MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD06

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011889	GAT	2	6	294	299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
2	NC_011889	ATC	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
3	NC_011889	TGA	2	6	479	484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
4	NC_011889	AGA	3	9	599	607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
5	NC_011889	AGG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
6	NC_011889	AGC	2	6	716	721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
7	NC_011889	ACA	2	6	913	918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
8	NC_011889	AAT	3	9	927	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
9	NC_011889	AAC	2	6	945	950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
10	NC_011889	ATG	2	6	967	972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915102
11	NC_011889	ACG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
12	NC_011889	ATC	2	6	979	984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
13	NC_011889	GAG	2	6	993	998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915102
14	NC_011889	CCA	2	6	1023	1028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
15	NC_011889	TCA	2	6	1164	1169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
16	NC_011889	CAA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
17	NC_011889	ATT	2	6	1412	1417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220915102
18	NC_011889	CAA	2	6	1439	1444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
19	NC_011889	TAA	2	6	1475	1480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
20	NC_011889	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220915102
21	NC_011889	ACC	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915102
22	NC_011889	AGA	2	6	1562	1567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915102
23	NC_011889	AAC	3	9	1571	1579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915102
24	NC_011889	CAG	2	6	1624	1629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915102
25	NC_011889	CTA	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915102
26	NC_011889	GCC	2	6	2125	2130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
27	NC_011889	TGC	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
28	NC_011889	TCC	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915103
29	NC_011889	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915103
30	NC_011889	TGA	2	6	2459	2464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915103
31	NC_011889	CAC	2	6	2472	2477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220915103
32	NC_011889	GCC	2	6	2683	2688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915103
33	NC_011889	GCG	2	6	2704	2709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915103
34	NC_011889	GGT	2	6	2718	2723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915103
35	NC_011889	TGC	2	6	3031	3036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
36	NC_011889	GCT	2	6	3072	3077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915104
37	NC_011889	GCC	2	6	3108	3113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915104
38	NC_011889	GGA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915104
39	NC_011889	CAA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915104
40	NC_011889	GAA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915104
41	NC_011889	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
42	NC_011889	TGC	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
43	NC_011889	ATC	2	6	3631	3636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915105
44	NC_011889	CTG	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
45	NC_011889	GGT	2	6	3700	3705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915105
46	NC_011889	TCG	2	6	3737	3742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915105
47	NC_011889	CGG	2	6	3750	3755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
48	NC_011889	CGG	3	9	3882	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915105
49	NC_011889	GCC	2	6	4011	4016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915105
50	NC_011889	GAT	2	6	4528	4533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
51	NC_011889	CTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915107
52	NC_011889	CGA	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
53	NC_011889	GCT	2	6	4804	4809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
54	NC_011889	CGA	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
55	NC_011889	CAA	2	6	4834	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915107
56	NC_011889	GTC	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915107
57	NC_011889	AGC	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
58	NC_011889	ATG	2	6	4982	4987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
59	NC_011889	GAT	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915107
60	NC_011889	GCG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915107
61	NC_011889	GAC	2	6	5229	5234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915107
62	NC_011889	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
63	NC_011889	GCG	2	6	5682	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
64	NC_011889	CCG	2	6	5756	5761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
65	NC_011889	GCG	2	6	5778	5783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
66	NC_011889	GCG	2	6	5790	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
67	NC_011889	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
68	NC_011889	GCA	2	6	5862	5867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
69	NC_011889	CGT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
70	NC_011889	CGA	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
71	NC_011889	ATC	2	6	5986	5991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
72	NC_011889	CGC	2	6	6003	6008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
73	NC_011889	GGC	2	6	6022	6027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
74	NC_011889	GCG	2	6	6038	6043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
75	NC_011889	CGG	3	9	6069	6077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
76	NC_011889	TGG	2	6	6095	6100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
77	NC_011889	TGC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
78	NC_011889	GGT	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915108
79	NC_011889	CGA	2	6	6291	6296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
80	NC_011889	CAT	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
81	NC_011889	GAG	3	9	6316	6324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915108
82	NC_011889	CGA	2	6	6492	6497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
83	NC_011889	ATC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
84	NC_011889	CGG	2	6	6543	6548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
85	NC_011889	GCG	2	6	6587	6592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
86	NC_011889	AAG	2	6	6682	6687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915108
87	NC_011889	CGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
88	NC_011889	CAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915108
89	NC_011889	GCT	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
90	NC_011889	GCC	2	6	7053	7058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
91	NC_011889	AGC	2	6	7244	7249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
92	NC_011889	CGC	2	6	7323	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
93	NC_011889	GAT	3	9	7344	7352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220915108
94	NC_011889	CAA	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915108
95	NC_011889	GCG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
96	NC_011889	GCA	2	6	7480	7485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915108
97	NC_011889	CTC	2	6	7561	7566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915108
98	NC_011889	TGC	2	6	7706	7711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915108
99	NC_011889	CGG	2	6	7721	7726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915108
100	NC_011889	CCG	2	6	7810	7815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915108
101	NC_011889	AGG	2	6	7841	7846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915108
102	NC_011889	AGG	2	6	7853	7858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220915108
103	NC_011889	CCG	2	6	8358	8363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915109
104	NC_011889	GCA	2	6	8379	8384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915109
105	NC_011889	ACA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915110
106	NC_011889	ATT	2	6	8750	8755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220915110
107	NC_011889	AAC	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220915110
108	NC_011889	GAA	2	6	9002	9007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915110
109	NC_011889	GAA	2	6	9039	9044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915110
110	NC_011889	TCG	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915111
111	NC_011889	GAC	2	6	9399	9404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915111
112	NC_011889	GGC	2	6	9409	9414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915111
113	NC_011889	CCG	2	6	9453	9458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915111
114	NC_011889	CAT	2	6	9478	9483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220915111
115	NC_011889	GGC	2	6	10389	10394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915112
116	NC_011889	GCG	2	6	10399	10404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915112
117	NC_011889	CGG	2	6	10521	10526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915112
118	NC_011889	CTC	2	6	10535	10540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915112
119	NC_011889	CGG	2	6	10561	10566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915112
120	NC_011889	CCT	2	6	10594	10599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915112
121	NC_011889	GCA	3	9	10749	10757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915112
122	NC_011889	TTC	2	6	10758	10763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220915112
123	NC_011889	GGC	2	6	11517	11522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915113
124	NC_011889	CGA	2	6	11676	11681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915113
125	NC_011889	CTC	2	6	11771	11776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220915113
126	NC_011889	GCT	2	6	11884	11889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915113
127	NC_011889	GCG	2	6	11953	11958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915113
128	NC_011889	GCC	2	6	11968	11973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915113
129	NC_011889	AGA	2	6	11982	11987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915113
130	NC_011889	GTG	2	6	12027	12032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220915113
131	NC_011889	CGC	2	6	12139	12144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
132	NC_011889	GAA	2	6	12182	12187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220915114
133	NC_011889	CGC	2	6	12274	12279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
134	NC_011889	GCA	2	6	12310	12315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220915114
135	NC_011889	CCG	2	6	12321	12326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
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139	NC_011889	GCC	2	6	12452	12457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220915114
140	NC_011889	GGC	2	6	12481	12486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915114

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.