MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011883	TGTTTT	2	12	49054	49065	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011883	AGGCGG	2	12	95848	95859	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011883	GATACG	2	12	102475	102486	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011883	TGGCCG	2	12	114226	114237	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011883	GGAGGG	2	12	114732	114743	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011883	GCCGGA	2	12	147702	147713	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011883	GGATGA	2	12	152018	152029	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011883	GCCCCG	2	12	188847	188858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011883	GGCCGG	2	12	188880	188891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011883	GTGCTG	2	12	222004	222015	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011883	GATCAC	2	12	224890	224901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011883	GCCTGC	2	12	248188	248199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_011883	GCAGGG	2	12	255614	255625	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011883	CTCTCC	2	12	319142	319153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011883	TACATC	2	12	319324	319335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011883	CCCTGC	2	12	355406	355417	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_011883	ACAGGC	2	12	368115	368126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011883	TCAATG	2	12	389357	389368	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011883	GCCGTT	2	12	394645	394656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011883	CGCAGG	2	12	400392	400403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011883	TTCCAC	2	12	406624	406635	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011883	GCGGTG	2	12	445238	445249	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011883	ACCCGA	2	12	461479	461490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_011883	CTGCCC	2	12	464263	464274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_011883	GGGAGT	2	12	480831	480842	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011883	AACCGC	2	12	488101	488112	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011883	TTTCTG	2	12	499077	499088	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011883	GCCGGG	2	12	535207	535218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011883	CCTTAA	2	12	550774	550785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011883	TGGCCG	2	12	581348	581359	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011883	TTATCA	2	12	620996	621007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_011883	CATTTT	2	12	623849	623860	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011883	GTTGCC	2	12	637144	637155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011883	TTTTTG	2	12	656946	656957	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011883	GCGCGG	2	12	666221	666232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011883	GATAAA	2	12	676159	676170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011883	TGGTTG	2	12	710342	710353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011883	CCTGTG	2	12	718012	718023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011883	TAAAAA	2	12	720382	720393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011883	TATATT	2	12	777420	777431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011883	ATTTTT	2	12	779362	779373	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011883	AAATTC	2	12	786016	786027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011883	CTGATC	2	12	792354	792365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011883	CGCGCC	2	12	793386	793397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_011883	CAAAAA	2	12	800446	800457	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_011883	TGGGGG	2	12	835411	835422	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011883	GGGCCG	2	12	841689	841700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011883	TGCCTG	2	12	883827	883838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011883	CCTTGC	2	12	914099	914110	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011883	GGAAGG	2	12	936527	936538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011883	TTCCCC	2	12	936590	936601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011883	CAGACG	2	12	942216	942227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011883	GCCCAT	2	12	950557	950568	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011883	ATTTAT	2	12	1010705	1010716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011883	GGCAGC	2	12	1046125	1046136	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011883	GTATTT	2	12	1083760	1083771	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011883	TTTATT	2	12	1100370	1100381	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011883	AGGCGG	2	12	1227063	1227074	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011883	GGAGAG	2	12	1228401	1228412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011883	ATATTC	2	12	1257333	1257344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_011883	AACGCA	2	12	1291412	1291423	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011883	AAAATG	2	12	1372120	1372131	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011883	GGGAAG	2	12	1395627	1395638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011883	CGTGCC	2	12	1396240	1396251	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_011883	TATGTG	2	12	1433391	1433402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011883	ATTACA	2	12	1438727	1438738	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011883	AGCGTA	2	12	1443519	1443530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011883	TTGCGC	2	12	1451065	1451076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011883	GGGCAG	2	12	1487051	1487062	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011883	TCGGGT	2	12	1489835	1489846	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011883	AAATTC	2	12	1616865	1616876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_011883	AACCGG	2	12	1619516	1619527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011883	GGACAG	2	12	1655504	1655515	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_011883	CCATGA	2	12	1689499	1689510	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011883	GGCAAG	2	12	1740246	1740257	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_011883	CCCCGG	2	12	1747342	1747353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011883	AATTTC	2	12	1747526	1747537	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_011883	TTCGGC	2	12	1770100	1770111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011883	TGCTCC	2	12	1784744	1784755	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_011883	TTGCGC	2	12	1799409	1799420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011883	TGCACC	2	12	1814473	1814484	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_011883	GCGGCA	2	12	1853649	1853660	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011883	GACATT	2	12	1858331	1858342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011883	GCTCTT	2	12	1858796	1858807	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011883	CTGTTT	2	12	1876536	1876547	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_011883	AAACCG	2	12	1897250	1897261	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011883	GCCGTG	2	12	1906799	1906810	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011883	TGCTCG	2	12	1906845	1906856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011883	AAATGA	2	12	1907115	1907126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011883	TTCGCT	2	12	1907338	1907349	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011883	AATTGA	2	12	1907808	1907819	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011883	CAGGGC	2	12	1914992	1915003	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011883	GCCTGT	2	12	1985073	1985084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011883	AAAGCA	2	12	1985220	1985231	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_011883	TGAAAT	2	12	1988744	1988755	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011883	CCAGCG	2	12	2025780	2025791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_011883	GGGCAG	2	12	2037848	2037859	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_011883	TCGGGT	2	12	2040632	2040643	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_011883	GCCTGT	2	12	2088824	2088835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011883	AAAAAC	2	12	2101356	2101367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011883	TTCCGG	2	12	2137549	2137560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011883	GTGCCT	2	12	2144174	2144185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011883	TTCAAC	2	12	2164402	2164413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011883	TTGCGC	2	12	2164507	2164518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011883	AAGGGC	2	12	2177156	2177167	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_011883	CGCAAA	2	12	2219194	2219205	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011883	AAGGCC	2	12	2239768	2239779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011883	ATTGAA	2	12	2263050	2263061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011883	CTTTGC	2	12	2280383	2280394	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011883	TGGCAA	2	12	2297513	2297524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011883	GGGGGC	2	12	2298078	2298089	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011883	CTCCAT	2	12	2308492	2308503	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011883	TTTTTA	2	12	2309907	2309918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011883	CCGCAA	2	12	2315191	2315202	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011883	GCATGC	2	12	2347994	2348005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011883	CGGCAA	2	12	2386815	2386826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011883	CAGAAA	2	12	2393249	2393260	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_011883	AAAAAC	2	12	2433580	2433591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011883	AGGCAC	2	12	2439309	2439320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011883	GAACCG	2	12	2454661	2454672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011883	TGGCCT	2	12	2503178	2503189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011883	CGCAGC	2	12	2533712	2533723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011883	AACCCA	2	12	2534920	2534931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011883	TGCGGT	2	12	2559446	2559457	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_011883	TCATAA	2	12	2607314	2607325	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_011883	AAAGAC	2	12	2649726	2649737	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011883	GTCTTT	2	12	2649755	2649766	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011883	CTTTTT	2	12	2687528	2687539	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011883	TGAAAA	2	12	2689248	2689259	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011883	CCGCAG	2	12	2706106	2706117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011883	CAGCCG	2	12	2713747	2713758	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011883	CGCCTG	2	12	2717965	2717976	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011883	TTGCAT	2	12	2726569	2726580	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_011883	CTGCCC	2	12	2755349	2755360	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_011883	AAAACC	2	12	2831540	2831551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.