MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742503

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011882	ACCGC	2	10	2711	2720	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_011882	AAGAT	2	10	3101	3110	60 %	20 %	20 %	0 %	219883413
3	NC_011882	AATTG	2	10	4033	4042	40 %	40 %	20 %	0 %	219883413
4	NC_011882	TCTGC	2	10	4231	4240	0 %	40 %	20 %	40 %	219883413
5	NC_011882	AAGGT	2	10	4560	4569	40 %	20 %	40 %	0 %	219883413
6	NC_011882	AGTCT	2	10	5359	5368	20 %	40 %	20 %	20 %	219883414
7	NC_011882	TTCCC	2	10	10677	10686	0 %	40 %	0 %	60 %	219883423
8	NC_011882	ATGGC	2	10	13143	13152	20 %	20 %	40 %	20 %	219883425
9	NC_011882	TTGTA	2	10	17821	17830	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011882	GTTTT	2	10	18739	18748	0 %	80 %	20 %	0 %	219883428
11	NC_011882	CTTTG	2	10	19906	19915	0 %	60 %	20 %	20 %	219883429
12	NC_011882	GATGC	2	10	20768	20777	20 %	20 %	40 %	20 %	219883429
13	NC_011882	ACGAG	2	10	21006	21015	40 %	0 %	40 %	20 %	219883430
14	NC_011882	CCCAT	2	10	21985	21994	20 %	20 %	0 %	60 %	219883431
15	NC_011882	AAAGC	2	10	24018	24027	60 %	0 %	20 %	20 %	219883432
16	NC_011882	CTTGC	2	10	25837	25846	0 %	40 %	20 %	40 %	219883434
17	NC_011882	AATTC	2	10	27172	27181	40 %	40 %	0 %	20 %	219883435
18	NC_011882	GTTTG	2	10	27414	27423	0 %	60 %	40 %	0 %	219883435
19	NC_011882	GATGA	2	10	30013	30022	40 %	20 %	40 %	0 %	219883435
20	NC_011882	CAACT	2	10	31372	31381	40 %	20 %	0 %	40 %	219883436
21	NC_011882	CTTGC	2	10	33821	33830	0 %	40 %	20 %	40 %	219883438

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.