MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	CTGGT	2	10	128	137	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011888	GACAG	2	10	481	490	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011888	TTATA	2	10	615	624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011888	TGCGC	2	10	2628	2637	0 %	20 %	40 %	40 %	220915083
5	NC_011888	CGAGG	2	10	3283	3292	20 %	0 %	60 %	20 %	220915083
6	NC_011888	CATCC	2	10	3738	3747	20 %	20 %	0 %	60 %	220915083
7	NC_011888	TGCGC	2	10	5165	5174	0 %	20 %	40 %	40 %	220915085
8	NC_011888	TTGAT	2	10	6246	6255	20 %	60 %	20 %	0 %	220915087
9	NC_011888	CTCGC	2	10	8935	8944	0 %	20 %	20 %	60 %	220915090
10	NC_011888	GGCCG	2	10	9594	9603	0 %	0 %	60 %	40 %	220915091
11	NC_011888	GCTCG	2	10	10264	10273	0 %	20 %	40 %	40 %	220915092
12	NC_011888	GCCGC	2	10	11640	11649	0 %	0 %	40 %	60 %	220915094
13	NC_011888	AACGC	2	10	12585	12594	40 %	0 %	20 %	40 %	220915095
14	NC_011888	CTGCG	2	10	13219	13228	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_011888	CGAGT	2	10	15139	15148	20 %	20 %	40 %	20 %	220915097
16	NC_011888	CAAAA	2	10	16006	16015	80 %	0 %	0 %	20 %	220915098
17	NC_011888	AAAGG	2	10	16055	16064	60 %	0 %	40 %	0 %	220915098
18	NC_011888	CGGCG	2	10	18964	18973	0 %	0 %	60 %	40 %	220915099
19	NC_011888	GCAGC	2	10	19078	19087	20 %	0 %	40 %	40 %	220915099
20	NC_011888	CGCGG	2	10	19279	19288	0 %	0 %	60 %	40 %	220915100
21	NC_011888	AGCCG	2	10	19360	19369	20 %	0 %	40 %	40 %	220915100
22	NC_011888	AGCGC	2	10	20051	20060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.