MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD02

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011887	GCCTGC	2	12	788	799	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914670
2	NC_011887	CCCGGC	2	12	2276	2287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914671
3	NC_011887	TCGCCC	2	12	3945	3956	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914672
4	NC_011887	ACGTCC	2	12	5035	5046	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914674
5	NC_011887	TGGTCG	2	12	5134	5145	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914674
6	NC_011887	GGCCGC	2	12	5423	5434	0 %	0 %	50 %	50 %	220914674
7	NC_011887	CGGCGA	2	12	6544	6555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914675
8	NC_011887	CATCGG	2	12	12214	12225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914679
9	NC_011887	GGCGCT	2	12	13790	13801	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914680
10	NC_011887	CGCGGC	2	12	13844	13855	0 %	0 %	50 %	50 %	220914680
11	NC_011887	CGTCCT	2	12	20173	20184	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220914687
12	NC_011887	GCACCA	2	12	30247	30258	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914693
13	NC_011887	CAGGAT	2	12	39585	39596	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914700
14	NC_011887	CGGGAT	2	12	44907	44918	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914704
15	NC_011887	GGTCTG	2	12	45114	45125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914704
16	NC_011887	ATCCCG	2	12	47127	47138	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914706
17	NC_011887	TCTTCG	2	12	48111	48122	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220914707
18	NC_011887	CGTGCT	2	12	49844	49855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914708
19	NC_011887	GGTCGA	2	12	52312	52323	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914710
20	NC_011887	GGTCCG	2	12	53592	53603	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914712
21	NC_011887	TCGCCG	2	12	59806	59817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914718
22	NC_011887	CGAGGT	2	12	60596	60607	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914718
23	NC_011887	ACGTCG	2	12	72179	72190	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914730
24	NC_011887	GAAGGC	2	12	73672	73683	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914731
25	NC_011887	TCACCG	2	12	76214	76225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914733
26	NC_011887	ACCGGC	2	12	76768	76779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914733
27	NC_011887	GAGGGC	2	12	78863	78874	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914734
28	NC_011887	TGCCGC	2	12	83715	83726	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914739
29	NC_011887	ACCAGC	2	12	83780	83791	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914739
30	NC_011887	TGGTGA	2	12	84362	84373	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220914739
31	NC_011887	GTGCCA	2	12	88355	88366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914741
32	NC_011887	CGTCCT	2	12	89250	89261	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220914742
33	NC_011887	AGATCG	2	12	97157	97168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914748
34	NC_011887	GCCTCC	2	12	98031	98042	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914749
35	NC_011887	CGTTGG	2	12	98089	98100	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914749
36	NC_011887	GGGCGA	2	12	98524	98535	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914749
37	NC_011887	GCCGGA	2	12	99789	99800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914752
38	NC_011887	CGGTGG	2	12	100713	100724	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914753
39	NC_011887	CGGCAA	2	12	104098	104109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914755
40	NC_011887	GCAGGA	2	12	109563	109574	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914762
41	NC_011887	GCGACC	2	12	109924	109935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914762
42	NC_011887	GCGGCC	2	12	112910	112921	0 %	0 %	50 %	50 %	220914763
43	NC_011887	CGCTTG	2	12	118254	118265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914766
44	NC_011887	CGTTGT	2	12	127005	127016	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	220914770
45	NC_011887	CTCATC	2	12	131229	131240	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220914773
46	NC_011887	CGCGCT	2	12	142102	142113	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914781
47	NC_011887	GCCATC	2	12	144375	144386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914783
48	NC_011887	TCGGCA	2	12	145051	145062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914783
49	NC_011887	GGCCTT	2	12	145307	145318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914784
50	NC_011887	CGGCGA	2	12	154367	154378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914792
51	NC_011887	GCCGAT	2	12	158225	158236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914797
52	NC_011887	GCCGCG	2	12	159925	159936	0 %	0 %	50 %	50 %	220914799
53	NC_011887	CTGCCG	2	12	163564	163575	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914802
54	NC_011887	CAGCGT	2	12	164352	164363	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914803
55	NC_011887	GCGCCC	2	12	168499	168510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914807
56	NC_011887	CTCGGC	2	12	172327	172338	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914810
57	NC_011887	CGAGGC	2	12	173917	173928	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914812
58	NC_011887	GACGAG	2	12	174235	174246	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914813
59	NC_011887	CGGAAC	2	12	174868	174879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914813
60	NC_011887	ATGCCG	2	12	175387	175398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914814
61	NC_011887	TGAAGA	2	12	175703	175714	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220914814
62	NC_011887	CAGGAC	2	12	185178	185189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914824
63	NC_011887	GCCCGC	2	12	187032	187043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914825
64	NC_011887	GAGATC	2	12	200744	200755	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914837
65	NC_011887	GCACCT	2	12	205399	205410	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914841
66	NC_011887	TCGCCG	2	12	206895	206906	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914841
67	NC_011887	GAACTC	2	12	207053	207064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220914841
68	NC_011887	CAGCAC	2	12	207683	207694	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914841
69	NC_011887	GTTGGG	2	12	208051	208062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220914842
70	NC_011887	GCGGGT	2	12	209015	209026	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914842
71	NC_011887	CGCGGG	2	12	209095	209106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220914842
72	NC_011887	GCCAGG	2	12	209996	210007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914843
73	NC_011887	CATCAC	2	12	216925	216936	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220914849
74	NC_011887	AGGCGC	2	12	218753	218764	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914851
75	NC_011887	CCGAGC	2	12	219023	219034	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914851
76	NC_011887	GCGGCC	2	12	223815	223826	0 %	0 %	50 %	50 %	220914855
77	NC_011887	TCGGGG	2	12	225736	225747	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914856
78	NC_011887	CAGCGC	2	12	225768	225779	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914856
79	NC_011887	GAACTG	2	12	226563	226574	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914857
80	NC_011887	GGAACC	2	12	238982	238993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914864
81	NC_011887	GCCATC	2	12	239162	239173	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914864
82	NC_011887	TCACCG	2	12	247263	247274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914873
83	NC_011887	GACGGC	2	12	252598	252609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914878
84	NC_011887	ACCGGG	2	12	255867	255878	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914882
85	NC_011887	GGTCCG	2	12	256107	256118	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914882
86	NC_011887	CAAGGC	2	12	257519	257530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914884
87	NC_011887	GCGCAG	2	12	258347	258358	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914885
88	NC_011887	CGAGGC	2	12	258933	258944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914886
89	NC_011887	AGACCG	2	12	259056	259067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914886
90	NC_011887	GTCCGG	2	12	259740	259751	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914887
91	NC_011887	GACCGC	2	12	260175	260186	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914887
92	NC_011887	TCCGGG	2	12	261203	261214	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914888
93	NC_011887	CGGCAC	2	12	261262	261273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914888
94	NC_011887	GAGCGA	2	12	262991	263002	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914891
95	NC_011887	CTTGGC	2	12	263548	263559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914892
96	NC_011887	GCGGTC	2	12	268057	268068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914894
97	NC_011887	GCGACG	2	12	270629	270640	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914896
98	NC_011887	CGCCGT	2	12	272591	272602	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914898
99	NC_011887	CGTCGA	2	12	272795	272806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914898
100	NC_011887	CTTCGG	2	12	275251	275262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914900
101	NC_011887	CCGCGG	2	12	276840	276851	0 %	0 %	50 %	50 %	220914902
102	NC_011887	CCATGA	2	12	277551	277562	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220914903
103	NC_011887	TGGTGC	2	12	278388	278399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914903
104	NC_011887	GGCATG	2	12	281325	281336	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914906
105	NC_011887	CTGTTC	2	12	281517	281528	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220914906
106	NC_011887	GGCGCA	2	12	281675	281686	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914906
107	NC_011887	ATATTT	2	12	282728	282739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220914907
108	NC_011887	CGACCA	2	12	283061	283072	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914907
109	NC_011887	ATCGGC	2	12	285248	285259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914911
110	NC_011887	CGGCCG	2	12	289468	289479	0 %	0 %	50 %	50 %	220914916
111	NC_011887	CGAGGT	2	12	289742	289753	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914916
112	NC_011887	GCGCAG	2	12	291213	291224	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914918
113	NC_011887	CCGGCC	2	12	291228	291239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914918
114	NC_011887	GGACAG	2	12	294261	294272	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914920
115	NC_011887	CGCAGC	2	12	294910	294921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914921
116	NC_011887	GGTCGA	2	12	295496	295507	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914921
117	NC_011887	TGGGCG	2	12	298817	298828	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914923
118	NC_011887	CGAGAT	2	12	299756	299767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914924
119	NC_011887	ACGGCG	2	12	302599	302610	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914925
120	NC_011887	CCTCGC	2	12	305864	305875	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914926
121	NC_011887	GTCGCG	2	12	310235	310246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914933
122	NC_011887	CGGCCG	2	12	313744	313755	0 %	0 %	50 %	50 %	220914937
123	NC_011887	CGCCGG	2	12	313880	313891	0 %	0 %	50 %	50 %	220914937
124	NC_011887	GTGCTG	2	12	314708	314719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914938
125	NC_011887	CTGAAG	2	12	316175	316186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914939
126	NC_011887	GCTTGC	2	12	319492	319503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914942
127	NC_011887	TCGTGA	2	12	320623	320634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220914943
128	NC_011887	CGACGC	2	12	321452	321463	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914943
129	NC_011887	CCAGGT	2	12	322689	322700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914944
130	NC_011887	CCCGAA	2	12	323879	323890	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914945
131	NC_011887	ACCGCG	2	12	324778	324789	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914946
132	NC_011887	GAACAG	2	12	325623	325634	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220914946
133	NC_011887	GGCCTG	2	12	328165	328176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914948
134	NC_011887	TCTCGA	2	12	330209	330220	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220914950
135	NC_011887	TGGGCG	2	12	337116	337127	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914959
136	NC_011887	TGATCG	2	12	337138	337149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220914959
137	NC_011887	GTCTCG	2	12	341347	341358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914964
138	NC_011887	GCTGGC	2	12	342247	342258	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914965
139	NC_011887	GCCTCG	2	12	346132	346143	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914969
140	NC_011887	CCGGCA	2	12	346995	347006	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914970
141	NC_011887	CGTCAG	2	12	349685	349696	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914972
142	NC_011887	CGATCG	2	12	349888	349899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914972
143	NC_011887	GCCCGC	2	12	350096	350107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914972
144	NC_011887	AGCCGC	2	12	353005	353016	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914975
145	NC_011887	CTGAAG	2	12	365172	365183	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914990
146	NC_011887	CGTCAT	2	12	365863	365874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220914990
147	NC_011887	GCAGCC	2	12	368512	368523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914991
148	NC_011887	CTCGAC	2	12	371574	371585	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914995
149	NC_011887	CATCGG	2	12	371673	371684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914995
150	NC_011887	GCCGCG	2	12	371769	371780	0 %	0 %	50 %	50 %	220914996
151	NC_011887	CCTGCT	2	12	374778	374789	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220915000
152	NC_011887	CGGCTC	2	12	376201	376212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220915001
153	NC_011887	GCCTCG	2	12	378106	378117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220915002
154	NC_011887	CTCTTG	2	12	380019	380030	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220915004
155	NC_011887	CTTGCT	3	18	380063	380080	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220915004
156	NC_011887	GGGCCG	2	12	386646	386657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915009
157	NC_011887	CGGGGC	2	12	388064	388075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915010
158	NC_011887	CGCCCT	2	12	388305	388316	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220915011
159	NC_011887	TGCGAG	2	12	391239	391250	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220915014
160	NC_011887	CTGCCA	2	12	392279	392290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220915014
161	NC_011887	GCCGGC	2	12	392966	392977	0 %	0 %	50 %	50 %	220915014
162	NC_011887	GGCCAG	2	12	395184	395195	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915017
163	NC_011887	GGCGTT	2	12	396046	396057	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220915019
164	NC_011887	CAGCGC	2	12	396475	396486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220915019
165	NC_011887	GCGCCG	2	12	397017	397028	0 %	0 %	50 %	50 %	220915020
166	NC_011887	AGGCGC	2	12	397713	397724	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915021
167	NC_011887	GGCCCA	2	12	410529	410540	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220915034
168	NC_011887	TGAGCT	2	12	411565	411576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220915035
169	NC_011887	TTCGCC	2	12	412464	412475	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220915038
170	NC_011887	CGAGCG	2	12	417884	417895	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915042
171	NC_011887	AGAACA	2	12	423021	423032	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220915045
172	NC_011887	GCTACG	2	12	429327	429338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220915051
173	NC_011887	TCCTGA	2	12	430883	430894	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220915053
174	NC_011887	AGCCGG	2	12	431109	431120	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915053
175	NC_011887	TCGGCT	2	12	433128	433139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915055
176	NC_011887	TCCGCG	2	12	436254	436265	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220915057
177	NC_011887	GGATCG	2	12	440946	440957	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220915064
178	NC_011887	GCCGGA	2	12	441350	441361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915065
179	NC_011887	TCTGGC	2	12	444528	444539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220915068
180	NC_011887	CCATCG	2	12	446672	446683	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220915069
181	NC_011887	CGCGCT	2	12	447084	447095	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220915069
182	NC_011887	CGCCTG	2	12	447304	447315	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220915069
183	NC_011887	TCCTGC	2	12	447566	447577	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220915069
184	NC_011887	AGGCGC	2	12	449270	449281	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220915071
185	NC_011887	GCGACC	2	12	450967	450978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220915074
186	NC_011887	CCCGGA	2	12	451353	451364	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220915075
187	NC_011887	GGGCGC	2	12	456519	456530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220915077

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.