCCGA	2	12	160998	161009	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011892	GCCGAG	2	12	161478	161489	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011892	GCCTCC	2	12	165094	165105	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011892	TGGCCT	2	12	194446	194457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011892	CGAGGA	2	12	199589	199600	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011892	CCGACG	3	18	234955	234972	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011892	CGAGCC	2	12	239218	239229	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011892	CTCGGC	2	12	240369	240380	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011892	CGAAGC	2	12	253049	253060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011892	GCGTCG	2	12	280981	280992	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011892	GCCCGC	2	12	283453	283464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011892	GCTCGC	2	12	288682	288693	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011892	GTCGAT	2	12	296420	296431	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011892	ATTTGC	2	12	314953	314964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011892	GCTGCA	2	12	316764	316775	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011892	GCGCGA	2	12	337154	337165	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011892	GGGTTC	2	12	351934	351945	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011892	CGGTTT	2	12	369574	369585	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_011892	GGATCG	2	12	377274	377285	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011892	GAACCT	2	12	381467	381478	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011892	GACGAG	2	12	385178	385189	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_011892	AGGTCG	2	12	385986	385997	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011892	CGGCCC	2	12	386763	386774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011892	GCCGAG	2	12	387040	387051	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011892	CTCGTG	2	12	387103	387114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011892	AAGGCA	2	12	394297	394308	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011892	CGTCGC	2	12	409829	409840	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011892	GCCGGC	2	12	413315	413326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011892	GATCGC	2	12	414132	414143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011892	TTTCTA	2	12	424043	424054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011892	AAACGG	2	12	425127	425138	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011892	CGCCCT	2	12	430118	430129	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011892	GCTTCG	2	12	430775	430786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011892	GTGGCC	2	12	437382	437393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011892	CCGTCG	2	12	440716	440727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011892	ATCCGG	2	12	441454	441465	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011892	GGTGTC	2	12	442979	442990	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011892	CCCATA	2	12	476553	476564	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011892	TGCGGG	2	12	480582	480593	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.