MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 chromosome

Total Repeats: 56161

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011884	GAA	2	6	300	305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905644
2	NC_011884	CAG	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905644
3	NC_011884	GAG	2	6	318	323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905644
4	NC_011884	CGT	2	6	434	439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905644
5	NC_011884	AAT	2	6	447	452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905644
6	NC_011884	GGA	2	6	525	530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905644
7	NC_011884	TGG	2	6	709	714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905644
8	NC_011884	GAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905644
9	NC_011884	GGT	2	6	800	805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905644
10	NC_011884	CAC	2	6	1106	1111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905644
11	NC_011884	CTG	2	6	1143	1148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905644
12	NC_011884	CGC	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905644
13	NC_011884	GGC	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905644
14	NC_011884	TGC	2	6	2019	2024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
15	NC_011884	AGA	2	6	2254	2259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905645
16	NC_011884	TGC	2	6	2422	2427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
17	NC_011884	GGT	2	6	2587	2592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905645
18	NC_011884	CTG	2	6	2639	2644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905645
19	NC_011884	CAG	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905645
20	NC_011884	CTC	2	6	2826	2831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905645
21	NC_011884	GAA	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905645
22	NC_011884	GCC	2	6	2963	2968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905645
23	NC_011884	TGA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905646
24	NC_011884	TGT	2	6	3609	3614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905646
25	NC_011884	GTA	2	6	4287	4292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
26	NC_011884	ATT	2	6	4364	4369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905647
27	NC_011884	TTC	2	6	4539	4544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905647
28	NC_011884	GCG	2	6	4643	4648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
29	NC_011884	GGC	2	6	4672	4677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
30	NC_011884	TAG	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
31	NC_011884	GGC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
32	NC_011884	CTA	2	6	4834	4839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
33	NC_011884	ATC	2	6	4905	4910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
34	NC_011884	GAG	2	6	4935	4940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905647
35	NC_011884	CAG	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905647
36	NC_011884	TAG	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905647
37	NC_011884	CAG	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905647
38	NC_011884	CAC	2	6	5117	5122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905647
39	NC_011884	ACC	2	6	5144	5149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905647
40	NC_011884	GTG	2	6	5193	5198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905647
41	NC_011884	GCT	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905647
42	NC_011884	AGG	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905647
43	NC_011884	CGG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
44	NC_011884	ATC	2	6	5454	5459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905647
45	NC_011884	GCG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905647
46	NC_011884	GAA	2	6	5588	5593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905647
47	NC_011884	CTG	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
48	NC_011884	GCG	2	6	5821	5826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905648
49	NC_011884	GAT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905648
50	NC_011884	TGC	2	6	5981	5986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
51	NC_011884	CAG	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
52	NC_011884	AGC	2	6	6068	6073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
53	NC_011884	GCC	2	6	6106	6111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905648
54	NC_011884	AGG	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905648
55	NC_011884	CAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
56	NC_011884	CTG	2	6	6232	6237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
57	NC_011884	TGC	2	6	6255	6260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
58	NC_011884	CTG	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
59	NC_011884	GCT	2	6	6373	6378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905648
60	NC_011884	CAA	2	6	6502	6507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905648
61	NC_011884	TCC	2	6	6556	6561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905648
62	NC_011884	CTA	2	6	6585	6590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905648
63	NC_011884	AGC	2	6	6594	6599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905648
64	NC_011884	CGC	2	6	6880	6885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905649
65	NC_011884	TGC	3	9	6960	6968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
66	NC_011884	TCC	2	6	7004	7009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905649
67	NC_011884	CGG	2	6	7085	7090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905649
68	NC_011884	CAG	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
69	NC_011884	AGC	2	6	7173	7178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
70	NC_011884	GTG	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905649
71	NC_011884	GCG	2	6	7224	7229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905649
72	NC_011884	CAA	2	6	7232	7237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905649
73	NC_011884	AGT	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905649
74	NC_011884	TGT	2	6	7332	7337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905649
75	NC_011884	TGC	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
76	NC_011884	CTG	4	12	7496	7507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
77	NC_011884	CTG	2	6	7517	7522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905649
78	NC_011884	TGT	2	6	7605	7610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905649
79	NC_011884	CCA	2	6	7619	7624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905649
80	NC_011884	AAG	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905649
81	NC_011884	CTC	2	6	7814	7819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905649
82	NC_011884	AGC	2	6	7986	7991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905649
83	NC_011884	CAG	2	6	8349	8354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905650
84	NC_011884	CTG	2	6	8401	8406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
85	NC_011884	GGT	2	6	8515	8520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905650
86	NC_011884	CGG	2	6	8529	8534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
87	NC_011884	CGG	2	6	8574	8579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
88	NC_011884	GTT	2	6	8703	8708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905650
89	NC_011884	CTG	2	6	8733	8738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
90	NC_011884	GGC	2	6	8803	8808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
91	NC_011884	TCA	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905650
92	NC_011884	CTG	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
93	NC_011884	GTT	3	9	8952	8960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905650
94	NC_011884	GGC	2	6	9132	9137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905650
95	NC_011884	CTG	2	6	9268	9273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905650
96	NC_011884	CAG	2	6	9367	9372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905650
97	NC_011884	TAA	2	6	9426	9431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905650
98	NC_011884	GAG	2	6	9478	9483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905650
99	NC_011884	ATT	2	6	9765	9770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905651
100	NC_011884	CTC	2	6	10004	10009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905651
101	NC_011884	GCT	2	6	10020	10025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905651
102	NC_011884	TGT	2	6	10164	10169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220905651
103	NC_011884	AAG	2	6	10170	10175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905651
104	NC_011884	GGT	2	6	10181	10186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905651
105	NC_011884	TGA	2	6	10565	10570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905652
106	NC_011884	CAG	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
107	NC_011884	CGG	2	6	10997	11002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905652
108	NC_011884	ATC	2	6	11033	11038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905652
109	NC_011884	CAG	2	6	11235	11240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
110	NC_011884	GGT	2	6	11316	11321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905652
111	NC_011884	GGA	2	6	11574	11579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220905652
112	NC_011884	CAG	2	6	11686	11691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905652
113	NC_011884	ATT	2	6	11842	11847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905652
114	NC_011884	CCG	2	6	11865	11870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905652
115	NC_011884	GAA	2	6	12037	12042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905652
116	NC_011884	CCT	2	6	12193	12198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905653
117	NC_011884	CGC	2	6	12280	12285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905653
118	NC_011884	GGT	2	6	12339	12344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220905653
119	NC_011884	TGC	2	6	12371	12376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905653
120	NC_011884	CGC	2	6	12604	12609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905653
121	NC_011884	CAA	2	6	12706	12711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	220905653
122	NC_011884	ATT	2	6	12811	12816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905653
123	NC_011884	GCT	2	6	12993	12998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905654
124	NC_011884	CAT	3	9	13281	13289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905654
125	NC_011884	TCA	2	6	13313	13318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905654
126	NC_011884	CTG	2	6	13386	13391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905654
127	NC_011884	GCC	2	6	13682	13687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220905655
128	NC_011884	CAG	2	6	13723	13728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905655
129	NC_011884	CCA	2	6	13821	13826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905655
130	NC_011884	ATG	2	6	13850	13855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220905655
131	NC_011884	ATA	2	6	13900	13905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220905655
132	NC_011884	TCC	2	6	14210	14215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905656
133	NC_011884	CTG	2	6	14217	14222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905656
134	NC_011884	GGC	2	6	14359	14364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905656
135	NC_011884	ATT	2	6	14466	14471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220905656
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137	NC_011884	TCC	2	6	14517	14522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905656
138	NC_011884	TCG	2	6	14576	14581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905656
139	NC_011884	GCT	2	6	14681	14686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905656
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142	NC_011884	GCG	2	6	14942	14947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220905656
143	NC_011884	CTC	2	6	15094	15099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220905656
144	NC_011884	CTG	2	6	15123	15128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905656
145	NC_011884	CAC	2	6	15135	15140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905656
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149	NC_011884	CCA	2	6	16287	16292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220905657
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152	NC_011884	GTC	2	6	16431	16436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905657
153	NC_011884	TCG	2	6	16452	16457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905657
154	NC_011884	GCA	2	6	16469	16474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905658
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162	NC_011884	CTG	2	6	16907	16912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220905658
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249	NC_011884	GAA	2	6	25125	25130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220905665
250	NC_011884	TCA	3	9	25889	25897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220905666
251	NC_011884	AGC	2	6	25915	25920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220905666
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253	NC_011884	TTC	2	6	25959	25964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220905666
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