MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 14488

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011884	AAAG	2	8	932	939	75 %	0 %	25 %	0 %	220905644
2	NC_011884	TCGA	2	8	1574	1581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011884	TCCA	2	8	1786	1793	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_011884	CCCG	2	8	2129	2136	0 %	0 %	25 %	75 %	220905645
5	NC_011884	GTCA	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	220905645
6	NC_011884	ACAA	2	8	2664	2671	75 %	0 %	0 %	25 %	220905645
7	NC_011884	TTGA	2	8	2909	2916	25 %	50 %	25 %	0 %	220905645
8	NC_011884	TGGA	2	8	3438	3445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011884	CTGC	2	8	4004	4011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011884	TGGT	2	8	4508	4515	0 %	50 %	50 %	0 %	220905647
11	NC_011884	CCCA	2	8	4553	4560	25 %	0 %	0 %	75 %	220905647
12	NC_011884	TATT	2	8	4694	4701	25 %	75 %	0 %	0 %	220905647
13	NC_011884	TGAT	2	8	4782	4789	25 %	50 %	25 %	0 %	220905647
14	NC_011884	CGCC	2	8	5089	5096	0 %	0 %	25 %	75 %	220905647
15	NC_011884	GCCC	2	8	5125	5132	0 %	0 %	25 %	75 %	220905647
16	NC_011884	CGAT	2	8	5391	5398	25 %	25 %	25 %	25 %	220905647
17	NC_011884	TCAG	2	8	5481	5488	25 %	25 %	25 %	25 %	220905647
18	NC_011884	TGAT	2	8	5642	5649	25 %	50 %	25 %	0 %	220905648
19	NC_011884	TACC	2	8	5763	5770	25 %	25 %	0 %	50 %	220905648
20	NC_011884	CGGG	2	8	6490	6497	0 %	0 %	75 %	25 %	220905648
21	NC_011884	GCGG	2	8	6776	6783	0 %	0 %	75 %	25 %	220905649
22	NC_011884	TCAA	2	8	7035	7042	50 %	25 %	0 %	25 %	220905649
23	NC_011884	CAGG	2	8	7402	7409	25 %	0 %	50 %	25 %	220905649
24	NC_011884	ATCG	2	8	7509	7516	25 %	25 %	25 %	25 %	220905649
25	NC_011884	GTGG	2	8	7755	7762	0 %	25 %	75 %	0 %	220905649
26	NC_011884	ATCG	2	8	8646	8653	25 %	25 %	25 %	25 %	220905650
27	NC_011884	TGGG	2	8	8792	8799	0 %	25 %	75 %	0 %	220905650
28	NC_011884	CTGG	2	8	9797	9804	0 %	25 %	50 %	25 %	220905651
29	NC_011884	GACT	2	8	9856	9863	25 %	25 %	25 %	25 %	220905651
30	NC_011884	CCCA	2	8	10227	10234	25 %	0 %	0 %	75 %	220905651
31	NC_011884	GATA	2	8	10388	10395	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011884	GATC	2	8	10472	10479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_011884	GTTT	2	8	10925	10932	0 %	75 %	25 %	0 %	220905652
34	NC_011884	ATCC	2	8	11209	11216	25 %	25 %	0 %	50 %	220905652
35	NC_011884	CTGG	2	8	11550	11557	0 %	25 %	50 %	25 %	220905652
36	NC_011884	GAAA	2	8	11595	11602	75 %	0 %	25 %	0 %	220905652
37	NC_011884	GCAG	2	8	11988	11995	25 %	0 %	50 %	25 %	220905652
38	NC_011884	GGCA	2	8	11997	12004	25 %	0 %	50 %	25 %	220905652
39	NC_011884	AATT	2	8	12075	12082	50 %	50 %	0 %	0 %	220905652
40	NC_011884	CTGG	2	8	12231	12238	0 %	25 %	50 %	25 %	220905653
41	NC_011884	TCTA	2	8	12241	12248	25 %	50 %	0 %	25 %	220905653
42	NC_011884	TGGA	2	8	12316	12323	25 %	25 %	50 %	0 %	220905653
43	NC_011884	TGGG	2	8	13000	13007	0 %	25 %	75 %	0 %	220905654
44	NC_011884	CCAA	2	8	13061	13068	50 %	0 %	0 %	50 %	220905654
45	NC_011884	TGGC	2	8	13146	13153	0 %	25 %	50 %	25 %	220905654
46	NC_011884	CTGT	2	8	13254	13261	0 %	50 %	25 %	25 %	220905654
47	NC_011884	TGAG	2	8	13334	13341	25 %	25 %	50 %	0 %	220905654
48	NC_011884	CAAA	2	8	13482	13489	75 %	0 %	0 %	25 %	220905654
49	NC_011884	TAGG	2	8	15327	15334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011884	ACGG	2	8	15757	15764	25 %	0 %	50 %	25 %	220905657
51	NC_011884	TTGG	2	8	16308	16315	0 %	50 %	50 %	0 %	220905657
52	NC_011884	TCAT	2	8	16749	16756	25 %	50 %	0 %	25 %	220905658
53	NC_011884	TATT	2	8	16954	16961	25 %	75 %	0 %	0 %	220905658
54	NC_011884	AAGG	2	8	17360	17367	50 %	0 %	50 %	0 %	220905658
55	NC_011884	GCTT	2	8	18264	18271	0 %	50 %	25 %	25 %	220905659
56	NC_011884	CCGG	2	8	18642	18649	0 %	0 %	50 %	50 %	220905659
57	NC_011884	ATTT	2	8	18801	18808	25 %	75 %	0 %	0 %	220905659
58	NC_011884	CGAT	2	8	19368	19375	25 %	25 %	25 %	25 %	220905659
59	NC_011884	TGGT	2	8	19608	19615	0 %	50 %	50 %	0 %	220905659
60	NC_011884	ATCA	2	8	19640	19647	50 %	25 %	0 %	25 %	220905659
61	NC_011884	ACCT	2	8	19670	19677	25 %	25 %	0 %	50 %	220905659
62	NC_011884	TGTC	2	8	19770	19777	0 %	50 %	25 %	25 %	220905660
63	NC_011884	GTTT	2	8	20614	20621	0 %	75 %	25 %	0 %	220905660
64	NC_011884	ACTC	2	8	21205	21212	25 %	25 %	0 %	50 %	220905661
65	NC_011884	ATAA	2	8	21456	21463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011884	CTTC	2	8	21617	21624	0 %	50 %	0 %	50 %	220905662
67	NC_011884	CAGT	2	8	22464	22471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_011884	TAGC	2	8	22630	22637	25 %	25 %	25 %	25 %	220905663
69	NC_011884	AGCC	2	8	22672	22679	25 %	0 %	25 %	50 %	220905663
70	NC_011884	ACCA	2	8	22715	22722	50 %	0 %	0 %	50 %	220905663
71	NC_011884	AAAG	2	8	22727	22734	75 %	0 %	25 %	0 %	220905663
72	NC_011884	CCAG	2	8	22936	22943	25 %	0 %	25 %	50 %	220905663
73	NC_011884	CCAA	2	8	23258	23265	50 %	0 %	0 %	50 %	220905663
74	NC_011884	AGCC	2	8	24895	24902	25 %	0 %	25 %	50 %	220905664
75	NC_011884	GCCT	2	8	25232	25239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011884	AGCC	2	8	25468	25475	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_011884	AACC	2	8	25949	25956	50 %	0 %	0 %	50 %	220905666
78	NC_011884	GTAA	2	8	26050	26057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011884	ATTC	2	8	26207	26214	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011884	GAAT	2	8	26316	26323	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011884	GTTC	2	8	26458	26465	0 %	50 %	25 %	25 %	220905667
82	NC_011884	GCCC	2	8	27076	27083	0 %	0 %	25 %	75 %	220905667
83	NC_011884	CAAA	2	8	27181	27188	75 %	0 %	0 %	25 %	220905667
84	NC_011884	CCCT	2	8	27977	27984	0 %	25 %	0 %	75 %	220905668
85	NC_011884	CCAG	2	8	28309	28316	25 %	0 %	25 %	50 %	220905668
86	NC_011884	GGTT	2	8	28882	28889	0 %	50 %	50 %	0 %	220905668
87	NC_011884	ATCG	2	8	29048	29055	25 %	25 %	25 %	25 %	220905669
88	NC_011884	CATC	2	8	29218	29225	25 %	25 %	0 %	50 %	220905669
89	NC_011884	CCTC	2	8	29345	29352	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_011884	TTTC	2	8	29367	29374	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_011884	TTCA	2	8	29579	29586	25 %	50 %	0 %	25 %	220905670
92	NC_011884	CTTG	2	8	29599	29606	0 %	50 %	25 %	25 %	220905670
93	NC_011884	GATA	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	220905670
94	NC_011884	CAGC	2	8	29830	29837	25 %	0 %	25 %	50 %	220905670
95	NC_011884	TCAA	2	8	29985	29992	50 %	25 %	0 %	25 %	220905670
96	NC_011884	GCCT	2	8	30698	30705	0 %	25 %	25 %	50 %	220905671
97	NC_011884	TCGG	2	8	30816	30823	0 %	25 %	50 %	25 %	220905671
98	NC_011884	CTTC	2	8	30940	30947	0 %	50 %	0 %	50 %	220905671
99	NC_011884	TGCC	2	8	31289	31296	0 %	25 %	25 %	50 %	220905672
100	NC_011884	AGGT	2	8	31914	31921	25 %	25 %	50 %	0 %	220905673
101	NC_011884	GGAG	2	8	32486	32493	25 %	0 %	75 %	0 %	220905673
102	NC_011884	TGGC	2	8	32966	32973	0 %	25 %	50 %	25 %	220905673
103	NC_011884	TTAC	2	8	33666	33673	25 %	50 %	0 %	25 %	220905674
104	NC_011884	TCTT	2	8	33737	33744	0 %	75 %	0 %	25 %	220905674
105	NC_011884	CCTG	2	8	33815	33822	0 %	25 %	25 %	50 %	220905674
106	NC_011884	TTCC	2	8	34011	34018	0 %	50 %	0 %	50 %	220905674
107	NC_011884	TCAG	2	8	34299	34306	25 %	25 %	25 %	25 %	220905674
108	NC_011884	TAAT	2	8	34349	34356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011884	ATCG	2	8	34757	34764	25 %	25 %	25 %	25 %	220905675
110	NC_011884	ACAG	2	8	35560	35567	50 %	0 %	25 %	25 %	220905677
111	NC_011884	TAGG	2	8	36170	36177	25 %	25 %	50 %	0 %	220905678
112	NC_011884	GCTC	2	8	36687	36694	0 %	25 %	25 %	50 %	220905678
113	NC_011884	GGGT	2	8	36931	36938	0 %	25 %	75 %	0 %	220905678
114	NC_011884	CGAT	2	8	37375	37382	25 %	25 %	25 %	25 %	220905679
115	NC_011884	CAAA	2	8	37682	37689	75 %	0 %	0 %	25 %	220905680
116	NC_011884	TTCT	2	8	37772	37779	0 %	75 %	0 %	25 %	220905680
117	NC_011884	AAGC	2	8	38055	38062	50 %	0 %	25 %	25 %	220905680
118	NC_011884	CGCT	2	8	38398	38405	0 %	25 %	25 %	50 %	220905680
119	NC_011884	TAGC	2	8	38551	38558	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
120	NC_011884	GATC	2	8	38655	38662	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
121	NC_011884	GAGC	2	8	38689	38696	25 %	0 %	50 %	25 %	220905681
122	NC_011884	CAGC	2	8	38862	38869	25 %	0 %	25 %	50 %	220905681
123	NC_011884	TCGA	2	8	39295	39302	25 %	25 %	25 %	25 %	220905681
124	NC_011884	TCTG	2	8	40017	40024	0 %	50 %	25 %	25 %	220905682
125	NC_011884	CTGG	2	8	40100	40107	0 %	25 %	50 %	25 %	220905682
126	NC_011884	GAAT	2	8	40467	40474	50 %	25 %	25 %	0 %	220905683
127	NC_011884	CCAT	2	8	41399	41406	25 %	25 %	0 %	50 %	220905684
128	NC_011884	ACTG	2	8	41535	41542	25 %	25 %	25 %	25 %	220905684
129	NC_011884	CAAT	2	8	41688	41695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_011884	GGTC	2	8	42493	42500	0 %	25 %	50 %	25 %	220905685
131	NC_011884	CCTG	2	8	42906	42913	0 %	25 %	25 %	50 %	220905685
132	NC_011884	CCAG	2	8	44234	44241	25 %	0 %	25 %	50 %	220905687
133	NC_011884	CCTT	2	8	44585	44592	0 %	50 %	0 %	50 %	220905687
134	NC_011884	ACGG	2	8	44851	44858	25 %	0 %	50 %	25 %	220905687
135	NC_011884	GCCA	2	8	45314	45321	25 %	0 %	25 %	50 %	220905687
136	NC_011884	CTGG	2	8	45859	45866	0 %	25 %	50 %	25 %	220905688
137	NC_011884	TGGA	2	8	46615	46622	25 %	25 %	50 %	0 %	220905689
138	NC_011884	AGGC	2	8	46826	46833	25 %	0 %	50 %	25 %	220905689
139	NC_011884	CGAT	2	8	46970	46977	25 %	25 %	25 %	25 %	220905690
140	NC_011884	AATG	2	8	47622	47629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011884	CCAG	2	8	47799	47806	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011884	TTGA	2	8	47811	47818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011884	CGAT	2	8	48287	48294	25 %	25 %	25 %	25 %	220905692
144	NC_011884	TGAC	2	8	48320	48327	25 %	25 %	25 %	25 %	220905692
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152	NC_011884	CATA	2	8	52559	52566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011884	CTCA	2	8	52638	52645	25 %	25 %	0 %	50 %	220905698
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157	NC_011884	AGTA	2	8	53265	53272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011884	CAGT	2	8	53518	53525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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160	NC_011884	CAGT	2	8	54046	54053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_011884	GATT	2	8	55983	55990	25 %	50 %	25 %	0 %	220905699
162	NC_011884	CCCT	2	8	56576	56583	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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181	NC_011884	TTTC	2	8	66153	66160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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277	NC_011884	ATTA	2	8	98109	98116	50 %	50 %	0 %	0 %	220905739
278	NC_011884	CTGG	2	8	98303	98310	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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