MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD05

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011888	AGGT	2	8	112	119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011888	TGGA	2	8	1095	1102	25 %	25 %	50 %	0 %	220915081
3	NC_011888	CGCC	2	8	1468	1475	0 %	0 %	25 %	75 %	220915082
4	NC_011888	GTAA	2	8	1671	1678	50 %	25 %	25 %	0 %	220915082
5	NC_011888	GGCC	2	8	1766	1773	0 %	0 %	50 %	50 %	220915082
6	NC_011888	CCGC	2	8	1905	1912	0 %	0 %	25 %	75 %	220915083
7	NC_011888	GCCG	2	8	1945	1952	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
8	NC_011888	GCCG	2	8	2293	2300	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
9	NC_011888	GCCG	2	8	3378	3385	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
10	NC_011888	CCGG	2	8	3552	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	220915083
11	NC_011888	GCGG	2	8	4047	4054	0 %	0 %	75 %	25 %	220915083
12	NC_011888	GCTT	2	8	4289	4296	0 %	50 %	25 %	25 %	220915083
13	NC_011888	ACTC	2	8	4350	4357	25 %	25 %	0 %	50 %	220915083
14	NC_011888	CCGT	2	8	4568	4575	0 %	25 %	25 %	50 %	220915084
15	NC_011888	TCGA	2	8	4691	4698	25 %	25 %	25 %	25 %	220915085
16	NC_011888	TCCA	2	8	5029	5036	25 %	25 %	0 %	50 %	220915085
17	NC_011888	GCCG	2	8	5055	5062	0 %	0 %	50 %	50 %	220915085
18	NC_011888	GAGG	2	8	5332	5339	25 %	0 %	75 %	0 %	220915085
19	NC_011888	ACGG	2	8	5710	5717	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011888	TGAT	2	8	5851	5858	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
21	NC_011888	CCTT	2	8	5998	6005	0 %	50 %	0 %	50 %	220915087
22	NC_011888	TGAT	2	8	6701	6708	25 %	50 %	25 %	0 %	220915087
23	NC_011888	CTGC	2	8	7413	7420	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011888	CGCC	3	12	7489	7500	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
25	NC_011888	CGGT	2	8	7667	7674	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011888	TCGA	2	8	7853	7860	25 %	25 %	25 %	25 %	220915089
27	NC_011888	GCCG	2	8	8116	8123	0 %	0 %	50 %	50 %	220915089
28	NC_011888	GGTG	2	8	8372	8379	0 %	25 %	75 %	0 %	220915089
29	NC_011888	CGGG	2	8	8493	8500	0 %	0 %	75 %	25 %	220915089
30	NC_011888	GGAC	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011888	AGCG	2	8	8761	8768	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011888	TGTC	2	8	9142	9149	0 %	50 %	25 %	25 %	220915091
33	NC_011888	AGGT	2	8	9481	9488	25 %	25 %	50 %	0 %	220915091
34	NC_011888	CGCC	2	8	9529	9536	0 %	0 %	25 %	75 %	220915091
35	NC_011888	AGTC	2	8	9665	9672	25 %	25 %	25 %	25 %	220915091
36	NC_011888	CGTC	2	8	10177	10184	0 %	25 %	25 %	50 %	220915092
37	NC_011888	CCCG	2	8	10303	10310	0 %	0 %	25 %	75 %	220915092
38	NC_011888	CGCC	2	8	10493	10500	0 %	0 %	25 %	75 %	220915092
39	NC_011888	ACTC	2	8	10690	10697	25 %	25 %	0 %	50 %	220915092
40	NC_011888	GACG	2	8	11690	11697	25 %	0 %	50 %	25 %	220915094
41	NC_011888	CCGT	2	8	11832	11839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011888	GCCG	2	8	12072	12079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011888	GCTC	2	8	12453	12460	0 %	25 %	25 %	50 %	220915095
44	NC_011888	GCGA	2	8	12601	12608	25 %	0 %	50 %	25 %	220915095
45	NC_011888	AGCG	2	8	13129	13136	25 %	0 %	50 %	25 %	220915095
46	NC_011888	GGAG	2	8	13234	13241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011888	CACG	2	8	13394	13401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011888	AAGA	2	8	13880	13887	75 %	0 %	25 %	0 %	220915096
49	NC_011888	AATA	2	8	14133	14140	75 %	25 %	0 %	0 %	220915096
50	NC_011888	CGCC	2	8	14755	14762	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_011888	AGGC	2	8	14783	14790	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011888	GGAC	2	8	15015	15022	25 %	0 %	50 %	25 %	220915097
53	NC_011888	CGAT	2	8	15041	15048	25 %	25 %	25 %	25 %	220915097
54	NC_011888	ATTC	2	8	16342	16349	25 %	50 %	0 %	25 %	220915098
55	NC_011888	CGAA	2	8	17234	17241	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011888	GGGC	2	8	17452	17459	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011888	AGGT	2	8	17740	17747	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011888	ACCG	2	8	18305	18312	25 %	0 %	25 %	50 %	220915099
59	NC_011888	TCGG	2	8	18414	18421	0 %	25 %	50 %	25 %	220915099
60	NC_011888	TTCC	2	8	18686	18693	0 %	50 %	0 %	50 %	220915099
61	NC_011888	TGCT	2	8	19122	19129	0 %	50 %	25 %	25 %	220915099
62	NC_011888	CGAA	2	8	19418	19425	50 %	0 %	25 %	25 %	220915100
63	NC_011888	CCGG	2	8	19460	19467	0 %	0 %	50 %	50 %	220915100
64	NC_011888	CGCC	2	8	19489	19496	0 %	0 %	25 %	75 %	220915100
65	NC_011888	GCCA	2	8	19785	19792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_011888	GAGC	2	8	19899	19906	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011888	CGGG	2	8	20072	20079	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.