MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Arthrobacter chlorophenolicus A6 chromosome

Total Repeats: 2585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011886	CTTCCG	2	12	4260222	4260233	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	220914549
2502	NC_011886	GGACGC	2	12	4263350	4263361	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914552
2503	NC_011886	TCGTAG	2	12	4266736	4266747	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220914554
2504	NC_011886	TGCCCC	2	12	4267896	4267907	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_011886	GTGGCT	2	12	4269053	4269064	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914557
2506	NC_011886	GGGCCT	2	12	4272138	4272149	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914559
2507	NC_011886	CGGTGG	2	12	4272816	4272827	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914560
2508	NC_011886	CGCGGC	2	12	4273192	4273203	0 %	0 %	50 %	50 %	220914561
2509	NC_011886	GCCCAT	2	12	4274624	4274635	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914563
2510	NC_011886	GGAGGC	2	12	4275244	4275255	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914564
2511	NC_011886	AGGCCG	2	12	4275282	4275293	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914564
2512	NC_011886	CACCGC	2	12	4276646	4276657	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220914566
2513	NC_011886	GGTGGC	2	12	4277649	4277660	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914567
2514	NC_011886	GCAGGA	2	12	4278276	4278287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914567
2515	NC_011886	GGCCAG	2	12	4281165	4281176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914569
2516	NC_011886	GCCGTT	2	12	4282274	4282285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914571
2517	NC_011886	CGCCAC	2	12	4283878	4283889	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220914572
2518	NC_011886	GCCGCA	2	12	4284682	4284693	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914573
2519	NC_011886	GGTGCT	2	12	4285393	4285404	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914574
2520	NC_011886	TCCAGG	2	12	4289310	4289321	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914578
2521	NC_011886	CGCCCG	2	12	4289839	4289850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914578
2522	NC_011886	GGGCCG	2	12	4290453	4290464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220914579
2523	NC_011886	CGCGGC	2	12	4291825	4291836	0 %	0 %	50 %	50 %	220914581
2524	NC_011886	TTCTGC	2	12	4295579	4295590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220914585
2525	NC_011886	GCCGTC	2	12	4297573	4297584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914587
2526	NC_011886	CCGTCC	2	12	4298154	4298165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914588
2527	NC_011886	GCTGGG	2	12	4298441	4298452	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914588
2528	NC_011886	AGGGCG	2	12	4298478	4298489	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914588
2529	NC_011886	GCCCAG	2	12	4303781	4303792	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914592
2530	NC_011886	GCGGTG	2	12	4304941	4304952	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914593
2531	NC_011886	GAACGG	2	12	4310538	4310549	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914601
2532	NC_011886	CGGGAA	2	12	4310718	4310729	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914601
2533	NC_011886	CAACGG	3	18	4310748	4310765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914601
2534	NC_011886	GGCAAC	2	12	4310770	4310781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914601
2535	NC_011886	CGGTGG	3	18	4310913	4310930	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	220914601
2536	NC_011886	CGGAGG	2	12	4310958	4310969	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914601
2537	NC_011886	CGGAGG	2	12	4310994	4311005	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914601
2538	NC_011886	CGGAGG	2	12	4311030	4311041	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	220914601
2539	NC_011886	CGTGGA	2	12	4313618	4313629	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914605
2540	NC_011886	CCAGGA	2	12	4317624	4317635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220914609
2541	NC_011886	CCCTGC	2	12	4319565	4319576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914612
2542	NC_011886	TTGGCG	2	12	4322011	4322022	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2543	NC_011886	GGCCTG	2	12	4323989	4324000	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914616
2544	NC_011886	TGTGGC	2	12	4325294	4325305	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914617
2545	NC_011886	TCCACG	2	12	4326374	4326385	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914618
2546	NC_011886	GACGGC	2	12	4329695	4329706	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914624
2547	NC_011886	CAGGAA	2	12	4330404	4330415	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	220914625
2548	NC_011886	CGATGG	2	12	4330724	4330735	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914625
2549	NC_011886	GGCGAT	2	12	4331415	4331426	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914625
2550	NC_011886	CAGCGC	2	12	4332083	4332094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914626
2551	NC_011886	GTCCGA	2	12	4332095	4332106	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914626
2552	NC_011886	GCCCGG	2	12	4335895	4335906	0 %	0 %	50 %	50 %	220914627
2553	NC_011886	CACGTG	2	12	4337119	4337130	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914628
2554	NC_011886	CTGGAC	2	12	4338938	4338949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914630
2555	NC_011886	CGGTGA	2	12	4341059	4341070	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	220914632
2556	NC_011886	CTTCGG	2	12	4341879	4341890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220914633
2557	NC_011886	CGGCAG	2	12	4342943	4342954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914633
2558	NC_011886	CTCATC	2	12	4347381	4347392	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220914637
2559	NC_011886	GTCTAT	2	12	4348064	4348075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220914638
2560	NC_011886	GTGGCC	2	12	4353350	4353361	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914641
2561	NC_011886	GTTGCG	2	12	4356431	4356442	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220914641
2562	NC_011886	AACCGG	2	12	4358618	4358629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_011886	GCTTGA	2	12	4359898	4359909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220914642
2564	NC_011886	GACGCG	2	12	4360885	4360896	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	220914643
2565	NC_011886	GCCCGC	2	12	4362044	4362055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914645
2566	NC_011886	GTCCAC	2	12	4362158	4362169	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914645
2567	NC_011886	CGATGC	2	12	4362652	4362663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914645
2568	NC_011886	ATCCGG	2	12	4363865	4363876	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914646
2569	NC_011886	GCCGAC	2	12	4363983	4363994	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914646
2570	NC_011886	CTGCAG	2	12	4364411	4364422	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	220914647
2571	NC_011886	CAATGA	2	12	4364512	4364523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	220914647
2572	NC_011886	CGGCCC	2	12	4365616	4365627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220914648
2573	NC_011886	GAGCAG	2	12	4368342	4368353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914650
2574	NC_011886	GCAGGA	2	12	4368371	4368382	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220914650
2575	NC_011886	CGTCCG	2	12	4376929	4376940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914656
2576	NC_011886	TGCCCC	2	12	4378003	4378014	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	220914657
2577	NC_011886	GGTGCC	2	12	4380111	4380122	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914658
2578	NC_011886	CGAGCC	2	12	4381233	4381244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	220914659
2579	NC_011886	ACGATG	2	12	4381793	4381804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220914659
2580	NC_011886	GCCGGT	2	12	4390438	4390449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	220914662
2581	NC_011886	CATCCG	2	12	4390484	4390495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914662
2582	NC_011886	TCGATG	2	12	4393087	4393098	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220914665
2583	NC_011886	CGGCCT	2	12	4393340	4393351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	220914666
2584	NC_011886	CACCAG	2	12	4394106	4394117	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220914666
2585	NC_011886	CGTCCA	2	12	4394133	4394144	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220914666

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.