MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD02

Total Repeats: 285

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011887	GGGTC	2	10	509	518	0 %	20 %	60 %	20 %	220914670
2	NC_011887	TCGCC	2	10	653	662	0 %	20 %	20 %	60 %	220914670
3	NC_011887	CTCGC	2	10	3362	3371	0 %	20 %	20 %	60 %	220914672
4	NC_011887	GGGCC	2	10	3414	3423	0 %	0 %	60 %	40 %	220914672
5	NC_011887	GCGCT	2	10	3710	3719	0 %	20 %	40 %	40 %	220914672
6	NC_011887	GCAAG	2	10	4958	4967	40 %	0 %	40 %	20 %	220914674
7	NC_011887	GGATC	2	10	7280	7289	20 %	20 %	40 %	20 %	220914676
8	NC_011887	CTGCG	2	10	7892	7901	0 %	20 %	40 %	40 %	220914676
9	NC_011887	CGTTC	2	10	11623	11632	0 %	40 %	20 %	40 %	220914679
10	NC_011887	TCCCG	2	10	14801	14810	0 %	20 %	20 %	60 %	220914682
11	NC_011887	CGGCC	2	10	15187	15196	0 %	0 %	40 %	60 %	220914683
12	NC_011887	TCGCG	2	10	16506	16515	0 %	20 %	40 %	40 %	220914684
13	NC_011887	CGGCC	2	10	18613	18622	0 %	0 %	40 %	60 %	220914686
14	NC_011887	CCGCT	2	10	18634	18643	0 %	20 %	20 %	60 %	220914686
15	NC_011887	CGACC	2	10	19152	19161	20 %	0 %	20 %	60 %	220914686
16	NC_011887	TGCGC	2	10	20089	20098	0 %	20 %	40 %	40 %	220914687
17	NC_011887	TGTTT	2	10	23569	23578	0 %	80 %	20 %	0 %	220914690
18	NC_011887	CGGCC	2	10	29286	29295	0 %	0 %	40 %	60 %	220914692
19	NC_011887	TCGCC	2	10	30787	30796	0 %	20 %	20 %	60 %	220914693
20	NC_011887	GGGCC	2	10	31190	31199	0 %	0 %	60 %	40 %	220914694
21	NC_011887	CCGGT	2	10	32213	32222	0 %	20 %	40 %	40 %	220914694
22	NC_011887	CGTCC	2	10	33534	33543	0 %	20 %	20 %	60 %	220914695
23	NC_011887	GGCGA	2	10	35598	35607	20 %	0 %	60 %	20 %	220914696
24	NC_011887	CGGCC	2	10	36286	36295	0 %	0 %	40 %	60 %	220914697
25	NC_011887	GGCGA	2	10	38433	38442	20 %	0 %	60 %	20 %	220914699
26	NC_011887	GCCGA	2	10	40954	40963	20 %	0 %	40 %	40 %	220914701
27	NC_011887	TGATC	2	10	41329	41338	20 %	40 %	20 %	20 %	220914701
28	NC_011887	GTCAT	2	10	42237	42246	20 %	40 %	20 %	20 %	220914702
29	NC_011887	ATCAG	2	10	43435	43444	40 %	20 %	20 %	20 %	220914703
30	NC_011887	GACGC	2	10	43668	43677	20 %	0 %	40 %	40 %	220914703
31	NC_011887	CTCGG	2	10	45394	45403	0 %	20 %	40 %	40 %	220914705
32	NC_011887	GCCCG	2	10	46413	46422	0 %	0 %	40 %	60 %	220914705
33	NC_011887	CGACG	2	10	47147	47156	20 %	0 %	40 %	40 %	220914706
34	NC_011887	CCCCA	2	10	47963	47972	20 %	0 %	0 %	80 %	220914706
35	NC_011887	GCGCC	2	10	48458	48467	0 %	0 %	40 %	60 %	220914707
36	NC_011887	TCGGC	2	10	49242	49251	0 %	20 %	40 %	40 %	220914707
37	NC_011887	CGGCC	2	10	49490	49499	0 %	0 %	40 %	60 %	220914708
38	NC_011887	CCTGG	2	10	49535	49544	0 %	20 %	40 %	40 %	220914708
39	NC_011887	CGGCG	2	10	49560	49569	0 %	0 %	60 %	40 %	220914708
40	NC_011887	CCCGA	2	10	52079	52088	20 %	0 %	20 %	60 %	220914710
41	NC_011887	AAGGC	2	10	52278	52287	40 %	0 %	40 %	20 %	220914710
42	NC_011887	CAGGG	2	10	52790	52799	20 %	0 %	60 %	20 %	220914711
43	NC_011887	TTTCT	2	10	61913	61922	0 %	80 %	0 %	20 %	220914719
44	NC_011887	CCGGC	2	10	65511	65520	0 %	0 %	40 %	60 %	220914722
45	NC_011887	TCGCC	2	10	67650	67659	0 %	20 %	20 %	60 %	220914724
46	NC_011887	CGCGC	2	10	70548	70557	0 %	0 %	40 %	60 %	220914729
47	NC_011887	CGCTG	2	10	71559	71568	0 %	20 %	40 %	40 %	220914729
48	NC_011887	AAGCC	2	10	71865	71874	40 %	0 %	20 %	40 %	220914730
49	NC_011887	CCGCG	2	10	73377	73386	0 %	0 %	40 %	60 %	220914731
50	NC_011887	CCGAG	2	10	75697	75706	20 %	0 %	40 %	40 %	220914732
51	NC_011887	AGCCG	2	10	76400	76409	20 %	0 %	40 %	40 %	220914733
52	NC_011887	GGCCG	2	10	76671	76680	0 %	0 %	60 %	40 %	220914733
53	NC_011887	CGCGG	2	10	76805	76814	0 %	0 %	60 %	40 %	220914733
54	NC_011887	GCGCC	2	10	78311	78320	0 %	0 %	40 %	60 %	220914734
55	NC_011887	CCGAG	2	10	80086	80095	20 %	0 %	40 %	40 %	220914735
56	NC_011887	GCCCC	2	10	80861	80870	0 %	0 %	20 %	80 %	220914736
57	NC_011887	GCGCC	2	10	81048	81057	0 %	0 %	40 %	60 %	220914736
58	NC_011887	GACCC	2	10	81882	81891	20 %	0 %	20 %	60 %	220914737
59	NC_011887	TCGGG	2	10	85542	85551	0 %	20 %	60 %	20 %	220914739
60	NC_011887	ATCGA	2	10	86533	86542	40 %	20 %	20 %	20 %	220914740
61	NC_011887	AATTC	2	10	87849	87858	40 %	40 %	0 %	20 %	220914741
62	NC_011887	TGCGC	2	10	89166	89175	0 %	20 %	40 %	40 %	220914742
63	NC_011887	CATCC	2	10	90314	90323	20 %	20 %	0 %	60 %	220914743
64	NC_011887	GCCCA	2	10	91994	92003	20 %	0 %	20 %	60 %	220914744
65	NC_011887	GAGCG	2	10	93533	93542	20 %	0 %	60 %	20 %	220914746
66	NC_011887	TTGCC	2	10	93619	93628	0 %	40 %	20 %	40 %	220914746
67	NC_011887	TCCCG	2	10	97068	97077	0 %	20 %	20 %	60 %	220914748
68	NC_011887	CGCGG	2	10	97086	97095	0 %	0 %	60 %	40 %	220914748
69	NC_011887	GGCGC	2	10	98909	98918	0 %	0 %	60 %	40 %	220914750
70	NC_011887	CGGGT	2	10	100787	100796	0 %	20 %	60 %	20 %	220914753
71	NC_011887	TCTGA	2	10	100964	100973	20 %	40 %	20 %	20 %	220914753
72	NC_011887	CCGAG	2	10	102619	102628	20 %	0 %	40 %	40 %	220914754
73	NC_011887	CGAAG	2	10	105935	105944	40 %	0 %	40 %	20 %	220914757
74	NC_011887	CGAGC	2	10	106766	106775	20 %	0 %	40 %	40 %	220914758
75	NC_011887	GCCGC	2	10	106925	106934	0 %	0 %	40 %	60 %	220914758
76	NC_011887	GCGCC	2	10	108205	108214	0 %	0 %	40 %	60 %	220914760
77	NC_011887	CTCGG	2	10	113407	113416	0 %	20 %	40 %	40 %	220914764
78	NC_011887	CCATG	2	10	117426	117435	20 %	20 %	20 %	40 %	220914766
79	NC_011887	GCGTA	2	10	117509	117518	20 %	20 %	40 %	20 %	220914766
80	NC_011887	CACGC	2	10	120996	121005	20 %	0 %	20 %	60 %	220914767
81	NC_011887	GCCCG	2	10	121181	121190	0 %	0 %	40 %	60 %	220914767
82	NC_011887	AGCCA	2	10	121447	121456	40 %	0 %	20 %	40 %	220914767
83	NC_011887	GACAT	2	10	125094	125103	40 %	20 %	20 %	20 %	220914769
84	NC_011887	TCGGT	2	10	127093	127102	0 %	40 %	40 %	20 %	220914770
85	NC_011887	CGGCC	2	10	131111	131120	0 %	0 %	40 %	60 %	220914773
86	NC_011887	CGCGG	2	10	131330	131339	0 %	0 %	60 %	40 %	220914773
87	NC_011887	TTCCG	2	10	131370	131379	0 %	40 %	20 %	40 %	220914773
88	NC_011887	GGTCG	2	10	132723	132732	0 %	20 %	60 %	20 %	220914774
89	NC_011887	GCGCA	2	10	137941	137950	20 %	0 %	40 %	40 %	220914777
90	NC_011887	CGTCG	2	10	144155	144164	0 %	20 %	40 %	40 %	220914783
91	NC_011887	TGAGG	2	10	146284	146293	20 %	20 %	60 %	0 %	220914785
92	NC_011887	CTGCC	2	10	148322	148331	0 %	20 %	20 %	60 %	220914788
93	NC_011887	ACGCG	2	10	148910	148919	20 %	0 %	40 %	40 %	220914789
94	NC_011887	CAGAT	2	10	152010	152019	40 %	20 %	20 %	20 %	220914791
95	NC_011887	GACGC	2	10	153830	153839	20 %	0 %	40 %	40 %	220914792
96	NC_011887	CTCGC	2	10	154655	154664	0 %	20 %	20 %	60 %	220914793
97	NC_011887	CAGCC	2	10	157032	157041	20 %	0 %	20 %	60 %	220914795
98	NC_011887	TCGGC	2	10	163858	163867	0 %	20 %	40 %	40 %	220914802
99	NC_011887	GTCTC	2	10	166655	166664	0 %	40 %	20 %	40 %	220914805
100	NC_011887	CGAGA	2	10	167440	167449	40 %	0 %	40 %	20 %	220914807
101	NC_011887	CTTCG	2	10	167563	167572	0 %	40 %	20 %	40 %	220914807
102	NC_011887	GCCGC	2	10	170876	170885	0 %	0 %	40 %	60 %	220914809
103	NC_011887	GCCCT	2	10	171658	171667	0 %	20 %	20 %	60 %	220914810
104	NC_011887	GCGCA	2	10	172256	172265	20 %	0 %	40 %	40 %	220914810
105	NC_011887	GCGTC	2	10	172691	172700	0 %	20 %	40 %	40 %	220914810
106	NC_011887	GCCGG	2	10	173194	173203	0 %	0 %	60 %	40 %	220914811
107	NC_011887	CGGCG	2	10	173929	173938	0 %	0 %	60 %	40 %	220914812
108	NC_011887	CCCGA	2	10	175055	175064	20 %	0 %	20 %	60 %	220914814
109	NC_011887	GCCGC	2	10	175128	175137	0 %	0 %	40 %	60 %	220914814
110	NC_011887	GGTCC	2	10	176565	176574	0 %	20 %	40 %	40 %	220914815
111	NC_011887	AGCGC	2	10	177103	177112	20 %	0 %	40 %	40 %	220914815
112	NC_011887	CGCGC	2	10	178405	178414	0 %	0 %	40 %	60 %	220914817
113	NC_011887	CACTT	2	10	182366	182375	20 %	40 %	0 %	40 %	220914821
114	NC_011887	ACGGC	2	10	182451	182460	20 %	0 %	40 %	40 %	220914821
115	NC_011887	GGTCC	2	10	189627	189636	0 %	20 %	40 %	40 %	220914827
116	NC_011887	CGTGC	2	10	192299	192308	0 %	20 %	40 %	40 %	220914830
117	NC_011887	CTTCG	2	10	193042	193051	0 %	40 %	20 %	40 %	220914831
118	NC_011887	GGTCG	2	10	197300	197309	0 %	20 %	60 %	20 %	220914835
119	NC_011887	GGTGC	2	10	199706	199715	0 %	20 %	60 %	20 %	220914837
120	NC_011887	GCTCA	2	10	201149	201158	20 %	20 %	20 %	40 %	220914837
121	NC_011887	TCAGC	2	10	201346	201355	20 %	20 %	20 %	40 %	220914837
122	NC_011887	ACGGC	2	10	202902	202911	20 %	0 %	40 %	40 %	220914838
123	NC_011887	GCCCC	2	10	204632	204641	0 %	0 %	20 %	80 %	220914841
124	NC_011887	CGGCA	2	10	205643	205652	20 %	0 %	40 %	40 %	220914841
125	NC_011887	CCGAG	2	10	206089	206098	20 %	0 %	40 %	40 %	220914841
126	NC_011887	GCCGC	2	10	206921	206930	0 %	0 %	40 %	60 %	220914841
127	NC_011887	GCCCG	2	10	211091	211100	0 %	0 %	40 %	60 %	220914845
128	NC_011887	CAGGA	2	10	215730	215739	40 %	0 %	40 %	20 %	220914848
129	NC_011887	ACCGC	2	10	217554	217563	20 %	0 %	20 %	60 %	220914850
130	NC_011887	GCGCT	2	10	219047	219056	0 %	20 %	40 %	40 %	220914851
131	NC_011887	CGCAT	2	10	221165	221174	20 %	20 %	20 %	40 %	220914853
132	NC_011887	CCGCA	2	10	225309	225318	20 %	0 %	20 %	60 %	220914856
133	NC_011887	ATCGA	2	10	228047	228056	40 %	20 %	20 %	20 %	220914858
134	NC_011887	CCGAC	2	10	228478	228487	20 %	0 %	20 %	60 %	220914858
135	NC_011887	TCGTC	2	10	233901	233910	0 %	40 %	20 %	40 %	220914860
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249	NC_011887	TCGAG	2	10	395231	395240	20 %	20 %	40 %	20 %	220915017
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255	NC_011887	GCTCA	2	10	407266	407275	20 %	20 %	20 %	40 %	220915032
256	NC_011887	GGCGC	2	10	411155	411164	0 %	0 %	60 %	40 %	220915035
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258	NC_011887	AAGGT	2	10	417661	417670	40 %	20 %	40 %	0 %	220915042
259	NC_011887	TGAGC	2	10	417681	417690	20 %	20 %	40 %	20 %	220915042
260	NC_011887	GGCGC	2	10	418873	418882	0 %	0 %	60 %	40 %	220915043
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262	NC_011887	GCCAC	2	10	421027	421036	20 %	0 %	20 %	60 %	220915044
263	NC_011887	AGGCC	2	10	421241	421250	20 %	0 %	40 %	40 %	220915044
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265	NC_011887	GCCGC	2	10	428081	428090	0 %	0 %	40 %	60 %	220915050
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.