MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 1563

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	ACC	2	6	310	315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910611
2	NC_011885	CTG	2	6	362	367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
3	NC_011885	GCA	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910611
4	NC_011885	GGC	2	6	554	559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910611
5	NC_011885	TTG	2	6	568	573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910611
6	NC_011885	TGA	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910611
7	NC_011885	TGC	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
8	NC_011885	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910611
9	NC_011885	ACC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
10	NC_011885	CTT	2	6	1814	1819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910612
11	NC_011885	GTA	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910612
12	NC_011885	AAT	2	6	2136	2141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910612
13	NC_011885	GCG	2	6	2197	2202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910612
14	NC_011885	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910612
15	NC_011885	CCA	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
16	NC_011885	CCA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910612
17	NC_011885	CAG	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910613
18	NC_011885	ATC	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910613
19	NC_011885	ACG	2	6	3036	3041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910613
20	NC_011885	CAA	2	6	3082	3087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910613
21	NC_011885	CTG	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910613
22	NC_011885	AGG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910613
23	NC_011885	CTG	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910613
24	NC_011885	GAT	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910613
25	NC_011885	TTG	2	6	3525	3530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910613
26	NC_011885	TCA	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910613
27	NC_011885	AAC	2	6	3935	3940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910613
28	NC_011885	GGT	2	6	4915	4920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910614
29	NC_011885	GGA	2	6	5068	5073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910614
30	NC_011885	TGC	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
31	NC_011885	GCC	2	6	5181	5186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910614
32	NC_011885	CAA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910614
33	NC_011885	ACT	2	6	5233	5238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910614
34	NC_011885	GAC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910614
35	NC_011885	TTG	2	6	5316	5321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910614
36	NC_011885	GCA	2	6	5343	5348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910614
37	NC_011885	CTG	2	6	5354	5359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
38	NC_011885	GTT	3	9	5404	5412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910614
39	NC_011885	GCT	2	6	5523	5528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910614
40	NC_011885	ATG	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910614
41	NC_011885	CAC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910614
42	NC_011885	GGT	2	6	5892	5897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910614
43	NC_011885	CGC	2	6	6001	6006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910614
44	NC_011885	CTC	2	6	6116	6121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910615
45	NC_011885	AGC	2	6	6156	6161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910615
46	NC_011885	ACT	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910615
47	NC_011885	CGC	2	6	6273	6278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910615
48	NC_011885	GCA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910615
49	NC_011885	TAG	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910616
50	NC_011885	ACG	2	6	6631	6636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910616
51	NC_011885	GAC	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910616
52	NC_011885	CAA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910616
53	NC_011885	GTG	2	6	6989	6994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910616
54	NC_011885	ATA	2	6	7022	7027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910616
55	NC_011885	TCC	2	6	7118	7123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910616
56	NC_011885	ATT	2	6	7165	7170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910616
57	NC_011885	GAA	2	6	7254	7259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910616
58	NC_011885	CGT	2	6	7318	7323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910616
59	NC_011885	TAC	2	6	7405	7410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910616
60	NC_011885	GCG	3	9	7486	7494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910617
61	NC_011885	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910617
62	NC_011885	AAC	2	6	7784	7789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910617
63	NC_011885	CAA	2	6	7893	7898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910617
64	NC_011885	CTC	2	6	7903	7908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910617
65	NC_011885	GTA	2	6	7927	7932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910617
66	NC_011885	GCA	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910617
67	NC_011885	ATA	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910618
68	NC_011885	CTG	2	6	8221	8226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910618
69	NC_011885	CCG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910618
70	NC_011885	AAT	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910618
71	NC_011885	GCG	2	6	8409	8414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910618
72	NC_011885	ATG	2	6	8432	8437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
73	NC_011885	AGG	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910618
74	NC_011885	GCA	2	6	8700	8705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910618
75	NC_011885	AAC	2	6	8826	8831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910618
76	NC_011885	GAT	2	6	8897	8902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
77	NC_011885	GCA	2	6	9019	9024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910618
78	NC_011885	CCT	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910618
79	NC_011885	ATG	2	6	9390	9395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910618
80	NC_011885	CGA	2	6	9792	9797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910619
81	NC_011885	CAT	2	6	9827	9832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910619
82	NC_011885	GCG	2	6	9872	9877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910619
83	NC_011885	CAC	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910619
84	NC_011885	TGG	2	6	9997	10002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910619
85	NC_011885	GCC	2	6	10193	10198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910619
86	NC_011885	TCC	2	6	10212	10217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910619
87	NC_011885	GCA	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
88	NC_011885	GCG	2	6	11296	11301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910620
89	NC_011885	ATC	2	6	11302	11307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910620
90	NC_011885	GCA	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
91	NC_011885	AAC	2	6	11393	11398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910620
92	NC_011885	AGG	2	6	11417	11422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910620
93	NC_011885	GCA	2	6	11440	11445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910620
94	NC_011885	AGT	2	6	11593	11598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910620
95	NC_011885	GCT	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910620
96	NC_011885	GCT	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910621
97	NC_011885	GGC	2	6	12263	12268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910621
98	NC_011885	CAC	2	6	12368	12373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910621
99	NC_011885	AGA	2	6	12396	12401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910621
100	NC_011885	ATG	2	6	12561	12566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910621
101	NC_011885	CAG	2	6	12584	12589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910621
102	NC_011885	AGT	2	6	12772	12777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910621
103	NC_011885	TCG	2	6	12832	12837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910621
104	NC_011885	AAG	2	6	12887	12892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910621
105	NC_011885	TGC	2	6	13045	13050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910622
106	NC_011885	ACC	2	6	13133	13138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910622
107	NC_011885	TAG	2	6	13183	13188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910622
108	NC_011885	GCC	3	9	13190	13198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910622
109	NC_011885	CTC	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220910622
110	NC_011885	GCT	2	6	13448	13453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910622
111	NC_011885	TCA	2	6	13466	13471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910622
112	NC_011885	AAT	2	6	13492	13497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910622
113	NC_011885	CAA	2	6	13515	13520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910622
114	NC_011885	GTA	2	6	13594	13599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910622
115	NC_011885	ACC	2	6	13609	13614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910622
116	NC_011885	GGA	2	6	13866	13871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910623
117	NC_011885	CAA	2	6	13961	13966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910623
118	NC_011885	TGA	2	6	14120	14125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910623
119	NC_011885	TCA	3	9	14476	14484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910624
120	NC_011885	TGC	2	6	15730	15735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910625
121	NC_011885	CAA	2	6	15803	15808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220910625
122	NC_011885	GCA	2	6	15881	15886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220910625
123	NC_011885	TTG	2	6	15960	15965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220910625
124	NC_011885	TTC	2	6	16075	16080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910625
125	NC_011885	TCA	2	6	16096	16101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910626
126	NC_011885	CTG	2	6	16143	16148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910626
127	NC_011885	TGG	2	6	16152	16157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910626
128	NC_011885	TCA	2	6	16267	16272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910626
129	NC_011885	TAG	2	6	16445	16450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910626
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132	NC_011885	GGT	2	6	16784	16789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910626
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249	NC_011885	AAG	2	6	29401	29406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910635
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498	NC_011885	GGA	2	6	62379	62384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910668
499	NC_011885	GGT	2	6	62403	62408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910668
500	NC_011885	GAA	2	6	62409	62414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220910668

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