MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	GATTGC	2	12	8605	8616	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910618
2	NC_011885	ATCCAC	2	12	11404	11415	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220910620
3	NC_011885	GATCTG	2	12	13500	13511	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910622
4	NC_011885	TACAGC	2	12	17550	17561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910628
5	NC_011885	AGGGAG	2	12	19206	19217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910630
6	NC_011885	TCGGTG	2	12	21858	21869	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	220910632
7	NC_011885	TTGAGC	2	12	24347	24358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910633
8	NC_011885	TCTCCC	2	12	30742	30753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910638
9	NC_011885	GATGGT	2	12	33040	33051	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	220910640
10	NC_011885	TCATGC	2	12	56427	56438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220910661
11	NC_011885	GCAACA	2	12	58352	58363	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	220910663
12	NC_011885	TTTGAT	2	12	62099	62110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	220910667
13	NC_011885	ATCAGG	2	12	63266	63277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	220910668
14	NC_011885	CGTTGC	2	12	65099	65110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910672
15	NC_011885	CTGAAC	2	12	65616	65627	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910672
16	NC_011885	ACCGCC	2	12	67077	67088	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	220910672
17	NC_011885	CCATCT	2	12	72451	72462	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220910676
18	NC_011885	GTCATC	2	12	72846	72857	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	220910676
19	NC_011885	CATCCT	2	12	73025	73036	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	220910676
20	NC_011885	CACCGA	2	12	77189	77200	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	220910677
21	NC_011885	TGAGTT	2	12	80110	80121	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220910678
22	NC_011885	TGTCTT	2	12	91560	91571	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	220910686
23	NC_011885	TGCATT	2	12	97591	97602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	220910692
24	NC_011885	GTTTGG	2	12	100270	100281	0 %	50 %	50 %	0 %	220910694
25	NC_011885	ATCTTC	2	12	106961	106972	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	220910701
26	NC_011885	ACTTTT	2	12	118427	118438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	220910711
27	NC_011885	TGATTG	2	12	124233	124244	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	220910719
28	NC_011885	GAACCT	2	12	128150	128161	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910721
29	NC_011885	GGGAGA	2	12	134647	134658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910729
30	NC_011885	CTTGCT	2	12	142781	142792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	220910734
31	NC_011885	ACCCTA	2	12	155379	155390	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	220910748
32	NC_011885	CCGGGC	2	12	159616	159627	0 %	0 %	50 %	50 %	220910752
33	NC_011885	AATGCC	2	12	168132	168143	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910767
34	NC_011885	ATGGCT	2	12	169600	169611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	220910769
35	NC_011885	GCTCAA	2	12	178241	178252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910779
36	NC_011885	TGTAAC	2	12	179149	179160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220910781
37	NC_011885	TGCACC	2	12	179163	179174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220910781
38	NC_011885	GCAAAA	2	12	179847	179858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220910782

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.