MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD06

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011889	GGCC	2	8	526	533	0 %	0 %	50 %	50 %	220915102
2	NC_011889	AACG	2	8	623	630	50 %	0 %	25 %	25 %	220915102
3	NC_011889	TGGG	2	8	809	816	0 %	25 %	75 %	0 %	220915102
4	NC_011889	GGAA	2	8	1091	1098	50 %	0 %	50 %	0 %	220915102
5	NC_011889	TCTG	2	8	1145	1152	0 %	50 %	25 %	25 %	220915102
6	NC_011889	GAAA	2	8	1356	1363	75 %	0 %	25 %	0 %	220915102
7	NC_011889	GGTC	2	8	1737	1744	0 %	25 %	50 %	25 %	220915102
8	NC_011889	GTCA	2	8	2646	2653	25 %	25 %	25 %	25 %	220915103
9	NC_011889	GGCG	2	8	2766	2773	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011889	ACGG	2	8	2833	2840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011889	ACGG	2	8	2883	2890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011889	GAAC	2	8	2897	2904	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011889	CGGA	2	8	2977	2984	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011889	ACCC	2	8	3061	3068	25 %	0 %	0 %	75 %	220915104
15	NC_011889	CCGA	2	8	3117	3124	25 %	0 %	25 %	50 %	220915104
16	NC_011889	GAGC	2	8	3152	3159	25 %	0 %	50 %	25 %	220915104
17	NC_011889	GCTC	2	8	3166	3173	0 %	25 %	25 %	50 %	220915104
18	NC_011889	TCGG	2	8	3647	3654	0 %	25 %	50 %	25 %	220915105
19	NC_011889	GTTC	2	8	4242	4249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011889	GTTC	2	8	4252	4259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011889	GGCG	2	8	4319	4326	0 %	0 %	75 %	25 %	220915106
22	NC_011889	GCCC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	25 %	75 %	220915106
23	NC_011889	ACCC	2	8	4377	4384	25 %	0 %	0 %	75 %	220915106
24	NC_011889	CGGA	2	8	4440	4447	25 %	0 %	50 %	25 %	220915106
25	NC_011889	GCCT	2	8	4622	4629	0 %	25 %	25 %	50 %	220915107
26	NC_011889	GCTT	2	8	4723	4730	0 %	50 %	25 %	25 %	220915107
27	NC_011889	GATA	2	8	4999	5006	50 %	25 %	25 %	0 %	220915107
28	NC_011889	ATGG	2	8	5435	5442	25 %	25 %	50 %	0 %	220915108
29	NC_011889	CGCC	2	8	6402	6409	0 %	0 %	25 %	75 %	220915108
30	NC_011889	GACG	2	8	6802	6809	25 %	0 %	50 %	25 %	220915108
31	NC_011889	TCCG	2	8	7297	7304	0 %	25 %	25 %	50 %	220915108
32	NC_011889	TCGG	2	8	7488	7495	0 %	25 %	50 %	25 %	220915108
33	NC_011889	GCGA	2	8	7780	7787	25 %	0 %	50 %	25 %	220915108
34	NC_011889	GGGC	2	8	7863	7870	0 %	0 %	75 %	25 %	220915108
35	NC_011889	TCGA	2	8	7879	7886	25 %	25 %	25 %	25 %	220915108
36	NC_011889	GCCG	2	8	8205	8212	0 %	0 %	50 %	50 %	220915109
37	NC_011889	GGGC	2	8	8219	8226	0 %	0 %	75 %	25 %	220915109
38	NC_011889	GAAG	2	8	8285	8292	50 %	0 %	50 %	0 %	220915109
39	NC_011889	AAGT	2	8	9710	9717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011889	CGGC	2	8	10418	10425	0 %	0 %	50 %	50 %	220915112
41	NC_011889	CGGC	2	8	10653	10660	0 %	0 %	50 %	50 %	220915112
42	NC_011889	CGAT	2	8	10671	10678	25 %	25 %	25 %	25 %	220915112
43	NC_011889	AGGC	2	8	10816	10823	25 %	0 %	50 %	25 %	220915112
44	NC_011889	CCTG	2	8	11380	11387	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011889	CGAT	2	8	11991	11998	25 %	25 %	25 %	25 %	220915113

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.