MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD07

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011890	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915116
2	NC_011890	GGA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915116
3	NC_011890	GCG	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
4	NC_011890	GGC	2	6	417	422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
5	NC_011890	GGC	2	6	438	443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
6	NC_011890	CGC	2	6	488	493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
7	NC_011890	GCC	2	6	498	503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915116
8	NC_011890	CGG	2	6	536	541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915116
9	NC_011890	TCG	2	6	1185	1190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915117
10	NC_011890	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915117
11	NC_011890	CCG	2	6	1320	1325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915117
12	NC_011890	CGG	2	6	2547	2552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915118
13	NC_011890	TGT	2	6	2732	2737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915118
14	NC_011890	CTG	2	6	2781	2786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915118
15	NC_011890	CGC	2	6	2848	2853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915118
16	NC_011890	CGT	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
17	NC_011890	GCC	2	6	3081	3086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
18	NC_011890	ACC	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
19	NC_011890	CGG	3	9	3132	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
20	NC_011890	TCG	2	6	3144	3149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
21	NC_011890	CGG	2	6	3167	3172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
22	NC_011890	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
23	NC_011890	CCT	2	6	3268	3273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
24	NC_011890	TCG	2	6	3274	3279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
25	NC_011890	CTG	2	6	3404	3409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
26	NC_011890	CGA	2	6	3439	3444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
27	NC_011890	CGC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
28	NC_011890	CGC	2	6	3589	3594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
29	NC_011890	TCA	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
30	NC_011890	TTG	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
31	NC_011890	AGC	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
32	NC_011890	GAC	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
33	NC_011890	GCA	2	6	3895	3900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
34	NC_011890	GCG	2	6	3981	3986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
35	NC_011890	TCA	2	6	4000	4005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
36	NC_011890	CGC	2	6	4082	4087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
37	NC_011890	GCG	2	6	4196	4201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
38	NC_011890	GCC	2	6	4237	4242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
39	NC_011890	TTG	2	6	4263	4268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
40	NC_011890	TCA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
41	NC_011890	GCA	2	6	4336	4341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
42	NC_011890	TGC	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
43	NC_011890	CAT	2	6	4550	4555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915119
44	NC_011890	TCC	3	9	4593	4601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915119
45	NC_011890	GAT	2	6	4604	4609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
46	NC_011890	GCT	2	6	4757	4762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
47	NC_011890	CAG	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
48	NC_011890	CCA	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915119
49	NC_011890	CCG	3	9	4839	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
50	NC_011890	CGC	2	6	4888	4893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
51	NC_011890	GAT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915119
52	NC_011890	TCG	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
53	NC_011890	ACG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
54	NC_011890	TGC	2	6	5049	5054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915119
55	NC_011890	AGC	2	6	5064	5069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
56	NC_011890	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220915119
57	NC_011890	CCG	2	6	5120	5125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
58	NC_011890	GCC	2	6	5131	5136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
59	NC_011890	CGG	2	6	5155	5160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
60	NC_011890	CAG	2	6	5251	5256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915119
61	NC_011890	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915119
62	NC_011890	CGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915119
63	NC_011890	GGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915120
64	NC_011890	GTC	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915120
65	NC_011890	CTC	2	6	6082	6087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
66	NC_011890	AGT	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
67	NC_011890	TGA	2	6	6245	6250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
68	NC_011890	TCC	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915120
69	NC_011890	TGA	2	6	6432	6437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915120
70	NC_011890	GCC	2	6	6442	6447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915120
71	NC_011890	AGG	2	6	6503	6508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915120
72	NC_011890	TCA	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915120
73	NC_011890	GCG	2	6	6621	6626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915121
74	NC_011890	TCA	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915121
75	NC_011890	CCA	2	6	8538	8543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915122
76	NC_011890	ACG	2	6	8547	8552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915122
77	NC_011890	GGC	2	6	8687	8692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
78	NC_011890	CGG	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
79	NC_011890	ACA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915122
80	NC_011890	TCG	2	6	8785	8790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915122
81	NC_011890	CGG	2	6	8822	8827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915122
82	NC_011890	CGT	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915122

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.