MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	CCGCG	2	10	2081	2090	0 %	0 %	40 %	60 %	220910612
2	NC_011885	GTTCA	2	10	2740	2749	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011885	CTAAC	2	10	6468	6477	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_011885	CGTAG	2	10	6921	6930	20 %	20 %	40 %	20 %	220910616
5	NC_011885	GCTTC	2	10	7194	7203	0 %	40 %	20 %	40 %	220910616
6	NC_011885	CGGGG	2	10	10483	10492	0 %	0 %	80 %	20 %	220910619
7	NC_011885	ACTGG	2	10	12223	12232	20 %	20 %	40 %	20 %	220910621
8	NC_011885	TTGGC	2	10	14145	14154	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011885	GCTTC	2	10	17130	17139	0 %	40 %	20 %	40 %	220910627
10	NC_011885	ACCCG	2	10	18915	18924	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_011885	CCTGA	2	10	19059	19068	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011885	AATGA	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	220910632
13	NC_011885	ACCGA	2	10	26346	26355	40 %	0 %	20 %	40 %	220910634
14	NC_011885	AGCTT	2	10	30219	30228	20 %	40 %	20 %	20 %	220910636
15	NC_011885	ATCTT	2	10	30246	30255	20 %	60 %	0 %	20 %	220910636
16	NC_011885	GTTCT	2	10	30294	30303	0 %	60 %	20 %	20 %	220910636
17	NC_011885	GAGAA	2	10	30594	30603	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011885	AACTC	2	10	36674	36683	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011885	GTTCA	2	10	41963	41972	20 %	40 %	20 %	20 %	220910646
20	NC_011885	TGGAT	2	10	44494	44503	20 %	40 %	40 %	0 %	220910647
21	NC_011885	TGCAG	2	10	45630	45639	20 %	20 %	40 %	20 %	220910647
22	NC_011885	ATTTA	2	10	46343	46352	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011885	AAACA	2	10	48529	48538	80 %	0 %	0 %	20 %	220910649
24	NC_011885	CTCGT	2	10	48596	48605	0 %	40 %	20 %	40 %	220910649
25	NC_011885	GGCAG	2	10	48842	48851	20 %	0 %	60 %	20 %	220910649
26	NC_011885	AACCA	2	10	50085	50094	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_011885	ATGAG	2	10	51182	51191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011885	CGTAC	2	10	53291	53300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011885	AGTCT	2	10	53301	53310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_011885	CGAAC	2	10	53369	53378	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_011885	CCCTG	2	10	55580	55589	0 %	20 %	20 %	60 %	220910660
32	NC_011885	TCCAA	2	10	57809	57818	40 %	20 %	0 %	40 %	220910663
33	NC_011885	AGTGA	2	10	61391	61400	40 %	20 %	40 %	0 %	220910667
34	NC_011885	GGATT	2	10	61972	61981	20 %	40 %	40 %	0 %	220910667
35	NC_011885	CAAAG	2	10	63815	63824	60 %	0 %	20 %	20 %	220910669
36	NC_011885	CGGGC	2	10	65652	65661	0 %	0 %	60 %	40 %	220910672
37	NC_011885	CCGGC	2	10	65913	65922	0 %	0 %	40 %	60 %	220910672
38	NC_011885	ACGGG	2	10	66564	66573	20 %	0 %	60 %	20 %	220910672
39	NC_011885	TTGGC	2	10	68340	68349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011885	CTAGG	2	10	70998	71007	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_011885	TCCCT	2	10	71120	71129	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_011885	TCATT	2	10	77606	77615	20 %	60 %	0 %	20 %	220910677
43	NC_011885	AGCCA	2	10	78810	78819	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011885	AGTGA	2	10	80048	80057	40 %	20 %	40 %	0 %	220910678
45	NC_011885	GAGCT	2	10	81092	81101	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011885	TCATG	2	10	81422	81431	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011885	CAGCA	2	10	83226	83235	40 %	0 %	20 %	40 %	220910679
48	NC_011885	TTGTA	2	10	90430	90439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011885	CACTT	2	10	91870	91879	20 %	40 %	0 %	40 %	220910686
50	NC_011885	AGACG	2	10	93712	93721	40 %	0 %	40 %	20 %	220910688
51	NC_011885	TGTTT	2	10	93781	93790	0 %	80 %	20 %	0 %	220910688
52	NC_011885	GCATT	2	10	97437	97446	20 %	40 %	20 %	20 %	220910692
53	NC_011885	AGCCC	2	10	97777	97786	20 %	0 %	20 %	60 %	220910692
54	NC_011885	CTGTA	2	10	99477	99486	20 %	40 %	20 %	20 %	220910693
55	NC_011885	CAATT	2	10	102063	102072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011885	AAACA	2	10	103073	103082	80 %	0 %	0 %	20 %	220910697
57	NC_011885	CTCGT	2	10	103140	103149	0 %	40 %	20 %	40 %	220910697
58	NC_011885	GGCAG	2	10	103386	103395	20 %	0 %	60 %	20 %	220910697
59	NC_011885	TATGA	2	10	105578	105587	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011885	TCACT	2	10	105614	105623	20 %	40 %	0 %	40 %	220910699
61	NC_011885	AGATG	2	10	106047	106056	40 %	20 %	40 %	0 %	220910699
62	NC_011885	AGGAG	2	10	107903	107912	40 %	0 %	60 %	0 %	220910703
63	NC_011885	TGAGG	2	10	108741	108750	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011885	GCAGA	2	10	109201	109210	40 %	0 %	40 %	20 %	220910704
65	NC_011885	ACTGG	2	10	112321	112330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_011885	AGTTG	2	10	112929	112938	20 %	40 %	40 %	0 %	220910705
67	NC_011885	AATCA	2	10	113068	113077	60 %	20 %	0 %	20 %	220910705
68	NC_011885	TGCTG	2	10	115688	115697	0 %	40 %	40 %	20 %	220910708
69	NC_011885	ATCAC	2	10	118053	118062	40 %	20 %	0 %	40 %	220910711
70	NC_011885	CATTT	2	10	118755	118764	20 %	60 %	0 %	20 %	220910712
71	NC_011885	TTGAC	2	10	120621	120630	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011885	GGTTG	2	10	121874	121883	0 %	40 %	60 %	0 %	220910717
73	NC_011885	AAATT	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	220910717
74	NC_011885	TAACC	2	10	122478	122487	40 %	20 %	0 %	40 %	220910718
75	NC_011885	ACTTC	2	10	122704	122713	20 %	40 %	0 %	40 %	220910718
76	NC_011885	AGCAG	2	10	123391	123400	40 %	0 %	40 %	20 %	220910719
77	NC_011885	TCCTC	2	10	123838	123847	0 %	40 %	0 %	60 %	220910719
78	NC_011885	ATATT	2	10	123912	123921	40 %	60 %	0 %	0 %	220910719
79	NC_011885	AGACG	2	10	125134	125143	40 %	0 %	40 %	20 %	220910720
80	NC_011885	TGTTT	2	10	125203	125212	0 %	80 %	20 %	0 %	220910720
81	NC_011885	CATTT	2	10	127645	127654	20 %	60 %	0 %	20 %	220910721
82	NC_011885	CGAAT	2	10	127774	127783	40 %	20 %	20 %	20 %	220910721
83	NC_011885	GTTTT	2	10	130747	130756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011885	CTCAT	2	10	132118	132127	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011885	TCCCA	2	10	132605	132614	20 %	20 %	0 %	60 %	220910727
86	NC_011885	TCAAC	2	10	132948	132957	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_011885	CGAAA	2	10	134006	134015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011885	CTTCT	2	10	135288	135297	0 %	60 %	0 %	40 %	220910730
89	NC_011885	ATTTG	2	10	136102	136111	20 %	60 %	20 %	0 %	220910730
90	NC_011885	AAGCT	2	10	141586	141595	40 %	20 %	20 %	20 %	220910733
91	NC_011885	AGCGA	2	10	141630	141639	40 %	0 %	40 %	20 %	220910733
92	NC_011885	AACTG	2	10	143570	143579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011885	AGAAA	2	10	144301	144310	80 %	0 %	20 %	0 %	220910735
94	NC_011885	CAATC	2	10	144591	144600	40 %	20 %	0 %	40 %	220910735
95	NC_011885	CTTCC	2	10	145135	145144	0 %	40 %	0 %	60 %	220910735
96	NC_011885	GAAAA	2	10	146118	146127	80 %	0 %	20 %	0 %	220910735
97	NC_011885	TTGGT	2	10	151116	151125	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011885	CCCAA	2	10	153772	153781	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_011885	GTAAT	2	10	157414	157423	40 %	40 %	20 %	0 %	220910749
100	NC_011885	CCAGT	2	10	158624	158633	20 %	20 %	20 %	40 %	220910751
101	NC_011885	AGGCG	2	10	159759	159768	20 %	0 %	60 %	20 %	220910752
102	NC_011885	TCCAG	2	10	163582	163591	20 %	20 %	20 %	40 %	220910757
103	NC_011885	TGGAT	2	10	163650	163659	20 %	40 %	40 %	0 %	220910757
104	NC_011885	TCTAC	2	10	165767	165776	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_011885	TTGCC	2	10	165846	165855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_011885	CTGTT	2	10	167119	167128	0 %	60 %	20 %	20 %	220910764
107	NC_011885	GTCCA	2	10	167397	167406	20 %	20 %	20 %	40 %	220910766
108	NC_011885	CAGGG	2	10	168231	168240	20 %	0 %	60 %	20 %	220910767
109	NC_011885	CTGCA	2	10	168997	169006	20 %	20 %	20 %	40 %	220910769
110	NC_011885	GACCA	2	10	169897	169906	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_011885	AGACG	2	10	170849	170858	40 %	0 %	40 %	20 %	220910770
112	NC_011885	TGTTT	2	10	170918	170927	0 %	80 %	20 %	0 %	220910770
113	NC_011885	CCAAA	2	10	172421	172430	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_011885	AAACT	2	10	174820	174829	60 %	20 %	0 %	20 %	220910774
115	NC_011885	AGCAG	2	10	176897	176906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011885	CCCGG	2	10	178206	178215	0 %	0 %	40 %	60 %	220910779
117	NC_011885	CCCCT	2	10	178813	178822	0 %	20 %	0 %	80 %	220910780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.