MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774 chromosome

Total Repeats: 457

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011883	CCTGT	2	10	63	72	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_011883	ATGAA	2	10	2309	2318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011883	GGGCA	2	10	20672	20681	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011883	CGCAG	2	10	21205	21214	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_011883	CCTGT	2	10	25778	25787	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_011883	GCCAG	2	10	28750	28759	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_011883	GCACG	2	10	47147	47156	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011883	ATTTT	2	10	49093	49102	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011883	TAAAG	2	10	53887	53896	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011883	GGCGG	2	10	53962	53971	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_011883	TCTTG	2	10	69224	69233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011883	GGCCG	2	10	70299	70308	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_011883	CGTGC	2	10	76181	76190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_011883	TTATT	2	10	88717	88726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011883	TAAAC	2	10	95870	95879	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011883	AAACG	2	10	111632	111641	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011883	GGCCC	2	10	114908	114917	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_011883	GATAT	2	10	117626	117635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011883	TGCCG	2	10	121064	121073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_011883	ATCAA	2	10	121310	121319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011883	TCAGG	2	10	127245	127254	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011883	CCTGC	2	10	130453	130462	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_011883	GGGCC	2	10	131867	131876	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_011883	GCTGC	2	10	141007	141016	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_011883	GGCCG	2	10	157368	157377	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_011883	GCGGA	2	10	157574	157583	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011883	CGCAG	2	10	159307	159316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011883	TCGCT	2	10	161067	161076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_011883	CGCGC	2	10	161091	161100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_011883	CAGGG	2	10	178428	178437	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_011883	GCCGG	2	10	181691	181700	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_011883	TGTGG	2	10	181718	181727	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011883	TCCGG	2	10	208003	208012	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011883	GCCGT	2	10	208190	208199	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011883	CCGTG	2	10	210366	210375	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_011883	GTGTT	2	10	212405	212414	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011883	CGGCC	2	10	220772	220781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_011883	CAGGG	2	10	221806	221815	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011883	GATGG	2	10	221900	221909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011883	TGCCG	2	10	222330	222339	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_011883	GGCGC	2	10	222431	222440	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_011883	GGGCA	2	10	232681	232690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011883	CGGCA	2	10	243284	243293	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_011883	TGCGG	2	10	244886	244895	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_011883	ATGAT	2	10	247755	247764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011883	CGTTG	2	10	248448	248457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011883	AGTGC	2	10	255162	255171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_011883	GGATT	2	10	263459	263468	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011883	CGTGC	2	10	263905	263914	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_011883	CGCGC	2	10	264076	264085	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
51	NC_011883	ATAAA	2	10	283597	283606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011883	ATTTT	2	10	309778	309787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011883	GCCAC	2	10	319355	319364	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_011883	GCAGG	2	10	330695	330704	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_011883	GGCAG	2	10	330786	330795	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011883	TTTGC	2	10	332933	332942	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011883	GCCTG	2	10	336954	336963	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011883	TCCGG	2	10	337019	337028	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_011883	CGCCC	2	10	337033	337042	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_011883	GGCAG	2	10	338554	338563	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011883	TGTGT	2	10	341037	341046	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011883	GTGGC	2	10	341396	341405	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011883	CAGGC	2	10	344249	344258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_011883	GGCAA	2	10	349497	349506	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011883	TTCCG	2	10	351796	351805	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_011883	TTCCT	2	10	356741	356750	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_011883	TCCCC	2	10	356776	356785	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
68	NC_011883	GTATG	2	10	369116	369125	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011883	TTTTG	2	10	380915	380924	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011883	ATCAG	2	10	382084	382093	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011883	GTAAG	2	10	387384	387393	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011883	CCTTT	2	10	399769	399778	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
73	NC_011883	GGGGC	2	10	400047	400056	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_011883	ATTTT	2	10	401022	401031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011883	TTGTA	2	10	415599	415608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011883	GCTTT	2	10	417847	417856	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_011883	AAGAA	2	10	422035	422044	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011883	GCTGC	2	10	422888	422897	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011883	CTTCC	2	10	425864	425873	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_011883	GGCAG	2	10	432771	432780	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011883	GCGCG	2	10	436716	436725	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011883	TGCCG	2	10	445639	445648	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_011883	TGCTG	2	10	449453	449462	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011883	CGGCA	2	10	452256	452265	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011883	GCGCG	2	10	455896	455905	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_011883	TCGTG	2	10	460228	460237	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011883	AAGGA	2	10	461313	461322	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011883	CGGCG	2	10	473652	473661	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_011883	GCGGT	2	10	475532	475541	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_011883	GCCCC	2	10	475643	475652	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
91	NC_011883	CCGCG	2	10	475817	475826	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_011883	AGGAG	2	10	479279	479288	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011883	GCTAA	2	10	480896	480905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011883	AAATG	2	10	482415	482424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011883	TTTTG	2	10	488077	488086	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011883	CCTGA	2	10	503155	503164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_011883	TAAAT	2	10	507316	507325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011883	GGCCG	2	10	522595	522604	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_011883	TCGAG	2	10	531075	531084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011883	CGGCC	2	10	537741	537750	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
101	NC_011883	GGCCG	2	10	537758	537767	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011883	AGGGC	2	10	539091	539100	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011883	CGGAC	2	10	548244	548253	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_011883	CAAAA	2	10	548364	548373	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011883	TTTAT	2	10	550045	550054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011883	GCCGT	2	10	550432	550441	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_011883	GCGCC	2	10	560825	560834	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
108	NC_011883	GAAAT	2	10	568553	568562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011883	CGCGC	2	10	569847	569856	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
110	NC_011883	CAAAA	2	10	600518	600527	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011883	TGTGG	2	10	600918	600927	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011883	GCCGG	2	10	602689	602698	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_011883	GGTTT	2	10	603161	603170	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011883	TATAG	2	10	609714	609723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011883	CGGCC	2	10	610118	610127	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011883	CCCCG	2	10	629649	629658	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
117	NC_011883	GAAAA	2	10	632862	632871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011883	GATGC	2	10	645615	645624	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011883	TGCCC	2	10	651144	651153	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_011883	TGCTT	2	10	655346	655355	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_011883	GCCGG	2	10	658264	658273	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_011883	CGGCA	2	10	664458	664467	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_011883	TATAA	2	10	669283	669292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011883	CGGGC	2	10	674640	674649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
125	NC_011883	TGCGG	2	10	674842	674851	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_011883	GCACA	2	10	676111	676120	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_011883	GCAAG	2	10	682477	682486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_011883	TTTCA	2	10	697671	697680	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_011883	AGGGC	2	10	702571	702580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_011883	GCCAA	2	10	705295	705304	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011883	GTACG	2	10	723880	723889	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_011883	TGTTT	2	10	731824	731833	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011883	GGACC	2	10	735004	735013	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_011883	TGCCG	2	10	743126	743135	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_011883	TCTGC	2	10	756061	756070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_011883	GCAGG	2	10	757799	757808	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011883	GCAGA	2	10	760344	760353	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011883	CTTGC	2	10	773704	773713	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_011883	TAATA	2	10	777486	777495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011883	GGGCA	2	10	782192	782201	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_011883	TCCGT	2	10	800907	800916	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_011883	CAAAG	2	10	812481	812490	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_011883	CGTAA	2	10	813544	813553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_011883	GGGCG	2	10	817633	817642	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
145	NC_011883	GGCGT	2	10	822956	822965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_011883	GTTTT	2	10	835310	835319	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011883	AAAAG	2	10	851937	851946	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011883	GAAAA	2	10	852060	852069	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011883	AAAAG	2	10	852122	852131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011883	GCCGG	2	10	853213	853222	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_011883	CCTGA	2	10	1803540	1803549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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285	NC_011883	TGACG	2	10	1897239	1897248	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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427	NC_011883	AAAAT	2	10	2699836	2699845	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
428	NC_011883	TAAAT	2	10	2703516	2703525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_011883	CCCTT	2	10	2710085	2710094	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
430	NC_011883	TCTCC	2	10	2715343	2715352	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
431	NC_011883	GCGCA	2	10	2715642	2715651	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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445	NC_011883	CCCCG	2	10	2797121	2797130	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
446	NC_011883	CAGGC	2	10	2800287	2800296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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450	NC_011883	CATAA	2	10	2821060	2821069	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
451	NC_011883	CCTGG	2	10	2834683	2834692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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455	NC_011883	CGGCA	2	10	2855080	2855089	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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457	NC_011883	TGTCT	2	10	2863294	2863303	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.