MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	CT	3	6	204	209	0 %	50 %	0 %	50 %	220910611
2	NC_011885	GC	3	6	240	245	0 %	0 %	50 %	50 %	220910611
3	NC_011885	GA	3	6	3578	3583	50 %	0 %	50 %	0 %	220910613
4	NC_011885	TC	3	6	6120	6125	0 %	50 %	0 %	50 %	220910615
5	NC_011885	GA	3	6	7681	7686	50 %	0 %	50 %	0 %	220910617
6	NC_011885	TC	3	6	7689	7694	0 %	50 %	0 %	50 %	220910617
7	NC_011885	CG	3	6	8452	8457	0 %	0 %	50 %	50 %	220910618
8	NC_011885	AC	5	10	10125	10134	50 %	0 %	0 %	50 %	220910619
9	NC_011885	AG	3	6	12891	12896	50 %	0 %	50 %	0 %	220910621
10	NC_011885	AG	3	6	13970	13975	50 %	0 %	50 %	0 %	220910623
11	NC_011885	GA	3	6	14097	14102	50 %	0 %	50 %	0 %	220910623
12	NC_011885	AG	3	6	16020	16025	50 %	0 %	50 %	0 %	220910625
13	NC_011885	AT	3	6	17257	17262	50 %	50 %	0 %	0 %	220910627
14	NC_011885	AG	4	8	17562	17569	50 %	0 %	50 %	0 %	220910628
15	NC_011885	AG	3	6	20170	20175	50 %	0 %	50 %	0 %	220910631
16	NC_011885	CT	3	6	20243	20248	0 %	50 %	0 %	50 %	220910631
17	NC_011885	GC	3	6	22407	22412	0 %	0 %	50 %	50 %	220910632
18	NC_011885	GA	3	6	25267	25272	50 %	0 %	50 %	0 %	220910634
19	NC_011885	TC	4	8	27036	27043	0 %	50 %	0 %	50 %	220910634
20	NC_011885	AG	3	6	27786	27791	50 %	0 %	50 %	0 %	220910634
21	NC_011885	CT	3	6	30327	30332	0 %	50 %	0 %	50 %	220910636
22	NC_011885	GC	3	6	32929	32934	0 %	0 %	50 %	50 %	220910640
23	NC_011885	CG	3	6	34441	34446	0 %	0 %	50 %	50 %	220910641
24	NC_011885	TC	3	6	40492	40497	0 %	50 %	0 %	50 %	220910644
25	NC_011885	TA	3	6	41693	41698	50 %	50 %	0 %	0 %	220910645
26	NC_011885	AG	3	6	42212	42217	50 %	0 %	50 %	0 %	220910646
27	NC_011885	AT	4	8	43843	43850	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
28	NC_011885	GA	3	6	45257	45262	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
29	NC_011885	AG	3	6	45978	45983	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
30	NC_011885	TA	3	6	46281	46286	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
31	NC_011885	CT	3	6	51760	51765	0 %	50 %	0 %	50 %	220910656
32	NC_011885	CA	3	6	54260	54265	50 %	0 %	0 %	50 %	220910659
33	NC_011885	TC	3	6	56244	56249	0 %	50 %	0 %	50 %	220910661
34	NC_011885	CG	3	6	57769	57774	0 %	0 %	50 %	50 %	220910663
35	NC_011885	CT	3	6	59034	59039	0 %	50 %	0 %	50 %	220910664
36	NC_011885	TC	3	6	60402	60407	0 %	50 %	0 %	50 %	220910666
37	NC_011885	CT	3	6	60985	60990	0 %	50 %	0 %	50 %	220910667
38	NC_011885	CT	3	6	63117	63122	0 %	50 %	0 %	50 %	220910668
39	NC_011885	CA	3	6	66525	66530	50 %	0 %	0 %	50 %	220910672
40	NC_011885	CT	3	6	67402	67407	0 %	50 %	0 %	50 %	220910672
41	NC_011885	CT	3	6	68703	68708	0 %	50 %	0 %	50 %	220910673
42	NC_011885	AG	3	6	68741	68746	50 %	0 %	50 %	0 %	220910673
43	NC_011885	AG	3	6	69521	69526	50 %	0 %	50 %	0 %	220910674
44	NC_011885	CT	3	6	73179	73184	0 %	50 %	0 %	50 %	220910676
45	NC_011885	TG	3	6	73362	73367	0 %	50 %	50 %	0 %	220910676
46	NC_011885	GC	3	6	76646	76651	0 %	0 %	50 %	50 %	220910677
47	NC_011885	GT	3	6	79826	79831	0 %	50 %	50 %	0 %	220910678
48	NC_011885	AC	3	6	83108	83113	50 %	0 %	0 %	50 %	220910679
49	NC_011885	GA	3	6	84549	84554	50 %	0 %	50 %	0 %	220910680
50	NC_011885	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	220910682
51	NC_011885	CA	3	6	94838	94843	50 %	0 %	0 %	50 %	220910689
52	NC_011885	GA	3	6	95809	95814	50 %	0 %	50 %	0 %	220910690
53	NC_011885	CA	3	6	95983	95988	50 %	0 %	0 %	50 %	220910690
54	NC_011885	CG	3	6	96380	96385	0 %	0 %	50 %	50 %	220910691
55	NC_011885	TC	3	6	96663	96668	0 %	50 %	0 %	50 %	220910691
56	NC_011885	GT	3	6	101446	101451	0 %	50 %	50 %	0 %	220910695
57	NC_011885	CT	3	6	101744	101749	0 %	50 %	0 %	50 %	220910695
58	NC_011885	TC	3	6	104249	104254	0 %	50 %	0 %	50 %	220910698
59	NC_011885	AT	3	6	104768	104773	50 %	50 %	0 %	0 %	220910698
60	NC_011885	AC	3	6	107915	107920	50 %	0 %	0 %	50 %	220910703
61	NC_011885	AT	3	6	109458	109463	50 %	50 %	0 %	0 %	220910704
62	NC_011885	AT	3	6	110119	110124	50 %	50 %	0 %	0 %	220910704
63	NC_011885	AG	3	6	110145	110150	50 %	0 %	50 %	0 %	220910704
64	NC_011885	GT	3	6	113253	113258	0 %	50 %	50 %	0 %	220910705
65	NC_011885	CA	3	6	121542	121547	50 %	0 %	0 %	50 %	220910717
66	NC_011885	AC	3	6	124284	124289	50 %	0 %	0 %	50 %	220910719
67	NC_011885	CA	3	6	126053	126058	50 %	0 %	0 %	50 %	220910721
68	NC_011885	AG	3	6	126789	126794	50 %	0 %	50 %	0 %	220910721
69	NC_011885	AT	3	6	127085	127090	50 %	50 %	0 %	0 %	220910721
70	NC_011885	GT	3	6	127711	127716	0 %	50 %	50 %	0 %	220910721
71	NC_011885	TC	3	6	135259	135264	0 %	50 %	0 %	50 %	220910730
72	NC_011885	AT	3	6	136112	136117	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
73	NC_011885	TA	3	6	136544	136549	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
74	NC_011885	AT	3	6	137137	137142	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
75	NC_011885	GA	3	6	139252	139257	50 %	0 %	50 %	0 %	220910732
76	NC_011885	CT	3	6	139349	139354	0 %	50 %	0 %	50 %	220910732
77	NC_011885	GC	3	6	139659	139664	0 %	0 %	50 %	50 %	220910732
78	NC_011885	GC	3	6	140001	140006	0 %	0 %	50 %	50 %	220910732
79	NC_011885	GA	3	6	142127	142132	50 %	0 %	50 %	0 %	220910734
80	NC_011885	AC	3	6	142548	142553	50 %	0 %	0 %	50 %	220910734
81	NC_011885	AC	3	6	142665	142670	50 %	0 %	0 %	50 %	220910734
82	NC_011885	TC	3	6	143777	143782	0 %	50 %	0 %	50 %	220910735
83	NC_011885	TG	3	6	143813	143818	0 %	50 %	50 %	0 %	220910735
84	NC_011885	AT	3	6	144116	144121	50 %	50 %	0 %	0 %	220910735
85	NC_011885	GC	3	6	145828	145833	0 %	0 %	50 %	50 %	220910735
86	NC_011885	GA	3	6	147558	147563	50 %	0 %	50 %	0 %	220910738
87	NC_011885	AG	3	6	148827	148832	50 %	0 %	50 %	0 %	220910740
88	NC_011885	AT	3	6	150157	150162	50 %	50 %	0 %	0 %	220910741
89	NC_011885	GA	3	6	151964	151969	50 %	0 %	50 %	0 %	220910745
90	NC_011885	AG	3	6	151983	151988	50 %	0 %	50 %	0 %	220910745
91	NC_011885	CT	3	6	152233	152238	0 %	50 %	0 %	50 %	220910745
92	NC_011885	GA	3	6	153177	153182	50 %	0 %	50 %	0 %	220910746
93	NC_011885	GA	3	6	154915	154920	50 %	0 %	50 %	0 %	220910747
94	NC_011885	CT	3	6	155618	155623	0 %	50 %	0 %	50 %	220910748
95	NC_011885	CT	3	6	156251	156256	0 %	50 %	0 %	50 %	220910748
96	NC_011885	CT	3	6	157182	157187	0 %	50 %	0 %	50 %	220910749
97	NC_011885	GA	3	6	157437	157442	50 %	0 %	50 %	0 %	220910749
98	NC_011885	TG	3	6	157570	157575	0 %	50 %	50 %	0 %	220910749
99	NC_011885	AC	3	6	158051	158056	50 %	0 %	0 %	50 %	220910750
100	NC_011885	AG	3	6	158856	158861	50 %	0 %	50 %	0 %	220910751
101	NC_011885	GA	3	6	162752	162757	50 %	0 %	50 %	0 %	220910755
102	NC_011885	TC	3	6	169071	169076	0 %	50 %	0 %	50 %	220910769
103	NC_011885	CA	3	6	175705	175710	50 %	0 %	0 %	50 %	220910774
104	NC_011885	GT	3	6	176568	176573	0 %	50 %	50 %	0 %	220910775
105	NC_011885	CT	3	6	179186	179191	0 %	50 %	0 %	50 %	220910781

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.