MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD01

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011892	CCGCG	2	10	943	952	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011892	CCTCA	2	10	4909	4918	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3	NC_011892	CCAGG	2	10	9221	9230	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011892	GAAGG	2	10	9522	9531	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011892	TCCGG	2	10	14730	14739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011892	GAACT	2	10	19583	19592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_011892	CAGGA	2	10	23634	23643	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_011892	CGGAG	3	15	25228	25242	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011892	CGCAA	2	10	30859	30868	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_011892	GGCTG	2	10	32617	32626	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011892	AGTAA	2	10	42779	42788	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011892	GCCGG	2	10	44177	44186	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011892	CTCAT	2	10	45148	45157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011892	GTCGC	2	10	47082	47091	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011892	CCGGG	2	10	50391	50400	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011892	ACCCG	2	10	57347	57356	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_011892	ATGGC	2	10	61112	61121	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_011892	CATGG	2	10	68698	68707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011892	CCCGG	2	10	69034	69043	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_011892	CCGGG	2	10	70364	70373	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_011892	GCCCG	2	10	73413	73422	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
22	NC_011892	CGGAC	2	10	80700	80709	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011892	TAGAG	2	10	81714	81723	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011892	GCGAG	2	10	82468	82477	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011892	GGCGG	2	10	84508	84517	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011892	GCGCC	2	10	87415	87424	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_011892	CGGCT	2	10	87534	87543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011892	AGCGA	2	10	90429	90438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011892	TCGGA	2	10	91505	91514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011892	GGTGC	2	10	91584	91593	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011892	CCCCG	2	10	105111	105120	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
32	NC_011892	AGATC	2	10	111938	111947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011892	TTGCC	2	10	114324	114333	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011892	TTTGC	2	10	117319	117328	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_011892	CGGCG	2	10	121360	121369	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011892	CGAGC	2	10	121548	121557	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011892	CGCCT	2	10	122174	122183	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_011892	CCGGT	2	10	122477	122486	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_011892	CGTGG	2	10	122673	122682	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011892	CGGCG	2	10	122754	122763	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011892	GCGCT	2	10	123563	123572	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011892	AGCCG	2	10	123743	123752	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011892	CTCGG	2	10	123928	123937	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011892	CGCGC	2	10	124209	124218	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_011892	GCTCC	2	10	127099	127108	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_011892	GAGGG	2	10	128726	128735	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011892	TCAGG	2	10	131330	131339	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011892	CGCCA	2	10	131402	131411	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_011892	CGAAC	2	10	146196	146205	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011892	CCGGC	2	10	148768	148777	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_011892	GCTGG	2	10	148812	148821	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
52	NC_011892	CCAGG	2	10	151046	151055	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_011892	TCGTG	2	10	156247	156256	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011892	GCCTG	2	10	161632	161641	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011892	CCGGC	2	10	163615	163624	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_011892	GCTGG	2	10	163659	163668	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011892	GCCCG	2	10	165122	165131	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_011892	TGAGT	2	10	166647	166656	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011892	TCCCC	2	10	173288	173297	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
60	NC_011892	CCGCC	2	10	177038	177047	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
61	NC_011892	TCACC	2	10	182139	182148	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_011892	TCCGC	2	10	195671	195680	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_011892	ATTTT	2	10	195682	195691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011892	TGATC	2	10	196249	196258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011892	GCATG	2	10	202177	202186	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011892	CACGC	2	10	202201	202210	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_011892	CGGCG	2	10	202721	202730	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_011892	GGTCT	2	10	220615	220624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_011892	GCCGC	2	10	223584	223593	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_011892	AAGCT	2	10	226556	226565	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011892	CCGGC	2	10	237818	237827	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_011892	ACCGC	2	10	238322	238331	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_011892	CTTGG	2	10	239047	239056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011892	CAGGC	2	10	240217	240226	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_011892	TTCCC	2	10	240950	240959	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_011892	AGTGC	2	10	261607	261616	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011892	TGCGC	2	10	267987	267996	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_011892	TGAGT	2	10	280211	280220	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011892	GGCGA	2	10	280472	280481	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_011892	AGCAC	2	10	280513	280522	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011892	AGGCA	2	10	281906	281915	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_011892	GTTTG	2	10	282195	282204	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011892	ACGAA	2	10	284832	284841	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011892	CAGCG	2	10	296296	296305	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011892	AACGC	2	10	296500	296509	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011892	CCCCT	2	10	312320	312329	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
87	NC_011892	GCTTC	2	10	312341	312350	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_011892	CAAAT	2	10	313536	313545	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011892	TTGGC	2	10	315579	315588	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011892	CGGCT	2	10	316518	316527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
91	NC_011892	CTCGG	2	10	317413	317422	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_011892	AGAGG	2	10	317545	317554	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011892	GAAAG	2	10	318534	318543	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011892	GCTGG	2	10	322053	322062	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_011892	GGCGA	2	10	336087	336096	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_011892	TGGCT	2	10	337072	337081	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011892	CGGAG	2	10	338169	338178	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011892	GTGGC	2	10	339359	339368	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011892	ATGGC	2	10	341570	341579	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011892	GGCCT	2	10	341758	341767	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_011892	GCGCT	2	10	348050	348059	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011892	GGTCG	2	10	349104	349113	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011892	GCGCG	3	15	349334	349348	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011892	CGCTC	2	10	352187	352196	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_011892	CGGGC	2	10	354926	354935	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011892	GCAGC	2	10	366741	366750	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011892	AGACG	2	10	375003	375012	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_011892	TCGCG	2	10	375039	375048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
109	NC_011892	CGAGG	2	10	377424	377433	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_011892	CCGAG	2	10	395301	395310	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011892	TGGCG	2	10	395337	395346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_011892	CAGCC	2	10	396703	396712	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_011892	GCCGC	2	10	409325	409334	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_011892	TCCTC	2	10	409634	409643	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_011892	GCCGT	2	10	409852	409861	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_011892	CGGCC	2	10	409929	409938	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_011892	GGCGG	2	10	413368	413377	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011892	CGGCG	2	10	413909	413918	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_011892	CCGTT	2	10	417423	417432	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_011892	TCGCC	2	10	425335	425344	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_011892	CCGAA	2	10	427066	427075	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011892	CCGGA	2	10	430535	430544	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011892	CTCGA	2	10	433601	433610	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_011892	GCAAA	2	10	434062	434071	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011892	TGGAG	2	10	434233	434242	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011892	CGCGC	2	10	437927	437936	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_011892	CAGGG	2	10	438161	438170	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011892	GCGCA	2	10	441789	441798	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_011892	GTGCG	2	10	450149	450158	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011892	GCCCA	2	10	454938	454947	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
131	NC_011892	TTCGT	2	10	469168	469177	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011892	GAGCG	2	10	474080	474089	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011892	CCGGC	2	10	477241	477250	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_011892	AGAAA	2	10	477536	477545	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011892	GCATA	2	10	477668	477677	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011892	CGGCC	2	10	478690	478699	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_011892	GCGCC	2	10	479347	479356	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_011892	TCGCC	2	10	480030	480039	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_011892	AGCCA	2	10	481443	481452	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_011892	CCATC	2	10	481757	481766	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
141	NC_011892	GTGCA	2	10	485950	485959	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_011892	CGCGC	2	10	487485	487494	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.