MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	CGAT	2	8	1014	1021	25 %	25 %	25 %	25 %	220910611
2	NC_011885	CCAG	2	8	1262	1269	25 %	0 %	25 %	50 %	220910611
3	NC_011885	CGGG	2	8	1286	1293	0 %	0 %	75 %	25 %	220910611
4	NC_011885	ATCG	2	8	1311	1318	25 %	25 %	25 %	25 %	220910611
5	NC_011885	GGCA	2	8	1436	1443	25 %	0 %	50 %	25 %	220910611
6	NC_011885	ACTC	2	8	1475	1482	25 %	25 %	0 %	50 %	220910611
7	NC_011885	CAAT	2	8	1785	1792	50 %	25 %	0 %	25 %	220910612
8	NC_011885	TAAA	2	8	1927	1934	75 %	25 %	0 %	0 %	220910612
9	NC_011885	GGCT	2	8	2889	2896	0 %	25 %	50 %	25 %	220910613
10	NC_011885	CAAT	2	8	3965	3972	50 %	25 %	0 %	25 %	220910613
11	NC_011885	CGAT	2	8	6136	6143	25 %	25 %	25 %	25 %	220910615
12	NC_011885	CTGC	2	8	6702	6709	0 %	25 %	25 %	50 %	220910616
13	NC_011885	GTTG	2	8	6878	6885	0 %	50 %	50 %	0 %	220910616
14	NC_011885	TACT	2	8	6956	6963	25 %	50 %	0 %	25 %	220910616
15	NC_011885	AGAA	2	8	7588	7595	75 %	0 %	25 %	0 %	220910617
16	NC_011885	CTCG	2	8	7995	8002	0 %	25 %	25 %	50 %	220910617
17	NC_011885	TGCC	2	8	8419	8426	0 %	25 %	25 %	50 %	220910618
18	NC_011885	CCAG	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	220910618
19	NC_011885	TTGG	2	8	8988	8995	0 %	50 %	50 %	0 %	220910618
20	NC_011885	GTTC	2	8	9900	9907	0 %	50 %	25 %	25 %	220910619
21	NC_011885	AGTC	2	8	11259	11266	25 %	25 %	25 %	25 %	220910620
22	NC_011885	CCAG	2	8	11494	11501	25 %	0 %	25 %	50 %	220910620
23	NC_011885	AAAC	2	8	11869	11876	75 %	0 %	0 %	25 %	220910621
24	NC_011885	TAGG	2	8	12024	12031	25 %	25 %	50 %	0 %	220910621
25	NC_011885	TTTG	2	8	12115	12122	0 %	75 %	25 %	0 %	220910621
26	NC_011885	CCTG	2	8	12486	12493	0 %	25 %	25 %	50 %	220910621
27	NC_011885	CGAT	2	8	12696	12703	25 %	25 %	25 %	25 %	220910621
28	NC_011885	GGCA	2	8	12812	12819	25 %	0 %	50 %	25 %	220910621
29	NC_011885	GGAA	2	8	14423	14430	50 %	0 %	50 %	0 %	220910624
30	NC_011885	AATC	2	8	15753	15760	50 %	25 %	0 %	25 %	220910625
31	NC_011885	TGGC	2	8	15920	15927	0 %	25 %	50 %	25 %	220910625
32	NC_011885	TCAA	2	8	16057	16064	50 %	25 %	0 %	25 %	220910625
33	NC_011885	GGAT	2	8	16192	16199	25 %	25 %	50 %	0 %	220910626
34	NC_011885	TCAA	2	8	16470	16477	50 %	25 %	0 %	25 %	220910626
35	NC_011885	CAGA	2	8	16769	16776	50 %	0 %	25 %	25 %	220910626
36	NC_011885	TTGG	2	8	16808	16815	0 %	50 %	50 %	0 %	220910626
37	NC_011885	GGCA	2	8	17938	17945	25 %	0 %	50 %	25 %	220910629
38	NC_011885	TCCC	2	8	18389	18396	0 %	25 %	0 %	75 %	220910629
39	NC_011885	GTTC	2	8	19957	19964	0 %	50 %	25 %	25 %	220910631
40	NC_011885	GCTG	2	8	20071	20078	0 %	25 %	50 %	25 %	220910631
41	NC_011885	AAGC	2	8	20537	20544	50 %	0 %	25 %	25 %	220910631
42	NC_011885	ATTG	2	8	20641	20648	25 %	50 %	25 %	0 %	220910632
43	NC_011885	GTTT	2	8	21079	21086	0 %	75 %	25 %	0 %	220910632
44	NC_011885	AGTA	2	8	21411	21418	50 %	25 %	25 %	0 %	220910632
45	NC_011885	TCCA	2	8	21566	21573	25 %	25 %	0 %	50 %	220910632
46	NC_011885	CTGG	2	8	21734	21741	0 %	25 %	50 %	25 %	220910632
47	NC_011885	GATG	2	8	21958	21965	25 %	25 %	50 %	0 %	220910632
48	NC_011885	GGTC	2	8	22015	22022	0 %	25 %	50 %	25 %	220910632
49	NC_011885	TGCC	2	8	22067	22074	0 %	25 %	25 %	50 %	220910632
50	NC_011885	CTTC	2	8	22173	22180	0 %	50 %	0 %	50 %	220910632
51	NC_011885	ATCA	2	8	22985	22992	50 %	25 %	0 %	25 %	220910632
52	NC_011885	TGAG	2	8	23004	23011	25 %	25 %	50 %	0 %	220910632
53	NC_011885	CTAT	2	8	24834	24841	25 %	50 %	0 %	25 %	220910634
54	NC_011885	ATTC	2	8	24910	24917	25 %	50 %	0 %	25 %	220910634
55	NC_011885	GAAC	2	8	25337	25344	50 %	0 %	25 %	25 %	220910634
56	NC_011885	ATCC	2	8	25918	25925	25 %	25 %	0 %	50 %	220910634
57	NC_011885	GATT	2	8	26357	26364	25 %	50 %	25 %	0 %	220910634
58	NC_011885	CGCA	2	8	26926	26933	25 %	0 %	25 %	50 %	220910634
59	NC_011885	TCAA	2	8	27149	27156	50 %	25 %	0 %	25 %	220910634
60	NC_011885	CAGC	2	8	27240	27247	25 %	0 %	25 %	50 %	220910634
61	NC_011885	CGAT	2	8	27518	27525	25 %	25 %	25 %	25 %	220910634
62	NC_011885	CGGT	2	8	27751	27758	0 %	25 %	50 %	25 %	220910634
63	NC_011885	AAAT	2	8	28050	28057	75 %	25 %	0 %	0 %	220910634
64	NC_011885	ATCG	2	8	28129	28136	25 %	25 %	25 %	25 %	220910634
65	NC_011885	AGTT	2	8	28248	28255	25 %	50 %	25 %	0 %	220910634
66	NC_011885	TTGG	2	8	29216	29223	0 %	50 %	50 %	0 %	220910635
67	NC_011885	TCCG	2	8	29246	29253	0 %	25 %	25 %	50 %	220910635
68	NC_011885	TGAC	2	8	29487	29494	25 %	25 %	25 %	25 %	220910635
69	NC_011885	AACA	2	8	29524	29531	75 %	0 %	0 %	25 %	220910635
70	NC_011885	GTCT	2	8	29904	29911	0 %	50 %	25 %	25 %	220910635
71	NC_011885	GGCC	2	8	29930	29937	0 %	0 %	50 %	50 %	220910635
72	NC_011885	ACAA	2	8	31662	31669	75 %	0 %	0 %	25 %	220910639
73	NC_011885	TAAT	2	8	33027	33034	50 %	50 %	0 %	0 %	220910640
74	NC_011885	TTGA	2	8	33152	33159	25 %	50 %	25 %	0 %	220910640
75	NC_011885	ACCC	2	8	33172	33179	25 %	0 %	0 %	75 %	220910640
76	NC_011885	TTGA	2	8	33317	33324	25 %	50 %	25 %	0 %	220910640
77	NC_011885	CGCC	2	8	33473	33480	0 %	0 %	25 %	75 %	220910641
78	NC_011885	GATT	2	8	33511	33518	25 %	50 %	25 %	0 %	220910641
79	NC_011885	TGAG	2	8	33616	33623	25 %	25 %	50 %	0 %	220910641
80	NC_011885	GATC	2	8	33703	33710	25 %	25 %	25 %	25 %	220910641
81	NC_011885	ACAA	2	8	33966	33973	75 %	0 %	0 %	25 %	220910641
82	NC_011885	AGGT	2	8	34014	34021	25 %	25 %	50 %	0 %	220910641
83	NC_011885	TCGC	2	8	34202	34209	0 %	25 %	25 %	50 %	220910641
84	NC_011885	CTCA	2	8	34406	34413	25 %	25 %	0 %	50 %	220910641
85	NC_011885	TCGA	2	8	34432	34439	25 %	25 %	25 %	25 %	220910641
86	NC_011885	GACG	2	8	34750	34757	25 %	0 %	50 %	25 %	220910641
87	NC_011885	ATCC	2	8	36784	36791	25 %	25 %	0 %	50 %	220910642
88	NC_011885	CAAG	2	8	36956	36963	50 %	0 %	25 %	25 %	220910642
89	NC_011885	TCAG	2	8	40926	40933	25 %	25 %	25 %	25 %	220910644
90	NC_011885	TCTT	2	8	41832	41839	0 %	75 %	0 %	25 %	220910646
91	NC_011885	CCCA	2	8	42015	42022	25 %	0 %	0 %	75 %	220910646
92	NC_011885	AAGA	2	8	42101	42108	75 %	0 %	25 %	0 %	220910646
93	NC_011885	TCGG	2	8	42393	42400	0 %	25 %	50 %	25 %	220910646
94	NC_011885	AAAG	2	8	43913	43920	75 %	0 %	25 %	0 %	220910647
95	NC_011885	CCTG	2	8	43958	43965	0 %	25 %	25 %	50 %	220910647
96	NC_011885	TTGG	2	8	44802	44809	0 %	50 %	50 %	0 %	220910647
97	NC_011885	CTGG	2	8	44828	44835	0 %	25 %	50 %	25 %	220910647
98	NC_011885	GCAG	2	8	45539	45546	25 %	0 %	50 %	25 %	220910647
99	NC_011885	CGAT	2	8	45702	45709	25 %	25 %	25 %	25 %	220910647
100	NC_011885	TGGT	2	8	45782	45789	0 %	50 %	50 %	0 %	220910647
101	NC_011885	GGAA	2	8	46255	46262	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
102	NC_011885	AGCC	2	8	47479	47486	25 %	0 %	25 %	50 %	220910648
103	NC_011885	CCCA	2	8	48186	48193	25 %	0 %	0 %	75 %	220910649
104	NC_011885	CCAC	2	8	48558	48565	25 %	0 %	0 %	75 %	220910649
105	NC_011885	GCCA	2	8	48861	48868	25 %	0 %	25 %	50 %	220910649
106	NC_011885	CTTG	2	8	49080	49087	0 %	50 %	25 %	25 %	220910649
107	NC_011885	GTCA	2	8	49542	49549	25 %	25 %	25 %	25 %	220910650
108	NC_011885	AAAT	2	8	50024	50031	75 %	25 %	0 %	0 %	220910651
109	NC_011885	ATCG	2	8	50202	50209	25 %	25 %	25 %	25 %	220910652
110	NC_011885	TGCT	2	8	50211	50218	0 %	50 %	25 %	25 %	220910652
111	NC_011885	CTTG	2	8	50667	50674	0 %	50 %	25 %	25 %	220910653
112	NC_011885	CCAA	2	8	50949	50956	50 %	0 %	0 %	50 %	220910654
113	NC_011885	TGCT	2	8	51283	51290	0 %	50 %	25 %	25 %	220910655
114	NC_011885	CCCA	2	8	51619	51626	25 %	0 %	0 %	75 %	220910656
115	NC_011885	ACCC	2	8	51811	51818	25 %	0 %	0 %	75 %	220910656
116	NC_011885	TCAA	2	8	53986	53993	50 %	25 %	0 %	25 %	220910659
117	NC_011885	GTTG	2	8	54391	54398	0 %	50 %	50 %	0 %	220910659
118	NC_011885	AGCA	2	8	54676	54683	50 %	0 %	25 %	25 %	220910659
119	NC_011885	CTGG	2	8	55613	55620	0 %	25 %	50 %	25 %	220910660
120	NC_011885	AAGC	2	8	56126	56133	50 %	0 %	25 %	25 %	220910661
121	NC_011885	GGCT	2	8	56798	56805	0 %	25 %	50 %	25 %	220910662
122	NC_011885	TCCA	2	8	57959	57966	25 %	25 %	0 %	50 %	220910663
123	NC_011885	TAAA	2	8	58093	58100	75 %	25 %	0 %	0 %	220910663
124	NC_011885	TTCC	2	8	58317	58324	0 %	50 %	0 %	50 %	220910663
125	NC_011885	GCCT	2	8	59415	59422	0 %	25 %	25 %	50 %	220910664
126	NC_011885	AGCC	2	8	60054	60061	25 %	0 %	25 %	50 %	220910665
127	NC_011885	TCTG	2	8	60138	60145	0 %	50 %	25 %	25 %	220910665
128	NC_011885	CGTT	2	8	60392	60399	0 %	50 %	25 %	25 %	220910666
129	NC_011885	TGGT	2	8	61485	61492	0 %	50 %	50 %	0 %	220910667
130	NC_011885	GCCA	2	8	61503	61510	25 %	0 %	25 %	50 %	220910667
131	NC_011885	TGGA	2	8	61658	61665	25 %	25 %	50 %	0 %	220910667
132	NC_011885	CTGG	2	8	62082	62089	0 %	25 %	50 %	25 %	220910667
133	NC_011885	ATTG	2	8	62122	62129	25 %	50 %	25 %	0 %	220910667
134	NC_011885	GCAA	2	8	62208	62215	50 %	0 %	25 %	25 %	220910668
135	NC_011885	CCCG	2	8	62508	62515	0 %	0 %	25 %	75 %	220910668
136	NC_011885	GAAT	2	8	62814	62821	50 %	25 %	25 %	0 %	220910668
137	NC_011885	CCAG	2	8	63784	63791	25 %	0 %	25 %	50 %	220910669
138	NC_011885	TGAG	2	8	64093	64100	25 %	25 %	50 %	0 %	220910669
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.