MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium nodulans ORS 2060 plasmid pMNOD02

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011887	GATC	2	8	4862	4869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011887	ACCA	2	8	7949	7956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011887	GGCT	2	8	8673	8680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011887	CGGC	2	8	8831	8838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011887	TTCG	2	8	8882	8889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011887	GCCG	2	8	9026	9033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011887	TCCC	2	8	12666	12673	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_011887	GCTC	2	8	13086	13093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011887	GGAC	2	8	13098	13105	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011887	CCTG	2	8	13278	13285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011887	ACGG	2	8	13453	13460	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011887	TCGC	2	8	14365	14372	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011887	GCAA	2	8	17874	17881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_011887	TCGC	2	8	17909	17916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011887	GCCA	2	8	18016	18023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011887	GCAA	2	8	18224	18231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011887	AGTT	2	8	18368	18375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011887	TACT	2	8	20913	20920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011887	GCCG	2	8	21112	21119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011887	CAGC	2	8	21289	21296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_011887	ATCG	2	8	24774	24781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011887	TGGT	2	8	26723	26730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011887	CGCC	2	8	26766	26773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_011887	GCAG	2	8	27923	27930	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011887	CCGC	2	8	28230	28237	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_011887	AACC	2	8	28341	28348	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011887	CGAA	2	8	28570	28577	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_011887	GTCC	2	8	28600	28607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011887	CGGT	2	8	35758	35765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011887	AAAG	2	8	42523	42530	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011887	TGGT	2	8	43928	43935	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011887	CGCC	2	8	46681	46688	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_011887	GTCG	2	8	50566	50573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011887	GCCT	2	8	50774	50781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011887	GGCC	2	8	50857	50864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_011887	GCAG	2	8	51177	51184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011887	TCAG	2	8	51441	51448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011887	AGCG	2	8	55492	55499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011887	ATTT	2	8	56354	56361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011887	AGCC	2	8	56713	56720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011887	GCCG	2	8	57250	57257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011887	CTCC	2	8	57817	57824	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_011887	CGGC	2	8	58051	58058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_011887	CCCA	2	8	58621	58628	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_011887	CGAC	2	8	61291	61298	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011887	CTCG	2	8	61743	61750	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011887	GGCG	2	8	62129	62136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_011887	CGCC	2	8	62555	62562	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_011887	GGTC	2	8	68730	68737	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_011887	CTTC	2	8	72317	72324	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011887	CGGC	2	8	72345	72352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011887	GTTG	2	8	74995	75002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011887	GGCC	2	8	77838	77845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011887	GCTG	2	8	77865	77872	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011887	GCCC	2	8	78089	78096	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_011887	GTTG	2	8	79384	79391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011887	TATC	2	8	81276	81283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011887	GGTA	2	8	81284	81291	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011887	CTAT	2	8	81333	81340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011887	CTTC	2	8	87052	87059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011887	CAGG	2	8	87289	87296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011887	TACT	2	8	89990	89997	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011887	CCGC	2	8	94602	94609	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_011887	GTCT	2	8	94671	94678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011887	GCTG	2	8	95074	95081	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011887	TCGG	2	8	98699	98706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_011887	ACCC	2	8	98729	98736	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_011887	GTCA	2	8	98740	98747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_011887	GGGC	2	8	100429	100436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011887	GCCT	2	8	101710	101717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011887	TGGG	2	8	102769	102776	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011887	GTCG	2	8	103158	103165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011887	CGAG	2	8	107740	107747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011887	AGGT	2	8	108875	108882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011887	CAGA	2	8	108905	108912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_011887	GACA	2	8	109144	109151	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_011887	GCTT	2	8	116385	116392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_011887	ACGG	2	8	118984	118991	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011887	TCGA	2	8	119088	119095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011887	GCCG	2	8	119451	119458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011887	ATCG	2	8	119482	119489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_011887	TTGC	2	8	119560	119567	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011887	TGGG	2	8	120680	120687	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011887	GGAT	2	8	123263	123270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011887	GCCA	2	8	123424	123431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011887	ACCG	2	8	124333	124340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011887	AGAT	2	8	126205	126212	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011887	CTTC	2	8	126311	126318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011887	GCTC	2	8	126429	126436	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011887	GGCG	2	8	127539	127546	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011887	GCCG	2	8	128305	128312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011887	CGAA	2	8	128796	128803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_011887	TCCT	2	8	129699	129706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011887	GCGA	2	8	129862	129869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_011887	AGCC	2	8	130128	130135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011887	GCAG	2	8	133280	133287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011887	TGAT	2	8	134175	134182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011887	GGCG	2	8	134414	134421	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011887	ACCG	2	8	134676	134683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011887	CTGT	2	8	134992	134999	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011887	CCGA	2	8	135459	135466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_011887	GATC	2	8	135891	135898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011887	AGTA	2	8	137119	137126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011887	CCTC	2	8	140454	140461	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
105	NC_011887	TGCA	2	8	140619	140626	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011887	CCCT	2	8	142766	142773	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_011887	TCGG	2	8	144032	144039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_011887	GGCG	2	8	149724	149731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_011887	AGCG	2	8	149832	149839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011887	TCGG	2	8	158168	158175	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011887	CGGG	2	8	158361	158368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011887	GCTC	2	8	160211	160218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011887	GGCC	2	8	160466	160473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011887	GCCC	2	8	160479	160486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
115	NC_011887	GGAC	2	8	162146	162153	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011887	GCGG	2	8	162234	162241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011887	GGCG	2	8	162323	162330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011887	GCCG	2	8	163075	163082	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011887	CCCT	2	8	164868	164875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_011887	CCCG	2	8	165435	165442	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_011887	AGCC	2	8	165476	165483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011887	CCTA	2	8	166760	166767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011887	GTCG	2	8	178964	178971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011887	AATG	2	8	180054	180061	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011887	AGGC	2	8	180390	180397	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011887	GGCG	2	8	180538	180545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011887	CTGA	2	8	181384	181391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011887	TCGC	2	8	183637	183644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011887	GAGC	2	8	184451	184458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011887	GCTT	2	8	184950	184957	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011887	AGGA	2	8	184990	184997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011887	GTCC	2	8	185952	185959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011887	CGGG	2	8	188516	188523	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011887	CGGG	2	8	188581	188588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011887	CGCC	2	8	188612	188619	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
136	NC_011887	ATGG	2	8	189730	189737	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011887	CTGG	2	8	189997	190004	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011887	AGGA	2	8	190774	190781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011887	TTGC	2	8	192244	192251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_011887	TCCG	2	8	194036	194043	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_011887	GCAT	2	8	194786	194793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_011887	CCGA	2	8	198364	198371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011887	CTGC	2	8	198422	198429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011887	CGCA	2	8	198657	198664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011887	GGCT	2	8	198950	198957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011887	GACA	2	8	202398	202405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_011887	CCAG	2	8	203508	203515	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_011887	ATGC	2	8	203611	203618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011887	TGCG	2	8	203994	204001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011887	AGAT	2	8	210354	210361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011887	GGAT	2	8	210445	210452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011887	CTGC	2	8	212213	212220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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181	NC_011887	GGCC	2	8	279743	279750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
182	NC_011887	CGGC	2	8	280800	280807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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300	NC_011887	TCTG	2	8	415660	415667	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
301	NC_011887	TCAC	2	8	415950	415957	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
302	NC_011887	GTTG	2	8	420389	420396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
303	NC_011887	AAGC	2	8	420557	420564	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
304	NC_011887	GCCT	2	8	421700	421707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
305	NC_011887	CTCG	2	8	421874	421881	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
306	NC_011887	CGTG	2	8	421906	421913	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
307	NC_011887	CACG	2	8	423439	423446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
308	NC_011887	CGGC	2	8	423817	423824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
309	NC_011887	TATC	2	8	424171	424178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
310	NC_011887	GCCC	2	8	425237	425244	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
311	NC_011887	CCAC	2	8	425452	425459	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
312	NC_011887	TGAT	2	8	425883	425890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
313	NC_011887	GAAT	2	8	425955	425962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
314	NC_011887	AGGG	2	8	430780	430787	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
315	NC_011887	TGCC	2	8	432151	432158	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
316	NC_011887	CCGA	2	8	432269	432276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
317	NC_011887	CGCC	2	8	438706	438713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
318	NC_011887	GTCT	2	8	438824	438831	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
319	NC_011887	CGGC	2	8	438984	438991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
320	NC_011887	CGGC	2	8	439351	439358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
321	NC_011887	CTCG	2	8	440143	440150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
322	NC_011887	GCGG	2	8	443044	443051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
323	NC_011887	CGGC	2	8	443454	443461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
324	NC_011887	GGCC	2	8	443998	444005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
325	NC_011887	CGCA	2	8	444358	444365	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
326	NC_011887	TCGT	2	8	445489	445496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
327	NC_011887	GGTC	2	8	446118	446125	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
328	NC_011887	GAGC	2	8	446374	446381	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
329	NC_011887	CTCG	2	8	446392	446399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
330	NC_011887	CCGA	2	8	455506	455513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
331	NC_011887	GCCC	2	8	455563	455570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
332	NC_011887	ACGG	2	8	456000	456007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.