MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	GATTGC	2	12	8605	8616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910618
2	NC_011885	ATCCAC	2	12	11404	11415	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220910620
3	NC_011885	GATCTG	2	12	13500	13511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910622
4	NC_011885	CAAACA	2	12	14834	14845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011885	CATTTC	2	12	15150	15161	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011885	TACAGC	2	12	17550	17561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910628
7	NC_011885	AGGGAG	2	12	19206	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910630
8	NC_011885	CTCTTC	2	12	19617	19628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011885	TCGGTG	2	12	21858	21869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220910632
10	NC_011885	TTGAGC	2	12	24347	24358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910633
11	NC_011885	TCTCCC	2	12	30742	30753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910638
12	NC_011885	GATGGT	2	12	33040	33051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220910640
13	NC_011885	CAGTTG	2	12	35391	35402	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011885	TCATGC	2	12	56427	56438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220910661
15	NC_011885	GCAACA	2	12	58352	58363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220910663
16	NC_011885	TTTGAT	2	12	62099	62110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220910667
17	NC_011885	ATCAGG	2	12	63266	63277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220910668
18	NC_011885	CGTTGC	2	12	65099	65110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910672
19	NC_011885	CTGAAC	2	12	65616	65627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910672
20	NC_011885	ACCGCC	2	12	67077	67088	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220910672
21	NC_011885	CCATCT	2	12	72451	72462	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220910676
22	NC_011885	GTCATC	2	12	72846	72857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220910676
23	NC_011885	CATCCT	2	12	73025	73036	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220910676
24	NC_011885	CACCGA	2	12	77189	77200	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220910677
25	NC_011885	TGAGTT	2	12	80110	80121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220910678
26	NC_011885	GCAAAA	2	12	81536	81547	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011885	GCTGCG	2	12	89072	89083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011885	TGTCTT	2	12	91560	91571	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	220910686
29	NC_011885	TAGTAA	2	12	92277	92288	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011885	TGCATT	2	12	97591	97602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220910692
31	NC_011885	GTTTGG	2	12	100270	100281	0 %	50 %	50 %	0 %	220910694
32	NC_011885	CCTGAT	2	12	104080	104091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011885	ATCTTC	2	12	106961	106972	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	220910701
34	NC_011885	ACTTTT	2	12	118427	118438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220910711
35	NC_011885	TTACTT	2	12	121308	121319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011885	AAGATA	2	12	123210	123221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011885	TGATTG	2	12	124233	124244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220910719
38	NC_011885	GAACCT	2	12	128150	128161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910721
39	NC_011885	CTAATC	2	12	132431	132442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011885	CTTATA	2	12	134399	134410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011885	GGGAGA	2	12	134647	134658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910729
42	NC_011885	CTTGCT	2	12	142781	142792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220910734
43	NC_011885	ACCCTA	2	12	155379	155390	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220910748
44	NC_011885	CCGGGC	2	12	159616	159627	0 %	0 %	50 %	50 %	220910752
45	NC_011885	ACAACC	2	12	161415	161426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_011885	AATGCC	2	12	168132	168143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910767
47	NC_011885	ATGGCT	2	12	169600	169611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910769
48	NC_011885	GCTCAA	2	12	178241	178252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910779
49	NC_011885	TGTAAC	2	12	179149	179160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220910781
50	NC_011885	TGCACC	2	12	179163	179174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220910781
51	NC_011885	GCAAAA	2	12	179847	179858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220910782

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.